1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_48 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 8.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.76 0.76 0.55 0.52 0.84 0.14 0.53 0.63 0.54 0.24 0.52 0.51 0.61 0.52 0.45 0.62 0.44 2.02 0.46 0.48 0.48 0.77 9.94 0.56 0.54 0.44 0.65 0.46 0.42 0.41
0.89 0.54 0.46 0.58 1.52 0.18 0.13 0.16 0.54 0.39 0.13 0.54 0.94 0.69 0.43 0.2 0.13 5.91 0.28 0.23 0.56 0.11 31.84 0.47 0.22 0.42 0.3 0.85 0.75 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.55 1.83 1.1 0.83 2.77 0.46 0.36 0.69 0.9 0.98 0.69 0.38 1.93 2.64 1.59 0.49 0.34 10.33 0.62 0.42 0.59 0.62 49.42 0.61 0.68 0.37 0.65 0.97 1.84 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 7.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.14 0.19 0.82 0.19 0.12 0.07 0.13 0.07 0.22 0.08 0.12 1.2 0.17 0.32 0.11 0.19 1.69 0.22 0.07 0.18 0.24 7.98 0.11 0.19 0.2 0.23 0.27 0.16 1.17
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
7.36 5.84 2.27 1.2 9.95 1.43 1.97 1.29 2.0 1.38 1.16 1.2 1.73 1.83 0.96 1.09 2.01 28.13 0.99 1.19 1.44 1.53 120.64 1.44 1.22 1.47 1.35 3.23 5.54 2.69
0.49 0.78 0.7 0.47 1.76 0.75 0.44 0.52 0.67 0.86 0.48 0.69 0.55 2.17 0.72 0.46 0.51 2.2 0.53 0.51 0.77 0.6 11.45 0.48 0.52 0.7 0.5 0.83 0.63 0.43
52.38 47.9 40.03 36.19 79.2 39.26 39.64 39.17 40.31 47.93 38.79 36.2 48.39 86.67 48.91 37.68 41.3 98.0 40.29 45.75 41.2 40.5 382.63 42.52 39.07 43.96 44.95 42.19 51.25 37.44
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.06 0.09 0.02 0.02 0.01 0.22 0.02 0.12 0.04 0.06 1.4 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.3 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 2.39 0.0 0.01 0.0 0.0 7.71 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0
Spov3_chr1.04887 (CYP72A7)
 2.64 1.62 0.8 0.8 3.35 2.2 2.38 1.81 0.69 0.94 0.94 1.05 10.04 5.07 1.87 1.85 1.41 33.83 1.28 1.14 1.15 0.99 174.82 1.35 1.15 1.0 0.89 1.27 1.07 0.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 4.52 0.0 0.0 0.0 0.0 100.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.17 0.02 0.04 0.3 0.06 0.0 0.03 0.04 0.05 0.02 0.03 0.05 0.3 0.05 0.06 0.03 0.18 0.02 0.01 0.02 0.01 2.6 0.03 0.01 0.04 0.02 0.08 0.03 0.14
Spov3_chr2.00923 (CYP76C2)
 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.16 0.02 0.01 0.02 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 16.89 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.03 0.03 0.02 0.0 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.1 0.03 0.04 0.01 0.01 0.48 0.03 0.02 0.02 0.01 6.08 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.46 0.14 0.0 0.0 0.63 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.09 0.0 0.0 177.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.81 1.26 0.7 0.82 3.1 0.39 0.58 0.23 0.34 0.79 0.81 0.25 0.91 0.35 3.64 0.21 0.52 6.68 1.16 0.68 0.78 0.45 63.05 0.67 0.54 0.49 1.16 0.35 1.08 0.22
3.45 2.17 0.76 0.47 8.72 0.17 0.44 0.26 0.28 0.1 0.39 0.12 0.35 0.67 13.29 0.71 0.29 16.1 0.63 0.11 0.2 0.27 688.72 0.45 0.58 0.49 0.74 0.35 0.55 0.08
1.33 1.05 0.89 0.92 2.58 1.3 1.34 1.35 1.05 1.36 1.21 1.11 2.18 2.59 1.3 0.96 1.33 3.19 1.12 1.18 1.28 1.07 17.16 1.2 1.18 1.23 1.66 1.06 1.03 1.14
0.14 0.08 0.12 0.04 0.12 0.02 0.06 0.03 0.03 0.14 0.02 0.05 0.08 0.21 0.09 0.04 0.01 0.2 0.05 0.05 0.13 0.07 2.63 0.01 0.09 0.1 0.04 0.08 0.09 0.07
0.02 0.01 0.01 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.02 0.0 0.0 47.54 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.1 0.06 0.05 0.03 0.23 0.07 0.05 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.17 0.15 0.09 0.02 0.02 0.3 0.03 0.02 0.06 0.01 1.92 0.03 0.01 0.05 0.0 0.03 0.08 0.04
