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Heatmap: Cluster_50 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.61 0.15 0.11 1.27 0.01 -1.71 -1.26 -0.46 -0.83 0.2 -0.57 -0.74 1.28 -2.03 -1.74 -1.57 -1.51 0.99 -0.16 -0.65 -0.28 0.42 0.6 -0.25 0.37 0.03 0.55 1.04 0.19 -0.66
-0.16 0.21 0.33 0.86 0.38 -0.83 -0.86 -0.57 -0.44 0.39 -0.32 -0.45 0.62 -0.86 -0.73 -0.7 -0.5 0.46 -0.11 -0.52 -0.0 -0.07 0.23 -0.19 0.13 0.07 0.48 0.74 0.29 -0.36
-0.2 -0.14 0.28 0.74 -0.09 -0.93 -0.84 -0.37 -0.51 0.07 -0.13 -0.3 0.7 -0.66 -0.41 -0.42 -0.41 0.9 0.11 0.01 0.31 0.14 0.37 -0.36 0.31 0.02 0.49 0.08 -0.3 -0.6
-0.76 -0.35 -0.13 0.54 -0.1 -1.62 -1.12 -0.4 -0.62 0.03 -0.26 -0.82 1.33 -1.69 -0.95 -0.86 -0.69 1.52 0.06 -0.84 -0.36 -0.05 0.97 0.04 0.1 -0.18 0.52 0.89 0.02 -0.43
-0.73 0.15 -0.07 0.83 0.27 -2.46 -1.65 -0.45 -1.01 0.29 -0.57 -0.91 1.34 -2.1 -2.0 -1.66 -1.47 1.14 0.01 -0.59 -0.24 0.01 0.72 -0.03 0.28 -0.04 0.88 1.21 0.36 -0.94
-0.98 0.12 0.02 0.46 0.91 -1.22 -0.92 -0.9 -1.35 0.51 -0.69 -0.61 1.26 -1.03 -1.48 -1.32 -1.13 1.09 0.04 -0.93 0.01 0.28 0.52 -0.06 0.4 -0.12 0.86 0.83 -0.25 -1.09
-0.51 0.29 0.04 0.63 0.5 -1.26 -1.18 -1.01 -0.61 0.59 -0.52 -0.5 0.99 -1.06 -1.12 -1.07 -0.78 0.7 0.06 -0.54 -0.04 0.1 0.59 0.11 0.23 -0.14 0.56 1.01 0.12 -0.88
-0.1 0.03 -0.1 0.43 0.36 -1.06 -0.76 -0.48 -0.73 0.04 -0.14 -0.72 1.26 -0.81 -0.52 -0.64 -0.47 1.07 -0.51 -0.51 -0.15 -0.09 0.8 -0.21 0.19 -0.15 0.17 0.65 -0.09 -0.18
-0.32 0.34 0.14 1.18 0.46 -1.43 -2.15 -1.53 -1.23 0.41 -0.87 -1.11 1.23 -1.27 -1.39 -1.04 -1.11 0.93 0.16 -0.99 -0.14 -0.2 0.45 0.21 0.27 -0.27 0.58 1.21 0.37 -1.25
-4.27 -0.2 -0.22 1.61 -1.12 - -5.73 -0.78 -2.32 -0.57 -1.0 -1.97 1.89 -5.85 -4.9 -2.59 -1.73 1.91 -0.04 -0.31 0.27 0.3 1.47 -0.01 0.78 -0.4 0.92 0.37 -0.76 -1.97
Spov3_chr1.00248 (CYCB1;4)
 -0.63 -0.08 -0.03 0.36 0.73 -1.48 -1.42 -0.8 -0.95 0.21 -0.58 -0.84 1.08 -1.35 -1.56 -1.74 -1.09 1.38 -0.11 -0.72 -0.04 0.05 0.88 -0.1 0.14 -0.01 0.96 1.13 0.06 -1.03
