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Heatmap: Cluster_101 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.47 0.1 -0.16 -0.39 0.79 0.06 0.18 0.13 0.21 0.31 0.08 -0.04 -0.49 0.7 -0.08 -0.07 -0.24 -1.1 -0.25 -0.27 0.08 -0.12 -1.59 -0.0 -0.16 0.03 0.17 0.2 0.05 -0.46
0.3 0.13 -0.08 -0.09 0.97 0.19 -0.05 -0.48 0.06 0.38 -0.14 -0.33 -0.89 1.14 -0.69 -0.32 -0.16 0.03 -0.07 -0.43 -0.06 -0.3 -0.52 -0.1 0.02 -0.06 -0.22 0.73 0.02 -1.79
0.1 0.12 0.12 0.02 0.14 -0.04 -0.02 0.03 0.11 0.13 -0.0 0.11 -0.22 0.35 -0.02 -0.02 -0.09 -0.29 -0.2 -0.14 -0.07 -0.09 -0.13 0.02 -0.09 -0.07 -0.04 0.15 0.19 -0.26
0.2 0.17 0.1 -0.16 0.1 0.22 0.18 0.07 0.11 0.04 -0.14 0.0 -0.4 0.46 0.13 0.11 -0.05 -0.6 -0.29 -0.37 -0.22 -0.11 -0.47 0.17 -0.12 -0.13 -0.24 0.25 0.28 0.11
0.28 0.42 0.03 -0.3 0.24 0.05 0.15 -0.26 -0.09 0.15 -0.13 -0.08 -0.31 0.58 -0.11 -0.11 -0.09 -0.82 -0.07 -0.21 -0.08 -0.08 -0.58 0.04 -0.03 0.03 -0.06 0.24 0.25 0.2
0.27 0.19 -0.11 -0.44 0.59 0.14 -0.05 -0.71 0.22 0.36 -0.09 -0.01 -0.56 0.68 -0.28 -0.12 -0.29 -0.04 -0.17 -0.42 -0.02 -0.21 0.2 -0.02 -0.17 0.01 -0.03 0.15 0.32 -0.41
0.86 -0.36 0.07 -0.11 -2.65 0.37 0.07 0.94 -0.19 -3.79 0.55 0.08 0.67 -2.07 0.03 0.61 -0.36 0.05 -1.84 -0.4 -0.62 -0.43 0.44 0.38 0.31 -0.63 0.49 -0.59 0.36 0.06
0.04 -0.18 0.03 -0.14 -0.01 0.67 0.49 -0.19 0.07 -0.22 0.07 0.17 -0.22 0.66 0.14 -0.06 -0.09 -0.17 -0.19 0.14 -0.36 -0.01 -0.43 0.13 -0.44 -0.46 -0.63 -0.03 0.07 0.21
0.2 0.27 -0.01 -0.23 0.26 0.19 -0.04 -0.21 0.05 0.14 -0.03 0.04 -0.32 0.6 -0.11 -0.07 -0.18 -0.0 -0.24 -0.15 -0.13 -0.02 -0.26 0.14 -0.11 -0.05 -0.03 0.13 0.13 -0.39
0.32 0.15 -0.06 -0.51 0.45 0.38 0.04 -0.84 -0.0 0.11 -0.08 0.03 -0.27 0.63 0.27 0.13 0.08 -0.73 -0.3 -0.35 -0.08 -0.21 -0.41 0.26 0.03 -0.1 -0.1 0.18 0.15 -0.25
-0.01 0.09 -0.17 -0.2 0.32 0.03 -0.01 -0.09 0.05 0.09 -0.09 -0.13 -0.14 0.62 0.05 0.04 0.07 0.25 -0.03 -0.15 0.03 -0.03 -0.24 -0.04 -0.09 0.04 -0.01 -0.08 -0.25 -0.25
