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Heatmap: Cluster_129 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.28 0.2 0.08 -0.06 0.37 0.16 0.21 -0.09 0.04 -0.03 -0.03 0.07 -0.02 -0.07 0.04 0.1 0.02 -0.86 -0.15 -0.23 -0.1 -0.09 -0.44 -0.17 -0.19 -0.07 -0.08 0.09 0.22 0.3
0.08 0.13 0.15 0.21 -0.17 -0.02 -0.07 0.27 -0.01 -0.15 0.05 0.01 -0.05 -0.09 0.05 0.25 0.13 -0.36 -0.31 -0.24 -0.03 -0.06 -0.48 -0.06 -0.02 0.05 0.08 0.09 0.09 0.16
0.0 0.05 -0.04 -0.06 0.3 -0.13 -0.07 0.02 -0.04 0.16 -0.08 -0.12 0.07 -0.18 0.2 0.13 0.19 -0.21 -0.18 -0.25 0.01 0.04 -0.07 -0.17 -0.05 -0.02 0.18 -0.09 0.03 0.16
0.13 0.12 -0.17 -0.71 0.48 0.2 0.21 -0.22 0.12 0.21 0.12 0.24 -0.03 0.22 -0.08 -0.1 -0.14 -1.58 0.01 -0.01 -0.01 0.03 -1.1 0.08 -0.03 0.11 0.06 0.2 0.3 -0.05
0.05 0.09 -0.01 -0.12 0.38 0.02 0.03 0.06 0.28 0.15 0.03 0.07 -0.12 -0.15 -0.05 0.06 0.1 -0.77 -0.13 -0.22 -0.11 -0.15 -0.71 0.09 -0.12 0.01 -0.02 0.16 0.38 0.14
0.16 0.12 -0.03 -0.23 0.35 0.06 0.22 0.04 0.11 0.27 0.1 0.17 -0.05 0.15 -0.05 -0.11 -0.13 -0.62 -0.18 -0.03 -0.11 -0.06 -0.41 0.16 0.02 -0.06 -0.04 0.19 0.03 -0.49
-0.29 -0.32 -0.21 -0.1 0.45 0.37 0.01 0.15 0.18 0.35 0.1 0.22 -0.18 -0.28 0.06 0.2 0.24 -0.96 -0.14 -0.21 -0.07 -0.28 -0.45 -0.1 -0.07 0.05 0.08 0.27 0.19 -0.07
0.56 0.29 0.02 -0.35 0.48 -0.02 0.06 -0.54 0.09 0.16 0.02 0.1 -0.32 -0.56 -0.43 -0.12 -0.12 -0.74 -0.31 -0.4 -0.27 -0.2 0.14 0.06 0.21 0.17 0.08 0.38 0.53 -0.03
-0.03 -0.11 -0.1 -0.13 0.47 0.16 0.07 0.11 0.26 0.27 0.18 0.12 -0.11 0.09 -0.16 -0.06 -0.08 -0.66 -0.03 -0.02 -0.13 -0.07 -0.45 0.02 -0.02 -0.04 -0.02 0.24 0.17 -0.47
-0.0 0.02 0.14 -0.28 0.31 0.24 0.08 -0.35 -0.05 -0.04 -0.07 0.09 -0.62 0.47 0.01 0.16 0.42 -0.54 -0.04 0.12 -0.12 -0.19 -1.43 -0.05 0.06 0.05 -0.0 0.08 0.05 0.37
0.02 -0.12 0.04 -0.15 0.47 0.33 0.13 -0.21 -0.39 -0.22 -0.04 -0.08 -0.07 0.28 0.07 0.25 0.2 -0.46 -0.44 -0.1 -0.01 0.1 -0.17 -0.06 -0.24 -0.07 -0.0 0.24 0.04 0.16
0.13 0.15 0.09 0.12 0.09 -0.06 -0.04 0.02 -0.06 -0.03 0.08 -0.01 -0.16 -0.37 -0.08 0.05 0.04 -0.44 -0.13 -0.18 -0.07 -0.05 -0.41 0.16 0.12 0.06 -0.0 0.11 0.32 0.24
-0.11 0.21 0.08 -0.21 0.15 0.25 0.07 -0.27 0.63 0.35 0.04 -0.06 -0.04 -1.29 0.02 0.12 0.2 -1.46 -0.94 -0.22 -0.21 0.03 -0.73 0.15 -0.12 -0.1 -0.03 0.33 0.6 0.51
