Heatmap: Cluster_136 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00090 (HIT3)	-0.02	0.04	0.02	-0.1	0.02	-0.06	0.03	-0.04	0.07	0.03	0.11	0.01	0.1	-0.15	0.08	0.11	0.23	-0.57	0.09	0.1	0.03	0.08	-0.29	-0.03	0.12	0.15	0.11	-0.03	-0.11	-0.4
Spov3_C0008.00090 (TRM21)	-	1.46	2.8	-	2.25	2.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.06	-	-	-	2.28	1.32
Spov3_C0025.00035	-0.16	-0.12	-0.18	-0.07	-0.11	-0.15	-0.0	0.27	-0.09	-0.04	0.03	-0.12	0.13	0.09	0.09	-0.13	0.05	-0.17	0.12	0.1	0.02	0.18	0.1	-0.06	0.08	0.16	0.26	-0.03	-0.21	-0.23
Spov3_C0033.00019 (MAN7)	-0.49	-0.23	-0.76	-1.04	0.54	-0.3	-0.25	-0.09	-0.41	0.3	-0.02	-0.15	0.33	0.47	0.03	0.0	-0.17	0.03	-0.1	-0.53	0.13	-0.03	0.22	0.31	0.17	0.18	0.35	0.2	0.53	-0.67
Spov3_C0062.00010 (AtHMP27)	-0.73	-1.1	-1.36	-1.02	1.07	0.68	0.36	-0.01	-0.6	0.26	0.05	-0.19	0.7	0.56	0.2	0.18	0.33	-0.96	0.31	-0.01	0.17	0.56	-0.76	-0.1	0.26	-0.0	0.32	-0.59	-1.27	-1.97
Spov3_chr1.00016 (DSA1)	0.01	-0.11	-0.09	-0.33	0.39	-0.14	-0.0	0.18	0.05	0.19	0.01	-0.2	-0.17	0.03	-0.2	-0.02	-0.19	-0.25	0.14	0.04	0.12	-0.01	0.15	0.07	-0.0	0.19	0.25	0.1	-0.01	-0.56
Spov3_chr1.01197	-1.08	-0.58	-	0.22	2.23	1.39	-	-	1.33	0.62	1.49	-0.75	-	1.66	0.36	0.46	-0.83	0.51	-	-	-1.02	-	-	-	0.55	1.4	-	-	-	-0.95
Spov3_chr1.01366	-0.42	-0.37	-0.63	-0.68	0.58	0.09	0.03	0.31	-0.53	-0.07	-0.03	-0.27	0.86	-0.33	-0.1	0.14	0.05	-0.11	-0.06	-0.0	-0.03	0.03	0.2	0.05	0.16	0.33	0.2	0.12	-0.35	-0.32
Spov3_chr1.01501 (GSDA)	-0.07	-0.1	-0.09	-0.51	0.87	-0.26	-0.13	-0.25	-0.31	-0.05	-0.01	-0.07	-0.04	0.17	0.15	0.09	0.09	-0.11	0.22	0.06	0.18	0.19	-0.18	0.06	0.4	0.27	0.25	-0.4	-0.47	-1.06
Spov3_chr1.01715 (RGR)	-0.09	0.03	-0.05	-0.04	0.28	-0.27	-0.26	0.1	-0.16	-0.04	-0.02	-0.25	0.2	-0.09	-0.01	-0.02	-0.09	0.13	0.03	-0.14	0.12	-0.01	0.11	0.05	0.15	-0.05	0.25	0.08	-0.03	-0.14
Spov3_chr1.01887	-0.32	-0.32	-0.14	-0.04	0.16	0.07	0.11	0.07	-0.08	-0.19	0.09	-0.09	0.2	0.2	0.25	0.24	0.28	-0.23	0.02	-0.09	0.06	-0.01	-0.01	-0.01	-0.02	0.04	0.09	-0.19	-0.31	-0.11
Spov3_chr1.02572	-1.78	-1.26	-0.79	-1.03	0.5	-0.65	-1.69	-0.52	-0.64	0.5	0.31	-0.14	1.38	-0.38	-0.31	-0.1	0.28	-0.32	0.22	0.46	0.19	0.4	0.34	0.32	0.72	0.08	0.77	-0.91	-0.44	-0.66
Spov3_chr1.02818	-	-0.95	0.49	-0.97	1.77	1.56	-1.21	-0.87	0.91	1.89	-	-	-0.93	-0.07	-0.13	-1.01	0.56	-0.2	0.43	-	-	-0.27	-	-	-1.2	1.99	-	-	0.57	0.4
