1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_153 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.46 0.47 0.35 0.29 0.47 0.54 0.48 0.47 0.34 0.37 0.36 0.41 0.35 1.0 0.48 0.43 0.41 0.73 0.42 0.38 0.43 0.44 0.33 0.48 0.38 0.4 0.39 0.45 0.39 0.33
0.16 0.22 0.12 0.02 0.3 0.2 0.13 0.07 0.12 0.07 0.1 0.09 0.05 1.0 0.2 0.12 0.08 0.27 0.03 0.09 0.11 0.13 0.09 0.31 0.11 0.13 0.13 0.02 0.17 0.11
0.0 0.08 0.0 0.0 0.26 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01
0.68 0.68 0.5 0.39 0.69 0.56 0.59 0.65 0.5 0.59 0.5 0.54 0.61 1.0 0.64 0.57 0.56 0.54 0.49 0.49 0.49 0.48 0.41 0.53 0.5 0.53 0.52 0.62 0.58 0.51
0.32 0.34 0.18 0.1 0.32 0.25 0.14 0.08 0.16 0.26 0.15 0.2 0.17 1.0 0.2 0.19 0.15 0.15 0.17 0.15 0.18 0.19 0.17 0.25 0.19 0.2 0.2 0.3 0.25 0.14
0.05 0.19 0.0 0.05 0.13 0.07 0.03 0.04 0.01 0.12 0.1 0.03 0.09 1.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.03 0.02 0.11 0.0 0.04 0.04 0.08 0.05 0.04 0.1 0.06 0.03
0.42 0.45 0.36 0.34 0.55 0.4 0.34 0.33 0.39 0.45 0.39 0.39 0.43 1.0 0.43 0.43 0.42 0.43 0.36 0.36 0.41 0.37 0.39 0.39 0.37 0.44 0.46 0.4 0.43 0.43
0.3 0.32 0.08 0.05 0.23 0.19 0.08 0.07 0.05 0.09 0.04 0.07 0.1 1.0 0.11 0.07 0.05 0.46 0.06 0.05 0.07 0.06 0.17 0.07 0.04 0.07 0.05 0.13 0.17 0.57
0.21 0.09 0.01 0.01 0.2 0.06 0.02 0.05 0.01 0.03 0.02 0.02 0.1 1.0 0.06 0.03 0.03 0.21 0.03 0.02 0.03 0.03 0.13 0.03 0.03 0.05 0.02 0.07 0.05 0.22
0.32 0.35 0.2 0.15 0.51 0.32 0.25 0.34 0.17 0.22 0.18 0.21 0.26 1.0 0.3 0.28 0.25 0.57 0.18 0.2 0.22 0.21 0.26 0.26 0.2 0.22 0.2 0.36 0.31 0.21
0.39 0.44 0.31 0.28 0.49 0.46 0.37 0.34 0.33 0.37 0.32 0.35 0.34 1.0 0.41 0.45 0.42 0.54 0.35 0.33 0.4 0.33 0.32 0.38 0.36 0.4 0.33 0.34 0.37 0.37
0.43 0.49 0.24 0.09 0.45 0.4 0.33 0.3 0.23 0.34 0.23 0.33 0.34 1.0 0.29 0.28 0.23 0.59 0.28 0.22 0.27 0.27 0.28 0.36 0.28 0.33 0.29 0.42 0.37 0.28
0.21 0.17 0.21 0.18 0.42 0.3 0.17 0.13 0.17 0.21 0.13 0.14 0.16 1.0 0.19 0.17 0.18 0.43 0.17 0.14 0.16 0.17 0.36 0.15 0.15 0.11 0.12 0.2 0.12 0.11
0.32 0.32 0.08 0.04 0.16 0.24 0.17 0.16 0.06 0.11 0.09 0.1 0.15 1.0 0.15 0.2 0.16 0.31 0.12 0.1 0.15 0.15 0.14 0.16 0.1 0.15 0.12 0.15 0.12 0.16
0.31 0.4 0.1 0.05 0.19 0.28 0.2 0.19 0.05 0.11 0.08 0.09 0.15 1.0 0.16 0.2 0.15 0.4 0.14 0.11 0.14 0.15 0.14 0.16 0.11 0.17 0.14 0.16 0.15 0.18
