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Heatmap: Cluster_72 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.61 0.35 0.1 -0.16 0.19 -0.33 0.14 -0.73 -0.31 -0.55 -0.19 -0.13 -1.06 0.66 -0.02 0.27 -0.18 0.01 -0.43 -0.82 -0.43 0.05 -0.16 0.01 0.25 0.19 -0.26 0.77 0.19 0.24
0.38 0.43 0.21 0.53 0.73 -0.1 -0.37 -0.42 -0.5 -0.9 -0.44 -0.19 -0.08 -0.31 -0.51 0.19 -0.29 0.19 -0.15 -0.47 0.18 0.27 0.22 0.16 0.27 -0.11 0.11 0.14 -0.12 -0.39
-0.56 -0.54 - - 0.59 1.18 0.09 -0.54 1.19 -0.76 - - - - - 1.93 -0.65 1.1 -0.78 -0.01 1.25 0.61 - -0.54 - 1.06 -0.87 -0.43 1.49 0.37
0.9 0.54 0.0 0.55 0.31 0.3 0.12 0.55 -0.08 -0.19 -0.65 -0.52 -0.41 0.38 -0.61 1.03 0.0 0.1 -1.15 -0.63 -1.44 0.22 -0.86 -1.13 -0.08 -0.53 -0.16 0.49 -0.09 -0.58
-0.92 -0.17 -0.35 0.04 0.67 0.61 0.09 -0.29 0.96 -0.67 -1.58 0.44 0.01 0.46 -0.21 -1.08 - -0.04 0.83 0.18 -1.08 -1.21 1.03 -0.11 -0.15 -0.77 1.15 -1.56 0.02 -0.08
0.6 - -1.46 1.74 -0.61 - -0.18 -1.69 1.7 0.12 -1.38 -0.1 -0.49 0.38 -1.72 1.53 -0.45 0.57 0.14 -0.71 - 0.36 - -1.67 -1.55 - -0.13 0.67 0.88 0.89
0.6 -1.34 0.57 -1.46 2.16 0.31 0.03 0.49 -0.62 - 1.72 -0.67 0.1 -0.44 0.36 0.56 - - - -0.84 - 0.37 - - -1.74 1.1 -0.59 0.66 0.14 0.38
0.72 -0.08 -1.44 -0.0 0.32 0.85 -0.02 0.1 -0.26 -0.6 -0.0 0.51 -0.2 0.07 - 0.94 -1.55 0.3 0.54 0.78 -0.98 -1.88 -2.62 -0.07 -0.49 -0.63 0.35 0.95 0.99 -
0.03 0.37 -0.74 0.56 0.24 0.23 0.77 0.34 0.29 -0.71 -0.15 -0.03 -1.11 0.67 -1.74 0.43 -0.25 0.18 0.15 -0.09 -0.8 -0.89 -0.56 -0.09 0.05 0.37 -0.08 0.48 0.1 -1.39
- - 2.51 - - - - - - - - - - 3.36 - - - - 0.76 - - - - - 1.84 1.72 - 0.92 1.85 -
0.27 0.4 -0.16 -0.58 1.19 1.35 0.46 1.25 -1.19 0.77 -0.35 -1.13 0.63 -0.04 -2.15 -0.49 -0.11 - -1.13 -0.63 -2.09 -0.66 -1.23 -1.23 -1.11 0.72 -0.18 1.57 -0.36 -
1.54 0.81 - - - 1.09 1.24 - - - - -0.39 - 0.43 - 0.63 0.54 - 2.5 0.93 - - 2.09 - - -0.47 -0.28 - - 1.24
-1.83 1.37 0.87 0.79 0.92 1.03 -2.41 0.49 -1.17 -0.05 -1.4 0.3 -2.71 1.05 0.66 -0.68 -0.8 0.24 0.0 -2.86 -0.74 -1.75 -0.08 -2.59 -1.77 -1.82 -2.13 0.59 1.17 0.2
0.48 0.49 0.28 -0.29 0.73 -0.06 0.33 -0.07 -0.32 -0.5 -0.39 -0.55 -0.41 0.21 -0.92 0.38 -0.4 -0.3 0.35 -0.12 -0.58 0.03 -0.6 -0.05 0.3 0.08 -0.11 0.52 0.03 -0.16
0.03 0.26 -0.36 0.29 0.1 -0.24 0.18 0.24 0.06 -0.1 0.13 0.23 0.22 -0.5 -0.27 -0.35 -0.05 -0.99 0.2 -0.31 0.17 -0.1 -0.33 -0.13 0.25 0.07 0.31 -0.13 -0.07 0.35