-0.19 0.14 -0.18 -0.33 0.37 0.31 0.25 -0.09 0.2 0.22 0.04 -0.02 0.06 -1.1 0.32 0.16 0.23 -1.71 -0.21 -0.39 -0.2 0.01 -0.5 0.3 0.06 0.04 -0.18 0.19 0.5 0.08
0.12 0.1 0.05 0.18 0.28 -0.14 -0.28 -0.25 0.05 0.12 -0.03 -0.01 0.02 0.27 0.15 0.03 0.02 -0.01 -0.16 -0.25 -0.05 -0.14 -0.25 -0.08 -0.11 -0.0 0.05 0.2 0.02 -0.12
0.07 -0.04 -0.19 -0.49 0.45 0.07 0.07 -0.43 0.14 0.14 -0.12 0.09 -0.7 -0.26 -0.07 -0.21 -0.09 -0.6 0.14 -0.04 0.26 0.16 -1.08 0.03 0.03 0.2 0.15 0.28 0.31 0.59
-0.11 0.06 -0.0 0.08 -0.07 -0.28 -0.29 -0.1 0.12 0.06 0.12 0.1 0.12 -0.23 0.22 0.23 0.32 -0.38 -0.24 -0.22 -0.06 0.03 -0.26 0.07 0.16 0.13 0.17 0.0 -0.06 -0.0
0.08 -0.04 -0.16 -0.21 0.05 -0.15 -0.09 -0.11 -0.02 0.03 -0.0 -0.04 -0.01 0.34 0.04 0.13 0.18 0.03 -0.07 -0.07 -0.03 0.03 -0.15 0.11 0.09 0.06 0.08 0.02 -0.1 -0.17
-0.11 0.11 0.01 -0.23 0.7 -0.21 -0.27 0.2 0.41 0.66 0.26 0.24 -0.48 0.33 -0.56 -0.33 -0.13 -0.41 -0.1 -0.29 0.02 -0.13 -1.02 -0.04 0.04 -0.0 0.03 0.39 0.27 -0.85
0.16 0.19 0.08 0.19 0.25 -0.02 -0.14 -0.05 0.08 0.11 -0.1 -0.03 -0.33 -0.19 -0.15 -0.16 -0.07 -0.17 -0.04 -0.08 0.03 -0.05 -0.2 -0.15 0.02 0.03 0.22 0.03 0.19 0.14
0.02 0.3 0.08 0.1 0.06 0.1 0.13 0.18 -0.04 0.3 -0.08 -0.23 0.23 0.07 0.04 0.07 0.07 -0.03 -0.34 -0.29 -0.34 -0.12 -0.43 -0.01 -0.44 -0.03 0.03 -0.14 0.03 0.31
0.01 0.1 -0.25 -0.71 0.44 -0.11 -0.06 0.09 -0.15 -0.12 -0.08 -0.27 0.15 0.56 0.05 0.09 0.0 -0.33 -0.19 -0.19 -0.06 -0.19 -0.3 -0.07 0.0 0.16 0.04 0.16 0.29 0.3
0.08 0.06 0.09 -0.12 0.19 -0.15 -0.14 -0.04 0.29 0.13 -0.06 -0.21 -0.13 0.19 0.13 0.17 0.11 0.11 -0.17 -0.33 0.05 -0.08 0.02 -0.28 -0.04 -0.03 0.02 -0.1 -0.0 0.03
0.23 0.13 -0.03 -0.17 0.25 -0.08 -0.03 -0.1 0.09 0.11 -0.01 0.01 -0.08 0.23 -0.1 -0.11 -0.11 -0.14 -0.16 -0.1 -0.11 -0.04 -0.33 -0.03 -0.02 0.02 0.03 0.04 0.32 0.05
0.33 0.18 0.07 -0.11 -0.07 -0.19 -0.02 0.13 0.03 -0.0 0.19 0.21 0.02 0.21 0.01 -0.09 0.01 -0.54 -0.07 0.01 -0.03 0.05 -0.54 -0.11 0.08 0.06 0.13 -0.05 -0.1 -0.14
0.07 0.02 0.17 0.16 0.29 -0.06 -0.04 -0.05 0.15 0.09 0.07 -0.05 -0.18 -0.33 0.06 0.14 0.26 -0.62 -0.01 -0.1 -0.05 -0.06 -0.11 -0.17 0.02 0.08 0.04 0.05 0.1 -0.25
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 0.48 0.6 0.46 0.34 -0.44 -0.55 -0.24 0.03 0.3 0.53 0.12 -0.23 -0.09 -0.96 -0.39 -0.08 -0.23 -0.66 -0.03 -0.25 -0.11 -0.17 -0.96 -0.36 -0.03 -0.13 0.11 0.3 0.33 0.57