0.41 0.39 0.35 0.33 0.4 0.39 0.29 0.34 0.38 0.39 0.31 0.34 0.35 1.0 0.4 0.41 0.38 0.53 0.31 0.29 0.33 0.31 0.31 0.37 0.33 0.34 0.33 0.28 0.33 0.32
0.77 0.74 0.7 0.7 0.78 0.7 0.7 0.78 0.72 0.72 0.75 0.75 0.67 1.0 0.78 0.72 0.71 0.6 0.63 0.65 0.71 0.72 0.69 0.65 0.67 0.71 0.72 0.76 0.7 0.62
0.16 0.17 0.07 0.04 0.28 0.23 0.11 0.13 0.09 0.13 0.09 0.07 0.21 1.0 0.1 0.1 0.11 0.43 0.14 0.13 0.11 0.17 0.36 0.11 0.12 0.17 0.14 0.17 0.14 0.1
0.32 0.27 0.14 0.07 0.3 0.21 0.08 0.12 0.13 0.18 0.07 0.11 0.22 1.0 0.1 0.12 0.07 0.44 0.1 0.05 0.13 0.07 0.31 0.13 0.07 0.16 0.12 0.19 0.26 0.38
0.56 0.54 0.41 0.4 0.53 0.65 0.54 0.58 0.44 0.44 0.43 0.48 0.49 1.0 0.5 0.51 0.46 0.44 0.42 0.4 0.43 0.48 0.67 0.5 0.46 0.43 0.42 0.57 0.5 0.46
0.46 0.31 0.17 0.15 0.38 0.26 0.2 0.18 0.13 0.17 0.18 0.19 0.24 1.0 0.22 0.21 0.22 0.48 0.19 0.17 0.19 0.21 0.39 0.22 0.19 0.2 0.22 0.27 0.2 0.17
0.21 0.29 0.18 0.05 0.39 0.3 0.16 0.16 0.15 0.23 0.25 0.27 0.2 1.0 0.28 0.36 0.25 0.3 0.15 0.12 0.21 0.21 0.17 0.27 0.13 0.24 0.13 0.11 0.26 0.18
0.67 0.56 0.46 0.37 0.56 0.4 0.37 0.37 0.38 0.39 0.32 0.35 0.35 1.0 0.44 0.38 0.38 0.73 0.36 0.35 0.36 0.37 0.37 0.34 0.32 0.33 0.36 0.38 0.49 0.38
0.32 0.37 0.25 0.22 0.46 0.27 0.21 0.13 0.24 0.27 0.22 0.22 0.2 1.0 0.33 0.32 0.3 0.33 0.23 0.21 0.25 0.25 0.24 0.27 0.2 0.24 0.22 0.27 0.22 0.22
0.16 0.17 0.12 0.12 0.34 0.17 0.1 0.08 0.12 0.17 0.1 0.11 0.29 1.0 0.2 0.14 0.11 0.25 0.12 0.1 0.14 0.1 0.16 0.11 0.09 0.11 0.1 0.18 0.18 0.07
0.4 0.48 0.31 0.25 0.49 0.41 0.32 0.27 0.23 0.26 0.25 0.26 0.24 1.0 0.33 0.32 0.32 0.44 0.29 0.25 0.32 0.32 0.3 0.26 0.25 0.28 0.25 0.3 0.31 0.3
0.04 0.19 0.05 0.01 0.17 0.07 0.06 0.0 0.01 0.04 0.0 0.08 0.04 1.0 0.0 0.1 0.06 0.06 0.06 0.02 0.09 0.08 0.02 0.05 0.04 0.05 0.06 0.15 0.07 0.11
0.54 0.36 0.17 0.09 0.28 0.23 0.17 0.13 0.15 0.2 0.15 0.18 0.1 1.0 0.16 0.12 0.13 0.47 0.13 0.13 0.14 0.13 0.22 0.18 0.13 0.16 0.14 0.21 0.2 0.14
0.35 0.33 0.18 0.13 0.39 0.28 0.23 0.17 0.21 0.21 0.19 0.2 0.19 1.0 0.25 0.24 0.2 0.33 0.19 0.19 0.2 0.2 0.21 0.23 0.19 0.21 0.2 0.26 0.27 0.19
0.61 0.59 0.35 0.23 0.42 0.35 0.39 0.48 0.3 0.36 0.33 0.38 0.39 1.0 0.36 0.35 0.35 0.46 0.33 0.34 0.34 0.38 0.32 0.41 0.39 0.38 0.38 0.52 0.45 0.39
0.27 0.26 0.11 0.05 0.32 0.13 0.09 0.1 0.07 0.11 0.08 0.09 0.14 1.0 0.11 0.1 0.11 0.36 0.1 0.1 0.11 0.12 0.11 0.14 0.13 0.11 0.12 0.22 0.14 0.13