0.06 0.02 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.03 0.0 0.0 12.4 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 0.92 0.86 0.94 2.3 1.67 1.39 1.33 0.95 1.21 0.86 0.82 1.46 2.19 1.13 0.96 1.06 2.27 0.99 1.13 1.13 1.25 9.27 1.01 1.23 1.12 1.34 1.29 1.3 1.63
2.8 3.11 1.81 1.39 3.78 1.48 1.09 0.98 1.4 1.39 1.89 1.27 3.0 2.0 1.71 2.01 2.1 9.13 1.26 1.77 1.41 1.66 37.26 1.71 1.98 1.88 1.55 2.0 2.07 1.59
0.11 0.08 0.0 0.02 0.11 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.06 0.02 0.0 0.0 1.31 0.0 0.0 0.01 0.0 60.77 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02
0.85 0.75 0.41 0.74 1.06 0.76 1.25 1.55 0.93 1.0 0.94 1.01 1.21 0.58 0.72 0.57 0.71 0.59 0.77 0.83 0.67 0.97 58.51 1.01 0.67 0.66 1.03 1.06 0.67 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 8.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.08 0.03 0.12 0.18 0.09 0.13 0.09 0.24 0.11 0.15 0.09 0.26 0.13 0.23 0.1 0.14 0.47 0.19 0.21 0.08 0.16 4.18 0.11 0.12 0.17 0.1 0.13 0.14 0.12
0.34 0.29 0.04 0.06 0.32 0.01 0.07 0.05 0.05 0.08 0.07 0.0 0.07 0.03 0.13 0.03 0.04 3.37 0.0 0.16 0.03 0.03 17.85 0.02 0.07 0.04 0.02 0.2 0.07 0.02
6.21 7.08 7.15 5.57 15.13 7.59 5.22 5.37 6.53 11.13 8.76 7.37 24.63 3.56 3.97 6.35 5.33 36.27 10.78 7.85 9.6 9.64 134.74 7.26 9.95 9.7 13.82 10.72 7.96 10.39
3.85 0.54 2.2 0.49 3.17 0.85 2.07 1.74 2.2 0.56 0.0 0.0 1.83 3.21 0.65 1.14 2.7 17.08 0.41 0.78 0.66 2.76 47.49 0.75 1.66 2.64 1.58 1.69 1.83 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Spov3_chr4.02979 (GAPCP-2)
 3.92 4.38 3.71 4.22 5.98 2.18 2.41 4.21 2.94 4.6 3.57 2.77 8.42 2.99 2.66 2.45 2.62 10.06 3.53 3.31 3.61 4.22 50.13 3.72 3.7 4.27 4.79 5.7 4.1 4.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 49.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 1.46 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01
0.49 0.17 0.03 0.06 0.81 0.03 0.05 0.1 0.04 0.17 0.0 0.0 0.52 0.09 0.07 0.01 0.01 4.36 0.07 0.04 0.03 0.0 21.76 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.19 0.0
3.72 2.92 2.61 2.25 5.1 3.02 3.94 2.33 2.52 2.98 2.72 2.42 2.52 4.89 2.88 3.38 2.81 6.18 2.64 1.03 2.87 2.0 27.34 3.0 2.1 3.49 2.9 5.29 3.29 3.98
0.54 0.37 0.37 0.24 0.64 0.33 0.41 0.25 0.48 0.37 0.41 0.37 0.47 0.41 0.32 0.3 0.48 2.67 0.3 0.36 0.41 0.26 14.36 0.27 0.4 0.37 0.43 0.41 0.81 1.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.15 0.06 0.04 0.21 0.09 0.08 0.05 0.05 0.09 0.06 0.07 0.07 0.24 0.14 0.08 0.1 0.34 0.05 0.07 0.06 0.02 3.09 0.05 0.04 0.06 0.1 0.07 0.14 0.12
0.22 0.05 0.03 0.02 0.19 0.06 0.0 0.02 0.01 0.05 0.02 0.02 0.44 0.56 0.13 0.03 0.03 4.21 0.01 0.0 0.02 0.02 17.22 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.39 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.0
0.87 0.27 0.02 0.11 0.97 0.1 0.11 0.06 0.18 0.24 0.1 0.08 0.34 0.34 0.22 0.1 0.09 7.1 0.03 0.06 0.06 0.06 34.44 0.16 0.04 0.06 0.07 0.07 0.29 0.04
0.01 0.06 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.14 0.35 0.03 0.0 0.02 3.4 0.02 0.02 0.04 0.04 12.92 0.02 0.05 0.01 0.02 0.03 0.03 0.0
0.86 0.19 0.09 0.0 1.08 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.62 2.76 0.0 0.21 8.65 0.0 0.18 0.0 0.0 175.18 0.0 0.0 0.0 0.24 0.57 0.99 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.34 0.0 0.0 0.0 0.0 7.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55
0.75 0.83 0.4 0.37 1.52 0.27 0.47 0.37 0.38 0.48 0.39 0.31 0.49 0.68 0.22 0.45 0.24 2.49 0.39 0.22 0.48 0.36 10.76 0.53 0.41 0.46 0.42 0.56 0.7 0.66
0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 7.37 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.25 0.22 0.17 0.03 0.8 0.18 0.06 0.15 0.24 0.03 0.33 0.17 0.48 0.16 0.19 0.13 0.08 3.58 0.07 0.2 0.08 0.18 13.62 0.14 0.32 0.17 0.21 0.03 0.26 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)