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Heatmap: Cluster_165 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.06 0.08 -0.07 0.05 0.01 -0.19 -0.22 -0.07 -0.08 -0.03 -0.03 -0.05 0.08 0.49 0.24 0.11 0.2 0.01 -0.08 -0.15 -0.03 -0.07 0.09 0.07 -0.0 -0.04 0.0 -0.03 -0.22 -0.37
0.02 0.12 0.06 0.07 -0.02 -0.02 -0.01 0.16 -0.1 -0.04 -0.07 -0.01 -0.07 0.3 0.18 0.0 0.08 -0.24 -0.3 -0.25 -0.12 -0.02 0.12 -0.13 -0.09 0.01 0.02 0.04 0.02 0.13
0.16 0.17 -0.06 0.02 0.04 -0.02 -0.08 -0.07 -0.15 -0.01 -0.16 -0.17 0.11 0.54 0.27 0.15 0.17 -0.4 -0.24 -0.3 -0.05 -0.08 0.11 -0.04 -0.05 -0.1 -0.03 0.04 0.0 -0.08
0.11 0.17 -0.01 0.1 -0.03 -0.08 -0.08 0.1 -0.21 -0.11 -0.08 -0.11 -0.0 0.43 0.15 0.1 0.16 -0.21 -0.25 -0.31 -0.09 -0.06 0.13 -0.15 -0.07 -0.04 0.01 0.1 0.05 0.06
0.15 0.28 -0.11 0.05 0.09 0.01 -0.02 -0.02 -0.31 -0.14 -0.19 -0.15 0.06 0.58 0.18 -0.04 0.1 -0.31 -0.26 -0.29 -0.09 -0.15 0.32 0.05 0.01 -0.19 -0.03 0.05 0.03 -0.06
-0.05 -0.12 -0.16 -0.11 -0.47 0.06 -0.07 -0.04 -0.09 -0.08 0.03 0.03 0.33 0.64 0.46 0.3 0.23 -0.11 -0.32 -0.22 -0.11 0.03 -0.29 0.04 -0.12 -0.09 -0.12 -0.04 -0.06 -0.04
-0.19 -0.12 0.05 0.1 -0.4 -0.33 -0.06 0.05 -0.12 0.06 0.08 -0.07 0.3 0.16 0.23 0.17 0.18 0.01 -0.22 -0.12 -0.03 -0.07 0.27 0.02 -0.12 -0.1 0.07 -0.02 -0.21 0.15
-0.04 0.1 0.01 -0.1 0.28 0.2 -0.05 -0.05 -0.03 -0.08 -0.19 -0.04 0.04 0.53 0.13 -0.0 0.16 -0.33 -0.33 -0.32 -0.01 -0.1 0.04 -0.14 -0.2 0.05 -0.04 0.03 0.07 0.08
0.24 0.21 -0.09 -0.26 0.12 0.1 -0.05 -0.01 -0.14 -0.07 -0.16 -0.09 -0.0 0.5 0.37 0.16 0.17 -0.47 -0.31 -0.29 -0.17 -0.08 -0.07 -0.08 -0.14 0.0 -0.03 0.12 0.15 -0.05
-0.03 -0.02 -0.12 0.04 -0.38 -0.23 -0.1 0.24 -0.1 -0.01 0.02 -0.03 0.28 0.18 0.21 0.09 0.18 -0.09 -0.36 -0.11 -0.18 0.03 0.36 -0.19 0.01 -0.07 -0.12 0.21 -0.06 0.03
-0.01 0.02 0.07 0.23 -0.07 -0.18 -0.15 0.19 0.05 0.1 -0.02 -0.01 0.0 0.27 0.13 0.14 0.21 -0.33 -0.27 -0.12 -0.13 -0.16 0.23 -0.07 -0.01 -0.06 0.02 0.06 -0.14 -0.24
0.08 0.16 -0.01 0.29 -0.29 -0.23 -0.17 0.12 -0.09 -0.08 -0.06 -0.17 0.26 0.53 0.25 0.14 0.25 -0.31 -0.18 -0.3 -0.06 -0.18 0.2 -0.02 -0.04 -0.1 -0.04 0.07 -0.15 -0.29
0.22 0.24 0.05 0.02 0.04 0.02 -0.02 -0.13 -0.1 -0.05 -0.15 -0.09 -0.02 0.47 0.23 0.14 0.12 -0.26 -0.4 -0.32 -0.14 -0.06 0.23 -0.11 -0.18 -0.13 -0.06 0.14 -0.03 -0.01
0.21 0.05 0.04 0.08 0.06 -0.16 0.03 0.07 -0.18 -0.04 -0.03 -0.18 -0.07 0.53 0.13 0.08 0.06 -0.11 -0.26 -0.35 -0.24 -0.11 0.19 -0.08 -0.13 -0.03 0.03 0.05 0.0 0.09