0.44 0.28 0.28 1.1 0.39 -1.14 -1.04 -0.76 -0.38 0.37 -0.37 -0.38 0.76 -1.96 -1.27 -1.03 -0.85 0.83 -0.13 -0.4 -0.2 -0.16 0.17 -0.02 0.16 -0.35 0.25 0.95 0.36 -0.8
-0.88 -0.33 -0.64 0.57 0.48 -0.8 -1.06 -1.07 -0.91 0.06 -1.13 -0.88 1.55 -1.44 -1.22 -1.42 -1.55 1.51 0.61 -0.16 0.18 0.57 0.66 -0.06 0.16 -0.22 0.57 0.7 -0.55 -1.36
-1.06 0.12 -0.08 0.57 0.27 -1.15 -0.84 -0.56 -0.9 0.38 -0.45 -0.54 1.27 -2.22 -1.07 -1.13 -0.54 0.81 -0.04 -0.71 -0.46 0.09 0.59 0.26 0.4 -0.08 0.57 1.27 0.16 -1.01
0.31 0.2 0.63 0.87 -0.04 -1.15 -0.69 -0.5 -0.39 0.29 -0.15 -0.23 0.78 -3.07 -1.33 -1.15 -0.75 0.25 0.21 -0.11 0.15 0.18 0.23 -0.33 0.4 0.01 0.61 0.63 0.07 -0.89
-0.96 0.24 -0.43 0.46 0.57 -0.85 -1.3 -1.28 -0.79 0.47 -0.57 -0.79 1.26 -1.31 -2.14 -0.84 -1.12 1.55 -0.17 -0.84 -0.34 -0.13 0.82 0.08 0.27 -0.2 0.26 0.92 0.27 -0.32
Spov3_chr1.02489 (CYCD3;3)
 -0.51 0.12 -0.05 0.68 0.26 -1.54 -1.18 -0.09 -0.6 0.38 -0.46 -0.7 1.28 -1.77 -1.31 -1.16 -0.84 1.33 -0.12 -0.44 -0.22 -0.05 0.57 -0.02 0.0 -0.29 0.38 0.78 0.13 -0.21
-0.55 -0.23 0.16 0.68 0.39 -0.95 -0.59 -0.58 -0.41 0.23 -0.29 -0.34 0.79 -0.86 -0.45 -0.45 -0.64 0.82 -0.08 -0.76 -0.06 0.11 0.84 -0.24 0.16 0.11 0.46 0.38 -0.01 -0.27
-0.39 0.22 -0.02 0.83 0.08 -1.21 -0.92 -0.98 -0.65 0.34 -0.49 -0.34 0.85 -0.41 -0.91 -0.65 -0.62 0.74 0.0 -0.31 -0.08 0.17 -0.0 0.17 0.23 -0.25 0.59 0.85 0.25 -0.27
-0.39 -0.15 -0.39 0.2 -0.1 -1.27 -1.13 -0.42 -0.8 0.3 -0.36 -0.91 0.94 -0.16 -0.58 -0.5 -0.4 1.52 -0.09 -0.5 0.04 -0.04 0.35 0.03 0.23 0.04 0.28 0.6 -0.11 0.19
-1.0 0.07 -0.02 1.06 0.26 -1.47 -1.54 -0.89 -1.19 0.39 -0.81 -1.29 1.48 -1.4 -1.87 -1.46 -1.38 0.99 0.08 -0.49 -0.15 0.16 0.58 0.01 0.24 -0.07 0.79 1.16 0.16 -0.93
-0.08 0.04 0.22 0.44 0.16 -0.73 -0.39 -0.05 -0.15 0.38 -0.05 -0.11 0.57 -0.87 -0.7 -0.46 -0.35 0.56 0.0 -0.21 0.07 0.03 0.48 -0.27 0.18 -0.05 0.37 0.3 -0.09 -0.72
-0.57 0.4 0.12 0.34 0.58 -1.05 -1.35 -1.07 -0.91 0.42 -0.42 -0.87 0.97 -1.36 -1.74 -1.2 -1.15 0.73 0.26 -0.67 0.15 0.35 0.6 0.09 0.27 0.02 0.41 1.32 0.25 -1.29