0.21 -0.14 -0.04 0.2 0.21 0.0 -0.03 0.14 0.14 0.04 0.03 0.0 -0.04 0.04 0.11 -0.08 0.06 -0.07 -0.31 -0.28 -0.18 -0.15 -0.09 -0.17 -0.02 -0.09 0.09 0.25 0.08 -0.12
0.43 0.22 0.04 -0.01 0.24 -0.06 -0.0 -0.12 -0.02 0.1 -0.11 -0.04 -0.14 0.18 -0.12 -0.08 -0.12 -0.63 -0.03 -0.25 -0.03 -0.11 -0.17 0.04 -0.09 -0.07 0.0 0.18 0.23 0.16
-0.4 0.01 0.56 0.46 0.65 0.24 0.33 1.15 -0.16 -0.83 -0.26 -0.38 -0.24 -0.2 -0.4 0.38 0.32 -0.39 -0.11 -1.1 -0.04 -0.58 -0.29 -0.47 -0.33 -0.83 0.15 0.21 0.04 0.13
0.5 0.46 0.02 0.53 0.3 0.15 0.25 0.6 0.15 0.01 -0.49 0.09 -0.74 0.05 0.17 0.19 -0.52 -0.67 -0.61 -0.99 -0.83 -0.88 -0.53 -1.03 -0.13 -0.53 0.21 0.7 0.8 -0.0
-0.2 -0.4 -1.78 1.66 -0.91 -0.99 0.65 -0.36 0.59 1.48 -0.55 0.07 -1.26 -0.23 -0.74 - -2.29 -0.76 0.55 0.53 -0.89 -1.7 -0.77 -1.4 0.33 -0.16 -0.14 1.16 -0.07 0.92
-0.13 1.23 0.43 2.16 - - -0.63 -0.9 -1.45 0.26 0.14 -0.8 -1.71 1.15 -0.04 - 0.62 -2.27 -0.21 -2.2 - - - -1.23 0.32 -0.32 -0.81 0.8 1.98 0.52
0.34 0.49 0.23 -0.17 0.35 -0.15 -0.09 0.14 0.36 0.58 -0.14 0.21 -0.94 0.12 -0.61 -0.61 -0.65 -0.77 -0.09 -0.14 -0.03 -0.03 -0.66 0.0 -0.26 0.04 -0.04 0.58 0.55 -0.26
0.04 0.17 -0.13 -0.46 0.31 0.01 0.07 -0.27 -0.11 -0.06 -0.01 0.02 -0.08 0.58 0.08 0.09 0.03 -0.26 -0.06 -0.06 0.03 0.09 -0.1 0.08 -0.08 0.02 -0.03 0.12 -0.1 -0.32
0.41 0.05 -0.46 0.2 0.1 0.12 0.45 0.59 0.57 0.22 -0.06 0.09 -0.23 -0.4 0.16 -0.04 0.12 0.06 -0.77 -0.79 -0.09 -1.02 -1.01 -0.29 0.14 -0.15 -0.3 0.19 0.34 0.14
0.12 0.34 0.04 -0.26 0.63 -0.02 -0.52 -0.35 -0.05 0.26 -0.35 -0.18 -0.71 1.05 -0.23 0.14 0.11 0.1 -0.34 -0.4 -0.03 -0.16 -0.93 0.05 -0.25 -0.11 -0.29 0.14 0.26 0.35
- - - 2.75 - - - - 1.95 - 1.85 - - - - - - - - - - 1.48 - - - 1.53 - - 2.77 1.72
-0.25 -0.18 -0.11 -0.09 -0.03 0.13 0.0 0.2 0.35 -0.02 -0.08 0.08 -0.32 0.68 0.38 0.07 0.18 -0.21 -0.1 -0.18 -0.18 -0.11 -0.09 0.06 -0.15 -0.06 -0.12 0.02 -0.0 -0.37
