Heatmap: Cluster_115 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00250 (THH1)	-0.13	-0.4	-0.69	-0.73	-0.23	0.54	0.47	0.15	-0.45	-0.4	-0.2	-0.21	0.3	0.63	0.56	0.45	0.21	0.23	-0.27	-0.08	-0.19	-0.19	0.5	0.09	-0.13	-0.1	-0.26	-0.43	-0.33	-0.16
Spov3_C0003.00089	-2.15	-0.35	-0.94	-0.82	0.01	0.14	0.18	-0.24	-1.14	-0.05	-0.77	-1.6	1.42	0.78	-0.03	0.06	0.12	1.87	-0.86	-0.83	-0.31	-0.23	0.87	-0.4	-0.91	-0.1	0.11	-1.29	-0.61	0.43
Spov3_C0004.00051	-0.1	-0.24	-0.02	-0.09	-0.26	-0.12	0.05	0.11	-0.07	-0.27	-0.09	0.01	0.05	-0.16	0.25	0.17	0.24	0.84	-0.06	0.03	-0.07	-0.01	-0.02	-0.49	-0.15	0.04	0.05	-0.31	-0.2	0.28
Spov3_C0006.00069	-0.57	-0.38	-0.5	-0.49	0.07	-0.04	0.09	0.42	-0.31	-0.12	0.02	0.09	0.48	0.1	0.41	0.28	0.34	0.16	-0.16	-0.13	0.04	-0.03	0.61	0.06	0.09	-0.01	-0.1	-0.7	-0.51	-0.27
Spov3_C0008.00058	-0.28	-0.38	-0.33	-0.21	-0.23	0.08	0.29	0.41	-0.43	-0.48	-0.09	-0.22	0.4	-0.19	0.54	0.34	0.4	0.81	-0.06	0.01	-0.1	0.06	-0.09	-0.18	-0.03	-0.12	0.04	-0.39	-0.62	-0.11
Spov3_C0010.00004 (PAM18-1)	-0.28	-0.25	-0.3	-0.37	-0.12	-0.05	0.13	0.1	0.01	-0.11	0.03	0.18	0.44	0.37	-0.01	0.14	0.17	0.13	-0.16	0.03	0.01	0.08	0.51	-0.21	-0.19	-0.07	0.03	-0.44	-0.41	0.04
Spov3_C0024.00003	-0.27	-0.29	-0.16	-0.03	-0.06	-0.19	-0.12	0.01	0.06	0.03	0.04	0.09	0.31	0.36	0.12	0.13	0.25	0.07	-0.2	-0.08	-0.02	-0.02	0.27	-0.09	-0.08	-0.09	-0.03	-0.23	-0.12	0.07
Spov3_C0033.00022 (LPPepsilon1)	-0.3	-0.51	-0.65	-0.82	-0.79	0.29	0.35	0.41	-0.34	-0.51	-0.3	-0.12	0.49	0.85	0.83	0.56	0.5	0.14	-0.09	0.11	-0.07	0.13	0.25	-0.02	-0.28	-0.12	-0.25	-1.05	-0.85	-0.28
Spov3_C0033.00033 (NFL)	-0.33	-0.45	-0.75	-0.69	-0.21	-0.43	-0.28	-0.32	-0.5	-0.45	0.02	-0.45	1.13	0.2	0.16	0.16	0.47	1.01	-0.17	-0.24	-0.21	-0.1	0.67	0.01	-0.06	0.28	0.25	-0.39	-0.71	-0.02
Spov3_C0048.00008 (FER)	-0.19	-0.37	-0.34	-0.02	-0.28	-0.18	-0.24	-0.09	0.01	-0.01	0.05	-0.02	0.48	0.56	0.27	0.08	0.33	0.36	-0.2	-0.17	0.09	-0.12	0.12	-0.11	-0.06	-0.07	0.02	-0.08	-0.4	-0.0
Spov3_chr1.00124 (NF-YA9)	0.08	0.08	-0.45	-0.69	-0.15	0.37	0.01	-0.74	-0.57	-0.41	-0.38	-0.42	0.24	0.64	0.57	0.43	0.3	0.73	-0.1	-0.17	0.0	0.14	0.19	0.04	-0.2	-0.12	-0.16	-0.25	-0.48	-0.01
Spov3_chr1.00253 (RUB1)	-0.24	-0.41	-0.27	-0.14	-0.15	0.01	0.1	0.3	-0.36	-0.46	-0.13	-0.21	0.29	0.51	0.27	0.22	0.15	0.39	0.04	-0.01	0.0	-0.01	0.03	0.02	-0.01	-0.02	-0.07	-0.25	-0.21	0.07