0.41 0.43 0.21 0.12 0.39 0.39 0.26 0.21 0.22 0.26 0.21 0.27 0.24 1.0 0.3 0.3 0.28 0.55 0.24 0.22 0.25 0.27 0.22 0.29 0.2 0.28 0.24 0.34 0.28 0.25
0.13 0.13 0.09 0.04 0.27 0.14 0.07 0.06 0.07 0.11 0.08 0.06 0.1 1.0 0.11 0.09 0.11 0.16 0.09 0.08 0.08 0.12 0.14 0.11 0.08 0.07 0.08 0.17 0.12 0.11
0.41 0.36 0.22 0.18 0.52 0.31 0.21 0.2 0.17 0.25 0.19 0.17 0.21 1.0 0.26 0.26 0.23 0.45 0.24 0.18 0.25 0.21 0.28 0.25 0.18 0.24 0.23 0.31 0.31 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.07 0.1 0.0 0.04 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.31 0.36 0.19 0.12 0.36 0.21 0.19 0.19 0.2 0.26 0.18 0.2 0.18 1.0 0.16 0.18 0.18 0.3 0.22 0.2 0.21 0.23 0.17 0.24 0.23 0.25 0.26 0.33 0.2 0.17
0.3 0.32 0.14 0.13 0.34 0.19 0.14 0.17 0.12 0.18 0.12 0.14 0.19 1.0 0.11 0.09 0.1 0.54 0.15 0.11 0.13 0.13 0.41 0.13 0.15 0.15 0.16 0.24 0.18 0.22
0.38 0.39 0.27 0.23 0.53 0.28 0.25 0.17 0.27 0.32 0.23 0.24 0.23 1.0 0.33 0.33 0.3 0.44 0.26 0.23 0.29 0.25 0.23 0.36 0.27 0.29 0.26 0.29 0.29 0.24
0.7 0.71 0.65 0.66 0.59 0.62 0.66 0.82 0.65 0.68 0.61 0.61 0.58 1.0 0.64 0.62 0.59 0.51 0.52 0.55 0.56 0.58 0.68 0.57 0.55 0.57 0.6 0.71 0.65 0.57
0.23 0.18 0.05 0.04 0.16 0.04 0.05 0.04 0.06 0.06 0.05 0.05 0.03 1.0 0.03 0.03 0.03 0.05 0.07 0.04 0.05 0.06 0.08 0.06 0.03 0.05 0.07 0.09 0.08 0.07
0.51 0.53 0.42 0.34 0.39 0.37 0.42 0.56 0.39 0.4 0.34 0.38 0.34 1.0 0.36 0.34 0.32 0.34 0.29 0.31 0.33 0.35 0.53 0.34 0.34 0.35 0.34 0.47 0.47 0.41
0.31 0.38 0.22 0.16 0.4 0.27 0.24 0.22 0.26 0.31 0.25 0.24 0.25 1.0 0.26 0.27 0.24 0.38 0.24 0.25 0.27 0.24 0.22 0.32 0.25 0.3 0.22 0.34 0.3 0.17
0.6 0.7 0.49 0.42 0.46 0.48 0.44 0.59 0.51 0.57 0.43 0.47 0.38 1.0 0.46 0.49 0.39 0.55 0.41 0.41 0.54 0.42 0.69 0.5 0.4 0.44 0.42 0.54 0.54 0.48
0.34 0.31 0.28 0.23 0.37 0.16 0.13 0.17 0.18 0.24 0.15 0.15 0.24 1.0 0.16 0.17 0.15 0.45 0.15 0.12 0.14 0.17 0.41 0.17 0.2 0.17 0.19 0.26 0.2 0.24
0.34 0.36 0.24 0.14 0.28 0.32 0.22 0.26 0.23 0.29 0.21 0.26 0.26 1.0 0.27 0.34 0.3 0.33 0.22 0.17 0.22 0.3 0.23 0.24 0.21 0.21 0.19 0.29 0.31 0.25
0.03 0.06 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.27 0.22 0.23 0.28 0.28 0.24 0.29 0.2 0.21 0.24 0.27 0.38 1.0 0.37 0.34 0.29 0.25 0.2 0.18 0.24 0.22 0.31 0.29 0.21 0.27 0.25 0.26 0.26 0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)