- -0.03 - -0.24 -0.35 -1.41 1.6 -1.35 0.77 0.06 0.28 0.86 -0.92 1.9 0.51 0.38 0.19 1.11 1.48 - -0.46 0.21 0.34 - 0.34 - -1.61 - - -
0.02 -0.12 0.04 0.64 0.12 -0.15 -0.31 -0.21 0.14 -0.12 0.04 0.09 0.09 0.25 0.08 -0.15 0.41 0.01 -0.24 -0.47 -0.63 0.11 -0.3 0.08 -0.05 -0.2 0.33 -0.07 0.38 -0.63
0.54 0.91 -0.1 -0.23 -0.07 0.24 -0.39 0.09 -0.39 -0.42 -0.92 -0.48 -1.17 0.39 0.01 -0.45 -1.09 0.7 0.41 -0.22 -0.58 -1.52 -0.67 -0.05 -0.54 -0.06 0.41 0.55 0.58 0.87
-0.96 -0.02 -0.06 -0.29 -0.37 0.21 0.2 0.19 -0.51 0.18 -0.19 -0.17 -0.0 -0.32 -0.18 0.48 -0.01 0.56 -0.34 0.85 -0.14 0.07 -0.12 0.49 0.19 0.14 -0.71 0.14 -0.42 -0.36
-0.2 0.3 -0.42 0.04 0.25 0.84 0.39 0.78 0.24 -0.18 0.24 0.1 0.46 0.45 -0.24 0.37 -0.94 -1.68 -0.34 -0.45 -0.29 0.93 -1.83 -0.7 -1.36 -0.05 0.51 0.02 -0.84 -0.76
- 0.48 - - 1.16 - - 0.3 - - 0.26 - 1.9 0.13 0.13 - 1.16 1.65 2.19 - 0.84 - - - - - 1.91 - - 1.35
- 1.81 - - 1.44 - 1.55 2.55 - 1.67 - - - - 1.5 - - - - - - 2.67 - - - - 1.39 - - -
-0.16 -0.79 -1.16 -0.44 1.03 -0.2 0.77 0.64 -0.11 -0.92 0.48 -0.99 -0.17 0.59 0.97 0.55 0.16 0.47 -0.58 -1.93 -0.84 1.55 -0.56 -0.54 -0.51 0.3 -0.84 -2.0 -1.57 -0.66
-0.47 0.57 -1.68 -0.01 0.6 -0.19 0.18 -0.6 -0.12 0.1 -1.11 -0.09 0.59 0.65 -0.84 0.6 0.24 -0.1 -0.77 -1.0 0.01 0.36 -0.05 0.08 0.67 -0.4 0.0 0.05 -0.28 0.04
0.43 -0.54 1.61 0.07 -1.72 0.58 -1.85 0.11 - 0.69 0.5 0.28 -0.55 1.61 -1.78 1.04 -1.59 0.63 -0.51 -0.34 - - -0.74 -1.49 0.15 0.06 0.94 - -0.03 -0.03
0.69 -0.42 -0.53 -0.66 -1.18 -0.66 -0.46 -1.46 0.14 -0.27 0.16 -1.44 0.37 0.24 -0.49 0.36 -1.95 0.5 -0.59 0.51 -0.69 1.45 0.27 0.64 0.96 0.15 0.81 -0.01 -0.74 -
0.7 -1.95 -0.45 -2.23 -0.43 -0.76 0.31 -0.64 -0.36 -0.15 -0.76 0.84 1.06 - -1.27 -0.48 -1.02 0.34 1.9 -2.35 0.87 -1.36 -0.07 0.54 0.69 0.54 -0.64 -0.52 -1.18 0.61
0.7 -1.95 -0.45 -2.23 -0.43 -0.76 0.31 -0.64 -0.36 -0.15 -0.76 0.84 1.06 - -1.27 -0.48 -1.02 0.34 1.9 -2.35 0.87 -1.36 -0.07 0.54 0.69 0.54 -0.64 -0.52 -1.18 0.61
-0.26 0.74 -2.36 -1.22 0.45 0.61 -0.04 0.05 -0.34 0.19 0.06 -0.63 -0.75 -3.52 -2.65 1.1 -0.27 0.22 -0.05 -0.11 -3.79 -0.62 1.33 1.35 0.21 0.67 -0.12 0.56 -1.35 -2.61
0.26 - - 0.01 0.87 2.07 -0.27 1.54 - -0.1 1.08 - - - - 1.63 - - -0.12 - 1.5 0.7 0.99 - -0.05 -0.05 0.68 - -0.0 -
-0.59 0.04 0.49 -0.39 -0.14 -0.1 -0.24 -0.64 0.2 0.07 0.34 0.23 -1.42 0.35 -0.53 -0.54 0.8 -1.11 0.52 0.02 0.36 -0.26 -0.33 -0.24 -0.16 0.38 1.26 -0.2 -0.6 -0.71