Spov3_chr1.00432 (HSL1)	-0.15	-0.26	-0.39	-0.47	-0.13	-0.22	-0.41	-0.39	-0.26	-0.23	-0.11	0.01	0.49	0.86	0.3	0.16	0.31	0.19	-0.12	-0.03	0.29	0.08	0.36	0.11	0.11	0.03	0.1	-0.25	-0.48	-0.63
Spov3_chr1.00591 (NAP9)	-0.57	-0.45	-0.59	-0.63	-0.2	-0.01	0.15	0.55	-0.6	-0.46	-0.25	-0.37	0.58	0.49	0.33	0.06	0.05	1.35	-0.06	-0.08	-0.18	-0.1	0.44	0.13	-0.09	-0.15	-0.1	-0.29	-0.59	-0.58
Spov3_chr1.00901 (PPP1)	0.07	0.12	-0.38	-0.67	-0.99	0.17	0.19	0.26	-0.17	-0.11	-0.18	-0.03	-0.02	1.25	0.42	0.36	0.23	-0.17	-0.25	-0.25	-0.03	-0.07	-0.33	-0.02	-0.3	0.0	-0.05	-0.29	-0.29	-0.07
Spov3_chr1.00922	-0.45	-0.26	-0.56	-0.7	-0.62	0.38	0.43	0.69	-0.27	-0.32	-0.15	-0.14	0.47	0.55	0.62	0.43	0.3	0.67	-0.16	-0.1	-0.15	0.05	0.01	-0.06	-0.21	-0.18	-0.24	-0.85	-0.43	-0.68
Spov3_chr1.02155 (BGLC3)	-0.0	0.01	-0.18	-0.16	-0.01	0.13	0.11	0.1	-0.27	-0.12	-0.05	-0.07	0.15	0.52	0.3	0.35	0.38	-0.29	-0.27	-0.14	-0.02	-0.05	-0.17	-0.02	-0.04	0.06	0.03	-0.11	-0.25	-0.38
Spov3_chr1.02341 (UBQ4)	-0.38	-0.45	-0.69	-0.72	0.04	0.19	0.38	0.42	-0.56	-0.42	-0.27	-0.27	0.8	0.82	0.05	-0.08	-0.2	0.57	-0.12	-0.12	-0.15	-0.25	-0.05	0.27	-0.04	0.04	0.06	0.17	-0.48	-0.16
Spov3_chr1.02439 (PAE7)	-0.29	-0.06	-0.24	0.02	-0.36	0.05	0.19	0.2	-0.17	-0.1	-0.18	0.14	0.28	0.37	0.26	0.29	0.22	0.06	0.01	0.07	0.03	-0.08	-0.31	-0.07	-0.02	0.04	-0.03	-0.37	-0.41	0.04
Spov3_chr1.03011 (BGLU40)	-0.54	-0.92	-1.25	-1.41	-0.02	0.53	0.64	0.04	-0.91	-0.56	-0.39	-0.39	1.17	0.78	0.15	0.19	0.06	0.73	-0.3	-0.08	-0.32	-0.06	0.74	-0.14	-0.02	-0.23	-0.24	-0.18	-0.71	0.05
Spov3_chr1.03350 (NACA3)	-0.49	-0.39	-0.47	0.0	0.15	0.13	-0.2	0.57	-0.23	0.05	0.07	-0.07	0.38	0.08	0.33	0.35	0.52	-0.02	-0.2	-0.18	0.19	-0.12	0.31	-0.13	-0.04	-0.22	-0.14	-0.42	-0.36	-0.3
Spov3_chr1.03429	0.03	0.03	-0.08	-0.04	-0.15	-0.09	-0.12	0.13	-0.29	-0.2	-0.03	-0.18	0.34	-0.13	0.1	0.12	0.06	0.71	0.03	-0.28	-0.26	-0.07	-0.05	-0.04	-0.06	0.02	0.03	0.07	-0.08	0.08
Spov3_chr1.03537	-0.48	-0.56	-0.88	-0.98	-1.79	-0.02	0.24	-0.83	-1.18	-0.66	-0.18	-0.61	1.19	1.54	1.02	0.81	0.89	-0.01	-0.29	-0.22	0.13	0.07	-0.39	0.07	0.1	-0.07	-0.03	-0.99	-1.49	-0.67