-0.81 -0.46 -0.54 -0.34 0.39 0.29 -0.05 -0.01 0.36 0.54 0.18 0.17 -0.19 0.73 -0.04 0.34 0.12 -0.76 0.1 -0.03 0.16 -0.09 -0.92 -0.03 -0.06 0.18 0.03 -0.12 -0.18 -0.36
-0.03 0.04 -0.14 -0.48 0.53 0.4 0.1 -0.16 -0.09 -0.13 -0.1 0.0 -0.17 0.86 0.2 0.18 0.2 -0.94 -0.19 -0.13 0.05 -0.02 -0.35 0.05 -0.17 0.03 -0.08 -0.1 -0.11 -0.24
0.46 0.52 0.53 0.47 0.49 -0.86 -0.97 0.14 0.33 0.32 -0.27 -0.15 -1.6 1.87 -0.54 -0.83 -0.79 -2.3 -0.73 -0.92 -0.49 -0.84 -0.73 -0.44 -0.52 -0.38 -0.41 0.79 0.97 -0.16
-0.05 0.0 0.07 -0.25 0.45 0.1 -0.14 -0.12 -0.04 0.02 -0.04 -0.01 -0.3 0.7 0.05 0.09 0.16 -0.43 0.08 0.06 0.08 0.11 -0.71 -0.01 -0.07 0.04 -0.03 -0.01 -0.14 -0.26
-0.26 0.29 0.1 0.61 0.49 -0.54 -0.5 -0.92 0.34 0.42 -1.89 -0.31 0.32 0.0 0.95 -0.58 -0.74 0.1 0.32 0.82 0.38 - 1.37 -0.78 - -0.94 -2.2 -0.85 -0.21 1.13
0.74 0.78 0.51 0.88 -0.28 0.5 -0.53 -0.1 -0.64 -0.64 -2.22 -0.58 0.4 1.36 -0.06 0.26 -1.88 0.62 -0.02 -1.05 -0.64 -2.99 0.2 -2.09 -2.4 -1.24 -0.35 -0.59 0.68 1.12
-0.57 0.68 0.57 0.83 0.62 0.16 -0.31 0.47 0.15 0.58 -0.66 0.33 0.15 -0.9 -1.22 -0.27 -0.72 -0.03 -0.49 -0.34 -0.2 -1.25 0.34 -0.37 -1.31 -0.24 -0.06 -0.4 0.33 0.67
-0.17 1.03 0.39 0.5 0.07 0.3 0.78 0.58 0.91 1.36 -1.65 0.75 -1.57 -1.26 -0.88 0.03 - -0.16 0.08 -0.85 -2.78 -1.43 0.53 -0.87 - 0.37 0.54 0.12 -1.36 -0.2
0.06 0.15 0.15 0.11 0.23 -0.43 -0.4 0.25 -0.3 -0.21 -0.53 -0.46 0.42 0.13 -0.79 -0.12 -0.22 0.14 -0.03 -0.2 -0.13 -0.34 0.19 0.06 -0.21 -0.0 0.16 0.33 0.42 0.59
0.43 0.33 -0.06 -0.35 0.44 0.23 -0.0 -0.83 -0.01 0.12 -0.05 -0.06 -0.39 0.65 0.02 0.0 -0.22 -0.02 -0.18 -0.53 -0.05 -0.19 -0.32 0.08 -0.17 0.01 -0.09 0.22 0.18 -0.05
Spov3_chr1.00780 (CYP86C4)
 0.65 0.22 0.08 -0.28 0.39 0.82 0.45 -0.54 0.04 -0.04 -0.32 -0.22 -1.04 0.82 -0.01 0.22 -0.55 -0.34 -0.15 -0.19 -0.46 -0.09 0.01 -0.52 -0.81 -0.58 -0.68 -0.2 0.26 0.7
0.54 0.38 0.22 -0.04 0.84 -0.16 -0.74 -1.21 0.64 0.27 -0.06 0.11 -1.66 0.52 0.23 0.02 0.09 -1.49 -0.52 -0.48 0.14 -0.23 0.31 0.18 -0.54 0.01 -0.28 0.39 0.05 -0.69
