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Heatmap: Cluster_17 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.98 -0.58 1.52 0.62 -0.82 0.1 -0.95 -0.87 - -0.81 0.36 1.5 -0.77 0.75 - -0.59 - 0.06 - - 2.03 -0.84 - -0.85 - 0.13 0.75 0.93 - 0.78
0.21 0.03 -0.2 -0.11 0.64 -0.41 -0.39 -0.15 0.31 0.33 0.06 -0.08 -0.45 0.01 -0.1 -0.31 -0.3 -0.29 0.01 -0.19 -0.18 0.02 0.48 0.12 0.15 -0.16 0.17 -0.02 0.47 -0.54
1.93 0.09 0.7 1.05 -1.41 -1.77 -1.14 -1.69 0.49 -0.09 0.11 -0.27 -1.87 -5.72 -1.02 -0.91 -0.72 1.28 -0.42 -0.92 -0.46 -0.93 0.25 -1.25 -0.95 -0.54 -0.58 1.86 -0.29 -0.1
0.92 0.7 -0.19 -0.35 0.42 -0.41 -0.36 -0.53 -0.49 -0.33 -0.56 -0.47 -0.28 0.68 -0.39 -0.44 -0.42 0.59 -0.57 -0.56 -0.59 -0.6 0.87 -0.35 -0.6 -0.55 -0.39 1.32 0.21 0.19
0.33 0.06 0.03 -0.28 -0.24 -0.61 -1.0 -0.49 -0.17 0.15 -0.42 -0.11 0.04 0.39 -0.49 -0.77 -0.83 -0.21 -0.24 0.09 -0.36 -0.45 1.34 -0.18 -0.5 -0.43 -0.49 1.11 0.6 0.81
1.4 -0.71 0.76 0.45 0.08 -1.8 -0.94 -0.67 0.94 0.17 0.6 0.8 -0.85 -0.88 -0.65 0.01 0.34 -1.87 -0.17 -0.88 0.59 -0.15 -0.97 -0.1 0.45 -0.38 -0.07 0.42 -0.46 -2.48
1.57 1.9 -1.17 -1.49 0.8 -1.89 -2.79 -1.74 -3.25 - -2.35 -2.6 -1.23 -0.55 -2.1 -2.76 -2.02 -2.2 -2.98 -3.15 -2.55 -2.36 1.65 -3.22 -3.22 -6.37 -3.55 3.61 -0.29 -0.78
0.76 -0.03 0.46 0.75 -0.17 -0.9 -0.12 -0.36 0.5 0.27 0.42 0.16 -1.43 -1.45 -0.24 -0.18 -0.12 -1.03 -0.17 -0.18 -0.12 -0.39 0.83 0.09 -0.11 -0.09 -0.14 0.4 0.21 -0.6
0.86 0.1 0.2 0.49 -0.04 -0.23 -0.02 -0.31 0.21 -0.1 0.06 -0.0 -0.12 -0.15 0.18 0.02 -0.08 -1.65 -0.23 -0.29 -0.24 -0.17 0.37 -0.14 0.02 -0.44 -0.39 0.69 0.11 -0.4
0.56 -0.15 0.36 0.59 0.06 -0.31 -0.26 -0.17 0.33 0.09 -0.04 0.01 -0.53 -1.33 0.16 -0.1 -0.12 -0.5 -0.23 -0.36 -0.24 -0.36 0.46 -0.32 -0.13 -0.18 -0.2 0.84 0.29 0.1
- - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - 3.84 - -
0.26 0.15 0.4 -0.34 0.07 -0.21 0.05 0.64 0.16 0.09 -0.05 0.51 -1.23 -0.82 0.38 -0.06 0.68 -1.81 -0.88 0.2 0.56 -0.83 -0.79 0.16 -1.6 0.07 -0.22 0.64 0.04 0.14
0.94 -0.27 0.06 -0.18 -0.88 -1.03 0.3 -0.65 0.5 0.23 0.36 0.32 -1.06 -1.87 -0.69 -0.8 -0.21 -3.12 0.22 -0.04 -0.2 0.11 1.44 -0.07 0.18 0.04 -0.06 0.73 0.26 -0.58
1.46 0.37 0.22 -0.34 -1.1 -0.73 0.27 -0.27 -0.08 0.27 0.45 -0.87 -0.64 -1.78 -2.48 -0.21 -1.51 -4.68 0.6 0.07 -0.17 -0.29 1.57 0.2 -0.56 -0.13 -1.4 0.94 0.49 -0.32
1.06 -0.29 0.18 0.15 -0.73 -0.95 0.15 -0.59 0.77 -0.02 -0.21 0.02 -0.89 -2.01 -0.17 -0.44 -0.38 -2.35 0.02 0.33 0.17 -0.13 0.94 -0.09 0.82 -0.45 0.07 -0.38 0.52 0.12
1.24 0.9 -0.26 -0.62 0.9 -0.82 -0.53 -0.36 -0.47 -0.72 -0.93 -0.87 -1.34 -0.26 -0.79 -0.79 -0.95 -0.53 -0.82 -0.71 -0.82 -0.75 1.43 -0.74 -0.79 -0.88 -0.71 2.13 0.64 0.12
0.8 0.58 -0.43 -0.76 0.27 -1.07 -0.71 -0.04 -0.63 -0.6 -0.6 -0.81 -0.56 0.02 -0.84 -1.22 -1.11 -0.47 -0.82 -0.87 -0.95 -0.84 2.28 -0.54 -0.67 -0.77 -0.75 2.08 0.26 -0.37
0.3 0.12 0.07 0.27 -0.17 0.14 0.13 -0.13 0.06 -0.09 -0.09 -0.02 -0.26 -0.33 0.3 0.21 0.01 -0.77 -0.21 -0.25 0.01 0.12 0.16 0.03 -0.09 -0.01 0.04 0.15 0.12 -0.3