-0.88 -0.0 0.03 0.68 -0.59 -1.84 -2.18 -0.98 -0.62 0.18 -0.87 -0.5 1.51 -3.0 -2.2 -1.3 -0.94 1.96 -0.42 -1.07 -0.09 0.33 0.73 0.1 0.22 -0.29 0.48 0.95 0.08 -0.79
-0.98 0.1 0.04 0.54 0.61 -1.92 -1.27 -1.36 -1.47 0.31 -1.26 -0.79 1.34 -2.1 -1.28 -1.5 -1.5 1.05 0.56 -0.22 0.16 0.2 0.83 0.3 0.29 -0.6 0.68 1.2 -0.18 -0.91
0.01 0.04 -0.15 0.32 0.21 -0.6 -0.42 -0.23 -0.41 0.17 -0.36 -0.34 0.85 -0.68 -0.58 -0.23 -0.14 0.43 0.09 -0.2 0.05 0.04 -0.22 -0.16 0.32 -0.05 0.56 0.53 -0.03 -0.17
-0.5 -0.15 0.44 1.06 0.31 -1.98 -1.62 -0.74 -0.51 0.39 -0.09 -0.74 0.99 -2.52 -1.84 -1.15 -1.0 0.76 0.3 -0.13 0.05 0.16 0.31 0.21 0.48 -0.07 0.79 0.79 -0.14 -1.0
-0.28 0.15 -0.2 0.75 0.5 -1.11 -0.96 -0.61 -0.67 0.4 -0.57 -0.62 0.83 -0.9 -1.13 -1.19 -0.89 0.72 0.07 -0.41 0.05 0.11 0.45 0.08 0.18 -0.11 0.53 0.97 0.32 -0.42
Spov3_chr1.04971 (CYCB1;4)
 -0.23 0.2 -0.2 0.39 0.33 -0.74 -0.51 -1.03 -0.6 0.27 -0.32 -0.11 0.89 -0.59 -1.02 -0.69 -0.96 0.75 -0.01 -0.25 -0.1 -0.1 0.24 0.17 0.21 -0.06 0.43 0.84 0.5 -0.59
-0.28 0.18 -0.08 0.65 0.58 -0.93 -1.28 -0.72 -1.19 0.12 -0.5 -0.68 1.27 -0.98 -1.38 -0.82 -1.22 0.92 -0.35 -0.51 -0.09 0.03 0.59 -0.03 0.25 -0.06 0.56 0.81 0.36 -0.28
-1.06 0.24 -0.48 0.05 1.06 -1.83 -1.77 -0.9 -0.77 0.52 -0.86 -0.93 0.95 -1.35 -1.63 -0.96 -0.95 1.38 0.04 -0.53 -0.37 0.01 1.01 0.18 0.24 -0.19 0.69 1.2 0.02 -1.34
0.28 0.22 0.53 0.79 0.3 -1.31 -0.88 -0.77 -0.49 0.38 -0.24 -0.31 0.59 -2.8 -1.29 -1.1 -1.07 0.74 0.22 -0.2 0.22 0.14 0.37 -0.19 0.42 -0.1 0.54 0.63 0.13 -1.02
0.14 0.12 0.53 0.74 0.25 -1.35 -0.82 -0.85 -0.28 0.47 -0.1 -0.2 0.67 -3.31 -1.19 -1.16 -0.82 0.56 0.27 -0.03 0.23 0.22 0.28 -0.14 0.6 0.01 0.49 0.46 0.04 -1.42
0.04 0.06 0.39 0.89 0.35 -1.33 -0.91 -0.77 -0.53 0.4 -0.08 -0.11 0.87 -2.96 -1.39 -0.97 -0.75 0.61 0.15 -0.11 0.28 0.2 0.28 -0.26 0.57 -0.12 0.52 0.45 0.02 -1.17