0.17 0.25 0.23 0.5 0.17 0.06 -0.14 -0.28 0.45 0.15 -0.01 0.08 -0.63 0.02 -0.18 -0.05 -0.1 -0.47 -0.18 -0.38 -0.13 -0.26 -0.01 0.01 -0.13 -0.01 0.01 0.24 0.37 -0.48
0.14 0.28 -0.12 -0.17 0.75 0.26 0.06 -0.01 0.43 0.33 -0.27 -0.3 -1.18 0.52 0.11 0.21 -0.23 -1.11 -0.26 -0.48 -0.15 -0.09 -1.41 -0.02 0.1 -0.17 -0.54 0.39 0.56 0.13
0.18 0.32 -0.04 0.14 0.21 -0.1 -0.27 -0.11 0.17 0.1 0.09 0.1 -0.33 0.17 -0.03 -0.07 -0.08 -0.1 -0.15 -0.09 0.11 -0.33 -0.61 0.21 -0.09 0.03 0.21 0.1 0.2 -0.35
0.07 0.23 -0.11 -0.59 0.19 0.31 0.23 -0.25 -0.13 -0.08 -0.42 -0.32 -0.93 1.47 -0.09 0.23 -0.47 0.25 -0.09 -0.34 -0.24 -0.08 -1.04 -0.47 -0.46 -0.11 -0.13 -0.19 0.11 0.87
0.09 0.19 -0.28 -0.23 0.35 -0.03 -0.18 -0.21 -0.13 0.15 -0.17 -0.03 -0.17 0.86 0.03 -0.05 -0.03 0.07 -0.14 -0.28 0.03 -0.02 -0.31 0.18 -0.1 -0.01 -0.02 -0.04 0.02 -0.13
-0.23 -0.4 -0.44 -0.93 1.14 0.51 0.23 0.18 0.44 0.26 0.22 0.22 -0.56 0.72 -0.25 0.17 -0.4 -0.66 -0.38 -0.06 0.24 0.02 -2.07 -0.01 -0.33 -0.07 -0.02 0.24 -0.13 -0.65
-0.13 0.09 -0.27 -0.5 0.68 0.64 0.12 -0.36 -0.06 0.08 -0.2 0.1 -0.39 0.92 0.31 0.2 0.04 -0.42 -0.32 -0.21 0.01 -0.26 -0.68 -0.04 -0.4 0.01 -0.1 -0.05 0.09 -0.22
0.05 -0.25 -0.78 0.64 -0.35 -0.61 -0.31 -0.32 0.13 0.17 0.28 -0.94 -0.5 0.19 0.16 -0.3 0.38 -0.3 0.26 0.04 0.53 -0.17 -0.36 -0.16 0.66 0.17 0.31 0.37 0.18 -1.03
0.61 0.21 0.16 0.52 -0.11 0.18 0.0 0.51 0.02 -0.41 -0.43 -0.35 -0.02 0.38 0.64 0.51 -0.02 0.07 -0.81 -0.86 -0.53 -0.69 -0.37 -0.21 -0.43 -0.25 -0.2 -0.11 0.11 0.19
0.32 -0.5 -0.36 0.16 0.56 0.19 0.48 0.84 -0.12 -0.36 -0.2 -0.06 -0.65 0.41 0.4 0.1 -0.41 0.22 -0.61 -0.71 0.19 -0.62 -0.39 -0.1 -0.3 -0.63 -0.07 0.25 0.04 0.2
0.23 0.21 0.04 -0.01 0.31 0.01 -0.04 -0.23 0.11 0.13 -0.08 -0.07 -0.39 0.61 -0.06 -0.14 -0.1 -0.16 -0.16 -0.23 -0.13 -0.07 -0.2 -0.01 -0.08 -0.03 -0.03 0.21 0.24 -0.31
-0.63 -0.67 -0.42 -0.75 0.31 0.48 0.01 0.03 0.58 0.5 0.08 0.19 -0.54 0.92 0.34 0.22 0.1 -2.32 -0.17 -0.16 0.0 0.04 -0.98 0.1 -0.1 -0.17 -0.46 0.25 0.41 -0.22