Spov3_chr1.03744 (CAP1)	-0.34	-0.4	-0.21	0.02	0.09	0.01	0.17	0.12	-0.18	-0.15	0.05	-0.06	0.33	-0.34	0.29	0.27	0.34	-0.49	0.01	-0.05	0.07	0.1	-0.15	-0.03	0.11	0.03	0.25	-0.01	-0.22	-0.11
Spov3_chr1.04480 (SAUR67)	-0.12	-0.66	-0.09	-0.1	0.46	-0.36	-0.2	-0.52	0.39	0.43	0.35	0.15	0.3	-0.64	-0.13	0.26	0.09	-0.98	0.25	0.07	-0.1	0.36	-0.14	0.18	0.08	0.45	0.21	-0.19	-0.46	-0.79
Spov3_chr1.04550 (PIP3)	-0.73	-0.9	-0.6	0.13	-0.34	-0.33	0.16	0.3	0.19	0.06	0.44	0.04	0.63	-0.83	0.18	0.15	0.43	-0.56	0.31	-0.01	0.13	0.25	-0.56	-0.02	0.22	0.13	0.52	-0.4	-0.64	-0.08
Spov3_chr1.04580 (ATL17)	0.13	0.06	-0.1	-0.43	0.61	0.07	-0.04	-0.2	-0.11	0.07	-0.15	-0.09	-0.16	0.43	-0.23	0.11	-0.06	-0.07	0.1	-0.12	-0.09	0.01	-0.42	0.13	0.13	0.16	0.07	0.01	0.05	-0.36
Spov3_chr1.04621 (SLAH3)	-0.31	-0.17	-0.48	-0.62	0.57	-0.39	-0.14	-0.31	-0.04	0.16	0.04	-0.0	0.33	-0.0	0.16	0.11	0.2	0.07	0.21	0.04	0.27	0.18	-0.01	0.02	0.13	0.25	0.39	-0.43	-0.45	-0.72
Spov3_chr1.04776	-0.92	-0.84	-0.65	-0.64	0.34	-0.44	-0.4	0.15	-0.3	0.14	0.36	0.21	0.43	0.06	0.23	0.45	0.59	-0.73	-0.05	-0.02	0.22	0.15	0.14	0.17	0.31	0.23	0.39	-0.32	-0.76	-0.32
Spov3_chr1.05138 (GRF9)	-0.04	-0.1	0.01	-0.0	0.16	-0.0	0.02	0.11	-0.05	-0.05	0.04	-0.03	0.21	0.05	0.18	0.07	0.15	-0.33	-0.11	-0.07	-0.05	-0.04	0.29	-0.1	-0.03	-0.03	0.02	-0.05	-0.13	-0.28
Spov3_chr2.00268 (LOL1)	-1.16	-1.03	-0.48	-0.28	-0.6	-0.32	0.26	0.0	0.28	-0.09	0.4	0.25	0.28	-1.71	0.78	0.77	0.81	0.04	0.2	0.39	0.24	0.11	-0.39	0.09	0.32	0.28	0.25	-1.06	-1.19	-1.42
Spov3_chr2.00566 (ENODL8)	-1.43	-1.29	-0.34	0.28	0.24	-1.17	-0.79	-0.33	0.28	0.75	0.62	0.16	0.5	-1.36	-0.35	-0.06	-0.26	-0.08	0.55	0.24	0.54	0.21	-0.12	-0.26	0.4	0.48	0.98	-0.68	-1.09	-0.84
Spov3_chr2.00663 (GH9C2)	-0.52	-0.1	-0.71	-1.07	0.36	-0.69	-0.38	0.14	-0.31	0.17	-0.03	-0.16	0.72	0.53	0.24	0.3	-0.02	-0.47	-0.02	-0.13	0.19	0.01	0.55	0.11	0.11	0.33	0.32	-0.15	-0.15	-0.96
Spov3_chr2.00783	-0.13	-0.13	-0.22	-0.41	-0.55	0.29	0.6	0.27	-0.11	-0.17	0.14	0.25	0.22	-0.04	0.23	0.24	0.2	-0.53	-0.03	-0.12	0.02	0.09	0.04	0.05	0.03	-0.07	0.03	-0.09	-0.38	-0.45
Spov3_chr2.00886 (SCO4)	-0.15	-0.18	-0.14	-0.14	-0.22	0.08	0.23	0.23	-0.05	-0.17	0.09	0.07	0.21	0.4	0.18	0.18	0.11	-0.41	-0.07	-0.01	-0.08	0.05	0.02	0.04	0.06	-0.07	-0.12	-0.11	-0.14	-0.17
Spov3_chr2.01085 (UER1)	-0.36	-0.63	-0.39	-0.42	-0.18	-0.32	-0.12	0.14	-0.07	0.01	0.17	0.03	0.31	0.49	0.01	-0.03	0.07	0.12	0.07	0.08	0.21	0.08	0.21	-0.06	0.22	0.17	0.39	-0.21	-0.35	-0.33