0.16 0.11 0.59 0.96 0.38 -1.3 -1.03 -0.75 -0.33 0.5 -0.37 -0.38 0.62 -3.34 -1.5 -1.25 -1.13 0.53 0.28 -0.24 0.23 0.06 0.33 -0.31 0.57 0.04 0.75 0.48 0.16 -1.12
Spov3_chr2.01006 (3xHMG-box1)
 -1.02 -0.04 -0.13 0.8 0.43 -1.77 -1.75 -0.85 -1.17 0.14 -0.93 -0.88 1.58 -1.63 -1.87 -1.41 -1.42 1.45 -0.06 -0.7 0.06 0.08 0.89 -0.02 0.23 -0.34 0.54 1.14 0.07 -0.98
-0.17 0.32 -0.25 0.95 0.12 -1.7 -1.99 -1.13 -0.84 -0.11 -1.06 -1.25 1.57 -1.86 -1.08 -1.69 -0.96 1.76 -0.51 -0.68 -0.02 0.05 0.88 -0.35 -0.14 -0.05 0.38 0.92 -0.39 -0.2
-0.4 0.16 -0.38 0.16 0.66 -0.93 -1.11 -0.64 -0.57 0.41 -0.39 -0.45 1.4 -0.53 -0.88 -0.76 -0.63 1.19 -0.28 -0.65 -0.33 -0.17 0.76 0.11 -0.03 -0.15 0.18 0.58 0.1 -0.69
-0.9 0.13 -0.15 1.06 0.55 -1.62 -1.68 -1.31 -1.23 0.38 -0.57 -0.83 1.36 -1.97 -1.83 -1.29 -1.28 1.05 -0.09 -0.64 0.05 0.15 0.69 0.09 0.2 -0.15 0.72 1.16 0.16 -1.09
-0.07 0.08 0.54 1.02 -0.0 -1.25 -1.04 -0.67 -0.31 0.4 -0.23 -0.33 0.84 -2.0 -1.45 -1.02 -1.03 0.72 0.03 -0.38 0.22 0.04 0.43 -0.19 0.31 0.01 0.63 0.6 0.06 -0.77
-1.23 -0.1 -0.24 0.83 0.4 -1.62 -2.64 -1.18 -1.52 0.77 -0.88 -0.77 1.35 -3.6 -1.4 -1.78 -1.86 1.34 0.15 -0.39 -0.56 0.37 0.58 0.1 0.64 0.28 0.65 1.19 0.0 -1.15
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0.03 0.16 0.54 0.98 -0.04 -1.56 -1.29 -1.01 -0.34 0.34 -0.04 -0.21 0.92 -1.91 -1.3 -1.22 -0.9 0.66 0.06 -0.29 0.04 0.08 0.58 -0.27 0.34 -0.03 0.53 0.75 0.08 -0.93
-0.62 -0.19 -0.04 0.7 0.6 -1.09 -1.16 -0.56 -0.72 0.38 0.02 -0.33 1.09 -0.87 -1.2 -0.95 -0.79 0.69 0.05 -0.39 -0.13 0.19 0.33 -0.17 0.4 -0.14 0.59 1.02 -0.01 -1.06
0.24 0.28 0.57 1.01 0.31 -1.33 -0.97 -0.8 -0.5 0.37 -0.27 -0.5 0.7 -2.67 -1.69 -1.15 -1.23 0.59 0.1 -0.44 0.16 0.22 0.37 -0.03 0.61 -0.24 0.67 0.64 0.15 -1.39
-0.61 -0.06 -0.25 0.39 0.56 -0.69 -0.99 -0.1 -0.34 0.32 -0.26 -0.26 0.81 -0.56 -0.66 -0.7 -0.44 0.68 0.03 -0.45 -0.17 -0.13 0.23 0.11 0.12 -0.07 0.36 0.62 0.32 0.09
-0.87 0.15 -0.13 0.63 0.71 -1.58 -1.67 -1.53 -1.29 0.29 -0.87 -0.96 1.55 -1.71 -1.6 -1.65 -1.55 1.53 -0.21 -0.74 -0.25 0.13 0.82 -0.15 0.3 -0.19 0.73 1.17 -0.06 -1.3