0.16 0.11 -0.1 0.07 0.28 0.33 0.11 0.01 -0.36 0.12 0.02 -0.24 -0.27 -0.6 0.19 -0.21 -0.34 -0.43 0.01 0.03 0.13 -0.23 0.16 0.43 -0.09 0.09 0.04 0.1 0.19 -0.27
-0.03 0.06 -0.18 -0.07 0.18 0.29 0.39 0.31 -0.18 -0.16 -0.08 0.04 -0.15 0.04 0.07 0.01 0.06 -0.28 -0.31 -0.24 0.24 -0.05 -0.05 0.24 0.05 -0.1 -0.07 0.07 -0.13 -0.29
-0.53 -0.74 0.57 -0.38 -0.44 -0.15 -0.46 0.08 0.08 -0.44 0.38 -0.78 -0.16 0.53 -0.35 -1.06 -0.3 0.76 0.01 -0.24 -0.36 0.61 -1.1 0.34 -0.01 -0.36 0.66 -0.05 0.9 0.25
0.29 0.32 -0.09 -0.07 0.16 -0.77 -0.31 0.39 -0.33 0.19 -0.13 -0.18 0.49 -0.03 -0.43 -0.41 -0.31 0.29 -0.09 -0.05 -0.0 -0.06 -0.64 0.2 0.12 0.15 0.19 0.1 0.0 0.14
0.38 -0.39 -1.17 -0.17 0.12 -0.02 -0.08 -1.9 -1.14 -0.64 0.38 -0.26 0.86 -2.99 0.55 0.85 -0.27 1.3 0.23 -0.26 0.4 -0.38 0.52 0.11 -1.63 0.09 0.84 -0.35 -2.07 -0.38
0.16 0.94 -0.62 -0.03 -0.16 -0.3 0.09 -0.72 -0.33 0.23 0.08 -0.42 0.16 1.0 -1.18 -1.18 -0.54 -1.43 -1.07 -0.22 0.6 0.06 0.56 0.16 -0.42 0.28 0.58 0.16 -0.09 0.18
-0.39 0.99 -0.53 0.38 -0.13 0.08 0.22 0.25 -1.42 -1.66 -2.55 0.93 -1.61 0.33 0.19 -2.64 0.07 1.09 1.13 -0.85 0.79 -2.75 1.36 -0.95 -1.1 -2.2 -0.3 -1.77 0.38 0.37
0.65 -0.78 -1.82 2.08 0.07 -0.03 - -0.41 - 0.33 0.09 - -0.74 1.18 1.22 -0.57 1.44 -1.06 - 1.17 - 0.24 1.46 -1.03 -1.91 - - 0.44 -0.65 -1.97
0.15 - 1.3 -0.06 0.84 -0.14 - -0.83 - -0.31 1.45 0.68 0.66 - - - - 0.91 1.45 - - 0.73 1.05 - -0.0 - -0.93 -0.71 0.78 1.72
0.54 0.48 0.43 0.26 0.18 0.11 0.06 0.24 -0.14 -0.44 -0.43 -0.9 -0.83 0.29 -0.51 -0.45 -0.45 0.42 0.22 -0.63 -0.44 -0.18 -0.54 -0.3 -0.02 -0.05 -0.14 0.59 0.37 0.44
1.09 0.11 1.98 1.44 0.14 -1.7 -1.6 1.05 0.2 - -1.33 -1.6 - - - 0.52 -0.4 -0.73 0.39 -0.08 - -0.75 - 0.68 1.48 - 0.45 -0.42 0.77 -0.75
-1.13 0.71 -1.96 -1.76 -1.85 -0.41 -0.42 1.3 -0.21 0.54 - - 0.94 - 0.02 1.07 1.73 -2.04 -1.71 0.87 - 0.87 0.6 0.57 1.08 -1.97 -0.78 - -0.63 0.72
-0.08 -0.19 0.25 0.15 -0.21 -0.29 -0.06 -0.65 -0.12 -0.16 -1.56 0.33 -1.8 0.32 0.28 0.25 0.64 -0.56 -0.87 -0.29 0.26 -0.21 0.74 0.21 -0.37 0.31 -0.42 0.1 1.04 -0.19
0.64 0.51 -6.94 -3.13 -1.84 -3.06 -0.26 1.62 0.57 0.97 -1.43 1.08 -4.96 0.92 0.99 -0.42 - - 1.0 0.97 -0.58 - 1.49 -0.39 -0.62 - 0.86 - -1.08 -0.2
0.17 -0.58 -2.5 -0.35 0.64 1.58 0.21 0.49 0.88 0.37 -0.24 -0.07 0.54 0.43 0.08 -0.03 0.64 -0.3 -2.45 -1.54 -3.41 -1.31 -0.28 0.5 -0.45 -0.69 -1.88 0.06 -0.24 0.28