Spov3_chr1.03604 (GGP)	-0.83	-0.92	-1.16	-1.21	-0.59	0.78	0.63	-0.17	-0.57	-0.64	-0.19	-0.18	0.55	0.33	1.08	0.84	0.67	0.56	-0.28	-0.13	-0.23	-0.02	0.1	0.18	0.05	-0.19	-0.23	-0.78	-0.86	-0.4
Spov3_chr1.04253 (SC35)	-0.06	-0.05	-0.18	-0.12	-0.11	0.03	0.06	0.21	-0.32	-0.14	-0.12	-0.17	0.39	0.46	0.15	0.15	0.19	0.23	-0.15	0.02	-0.13	-0.05	-0.14	-0.13	-0.06	-0.16	-0.07	-0.19	-0.18	0.24
Spov3_chr1.04308 (NISP)	0.07	-0.17	-0.47	-0.48	0.02	0.37	0.23	-0.09	-0.3	-0.23	-0.2	-0.14	0.37	0.73	0.4	0.36	0.34	-0.02	-0.22	-0.26	-0.12	-0.17	0.21	-0.06	-0.11	-0.13	-0.17	-0.06	-0.28	-0.27
Spov3_chr1.04830 (SYT3)	-0.79	-0.76	-0.99	-1.34	-0.54	0.76	0.58	0.31	-0.61	-0.68	-0.23	-0.2	0.27	0.54	1.02	0.83	0.67	-0.28	-0.22	-0.14	-0.07	-0.04	0.09	0.34	-0.04	0.0	-0.24	-0.58	-0.79	-0.27
Spov3_chr1.05228	-0.12	-0.15	-0.12	-0.07	-0.37	-0.05	0.11	0.23	-0.15	-0.34	0.02	-0.06	0.26	0.46	0.43	0.31	0.46	0.02	-0.18	-0.09	-0.06	-0.23	-0.23	-0.18	0.0	-0.01	0.12	-0.14	-0.24	-0.17
Spov3_chr2.00172 (XTR4)	-0.79	-1.11	-0.56	-0.18	-1.01	0.74	0.35	-0.32	0.0	-0.48	0.0	0.15	0.32	0.79	0.81	0.57	0.49	-0.19	0.08	0.07	0.03	0.02	0.43	-0.07	-0.34	-0.31	-0.42	-0.9	-0.81	-0.11
Spov3_chr2.00195 (SYP23)	-0.46	-0.45	-0.47	-0.38	-0.09	0.47	0.24	0.24	-0.51	-0.45	-0.03	-0.17	0.32	0.81	0.58	0.46	0.47	-0.18	-0.15	-0.04	-0.02	0.01	0.01	-0.13	-0.17	-0.1	-0.07	-0.24	-0.58	-0.25
Spov3_chr2.00655 (ATL69)	-0.26	-0.24	-0.52	-0.74	-0.67	0.53	0.56	0.14	-0.15	-0.29	-0.02	0.27	0.08	-0.17	0.48	0.5	0.27	0.5	-0.18	0.08	-0.18	0.16	0.21	-0.18	-0.24	-0.25	-0.15	-0.56	-0.34	0.09
Spov3_chr2.00745 (PHR1)	-0.33	-0.34	-0.32	0.03	-1.04	-0.08	0.03	0.42	-1.18	-1.1	-0.52	-0.63	1.37	0.25	0.28	0.43	0.43	0.83	-0.2	-0.26	-0.22	-0.12	0.83	-0.02	-0.14	-0.46	-0.14	-0.2	-0.95	-0.13
Spov3_chr2.00814 (DHAD)	-0.06	-0.3	-1.09	-1.26	-0.81	0.54	0.81	0.04	-0.26	-0.58	-0.07	-0.15	0.14	1.21	0.61	0.54	-0.07	0.45	-0.39	0.29	-0.23	0.16	0.26	0.2	-0.25	-0.57	-0.68	-0.61	-0.32	-0.82
Spov3_chr2.01252 (B5 #4)	-0.74	-0.66	-0.67	-0.59	-0.28	-0.18	0.07	0.08	-0.4	-0.27	0.08	-0.03	0.95	0.41	0.47	0.36	0.48	0.58	-0.04	0.06	-0.06	0.03	0.5	-0.05	-0.05	-0.04	-0.06	-0.49	-0.87	-0.57
Spov3_chr2.01737 (PUP5)	-0.44	-0.46	-1.16	-1.08	-0.44	0.63	0.44	-0.39	-0.86	-0.54	-0.09	-0.19	0.52	1.21	0.68	0.56	0.35	0.49	-0.38	-0.16	-0.28	0.04	0.45	0.01	-0.12	-0.07	-0.32	-0.63	-0.53	-0.43