-0.29 0.14 -0.16 0.78 0.09 -1.0 -0.85 -0.69 -0.56 0.34 -0.36 -0.68 1.15 -0.67 -0.89 -0.55 -0.69 0.83 -0.03 -0.4 -0.2 -0.03 0.42 -0.06 0.26 -0.07 0.45 0.78 0.27 -0.73
-0.8 0.07 0.03 1.05 0.29 -1.91 -1.51 -0.87 -0.66 0.43 -0.43 -0.61 1.27 -1.76 -1.45 -1.75 -1.07 0.92 0.01 -0.6 0.04 0.17 0.56 -0.04 0.24 -0.27 0.73 1.07 0.03 -0.46
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-0.58 0.02 0.48 1.4 -0.25 -2.2 -1.63 -0.37 -0.64 0.1 -0.36 -0.61 1.24 -3.91 -1.82 -1.37 -1.34 0.83 -0.1 -0.35 0.01 0.29 0.71 -0.2 0.43 -0.01 0.72 0.8 -0.05 -0.78
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0.47 0.36 0.55 0.94 0.07 -1.36 -0.83 -0.62 -0.23 0.45 -0.17 -0.17 0.39 -2.01 -1.35 -1.11 -0.88 0.54 -0.03 -0.36 0.0 -0.03 0.55 -0.34 0.2 -0.09 0.46 0.81 0.24 -0.97
-0.65 0.15 -0.03 0.61 0.18 -1.05 -0.94 -0.5 -1.04 0.5 -0.43 -0.39 0.86 -1.33 -1.09 -0.9 -0.9 1.1 0.3 -0.52 0.15 0.02 0.93 0.02 0.07 -0.5 0.49 0.92 -0.16 -0.6
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-0.81 -0.09 -0.08 0.94 0.09 -2.16 -1.67 -1.0 -1.75 -0.01 -0.43 -0.9 1.68 -1.18 -1.78 -1.12 -2.09 1.31 -0.03 -0.54 -0.19 0.37 0.85 0.21 0.24 -0.6 0.34 1.31 0.07 -1.19
Spov3_chr6.01643 (CDKB1;2)
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Spov3_chr6.02995 (CYCB2;3)
 -0.78 0.18 -0.08 0.73 0.49 -1.76 -1.8 -1.26 -0.9 0.41 -0.62 -0.85 1.5 -0.99 -1.72 -1.19 -1.24 1.25 -0.19 -1.03 0.0 -0.12 0.45 0.15 0.44 -0.47 0.95 0.93 0.27 -1.18
Spov3_chr6.03137 (CYCA1;1)
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Spov3_S06.00055 (CDKB2;1)
 -0.85 -0.06 -0.1 0.81 0.32 -2.02 -1.95 -0.9 -1.24 0.5 -0.63 -0.71 1.4 -1.95 -1.79 -1.13 -1.31 1.11 0.08 -0.58 0.04 0.31 0.74 0.07 0.27 -0.15 0.67 1.16 0.16 -1.1
-0.49 -0.13 -0.02 0.85 -0.4 -0.99 -0.63 0.19 -0.46 0.22 -0.31 -0.58 1.29 -1.2 -0.92 -0.9 -0.8 1.09 -0.04 -0.21 -0.12 -0.13 0.37 -0.06 0.03 -0.1 0.46 0.35 -0.13 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.