1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_155 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.96 1.0 0.79 0.83 0.7 0.6 0.64 0.59 0.82 0.84 0.65 0.72 0.64 0.98 0.69 0.74 0.63 0.69 0.65 0.61 0.64 0.66 0.99 0.66 0.67 0.7 0.71 0.82 0.84 0.65
0.85 0.86 0.83 0.8 0.88 0.65 0.65 0.75 0.68 0.76 0.68 0.69 0.64 0.81 0.68 0.74 0.71 0.63 0.67 0.63 0.68 0.67 1.0 0.74 0.7 0.66 0.69 0.84 0.86 0.75
0.66 0.69 0.71 0.76 0.69 0.62 0.61 0.79 0.61 0.68 0.66 0.61 0.64 0.7 0.6 0.62 0.58 0.73 0.66 0.6 0.66 0.65 1.0 0.64 0.66 0.67 0.72 0.83 0.66 0.57
0.95 0.84 0.81 0.86 0.76 0.61 0.57 0.69 0.68 0.74 0.6 0.65 0.66 1.0 0.61 0.62 0.63 0.68 0.6 0.54 0.6 0.65 0.96 0.62 0.65 0.64 0.66 1.0 0.75 0.67
0.76 0.61 0.52 0.51 0.51 0.46 0.42 0.43 0.42 0.44 0.47 0.43 0.33 0.64 0.49 0.47 0.44 0.43 0.39 0.35 0.41 0.38 1.0 0.42 0.44 0.39 0.46 0.45 0.44 0.38
0.79 0.66 0.72 0.7 0.66 0.53 0.58 0.62 0.63 0.58 0.53 0.49 0.5 0.67 0.6 0.52 0.57 0.62 0.54 0.49 0.56 0.56 1.0 0.53 0.51 0.56 0.6 0.64 0.65 0.64
0.79 0.84 0.73 0.67 0.79 0.56 0.58 0.75 0.75 0.82 0.65 0.67 0.56 0.83 0.61 0.63 0.6 0.75 0.6 0.58 0.68 0.63 1.0 0.64 0.65 0.67 0.68 0.84 0.78 0.61
0.51 0.5 0.53 0.54 0.56 0.37 0.43 0.67 0.5 0.53 0.42 0.44 0.51 0.46 0.43 0.42 0.41 0.41 0.4 0.43 0.43 0.44 1.0 0.51 0.47 0.48 0.48 0.65 0.62 0.42
0.75 0.59 0.68 0.74 0.68 0.57 0.59 0.66 0.71 0.68 0.57 0.51 0.53 0.84 0.55 0.49 0.47 1.0 0.6 0.53 0.54 0.52 0.96 0.56 0.57 0.57 0.6 0.89 0.73 0.56
0.95 0.85 0.88 0.85 0.9 0.62 0.52 0.69 0.71 0.7 0.61 0.6 0.68 0.81 0.6 0.59 0.71 0.55 0.53 0.53 0.54 0.55 0.92 0.59 0.53 0.63 0.69 1.0 0.86 0.68
0.83 0.75 0.75 0.7 0.84 0.68 0.75 0.7 0.75 0.72 0.67 0.66 0.65 0.71 0.77 0.68 0.72 0.61 0.68 0.68 0.66 0.68 1.0 0.64 0.65 0.63 0.66 0.78 0.83 0.64
0.88 0.8 0.82 0.77 0.56 0.42 0.42 0.59 0.7 0.79 0.62 0.48 0.49 0.95 0.53 0.46 0.51 0.97 0.57 0.47 0.48 0.5 1.0 0.55 0.53 0.64 0.58 0.93 0.86 0.58
0.89 0.87 0.83 0.81 0.81 0.67 0.75 0.77 0.81 0.8 0.69 0.71 0.64 1.0 0.71 0.65 0.63 0.82 0.67 0.68 0.7 0.71 0.99 0.69 0.66 0.72 0.71 0.87 0.86 0.7
0.98 0.91 0.59 0.48 0.54 0.53 0.49 0.41 0.55 0.56 0.53 0.56 0.42 1.0 0.61 0.52 0.52 0.53 0.42 0.37 0.42 0.47 0.93 0.51 0.45 0.49 0.47 0.73 0.58 0.46
0.64 0.61 0.5 0.47 0.4 0.28 0.28 0.26 0.32 0.34 0.34 0.36 0.19 0.47 0.36 0.33 0.32 0.44 0.32 0.24 0.3 0.31 1.0 0.37 0.35 0.28 0.3 0.46 0.48 0.33
