Heatmap: Cluster_25 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00081 (AtPAE12)	0.22	0.93	0.23	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.41	0.0	1.0	0.41	0.0	0.68	0.4	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.18	0.0	0.0	0.23	0.0
Spov3_C0003.00023	0.27	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.49	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0005.00067	0.0	0.48	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.47
Spov3_C0014.00015 (SELO)	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.9	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93
Spov3_C0016.00051	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0019.00030	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.12	0.12	0.15	0.0	0.11	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.13	0.0	0.0	0.12
Spov3_C0021.00024 (FP3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0023.00026	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.65	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.27	0.91	0.0	0.0	0.28
Spov3_C0023.00051 (ETO1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0029.00001	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0
Spov3_C0040.00018 (E2FB)	0.39	0.33	0.0	0.34	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.91	0.0	0.0	0.62	0.56	0.0	1.0	0.53	0.34	0.28	0.61	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.28
Spov3_C0880.00002 (IPT5)	0.0	0.0	0.2	0.23	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	1.0	0.22	0.35	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89
Spov3_C1234.00001 (ATF1)	0.14	0.1	0.14	0.46	0.19	0.26	0.0	0.0	0.08	1.0	0.89	0.4	0.08	0.37	0.07	0.45	0.54	0.12	0.08	0.21	0.06	0.0	0.08	0.17	0.23	0.13	0.13	0.14	0.19	0.15
Spov3_chr1.00691	0.34	0.16	0.24	0.34	0.19	0.17	0.21	0.4	0.77	0.2	1.0	0.62	0.56	0.19	0.38	0.29	0.14	0.0	0.36	0.74	0.35	0.17	0.0	0.0	0.18	0.2	0.51	0.03	0.0	0.14
Spov3_chr1.01090	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0
Spov3_chr1.01091	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0
Spov3_chr1.01531 (HDA18)	0.0	0.0	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77
Spov3_chr1.01668	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.02117 (HAK5)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Spov3_chr1.03166 (NOV)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.03694 (BIR6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.03852	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65
Spov3_chr1.04105 (CYP705A15)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.01478	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.99	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.03447	0.0	0.24	0.0	0.24	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.21	0.21	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.24	0.0
Spov3_chr2.03927	0.0	0.21	0.56	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.34	0.0	0.41	0.0	1.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.55	0.0	0.32	0.0	0.32	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05017	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05177 (SYP124)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05471 (GTE7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05557	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.99	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.00669	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.01340	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.43	0.54	1.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0
Spov3_chr3.01650 (PES)	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.47	0.0	0.29	0.0	0.06	0.0	0.0	0.21	0.15	0.33	0.38	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53
Spov3_chr3.03113 (GGL22)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.03560	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.45	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0
Spov3_chr3.04391	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.00188	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.00405	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.00482 (Lhca6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.01483 (AHL3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.01737	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.02149 (RPL16)	0.45	0.0	0.0	0.16	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.02175	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.02864	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.03003 (CYP87A2)	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.77	0.33	0.56	0.51	0.0	0.17	0.0	0.5	0.14	1.0	0.36	0.45	0.21	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	0.46	0.44
Spov3_chr4.03100	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.01394	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.03817 (MGD2)	0.09	0.1	0.57	0.28	0.33	0.15	0.1	0.08	0.27	1.0	0.49	0.08	0.17	0.19	0.0	0.09	0.09	0.0	0.07	0.29	0.1	0.15	0.0	0.0	0.0	0.08	0.25	0.11	0.0	0.0
Spov3_chr5.03923 (SmD1b)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.41	0.59	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.04250 (NRPC2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.04509	0.31	0.0	0.0	0.14	0.0	0.23	0.21	0.34	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.09	0.0	0.0	0.0	0.31	0.09	0.0
Spov3_chr6.00669 (ATAF1)	0.0	0.06	0.15	0.35	0.0	0.76	0.25	1.0	0.64	0.05	0.76	0.42	0.05	0.0	0.32	0.56	0.24	0.0	0.14	0.55	0.0	0.37	0.0	0.0	0.18	0.04	0.04	0.0	0.11	0.15
Spov3_chr6.01076 (KINbeta1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.01784 (RPL16)	0.45	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	1.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.02138 (GT2L)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.02140 (RPB5D)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.02255	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.5	0.21	0.0	0.0	0.41	1.0	0.23	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.02433 (EMB3012)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0
Spov3_S01.00040 (MEKK4)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.96	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22
Spov3_S08.00014 (BRN1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45
Spov3_S09.00024 (CPK2)	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_S10.00037 (UCC2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)