0.17 0.2 0.11 0.47 -0.01 -0.13 -0.1 0.19 -0.26 -0.36 -0.21 -0.31 0.16 0.2 0.05 0.12 0.07 -0.09 -0.15 -0.24 -0.11 -0.14 0.41 0.01 -0.03 -0.13 -0.06 0.16 -0.1 -0.32
Spov3_chr2.00503 (G2484-1)
 0.13 0.18 -0.05 0.01 -0.08 0.14 0.05 -0.09 -0.13 -0.03 -0.13 -0.05 0.12 0.47 0.18 0.1 0.07 -0.27 -0.41 -0.34 -0.16 -0.06 0.15 0.01 -0.13 -0.08 -0.02 0.1 0.08 -0.04
0.16 0.13 0.05 0.17 0.15 -0.15 -0.26 0.22 -0.21 0.03 -0.12 -0.2 0.17 0.3 0.06 0.17 0.18 -0.14 -0.35 -0.29 -0.16 -0.11 0.09 -0.06 -0.3 -0.09 0.02 0.15 0.04 0.04
-0.08 0.02 0.05 0.1 -0.16 -0.13 -0.07 0.38 -0.26 -0.05 -0.04 -0.05 0.25 0.14 -0.03 0.1 0.16 -0.09 -0.14 -0.2 -0.14 0.02 0.31 -0.26 -0.06 0.01 0.06 0.08 -0.12 -0.05
0.06 0.08 0.0 0.2 0.18 -0.1 -0.04 0.07 -0.01 0.04 -0.07 -0.02 0.05 0.29 0.13 0.03 0.09 -0.34 -0.25 -0.28 -0.11 -0.14 0.05 -0.09 -0.1 -0.02 0.07 0.22 0.01 -0.21
Spov3_chr2.01654 (AtHMP46)
 0.25 0.21 0.09 -0.0 0.12 -0.38 -0.29 -0.16 0.06 0.28 0.06 0.12 0.05 0.11 -0.2 -0.08 -0.06 -0.29 -0.19 -0.18 -0.1 -0.1 -0.15 0.08 -0.03 -0.1 0.14 0.34 0.26 -0.19
0.23 0.23 0.03 0.16 -0.02 -0.21 -0.13 0.0 -0.17 -0.06 -0.06 -0.06 0.14 0.27 -0.0 0.0 -0.08 -0.11 -0.24 -0.31 0.04 -0.07 0.27 0.06 -0.1 -0.14 -0.01 0.31 -0.06 -0.19
-0.11 -0.02 -0.06 0.21 -0.28 -0.1 -0.06 0.45 -0.24 -0.18 -0.03 -0.05 0.15 0.08 0.2 0.21 0.22 -0.26 -0.13 -0.11 0.0 0.01 0.16 0.03 -0.05 -0.08 0.01 0.02 -0.17 -0.08
0.11 0.04 -0.13 0.01 -0.07 0.13 0.2 -0.13 -0.07 -0.03 -0.09 -0.04 -0.0 0.46 0.19 0.04 0.19 -0.61 -0.09 -0.13 -0.09 0.04 0.13 0.07 -0.06 -0.12 -0.08 -0.03 0.05 -0.2
0.22 0.25 0.02 -0.04 -0.23 -0.21 -0.02 -0.28 -0.21 -0.17 -0.11 -0.08 -0.16 0.71 0.3 0.1 0.17 -0.88 -0.21 -0.23 -0.02 0.09 0.33 -0.04 -0.06 -0.04 0.0 0.13 0.0 -0.02
0.89 -0.01 0.05 0.45 -0.5 -0.4 -0.16 -0.51 0.09 -0.45 0.12 -0.06 0.42 1.54 0.2 -0.08 -0.18 -2.16 -0.13 0.01 -0.43 -0.14 -0.14 0.03 -0.21 -0.49 -0.18 0.08 -0.04 -1.3
0.18 0.29 0.06 0.39 0.08 -0.1 -0.23 0.17 -0.24 -0.01 -0.35 -0.28 0.18 0.4 0.15 0.16 0.16 -0.18 -0.5 -0.33 -0.09 -0.15 0.19 -0.3 -0.23 0.08 0.02 0.05 -0.09 -0.02
0.09 0.14 0.05 0.32 -0.09 -0.15 -0.14 0.38 -0.23 -0.18 -0.14 -0.17 0.22 0.14 0.25 0.15 0.16 -0.43 -0.27 -0.22 -0.06 -0.06 0.1 -0.09 -0.04 -0.14 0.04 0.18 -0.2 -0.0
0.06 0.22 0.1 0.34 0.08 -0.08 -0.28 0.21 -0.25 -0.14 -0.13 -0.16 0.05 0.15 0.04 0.16 0.24 0.04 -0.19 -0.33 -0.01 -0.14 -0.19 -0.16 -0.18 -0.1 -0.07 0.2 0.05 0.15
0.02 -0.04 0.14 0.45 -0.13 -0.18 -0.13 0.39 0.01 0.05 0.01 -0.1 0.12 0.15 -0.05 -0.02 0.1 0.02 -0.13 -0.27 -0.04 -0.1 0.1 -0.15 -0.1 -0.1 -0.0 0.16 -0.24 -0.24
