Heatmap: Cluster_43 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.19 0.09 0.02 0.06 0.14 0.05 -0.01 0.21 -0.04 -0.12 -0.05 -0.18 -0.0 0.32 -0.03 0.05 -0.11 0.26 -0.35 -0.22 -0.13 -0.08 0.18 -0.1 -0.1 -0.12 -0.2 0.2 -0.01 -0.15
0.27 0.4 0.2 0.04 0.11 -0.06 -0.48 0.07 -0.25 -0.09 -0.36 -0.4 0.04 0.7 -0.38 -0.1 -0.03 0.48 -0.17 -0.34 -0.17 -0.11 0.08 -0.04 -0.17 -0.26 -0.34 0.01 0.21 0.3
0.2 0.29 0.14 0.03 0.07 0.01 -0.12 0.08 -0.34 -0.32 -0.31 -0.41 -0.11 0.46 0.13 0.01 -0.04 0.43 -0.14 -0.41 -0.17 0.01 0.07 0.07 -0.04 -0.11 -0.14 -0.11 0.24 0.07
-0.2 -0.2 -0.1 -0.18 0.09 -0.04 -0.2 0.04 -0.07 -0.05 -0.04 -0.11 0.01 0.69 0.26 0.14 0.1 0.32 -0.22 -0.06 -0.1 -0.09 0.21 -0.31 -0.21 -0.04 0.01 -0.11 -0.08 0.09
0.72 0.14 -0.75 -1.42 -0.34 0.75 -0.11 -0.82 -0.98 -0.9 -0.89 -0.31 0.76 1.46 0.33 -0.11 -0.34 1.91 -0.8 -0.41 -0.79 -0.55 0.39 -0.38 -1.13 -0.68 -1.13 -1.05 -0.39 0.38
0.03 -0.08 -0.15 -0.27 -0.06 0.13 0.13 0.19 -0.14 -0.19 -0.09 -0.04 0.23 0.64 0.29 0.13 0.12 -0.04 -0.11 -0.19 -0.19 -0.14 0.27 0.07 -0.08 -0.15 -0.19 -0.05 -0.15 -0.38
0.37 0.25 -0.22 -0.04 0.23 -0.09 0.04 0.49 -0.26 -0.09 -0.26 -0.24 0.2 0.68 -0.02 -0.11 -0.16 0.49 -0.37 -0.44 -0.37 -0.4 0.45 -0.35 -0.35 -0.33 -0.1 0.3 -0.12 -0.2
-0.4 0.11 -1.19 -2.23 0.62 0.74 -0.08 -1.32 -0.76 -0.61 -0.33 0.13 0.52 2.04 0.86 0.14 -0.21 0.93 -0.53 -0.63 -0.15 -0.53 -0.03 -0.13 -0.79 0.12 -1.2 -0.83 -0.75 -1.04
0.14 0.02 -0.3 -0.35 0.16 0.18 0.18 0.02 -0.35 -0.13 -0.18 -0.12 0.22 0.48 0.19 0.3 0.12 -0.11 -0.32 -0.27 -0.17 -0.19 0.3 0.13 0.0 -0.14 -0.09 0.18 -0.18 -0.18
0.18 0.0 -0.57 -0.61 -0.09 0.21 0.13 -0.1 -0.42 -0.34 -0.28 -0.24 0.39 0.59 0.65 0.44 0.06 0.1 -0.37 -0.61 -0.26 -0.11 0.3 0.19 0.0 -0.11 -0.11 0.03 -0.17 0.05
-0.42 0.8 -0.83 -0.68 0.63 0.35 -0.66 -1.16 -1.45 -0.58 -0.91 -1.08 0.36 1.84 0.44 0.25 -0.21 1.3 -0.57 -0.61 -0.39 -0.66 0.04 -0.41 -1.5 -0.28 -0.28 -0.35 -0.27 0.62
-0.22 0.11 -0.33 -0.79 0.44 0.07 -0.16 -0.21 0.08 0.23 -0.42 -0.12 -0.17 1.06 -0.08 0.24 -0.16 0.91 -0.27 -0.25 -0.07 -0.17 0.1 0.21 -0.45 0.01 -0.28 -0.32 -0.15 -0.4
-0.08 -0.25 -0.38 -0.39 -0.29 -0.0 0.16 -0.11 -0.48 -0.3 -0.02 -0.2 0.54 1.02 0.19 0.21 0.16 0.42 -0.25 -0.21 -0.15 -0.18 0.73 -0.4 -0.32 -0.26 -0.17 -0.45 -0.38 0.33