0.2 0.43 -0.07 0.15 0.32 -0.17 -0.13 -0.25 0.25 0.34 -0.01 -0.1 -0.27 0.33 -0.16 0.29 -0.03 -0.26 -0.57 0.04 -0.08 -0.27 -0.38 0.2 -0.03 -0.04 -0.12 0.04 0.02 -0.27
-0.32 -2.65 0.19 0.94 -0.59 -0.79 1.25 -1.64 -1.71 0.58 0.23 0.4 -2.63 -2.83 0.19 0.45 -1.09 0.68 0.72 0.45 0.54 0.08 -1.21 0.76 0.68 0.46 -0.43 0.04 -1.7 -2.69
0.32 -1.65 0.02 -0.82 0.41 -1.36 1.01 -2.7 1.04 - 0.24 -0.09 -0.15 0.11 -1.79 0.12 -0.93 0.44 0.11 0.98 0.47 -0.3 -2.77 -0.73 -0.2 0.57 -0.11 0.81 0.64 -0.05
0.32 -0.05 -0.18 0.1 -0.19 0.64 0.55 0.65 0.58 -0.66 -0.12 -0.49 0.04 -0.1 -0.6 -0.26 0.35 -0.26 -0.7 -0.57 -0.52 0.55 0.54 -0.23 0.38 -0.48 -0.56 -0.52 -0.43 0.19
0.24 0.25 -0.99 -2.05 0.83 -0.1 0.06 -0.73 -0.05 0.3 -0.03 0.32 -0.35 0.32 0.74 -0.42 -0.24 0.7 -1.17 0.15 0.24 -1.34 0.04 0.41 0.27 -0.81 0.24 1.08 -1.74 -1.64
-0.06 -0.75 0.66 - 0.65 0.53 - -0.85 -1.64 - -1.77 0.64 0.2 - 0.58 1.38 -0.33 1.83 1.25 -0.04 -0.91 -1.05 0.26 0.6 -2.08 0.23 -1.14 -0.14 -1.67 0.47
0.23 -0.45 -1.29 0.44 0.2 - -0.71 - 0.87 0.44 -0.8 0.23 -0.53 0.6 0.32 -0.25 0.91 0.22 -0.02 -1.08 -0.06 1.14 -1.98 -2.0 -0.41 0.56 0.99 0.7 0.01 -1.47
0.04 0.15 0.03 -0.09 0.06 0.2 0.24 0.16 -0.23 -0.24 0.08 -0.07 -0.22 0.15 -0.07 -0.04 -0.02 -0.1 0.09 -0.22 0.06 -0.1 -0.25 0.13 0.15 -0.06 0.1 -0.03 0.13 -0.26
-0.46 0.98 - -0.47 0.85 -0.28 0.14 -1.26 0.24 - -0.51 0.57 1.09 - -2.22 -0.4 1.33 0.85 - - 0.63 0.02 1.25 0.14 -0.22 0.47 0.28 -1.9 0.26 -0.56
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Spov3_chr3.04838 (mTERF22)
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- - 1.09 1.25 -0.16 - - -1.36 1.1 0.87 0.29 0.0 0.21 0.45 0.44 -1.29 -1.56 0.34 -0.63 -0.03 0.09 1.3 0.9 -0.02 -0.46 -0.58 -1.63 0.78 - -0.53
0.39 0.31 -0.91 -0.29 1.04 0.54 1.21 1.31 -0.4 -1.02 -1.77 -2.29 -1.09 - 0.15 -2.12 -0.43 0.07 -0.17 0.17 - 0.45 -1.35 -0.78 -1.18 0.55 0.93 0.29 0.35 0.84
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0.17 1.18 0.15 -0.41 -0.13 -0.49 0.05 -0.34 -0.17 -1.19 -0.2 -0.4 -0.99 0.65 -0.64 0.02 -0.44 -1.48 0.03 -0.31 0.72 -0.04 -0.09 0.53 -1.17 -0.94 -0.12 0.88 0.27 0.81
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Spov3_S01.00144 (AUXILIN-LIKE4)
 -1.3 0.55 -0.1 -0.02 1.18 0.11 0.59 -0.74 -0.55 -0.35 -0.62 -1.66 -0.36 -0.13 -0.04 -1.71 -0.37 -0.27 -0.69 -1.05 -0.7 1.04 0.86 0.59 -0.49 -0.55 -1.21 -0.11 1.29 0.54
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.