0.72 0.69 0.66 0.77 0.81 0.64 0.64 0.74 0.61 0.71 0.64 0.63 0.71 0.71 0.63 0.63 0.68 0.78 0.66 0.63 0.73 0.71 1.0 0.65 0.71 0.73 0.78 0.74 0.7 0.68
0.82 0.75 0.66 0.66 0.72 0.59 0.47 0.56 0.62 0.71 0.6 0.63 0.59 0.81 0.6 0.6 0.66 0.69 0.49 0.49 0.58 0.58 1.0 0.6 0.6 0.57 0.65 0.87 0.68 0.59
0.96 0.84 0.66 0.53 0.51 0.29 0.29 0.3 0.53 0.68 0.34 0.38 0.18 0.57 0.26 0.21 0.21 0.62 0.27 0.31 0.36 0.34 0.91 0.35 0.34 0.36 0.37 1.0 0.76 0.33
0.61 0.7 0.52 0.27 0.56 0.25 0.23 0.25 0.17 0.13 0.2 0.15 0.26 0.74 0.31 0.18 0.14 0.31 0.13 0.15 0.15 0.15 1.0 0.16 0.33 0.17 0.2 0.43 0.32 0.43
0.85 0.92 0.74 0.77 0.61 0.46 0.35 0.56 0.63 0.77 0.53 0.52 0.48 0.97 0.45 0.43 0.46 0.85 0.45 0.46 0.49 0.51 1.0 0.58 0.5 0.53 0.51 0.83 0.7 0.55
0.86 0.73 0.77 0.89 0.72 0.5 0.5 0.79 0.62 0.56 0.48 0.48 0.51 0.73 0.52 0.47 0.5 0.65 0.44 0.43 0.45 0.44 1.0 0.51 0.47 0.46 0.52 0.9 0.74 0.58
0.71 0.69 0.64 0.59 0.68 0.48 0.5 0.66 0.54 0.54 0.53 0.5 0.61 0.62 0.56 0.51 0.53 0.55 0.43 0.49 0.5 0.52 1.0 0.49 0.5 0.5 0.54 0.69 0.63 0.47
0.81 0.77 0.62 0.69 0.64 0.55 0.47 0.55 0.61 0.68 0.6 0.53 0.64 0.83 0.54 0.59 0.59 0.75 0.51 0.44 0.6 0.56 1.0 0.62 0.51 0.59 0.61 0.73 0.71 0.7
0.75 0.78 0.72 0.69 0.85 0.67 0.71 0.79 0.67 0.69 0.67 0.66 0.74 0.73 0.73 0.69 0.71 0.51 0.59 0.56 0.62 0.61 1.0 0.7 0.69 0.66 0.67 0.85 0.76 0.68
0.68 0.69 0.65 0.66 0.7 0.5 0.54 0.65 0.58 0.61 0.59 0.59 0.61 0.67 0.58 0.53 0.6 0.82 0.6 0.59 0.54 0.57 1.0 0.63 0.67 0.61 0.68 0.77 0.64 0.51
0.88 0.85 0.73 0.65 0.9 0.66 0.67 0.77 0.72 0.79 0.67 0.72 0.58 1.0 0.61 0.6 0.61 0.65 0.67 0.66 0.71 0.66 0.95 0.67 0.68 0.72 0.7 0.85 0.95 0.81
0.75 0.73 0.57 0.6 0.56 0.5 0.57 0.56 0.54 0.53 0.51 0.5 0.49 0.62 0.58 0.53 0.51 0.67 0.48 0.44 0.47 0.51 1.0 0.46 0.44 0.51 0.55 0.65 0.62 0.51
0.62 0.65 0.65 0.63 0.59 0.45 0.49 0.73 0.58 0.56 0.53 0.51 0.58 0.66 0.54 0.55 0.57 0.62 0.48 0.48 0.55 0.58 1.0 0.52 0.5 0.55 0.58 0.64 0.6 0.47
0.45 0.47 0.46 0.43 0.59 0.39 0.37 0.6 0.56 0.55 0.38 0.4 0.31 0.54 0.35 0.4 0.37 0.41 0.41 0.4 0.42 0.32 1.0 0.37 0.35 0.37 0.41 0.48 0.48 0.35
0.66 0.66 0.71 0.74 0.75 0.58 0.64 0.8 0.64 0.74 0.71 0.65 0.73 0.67 0.64 0.61 0.65 0.72 0.66 0.6 0.65 0.66 1.0 0.64 0.69 0.68 0.74 0.76 0.68 0.59
0.78 0.75 0.67 0.65 0.64 0.4 0.48 0.62 0.57 0.6 0.48 0.49 0.49 0.65 0.52 0.46 0.49 0.56 0.48 0.41 0.53 0.51 1.0 0.5 0.47 0.5 0.56 0.7 0.66 0.53