-0.18 -0.41 -0.67 -0.65 -0.08 0.22 0.11 0.39 -0.9 -0.5 -0.56 -0.44 0.54 1.59 0.53 0.18 0.04 0.73 -0.56 -0.58 -0.45 -0.61 0.94 0.06 -0.63 -0.41 -0.58 -0.56 -0.3 -0.05
Spov3_chr1.01600 (VAP27-2)
-0.15 -0.24 -0.4 -0.25 0.0 0.2 0.07 -0.12 -0.26 -0.27 -0.15 -0.04 0.18 0.71 0.41 0.18 0.19 0.53 -0.04 -0.25 -0.03 -0.12 0.09 -0.19 -0.21 -0.12 -0.06 -0.26 -0.23 0.14
-0.09 -0.13 -0.31 -0.05 0.06 -0.14 -0.17 -0.12 0.02 -0.07 -0.11 -0.04 0.18 0.85 0.25 0.13 0.08 0.28 -0.26 -0.23 -0.02 -0.08 0.32 -0.21 -0.18 -0.02 -0.02 -0.2 -0.18 -0.11
-0.16 -0.21 -0.49 -0.47 0.23 0.76 0.27 -0.07 -0.49 -0.55 -0.41 -0.35 0.33 0.71 0.49 0.39 0.35 0.39 -0.3 -0.27 -0.32 -0.36 0.59 -0.36 -0.45 -0.35 -0.37 -0.34 -0.27 0.3
0.02 0.11 -0.22 -0.26 0.19 0.27 0.18 -0.21 -0.95 -0.49 -0.28 -0.27 -0.09 0.89 0.43 0.28 0.4 0.5 -0.16 -0.4 -0.14 -0.1 0.05 0.07 -0.15 -0.12 -0.17 -0.27 -0.44 0.04
0.03 0.01 -0.2 -0.23 -0.03 0.1 0.08 -0.04 -0.21 -0.3 -0.02 -0.11 0.13 0.43 0.27 0.24 0.25 -0.0 -0.05 -0.19 -0.02 -0.09 0.32 0.12 -0.03 -0.01 -0.1 -0.02 -0.19 -0.51
0.34 0.17 -0.3 -0.35 0.15 0.02 -0.34 -0.03 -0.36 -0.13 -0.66 -0.25 0.83 1.14 0.36 -0.27 -0.35 1.42 -0.92 -0.93 -0.43 -0.43 0.12 -0.58 -0.55 -0.5 -0.42 -0.1 0.14 -0.13
0.16 0.18 -0.28 -0.37 0.12 0.3 0.24 0.07 -0.3 -0.1 -0.2 -0.15 0.05 0.69 0.32 0.16 0.07 -0.14 -0.42 -0.47 -0.23 -0.13 0.32 0.04 -0.13 -0.15 -0.16 0.08 -0.11 -0.15
0.25 0.05 -0.13 -0.35 0.11 -0.23 -0.35 -0.56 -0.48 -0.31 -0.1 -0.37 0.02 1.43 -0.12 -0.13 -0.03 0.58 -0.36 -0.5 -0.24 -0.21 0.81 0.07 -0.33 -0.39 -0.39 0.18 -0.12 0.09
-0.15 -0.05 -0.38 -0.89 0.5 0.51 0.05 -0.09 -0.65 -0.24 -0.23 -0.42 0.18 1.48 0.67 0.34 0.36 0.78 -0.5 -0.5 -0.19 -0.46 -0.22 -0.31 -0.52 -0.16 -0.39 -0.63 -1.22 0.06
-0.27 -0.26 -0.38 -0.28 0.05 -0.07 -0.23 0.03 -0.4 -0.13 -0.17 -0.16 0.51 1.1 0.43 0.23 0.23 0.56 -0.28 -0.26 -0.17 -0.04 0.38 -0.22 -0.3 -0.3 -0.15 -0.5 -0.33 -0.05
-0.09 -0.24 -0.39 -0.5 -0.04 0.09 0.19 -0.03 -0.15 -0.4 -0.14 -0.16 0.23 1.15 0.35 0.03 0.03 0.32 -0.13 -0.13 -0.11 -0.19 0.69 -0.09 -0.07 -0.29 -0.25 -0.24 -0.35 -0.44
-0.02 -0.21 -0.31 -0.17 -0.19 -0.15 0.08 -0.05 -0.4 -0.21 -0.13 -0.17 0.33 0.44 0.18 0.1 0.21 0.59 -0.28 -0.23 -0.07 -0.23 0.63 -0.18 -0.15 -0.08 -0.01 -0.29 -0.09 0.32