0.16 0.15 0.04 0.02 0.32 0.06 0.23 0.17 0.12 0.11 -0.01 0.12 -0.13 -0.07 0.01 0.07 0.25 -0.05 -0.14 -0.04 -0.11 -0.05 -1.05 -0.4 -0.25 0.06 0.09 -0.06 -0.01 -0.13
0.17 0.19 0.18 -0.07 1.41 0.23 -0.02 -0.56 0.63 0.52 -0.08 0.03 -0.73 0.28 -0.34 -0.5 -0.47 -2.1 -0.22 -0.33 -0.27 -0.24 -0.8 -0.3 -0.4 -0.25 -0.39 0.36 0.72 -0.12
0.19 0.12 0.08 -0.1 0.22 -0.07 -0.07 -0.21 0.19 0.36 0.05 0.14 -0.29 0.15 -0.19 -0.2 -0.19 -0.38 -0.13 -0.08 0.12 -0.04 -0.8 -0.05 -0.1 0.11 0.08 0.19 0.35 0.03
Spov3_chr5.01986 (AtOR-like)
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0.03 0.19 0.2 0.18 0.25 -0.04 0.03 0.12 0.11 -0.02 -0.09 -0.17 -0.23 -0.09 -0.05 0.28 0.11 0.08 -0.2 -0.25 0.02 -0.1 -0.15 -0.22 -0.17 -0.03 -0.03 -0.12 0.08 0.06
0.21 0.14 -0.12 -0.3 0.34 0.25 0.22 0.17 0.19 0.15 0.04 0.05 -0.36 0.33 -0.23 -0.19 -0.23 -0.6 0.06 -0.02 -0.06 -0.06 -0.56 0.1 -0.02 -0.03 -0.05 0.17 0.11 -0.23
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-0.08 -0.03 -0.1 -0.03 0.08 -0.08 0.1 0.26 0.13 0.13 -0.03 0.04 -0.26 0.28 -0.15 0.1 0.08 -0.0 -0.28 -0.13 -0.13 -0.08 0.09 0.06 0.09 0.08 0.01 0.1 -0.09 -0.33
-0.13 -0.02 -0.08 -0.11 0.11 -0.04 -0.01 0.27 -0.06 0.14 0.03 0.01 0.01 0.14 -0.02 0.15 0.16 -0.22 -0.0 -0.04 -0.16 -0.09 -0.03 0.06 0.01 -0.02 0.07 -0.01 -0.06 -0.18
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0.14 0.19 0.1 0.09 0.24 -0.04 0.07 0.07 0.09 0.18 0.1 -0.03 -0.36 -0.07 -0.27 -0.2 -0.24 -0.08 -0.17 -0.11 -0.05 0.0 -0.31 -0.04 0.07 0.05 0.04 0.18 0.16 -0.04
0.03 0.04 -0.07 0.03 0.04 -0.2 -0.24 -0.07 0.11 0.14 0.06 0.03 -0.02 0.16 -0.11 -0.06 0.04 -0.08 -0.06 -0.17 0.05 0.02 -0.16 -0.12 0.09 0.11 0.18 0.09 0.04 -0.01
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0.22 -0.01 -0.29 -0.65 0.89 0.53 0.39 -0.26 0.33 0.19 0.05 0.19 0.04 0.3 -0.15 -0.26 -0.42 -0.93 0.06 -0.0 -0.28 -0.08 -1.23 -0.06 -0.33 -0.29 -0.31 0.15 0.54 -0.12
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Spov3_S05.00014 (PDH-E1 BETA)
 0.11 0.11 0.07 0.01 0.05 -0.2 0.06 0.2 0.05 0.1 0.09 0.11 0.0 -0.2 -0.02 -0.12 0.02 -0.43 0.01 -0.04 -0.01 -0.03 -0.31 -0.07 0.07 0.01 0.07 0.15 0.09 -0.14
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.