Spov3_chr4.03635 (ABC1K11)
 0.83 0.72 0.67 0.53 0.72 0.56 0.6 0.55 0.64 0.63 0.55 0.64 0.6 0.79 0.59 0.46 0.51 0.48 0.45 0.52 0.49 0.51 1.0 0.57 0.53 0.53 0.52 0.69 0.77 0.62
0.76 0.64 0.65 0.57 0.78 0.5 0.52 0.69 0.52 0.55 0.53 0.53 0.48 0.57 0.51 0.48 0.51 0.43 0.52 0.53 0.57 0.54 1.0 0.54 0.58 0.49 0.54 0.67 0.61 0.44
0.71 0.7 0.59 0.62 0.7 0.43 0.35 0.47 0.57 0.75 0.54 0.47 0.46 0.81 0.4 0.41 0.43 0.67 0.49 0.4 0.5 0.46 1.0 0.52 0.56 0.52 0.63 0.87 0.68 0.44
0.59 0.64 0.65 0.64 0.47 0.46 0.5 0.63 0.58 0.6 0.53 0.55 0.49 0.52 0.57 0.54 0.54 0.49 0.45 0.45 0.53 0.52 1.0 0.51 0.53 0.57 0.55 0.62 0.54 0.49
0.72 0.69 0.65 0.61 0.84 0.58 0.58 0.6 0.61 0.71 0.55 0.56 0.58 0.8 0.55 0.62 0.56 0.65 0.51 0.49 0.64 0.59 1.0 0.64 0.54 0.67 0.6 0.76 0.78 0.66
0.95 0.48 0.68 0.34 0.75 0.08 0.09 0.07 0.05 0.06 0.03 0.02 0.18 0.63 0.16 0.05 0.06 0.44 0.09 0.07 0.03 0.07 1.0 0.01 0.15 0.06 0.03 0.13 0.56 0.19
0.79 0.8 0.59 0.61 0.62 0.46 0.39 0.38 0.51 0.5 0.44 0.44 0.43 0.75 0.55 0.6 0.57 0.53 0.42 0.39 0.48 0.44 1.0 0.54 0.44 0.48 0.48 0.67 0.56 0.53
0.84 0.86 0.76 0.76 0.83 0.65 0.62 0.7 0.73 0.76 0.65 0.65 0.63 1.0 0.66 0.61 0.68 0.66 0.52 0.55 0.65 0.67 0.83 0.61 0.56 0.65 0.63 0.9 0.95 0.76
0.83 0.76 0.79 0.73 0.66 0.43 0.44 0.55 0.59 0.56 0.5 0.44 0.39 0.66 0.53 0.47 0.47 0.55 0.44 0.41 0.43 0.45 1.0 0.41 0.45 0.47 0.47 0.61 0.67 0.53
1.0 0.99 0.91 0.97 0.85 0.78 0.68 0.84 0.85 0.84 0.75 0.85 0.78 0.99 0.73 0.8 0.74 0.77 0.65 0.68 0.66 0.69 0.92 0.81 0.65 0.82 0.83 0.97 0.98 0.84
1.0 0.97 0.74 0.66 0.67 0.45 0.51 0.4 0.56 0.6 0.48 0.42 0.52 0.86 0.57 0.51 0.5 0.61 0.47 0.52 0.46 0.59 0.95 0.53 0.45 0.55 0.61 0.92 0.81 0.57
0.93 0.93 0.81 0.8 0.89 0.73 0.75 0.84 0.79 0.85 0.76 0.79 0.75 1.0 0.73 0.69 0.74 0.75 0.69 0.67 0.72 0.71 0.97 0.74 0.72 0.76 0.78 0.93 0.96 0.87
0.66 0.58 0.58 0.6 0.58 0.37 0.38 0.49 0.52 0.5 0.53 0.47 0.54 0.51 0.51 0.47 0.54 0.64 0.46 0.46 0.48 0.48 1.0 0.48 0.53 0.48 0.53 0.81 0.57 0.52
1.0 0.91 0.54 0.57 0.6 0.59 0.38 0.31 0.48 0.52 0.4 0.48 0.39 0.99 0.6 0.54 0.56 0.74 0.41 0.3 0.5 0.36 0.99 0.54 0.42 0.41 0.41 0.67 0.53 0.51
0.9 0.93 0.73 0.65 0.61 0.49 0.52 0.52 0.59 0.64 0.51 0.49 0.46 0.7 0.52 0.55 0.5 0.7 0.49 0.5 0.62 0.58 1.0 0.47 0.44 0.5 0.49 0.69 0.68 0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)