-0.34 -0.22 -0.65 -1.05 0.09 0.16 -0.2 -0.48 -0.72 -0.18 -0.44 -0.43 0.65 1.28 0.41 0.29 0.23 0.59 -0.26 -0.48 0.01 0.01 0.5 0.0 -0.09 -0.01 -0.24 -0.28 -0.48 -0.08
-0.23 -0.64 -0.74 -0.67 0.01 -0.12 0.01 -0.71 -0.59 -0.5 -0.42 -0.19 0.34 1.8 0.01 -0.17 -0.3 0.41 -0.3 -0.23 -0.15 -0.34 1.74 -0.4 -0.31 -0.29 -0.48 -0.7 -0.55 -0.22
-0.22 -0.43 -0.66 -0.46 0.14 0.32 -0.02 0.08 -0.43 -0.47 -0.21 -0.03 0.09 1.39 0.35 0.11 0.08 0.49 -0.21 0.07 0.03 -0.16 0.41 0.07 -0.28 -0.33 -0.57 -0.2 -0.46 -0.43
0.19 0.08 -0.21 -0.44 -0.26 -0.01 -0.17 -0.35 -0.51 -0.28 -0.1 -0.2 0.25 0.77 0.08 -0.07 -0.09 0.97 -0.2 -0.28 -0.13 -0.26 0.42 -0.26 -0.23 -0.08 -0.04 -0.16 -0.18 0.48
-0.66 -0.31 -1.16 -0.89 0.57 0.85 0.19 0.22 -0.48 -0.85 -0.95 -0.75 0.19 1.09 0.85 0.51 0.64 1.03 -0.38 -0.24 0.13 0.11 0.55 -0.56 -0.9 -0.46 -0.47 -1.39 -1.01 -0.5
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0.07 0.05 -0.25 -0.39 -0.13 0.23 0.28 -0.1 -0.31 -0.37 -0.23 -0.16 -0.09 0.87 0.35 0.15 0.06 0.67 -0.17 -0.21 -0.16 -0.1 -0.09 -0.03 -0.21 -0.25 -0.31 -0.09 -0.0 0.05
-0.23 -0.21 -0.39 -0.65 -0.15 0.62 0.25 0.11 -0.43 -0.3 -0.34 -0.18 0.39 0.89 0.43 0.33 0.26 0.17 -0.59 -0.37 -0.24 -0.18 0.47 0.05 -0.2 -0.34 -0.32 -0.2 -0.22 0.12
0.16 0.08 -0.29 -0.33 0.19 0.19 0.1 0.01 -0.2 -0.2 -0.3 -0.48 -0.24 0.98 0.32 0.3 0.16 0.7 0.0 -0.16 -0.32 -0.35 -0.08 -0.11 -0.49 -0.21 -0.09 -0.46 -0.12 0.04
0.09 0.06 -0.47 -0.38 0.28 0.21 0.1 0.05 -0.3 -0.3 -0.33 -0.32 -0.09 1.09 0.35 0.05 0.04 0.34 -0.24 -0.27 0.04 -0.08 0.3 -0.16 -0.47 -0.11 -0.23 -0.06 -0.28 -0.04
-0.19 -0.28 -0.79 -1.22 -0.13 0.29 0.39 0.03 -0.35 -0.45 -0.18 -0.23 0.24 1.2 0.41 0.01 0.02 0.57 -0.14 -0.03 -0.36 -0.11 1.11 -0.21 -0.41 -0.21 -0.33 -0.53 -0.63 -0.19
-0.0 0.03 -0.38 -0.27 0.06 0.15 0.02 0.25 -0.28 -0.07 -0.31 -0.09 0.16 0.81 0.35 0.25 0.19 0.33 -0.46 -0.44 -0.25 -0.26 0.32 0.08 -0.1 -0.17 -0.12 -0.41 -0.03 -0.2
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0.09 0.22 -0.59 -0.8 -0.08 0.34 -0.28 -0.54 -0.66 0.25 -0.37 -0.2 0.49 0.22 -0.38 -0.01 -0.22 1.39 -0.2 -0.25 -0.08 -0.22 0.25 0.61 -0.27 -0.01 -0.26 -0.28 -0.15 -0.11
0.09 0.07 -0.36 -0.46 -0.45 0.04 0.12 0.03 -0.3 -0.12 -0.29 -0.11 0.0 1.09 0.27 -0.01 0.04 0.14 -0.28 -0.02 -0.12 -0.19 0.15 -0.03 -0.31 -0.08 -0.23 -0.21 0.17 0.38