-0.23 0.13 0.57 0.58 0.64 0.08 -0.48 -0.22 0.1 0.26 0.05 0.65 -0.97 -1.09 -0.31 -0.53 -0.38 0.22 -0.15 -0.83 -0.06 0.17 -0.43 -0.61 0.32 -0.16 -0.73 0.63 0.23 0.24
2.46 - - - - - - - - 2.56 - 2.23 - - - - - - - - - - 2.12 - 2.12 - 2.39 - - -
1.05 1.47 -0.87 -1.62 1.36 -0.88 -1.79 -1.04 -1.7 -1.46 -1.95 -1.81 -1.53 0.62 -1.03 -1.53 -0.94 0.57 -2.97 -1.7 -1.25 -1.24 2.8 -2.14 -0.76 -2.13 -1.49 1.82 -0.7 -0.62
1.35 1.42 -0.1 -1.07 1.12 -0.17 -0.71 -0.53 -0.56 -0.79 -1.2 -0.83 -0.49 1.43 -0.05 -1.35 -1.15 0.25 -1.34 -0.86 -0.83 -1.17 1.18 -0.64 -1.04 -1.08 -1.13 1.36 0.03 -1.08
0.12 -0.09 0.07 0.42 0.16 -0.19 -0.2 -0.03 0.11 0.04 0.18 0.07 -0.03 -0.33 0.08 -0.04 0.1 -0.46 -0.16 -0.14 -0.08 -0.11 0.22 -0.12 0.11 0.04 0.19 0.1 -0.1 -0.26
0.72 0.08 -0.21 -0.38 0.12 -0.08 -0.11 -0.28 -0.29 -0.32 -0.29 -0.2 -0.31 0.34 0.03 -0.05 -0.15 -0.01 -0.06 -0.37 -0.0 -0.15 0.66 0.05 -0.26 0.02 -0.08 0.72 0.05 -0.17
0.28 0.12 0.09 0.26 0.41 0.08 -0.16 -0.13 0.01 0.03 -0.28 -0.26 -0.2 0.2 -0.05 -0.1 -0.25 -0.35 -0.27 -0.38 -0.34 -0.28 0.06 0.03 -0.09 -0.15 -0.4 1.05 0.36 -0.33
0.45 0.1 0.67 0.74 -0.1 -0.23 -0.09 -0.08 0.15 -0.37 -0.59 -0.65 -0.06 -0.58 0.3 0.05 0.29 0.06 -0.17 -0.15 -0.3 -0.21 1.55 -0.89 -0.78 -0.75 -0.52 -0.37 -0.1 -0.37
1.35 -0.01 -0.15 -0.26 0.46 -0.22 -0.27 -1.26 -0.14 -0.31 -0.15 -0.2 -1.17 -1.38 -0.16 -0.19 -0.23 -2.28 -0.17 -0.28 -0.02 -0.21 0.03 -0.09 0.0 0.22 0.12 1.53 0.21 0.32
0.38 0.2 -0.2 -0.16 -0.03 -0.25 -0.21 -0.24 -0.14 -0.18 -0.04 -0.12 -0.0 0.47 -0.0 -0.16 -0.02 0.47 -0.29 -0.28 -0.26 -0.2 1.09 -0.29 -0.23 -0.18 -0.11 0.26 -0.17 -0.2
-0.01 -0.06 0.15 0.32 -0.2 0.31 -0.03 -0.02 -0.06 -0.09 0.03 0.04 0.05 -0.32 0.31 0.18 0.19 -0.6 -0.02 -0.09 0.1 0.01 -0.02 -0.16 -0.01 0.02 0.11 0.12 -0.17 -0.49
1.89 1.39 0.03 -0.15 -0.2 -1.55 -2.88 -2.58 -1.1 -1.97 -1.84 -1.8 -0.83 0.86 -0.68 -2.41 -2.34 1.24 -1.66 -1.9 -2.06 -2.02 2.77 -2.84 -1.43 -1.99 -2.28 1.49 -1.25 0.17
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Spov3_chr2.00233 (PLATZ11)
 1.38 0.81 -0.39 -0.13 0.9 -0.74 -1.28 -1.57 -0.22 -0.21 -1.04 -0.92 -1.19 1.47 -1.16 -1.34 -1.53 0.63 -1.16 -1.32 -1.32 -0.97 1.84 -0.7 -1.23 -1.0 -1.08 1.44 0.41 -0.61
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- - 1.28 0.26 -0.29 -1.18 0.08 -1.03 0.08 0.13 - -0.94 -0.76 -1.02 0.04 1.1 0.24 1.14 - -0.78 -0.7 0.06 1.37 - -0.93 0.15 - 2.16 -0.61 0.72
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1.73 -0.49 1.33 0.93 -1.28 -1.6 -0.43 -0.64 0.89 -0.43 -0.99 -1.0 -0.48 -0.91 -1.52 -1.51 -1.68 -3.95 0.78 0.19 -1.0 0.16 0.65 -0.96 -1.01 0.87 -0.49 1.14 -0.69 0.11
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1.57 -0.42 1.49 1.59 0.57 -0.67 -0.13 -1.95 0.41 -0.09 -0.02 0.08 - -1.24 0.08 -0.55 -1.06 -1.62 - 0.03 -0.14 0.56 1.06 -0.51 -0.17 - -0.58 0.02 -2.08 -0.14
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Spov3_S16.00001 (ERF016)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.