Heatmap: Cluster_27 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0
0.03 0.11 0.15 0.11 0.04 0.15 0.08 0.24 0.04 0.18 0.19 0.04 0.13 0.06 0.26 0.02 0.06 0.13 0.09 0.28 0.09 0.06 0.08 0.15 0.11 0.05 0.04 0.17 0.07 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.26 0.37 0.32 0.19 0.2 0.2 0.28 0.32 0.24 0.32 0.28 0.34 0.31 0.36 0.31 0.23 0.56 0.5 0.71 0.12 0.18 0.27 0.38 0.38 0.38 0.24 0.23 0.31 0.2
0.71 0.51 0.25 1.17 0.38 0.47 0.67 1.07 0.9 1.15 0.6 0.73 0.82 0.08 0.82 1.07 0.79 1.51 0.75 2.26 0.69 0.53 0.46 1.07 1.28 1.21 0.79 0.41 0.82 0.89
0.29 0.26 0.51 0.43 0.24 0.23 0.33 0.46 0.37 0.53 0.44 0.27 0.42 0.35 0.35 0.36 0.21 0.7 0.54 1.1 0.18 0.35 0.44 0.34 0.28 0.29 0.52 0.3 0.4 0.24
0.29 0.26 0.51 0.43 0.24 0.23 0.33 0.46 0.37 0.53 0.44 0.27 0.42 0.35 0.35 0.36 0.21 0.7 0.54 1.1 0.18 0.35 0.44 0.34 0.28 0.29 0.52 0.3 0.4 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.57 0.42 0.63 0.81 0.44 0.43 0.64 0.69 0.75 0.5 0.8 0.56 0.67 0.36 0.63 0.52 0.5 0.48 1.21 2.24 0.79 0.5 0.98 0.72 0.84 0.85 0.89 0.59 0.29 0.38
1.01 0.68 0.84 1.56 0.93 0.8 1.16 1.17 0.78 1.26 1.71 0.79 1.93 0.69 0.68 1.42 1.33 1.4 1.47 2.62 1.17 0.69 1.31 1.06 1.18 1.11 1.63 0.86 0.88 0.73
1.01 0.68 0.84 1.56 0.93 0.8 1.16 1.17 0.78 1.26 1.71 0.79 1.93 0.69 0.68 1.42 1.33 1.4 1.47 2.62 1.17 0.69 1.31 1.06 1.18 1.11 1.63 0.86 0.88 0.73
0.71 0.51 0.25 1.17 0.38 0.47 0.67 1.07 0.9 1.15 0.6 0.73 0.82 0.08 0.82 1.07 0.79 1.51 0.75 2.26 0.69 0.53 0.46 1.07 1.28 1.21 0.79 0.41 0.82 0.89
0.73 0.15 0.47 0.58 0.56 0.34 0.48 0.47 0.57 0.61 0.88 0.53 0.83 0.43 0.41 0.31 0.31 0.89 0.55 1.18 0.22 0.29 0.48 0.59 0.63 0.73 0.66 0.29 0.27 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0
0.08 0.02 0.22 0.08 0.12 0.05 0.07 0.08 0.14 0.12 0.09 0.2 0.12 0.18 0.17 0.15 0.13 0.28 0.15 0.29 0.16 0.11 0.21 0.26 0.15 0.16 0.09 0.16 0.15 0.0
0.37 0.99 1.84 1.64 1.24 1.22 4.63 2.21 2.97 4.52 1.41 3.73 3.0 0.2 1.87 1.39 1.02 8.42 2.27 9.4 2.48 1.03 3.2 2.07 3.02 3.34 3.39 1.55 0.88 1.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.04 0.0 0.12 0.0 0.05 0.0 0.05 0.05 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.04 0.04
0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr1.01747 (RALFL22)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.12
4.45 2.45 1.01 4.14 1.77 1.67 3.57 4.5 4.51 3.64 6.21 5.43 6.6 1.64 4.28 4.27 4.36 8.42 6.97 17.65 6.21 5.29 3.04 7.67 8.08 6.09 6.11 2.47 3.23 4.02
0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.23 0.12 0.22 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.33 0.32 0.14 0.21 0.0 0.59 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.21 0.0 0.22 0.0 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.04 0.0 0.03 0.05 0.0 0.07 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.12 0.0 0.16 0.12 0.0 0.03 3.13 0.03 0.02 0.0 0.0 0.08 0.09 0.13 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.37 0.0 0.0 0.77 0.0
Spov3_chr2.01933 (AtGLYI6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.07 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.35 0.17 0.0 0.27 0.0 0.32 0.6 0.0 0.78 0.44 0.0 0.33 0.21 0.3 0.63 0.54 0.19 0.24 0.63 1.52 0.83 0.16 0.0 0.1 0.29 0.52 0.42 0.29 0.09 0.23
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.56 2.21 0.0 1.5 0.0 0.0 2.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 2.39 0.0
1.38 1.49 2.05 1.28 0.98 1.3 1.49 1.09 1.71 1.32 1.52 1.64 0.56 1.33 1.16 0.74 0.88 0.38 1.54 3.55 1.02 1.95 0.66 1.12 0.87 0.97 1.37 2.19 1.26 0.34
2.61 3.04 3.44 2.68 2.17 3.1 4.07 3.25 3.66 3.93 2.63 3.96 1.62 3.51 3.13 2.39 2.34 0.86 4.51 10.35 2.22 3.23 0.67 2.73 1.84 2.63 2.43 4.31 2.44 0.74
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.53 0.64 2.4 1.06 0.51 0.22 0.0 0.0 0.0 0.26 0.26 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 11.81 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 3.52 3.49 0.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.23 0.0 0.44 1.09 0.24 0.44 0.06 0.0 0.0 0.71 1.65 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.15 0.12 0.0 0.04 0.07 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.03 0.13 0.0 0.04 0.02 0.0 0.13 0.02 0.05 0.07 0.03 0.05 0.06 0.06 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.07 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.15 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
0.53 0.4 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.28 0.63 0.0 0.15 0.0 0.0 0.13 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.11 0.0 0.13 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01
0.03 0.03 0.03 0.02 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.21 0.41 0.73 0.19 0.14 0.22 0.68 0.12 0.56 0.42 0.29 0.4 0.26 0.27 0.35 0.24 0.78 0.52 1.29 0.42 0.38 0.44 0.57 0.45 0.53 0.54 0.46 0.36 0.42
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01
0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09
0.01 0.01 0.07 0.03 0.0 0.01 0.05 0.03 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.06 0.04 0.0 0.06 0.01 0.14 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)