1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_196 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
6.37 9.25 7.63 4.93 7.84 4.4 4.37 4.11 7.06 8.26 4.83 6.85 8.22 9.06 5.57 6.87 6.81 6.18 5.37 4.82 6.18 7.04 5.31 5.4 4.84 5.77 5.09 5.87 7.62 7.75
0.11 0.05 0.11 0.1 0.03 0.01 0.0 0.05 0.06 0.02 0.01 0.02 0.05 0.03 0.03 0.01 0.03 0.04 0.04 0.05 0.0 0.03 0.0 0.07 0.02 0.06 0.04 0.06 0.05 0.07
3.26 4.03 2.14 2.17 3.14 2.43 3.3 1.43 2.39 1.74 1.71 2.37 1.18 3.4 2.12 2.92 1.51 2.7 1.93 2.07 2.81 3.0 1.22 2.08 2.46 1.85 1.35 2.13 2.81 1.97
0.34 0.14 0.24 0.12 0.09 0.11 0.14 0.11 0.07 0.21 0.03 0.13 0.02 0.17 0.07 0.03 0.21 0.03 0.01 0.16 0.16 0.18 0.1 0.2 0.05 0.04 0.13 0.09 0.08 0.07
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
1.0 0.79 0.89 0.51 0.76 0.71 0.65 0.64 0.63 0.63 0.62 0.73 0.47 0.77 0.78 0.84 0.67 0.33 0.61 0.65 0.68 0.72 0.44 0.62 0.47 0.71 0.62 0.8 0.55 0.6
0.03 0.03 0.05 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.04 0.04 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.03 0.02 0.01
1.37 1.18 2.38 1.38 2.21 1.06 0.57 1.69 0.63 3.39 0.33 1.51 1.86 1.75 2.86 1.82 2.51 1.76 2.53 0.4 2.27 1.19 1.97 4.8 0.61 2.01 2.26 1.91 2.43 1.04
0.22 0.21 0.24 0.11 0.16 0.17 0.09 0.1 0.15 0.2 0.13 0.14 0.16 0.17 0.09 0.13 0.14 0.13 0.11 0.15 0.12 0.23 0.04 0.14 0.12 0.17 0.12 0.13 0.09 0.15
7.82 7.85 3.26 2.7 5.11 6.16 5.15 1.21 3.33 2.37 4.6 3.07 1.83 7.88 5.09 5.29 2.88 2.97 3.76 1.66 5.28 6.57 0.27 3.15 2.98 5.25 1.04 5.4 5.96 3.72
0.0 0.09 0.11 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0
0.2 0.11 0.26 0.27 0.07 0.0 0.04 0.12 0.1 0.07 0.0 0.21 0.11 0.17 0.06 0.16 0.04 0.16 0.1 0.03 0.04 0.09 0.14 0.13 0.1 0.19 0.1 0.0 0.31 0.32
0.45 0.22 0.57 2.14 0.81 0.97 0.0 0.41 0.23 1.26 0.42 0.62 0.22 0.37 1.15 1.47 0.2 0.0 0.7 0.96 0.63 1.07 0.21 0.62 0.42 0.41 1.58 0.0 0.42 0.77

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)