Spov3_chr2.01230	-0.67	-0.62	-0.38	-0.3	-0.3	0.11	0.39	0.41	0.19	-0.04	0.3	0.3	0.14	-0.33	-0.0	0.08	0.18	0.04	0.05	0.31	0.07	0.14	-0.18	0.17	0.25	0.17	0.06	-0.33	-0.56	-0.61
Spov3_chr2.01283	-0.58	-0.59	-0.78	-0.98	0.6	0.24	0.22	-0.25	-0.21	0.05	0.02	0.07	0.02	0.17	0.51	0.33	0.34	-0.74	0.06	-0.05	0.29	0.26	-0.59	0.46	0.16	0.07	0.29	-0.01	-0.12	-1.11
Spov3_chr2.01345	-0.48	-0.4	-0.15	0.18	-0.2	-0.34	-0.11	0.45	0.05	-0.16	0.23	0.02	0.5	-0.63	0.29	0.26	0.3	-0.16	0.21	0.18	0.09	0.01	0.07	-0.18	0.16	-0.04	0.17	-0.41	-0.45	-0.31
Spov3_chr2.01980	-0.77	-0.31	-0.68	-0.68	0.26	-0.23	-0.17	0.18	-0.23	-0.18	0.08	0.12	0.63	0.29	0.22	0.16	0.21	-0.4	0.04	-0.02	0.08	0.09	-0.17	0.32	0.28	0.27	0.27	0.05	-0.18	-0.67
Spov3_chr2.02687 (ABD1)	0.1	-0.12	-0.17	-0.37	0.43	-0.15	-0.32	0.03	0.05	-0.03	0.02	-0.1	-0.16	0.27	0.01	-0.12	0.25	0.1	0.12	0.04	0.02	0.01	-0.1	-0.28	0.38	0.15	-0.09	-0.05	-0.08	-0.19
Spov3_chr2.02819 (APC3)	-0.06	0.02	-0.12	-0.2	-0.04	-0.11	0.13	0.47	-0.17	-0.16	-0.11	-0.08	0.18	0.22	0.18	0.03	0.06	-0.11	-0.05	0.03	-0.08	-0.05	0.17	0.02	0.1	-0.06	-0.05	-0.04	-0.19	-0.17
Spov3_chr2.03423 (HAE)	-0.52	-0.51	-0.43	-0.47	-0.65	-0.18	0.2	0.36	-0.02	-0.17	0.21	0.1	0.6	-0.01	0.45	0.29	0.27	-0.3	0.25	0.41	0.19	0.29	-0.46	0.23	0.25	0.08	-0.0	-0.34	-1.01	-0.58
Spov3_chr2.03633	-0.45	-0.46	0.05	0.29	-0.4	-0.4	-0.05	0.36	-0.02	-0.06	0.29	0.01	0.38	-0.42	0.22	0.26	0.52	-0.61	0.08	0.18	0.12	0.01	-0.22	-0.24	0.24	0.11	0.25	0.01	-0.61	-0.46
Spov3_chr2.04446	-0.6	-1.53	0.42	-0.1	0.42	0.55	0.28	0.18	-2.04	0.92	-0.84	-0.48	0.9	0.42	1.15	-0.67	1.22	1.32	-3.05	-1.22	-3.12	-0.47	-0.8	-0.82	-0.87	-0.23	-1.57	0.26	-1.59	0.57
Spov3_chr2.04523	-2.92	-1.5	-1.66	-0.18	0.69	-0.16	-0.28	0.71	-0.24	0.1	0.45	-0.17	1.41	-0.14	-0.11	0.35	0.39	-0.68	-0.29	-1.25	-0.87	-0.15	0.67	0.17	0.42	-1.1	-0.06	0.51	0.58	-1.36
Spov3_chr2.04642	-0.17	-0.26	-0.06	0.11	-0.06	-0.07	0.09	0.12	0.25	0.09	0.19	0.14	0.28	-0.64	-0.11	-0.06	-0.07	0.01	0.09	0.05	-0.02	-0.06	-0.01	-0.03	0.12	0.0	0.12	0.04	-0.05	-0.34
Spov3_chr2.04692 (ATH15)	-4.12	-2.85	-2.26	-2.91	1.79	0.02	-1.8	-2.76	-1.17	0.03	-0.49	-1.14	2.11	-1.64	-0.29	0.44	0.21	1.25	0.15	-1.06	-0.02	-0.99	1.77	-0.46	-0.12	0.58	0.36	-1.06	-3.58	-3.2
Spov3_chr2.04693	-	-3.54	-2.95	-3.87	2.05	-1.19	-2.44	-	-0.44	0.5	-1.16	-0.99	2.07	-2.23	-0.4	-0.77	0.11	0.4	0.13	-1.8	0.36	0.35	2.05	-1.07	0.79	1.02	-0.07	-1.25	-	-