0.46 0.38 0.21 -0.41 0.43 0.29 0.18 -0.32 0.06 0.24 -0.2 -0.13 -0.2 -0.09 0.17 0.22 -0.03 -0.7 -0.27 -0.18 -0.01 -0.18 -0.15 -0.23 -0.24 -0.14 -0.24 0.14 0.19 0.03
-0.2 -0.26 0.34 0.42 0.6 0.26 -0.42 -0.16 0.45 0.04 -0.19 -0.14 -1.04 0.2 0.5 0.27 0.56 -0.92 -0.01 -0.26 0.17 -0.2 -0.21 -0.19 -0.41 -0.23 -0.29 -0.1 -0.07 0.07
-0.06 0.22 -0.36 -0.61 0.56 0.32 0.03 -0.13 0.35 0.51 -0.09 0.1 -0.39 0.91 0.01 0.07 -0.13 -1.03 -0.34 -0.12 0.03 -0.21 -0.99 -0.0 -0.35 -0.17 -0.54 0.32 0.5 -0.2
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0.32 0.17 -0.18 -0.28 0.46 0.14 0.0 -0.26 -0.04 0.11 -0.05 0.03 -0.07 0.51 -0.01 -0.11 -0.09 -0.42 -0.17 -0.28 -0.2 -0.2 -0.29 0.11 -0.01 -0.01 0.03 0.17 0.05 0.07
0.2 0.26 -0.03 0.07 0.26 -0.22 -0.14 -0.18 -0.03 0.1 -0.17 -0.01 -0.12 0.42 -0.1 -0.12 -0.19 0.11 -0.08 -0.23 0.01 -0.01 -0.31 0.09 -0.09 0.09 -0.0 0.21 0.13 -0.28
0.56 0.61 0.21 -0.27 0.19 0.2 0.15 -0.23 0.27 0.39 -0.11 -0.27 -0.57 -0.06 -0.17 -0.05 -0.08 -0.9 -0.14 -0.15 0.13 -0.07 -1.25 -0.24 -0.1 0.1 0.16 0.3 0.11 -0.05
0.09 0.19 -0.08 -0.36 0.38 0.15 0.15 -0.23 0.05 0.16 0.01 0.05 -0.23 0.35 0.06 0.03 -0.05 -0.09 -0.1 -0.09 -0.15 -0.02 -0.47 -0.01 -0.11 -0.05 -0.13 0.08 0.06 0.05
1.31 0.5 0.0 -1.18 0.3 0.26 0.0 1.07 0.67 0.02 -0.69 -0.55 -0.34 -1.15 -0.97 -1.16 -0.89 1.53 -0.98 -2.62 - 0.75 - -0.63 -1.17 0.24 -0.13 0.33 1.26 -1.33
0.2 0.21 -0.19 -0.42 0.7 0.31 0.09 -0.5 -0.04 0.05 -0.09 0.08 -0.18 0.57 0.07 -0.13 -0.12 -0.34 -0.21 -0.21 -0.07 -0.17 -0.3 -0.1 -0.22 -0.25 -0.28 0.11 0.27 0.33
-0.13 -0.32 - - -0.34 2.08 1.63 1.7 - - - - - - - 1.0 -0.32 -0.65 0.5 - 1.21 0.52 - - -0.59 - 1.05 0.97 1.86 -
0.49 0.2 0.02 -0.15 -0.06 -0.05 0.14 -0.3 0.13 0.12 -0.03 0.12 -0.69 -0.05 0.0 -0.06 0.01 -0.54 -0.11 -0.27 -0.06 0.04 -0.19 0.19 0.09 0.11 0.01 0.31 0.18 -0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.