Spov3_chr2.01763 (CRK34)	-0.09	0.12	-0.29	-0.43	0.0	0.15	0.2	0.05	-0.2	-0.08	-0.14	-0.24	0.15	0.58	0.58	0.38	0.3	0.59	-0.11	-0.03	-0.26	-0.14	-0.01	0.22	-0.33	-0.18	-0.26	-0.32	-0.67	-0.6
Spov3_chr2.02673 (EIF5A)	-0.19	-0.29	-0.19	-0.07	0.03	0.2	0.08	0.08	-0.01	-0.07	0.09	-0.0	0.12	0.05	0.21	0.19	0.23	0.03	-0.04	0.01	-0.03	-0.04	0.43	-0.02	-0.02	-0.02	-0.04	-0.2	-0.42	-0.45
Spov3_chr2.02701	-0.58	-0.51	-0.82	-0.81	-0.13	0.52	0.3	-0.39	-0.88	-0.67	-0.31	-0.3	0.85	0.69	0.8	0.72	0.69	-0.1	-0.33	-0.3	-0.15	-0.03	0.34	0.07	0.03	-0.07	-0.09	-0.36	-0.66	-0.21
Spov3_chr2.03407	0.25	-0.28	-0.39	-0.88	-0.24	0.58	0.73	0.5	-0.09	-0.38	0.11	-0.45	-0.04	-0.22	0.37	0.51	-0.09	0.98	-0.13	0.23	-0.19	0.13	-0.5	-0.49	-0.12	0.12	0.04	-0.82	-0.78	-0.66
Spov3_chr2.03672	-1.01	-1.18	-0.61	-0.13	-1.44	-0.39	-0.16	0.86	-0.42	-0.35	-0.44	-1.13	0.37	-0.29	0.74	0.71	0.42	1.66	0.01	-0.29	0.18	-0.38	0.03	-0.39	-0.25	-0.46	-0.5	-0.52	-0.08	0.65
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Spov3_chr5.01207	-0.5	-0.5	-0.79	-0.73	-1.27	0.36	0.17	-0.69	-1.06	-0.51	-0.19	-0.37	0.56	1.23	1.06	0.79	0.77	0.81	-0.3	-0.0	-0.15	0.02	-0.56	-0.17	-0.32	-0.11	-0.22	-0.92	-1.56	0.35
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Spov3_chr6.01204	-0.16	-0.22	-0.24	-0.03	-0.15	-0.01	0.1	0.16	-0.28	-0.05	-0.03	-0.11	0.29	0.23	0.19	0.28	0.18	0.26	-0.24	-0.12	-0.02	0.01	0.11	-0.1	0.02	-0.12	0.11	-0.15	-0.18	-0.04
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Spov3_chr6.02432	-0.06	-0.43	-1.57	-2.19	-0.09	0.34	0.32	-0.04	-1.14	-0.34	-0.32	-0.16	0.92	1.01	0.56	0.65	0.43	0.3	-0.04	-0.34	-0.02	-0.32	-0.14	0.42	-0.0	-0.08	-0.07	-0.48	-0.69	-0.27
Spov3_chr6.02617 (MIPS2)	-0.03	-0.15	-0.92	-1.49	-0.92	0.22	0.53	0.24	-1.12	-0.84	-0.33	-0.15	0.77	1.8	0.79	0.38	0.27	-0.91	-0.17	0.0	-0.15	0.07	-0.12	-0.22	-0.43	-0.21	-0.29	-0.25	-0.76	-0.36
Spov3_S01.00206 (AHL13)	-0.14	-0.1	-0.05	-0.16	-0.51	0.2	0.05	0.06	-0.4	-0.31	-0.08	0.0	0.18	0.39	0.4	0.33	0.46	0.05	-0.11	-0.11	0.04	0.05	-0.28	-0.25	-0.04	-0.01	0.01	-0.3	-0.27	0.31
Spov3_S02.00016 (GNA1)	-0.25	-0.25	-0.15	-0.05	0.02	0.16	0.15	0.35	-0.14	-0.26	-0.04	-0.09	0.12	0.06	0.14	0.26	0.15	0.34	-0.15	0.04	0.07	0.03	0.33	-0.32	-0.07	-0.02	0.04	-0.54	-0.37	0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.