Spov3_chr2.04995	-0.35	-0.27	-0.03	-0.09	-0.09	-0.11	0.05	0.39	-0.07	-0.15	0.14	0.02	0.11	-0.53	0.24	0.18	0.35	-0.24	-0.0	-0.05	0.09	0.05	-0.17	-0.08	0.1	0.14	0.24	-0.1	-0.18	0.0
Spov3_chr2.05070 (HSS)	0.42	0.21	0.45	0.66	-0.43	0.44	-1.0	-0.23	-0.59	-0.74	-0.21	-0.32	-0.17	0.43	-0.39	0.62	-0.31	0.64	-0.05	-0.51	-0.21	0.17	0.13	-0.19	-1.1	-0.85	-0.91	0.19	0.27	0.8
Spov3_chr2.05193 (XTH8)	-1.41	-1.43	0.04	0.69	0.57	-0.59	-0.64	-0.36	0.39	0.5	0.8	0.15	0.33	-2.36	-0.13	-0.31	-0.27	0.02	0.34	-0.2	0.2	-0.24	-0.04	-0.38	0.63	0.39	0.76	-0.26	-0.55	-0.94
Spov3_chr3.00045	-	-	1.87	0.84	1.78	2.17	-	0.92	-	-	-	-	-	-	-	1.86	0.86	-	-	0.5	-	-	-	-	-	-	0.43	-	1.78	1.64
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Spov3_chr5.00825 (VHA-A1)	-0.05	-0.16	-0.02	0.08	-0.2	-0.26	-0.02	-0.01	0.08	-0.0	0.09	0.15	0.29	-0.17	0.01	0.03	0.18	0.02	-0.01	0.07	0.1	0.16	0.16	0.04	0.07	0.01	0.1	-0.22	-0.38	-0.39
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Spov3_chr6.00909 (ATH11)	0.05	-0.42	-1.09	-2.05	-0.92	1.07	1.46	-0.09	-1.06	-1.18	0.0	0.11	0.6	-0.58	0.32	0.42	0.12	-1.87	-0.79	-0.12	-0.32	0.19	0.83	1.26	0.23	-0.67	-0.71	-0.2	-0.74	-0.87
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Spov3_chr6.01713	0.04	0.15	-0.41	-0.42	0.74	-0.01	-0.04	-0.22	-0.31	0.01	-0.14	-0.18	0.16	0.31	-0.12	-0.17	-0.05	-0.06	-0.11	-0.07	-0.06	-0.04	-0.14	0.27	0.26	-0.13	0.2	0.24	0.01	-0.32
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Spov3_chr6.03081 (ESV1)	-0.67	-0.92	-0.47	-0.1	-0.72	-0.09	1.5	0.77	-0.24	-0.68	0.41	0.03	0.18	-1.25	0.45	0.26	0.02	-1.1	-0.06	-0.04	-0.06	0.11	0.35	0.36	0.37	-0.23	0.01	-0.16	-0.76	-0.95
Spov3_S01.00055 (FD3)	-3.11	0.84	-1.03	-1.56	-0.29	0.45	0.05	-0.18	0.36	0.57	0.13	-2.1	-0.12	0.9	-0.01	0.49	0.19	1.55	-1.76	-0.07	-0.54	-0.08	-0.93	-1.03	-2.17	0.66	-0.36	-1.88	0.49	0.74
Spov3_S04.00025 (PEX3)	-0.14	-0.18	0.05	0.25	-0.06	0.01	0.12	0.54	0.07	-0.12	-0.0	0.14	0.13	-0.6	0.1	0.17	0.36	-0.44	-0.18	-0.14	0.01	0.0	-0.31	-0.14	-0.09	0.06	0.17	-0.13	-0.24	0.08
Spov3_S11.00009 (ZRF1a)	-1.29	-1.5	-0.61	-0.22	0.67	-0.49	-0.73	-0.67	0.18	0.36	0.35	-0.03	1.0	0.48	0.06	0.01	-0.0	-1.05	0.15	0.05	0.08	-0.1	0.88	0.03	0.45	0.28	0.61	-0.73	-1.05	-1.28
Spov3_S12.00013 (FL8)	-0.02	0.02	0.93	1.06	-0.3	-0.41	0.78	0.32	-0.24	-0.98	-0.02	-1.23	-0.38	-0.01	-1.23	-0.6	-1.22	0.22	-0.56	-0.12	-1.37	-0.04	-0.88	-1.31	-0.69	-0.88	0.17	0.87	0.94	1.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.