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0.39 0.31 0.07 0.09 -0.17 0.04 0.03 0.48 -0.42 -0.42 -0.17 -0.27 -0.01 0.51 0.3 0.07 0.06 0.58 -0.74 -0.49 -0.32 0.02 0.21 -0.12 -0.48 -0.27 -0.21 0.05 -0.05 -0.09
-2.51 -1.8 -2.32 -2.85 -0.23 0.98 -1.09 -1.24 -1.76 -1.14 -1.43 -1.11 0.5 2.4 0.02 -0.41 -0.26 1.5 -0.67 -0.84 -0.58 -0.93 2.48 -0.87 -1.51 -0.9 -1.01 -1.44 -1.26 0.13
0.16 0.25 -0.11 -0.03 0.08 -0.02 0.01 0.42 -0.21 -0.1 -0.21 -0.17 0.04 0.68 -0.14 -0.35 -0.29 0.11 -0.39 -0.29 -0.23 -0.16 0.42 -0.12 0.06 -0.01 0.05 0.33 -0.15 -0.31
-0.06 -0.16 -0.26 -0.27 -0.16 0.11 0.06 0.02 -0.24 -0.27 -0.16 -0.18 0.08 0.85 0.42 0.21 0.22 0.09 -0.17 -0.12 -0.09 -0.12 0.47 0.0 -0.12 -0.12 -0.11 -0.22 -0.24 -0.2
-0.01 -0.08 -0.25 -0.2 -0.17 0.01 0.05 0.07 -0.3 -0.28 -0.14 -0.16 0.18 0.63 0.29 0.24 0.22 0.24 -0.08 -0.11 -0.04 -0.06 -0.06 -0.09 -0.04 -0.05 -0.06 -0.12 -0.16 0.12
-0.17 0.01 -0.32 -0.29 0.16 0.07 -0.01 0.28 -0.09 0.04 -0.19 -0.11 -0.06 0.63 0.23 0.23 0.12 0.58 -0.25 -0.45 -0.15 -0.13 0.02 0.1 -0.05 -0.08 -0.18 -0.28 -0.17 -0.14
-0.13 -0.04 -0.35 -0.39 0.14 0.23 0.04 0.17 -0.24 -0.16 -0.3 -0.12 0.22 1.06 0.39 0.32 0.34 0.51 -0.37 -0.27 -0.17 -0.35 -0.18 0.02 -0.18 -0.42 -0.32 -0.36 -0.18 -0.15
0.04 0.15 -0.37 -0.4 0.27 0.19 0.01 0.27 -0.22 0.05 -0.19 -0.0 -0.03 0.68 0.07 0.22 0.2 0.66 -0.34 -0.42 -0.22 -0.19 -0.23 -0.18 -0.24 -0.18 -0.11 -0.38 -0.07 0.11
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Spov3_chr4.02923 (AtSERGT1)
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-0.43 -0.31 -1.21 -0.76 -0.9 0.34 0.09 0.23 -1.21 -0.92 -0.73 -0.35 0.38 2.33 0.57 0.28 -0.07 0.47 -0.78 -0.64 -1.18 -0.63 0.75 0.24 -0.77 -0.8 -1.17 -0.63 -0.11 0.36
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-0.03 -0.04 -0.18 -0.25 0.1 0.15 0.05 0.04 -0.1 -0.16 -0.12 -0.04 -0.01 0.65 0.26 0.19 0.27 0.36 -0.11 -0.16 -0.03 -0.07 -0.2 -0.1 -0.27 -0.13 -0.09 -0.24 -0.19 0.03
0.13 0.14 0.02 -0.12 -0.17 -0.06 -0.03 0.22 -0.24 -0.2 -0.26 -0.23 0.13 0.62 0.4 0.1 0.11 0.76 -0.35 -0.25 -0.23 -0.15 0.21 -0.07 -0.29 -0.24 -0.24 -0.07 -0.19 -0.22
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.