0.25 0.18 0.09 0.12 0.04 0.07 -0.16 -0.2 -0.07 -0.01 -0.16 -0.12 -0.1 0.45 0.28 0.16 0.15 -0.19 -0.49 -0.34 -0.04 -0.17 0.02 -0.2 -0.15 -0.12 -0.08 0.1 0.19 0.07
0.15 0.06 -0.2 -0.13 0.21 0.22 0.09 0.02 -0.36 -0.25 -0.25 -0.25 0.08 0.66 0.35 0.31 0.2 -0.38 -0.24 -0.21 -0.2 -0.09 0.03 -0.14 -0.07 -0.14 -0.04 -0.02 -0.04 0.07
-0.15 -0.13 -0.12 -0.05 -0.01 -0.18 -0.12 0.31 -0.17 -0.15 0.07 -0.14 0.18 0.59 0.08 0.09 0.1 0.12 -0.08 -0.08 -0.04 -0.11 -0.17 -0.1 0.04 0.01 0.16 -0.01 -0.18 -0.09
0.15 0.12 -0.16 -0.08 0.25 -0.1 -0.01 0.0 -0.23 -0.1 -0.09 -0.05 0.07 0.39 0.2 0.17 0.15 -0.24 -0.33 -0.34 -0.09 -0.09 0.09 -0.06 -0.06 0.0 0.07 0.2 0.02 -0.13
0.12 0.02 0.05 0.19 0.19 -0.08 -0.05 0.07 0.01 0.12 0.08 -0.05 0.04 -0.07 -0.1 -0.06 -0.02 -0.11 -0.19 -0.24 -0.2 -0.1 -0.05 0.14 0.0 -0.0 0.0 0.28 0.06 -0.23
0.1 0.16 -0.01 0.08 0.09 0.12 -0.0 0.13 -0.1 -0.08 -0.07 0.08 0.07 0.36 0.11 0.11 0.06 -0.44 -0.4 -0.43 -0.24 -0.18 0.08 0.04 -0.12 -0.08 -0.07 0.2 0.15 -0.03
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-0.14 -0.07 -0.17 -0.1 0.03 -0.23 -0.35 -0.23 -0.13 0.04 -0.04 0.05 0.14 0.55 0.22 0.22 0.3 0.24 -0.12 -0.19 -0.11 -0.14 0.35 -0.02 -0.24 -0.12 -0.06 -0.05 -0.06 0.03
0.09 0.19 0.21 0.58 0.13 -0.12 -0.23 0.24 -0.25 -0.32 -0.23 -0.28 0.26 0.5 0.04 -0.11 0.12 0.19 -0.36 -0.29 -0.36 -0.17 0.14 -0.13 -0.29 -0.26 0.03 -0.01 0.01 0.04
0.23 0.16 0.03 -0.02 -0.05 -0.15 0.01 0.09 -0.24 -0.08 -0.11 -0.09 0.08 0.24 0.27 0.07 0.07 -0.29 -0.31 -0.19 -0.14 0.04 0.3 -0.2 -0.13 -0.08 -0.04 0.11 -0.01 0.16
Spov3_chr4.00793 (RAPTOR1)
 0.21 0.21 0.01 0.11 -0.07 0.05 -0.0 -0.06 -0.05 -0.05 -0.09 -0.05 0.06 0.41 0.29 0.21 0.2 -0.22 -0.36 -0.36 -0.15 -0.14 -0.14 -0.1 -0.11 -0.08 -0.01 -0.03 0.1 -0.1
0.19 0.17 -0.01 0.05 0.13 -0.19 -0.18 0.11 -0.09 0.04 -0.16 -0.14 0.2 0.24 0.15 0.13 0.07 -0.06 -0.24 -0.28 -0.11 -0.16 0.38 -0.05 -0.09 -0.15 -0.03 0.1 -0.09 -0.18
0.17 0.07 0.03 0.2 0.01 -0.1 -0.11 0.19 -0.15 -0.13 -0.08 -0.12 0.16 0.19 0.02 0.02 0.05 -0.18 -0.2 -0.31 -0.09 0.03 0.02 -0.03 -0.06 -0.11 0.01 0.19 0.07 0.05
0.04 -0.08 0.12 0.6 -0.09 -0.29 -0.29 0.44 -0.21 -0.22 -0.24 -0.13 0.39 0.4 0.05 -0.09 0.18 -0.02 -0.37 -0.07 -0.52 -0.19 0.28 -0.01 0.03 -0.35 0.0 0.19 0.09 -0.38
0.19 0.19 0.2 0.47 -0.05 -0.5 -0.19 0.47 -0.16 -0.18 -0.12 -0.25 0.43 0.34 0.01 0.07 0.1 -0.14 -0.22 -0.19 -0.06 -0.17 0.31 -0.28 -0.09 -0.07 0.01 0.04 -0.36 -0.48
Spov3_chr4.02850 (AtSEC23A)
 0.06 0.13 0.01 0.06 0.02 -0.28 -0.2 0.01 -0.08 -0.16 0.02 -0.09 0.2 0.48 0.33 0.16 0.2 0.03 -0.21 -0.34 -0.09 -0.06 0.25 -0.22 -0.21 -0.17 -0.03 0.01 -0.2 0.01
0.11 0.05 -0.07 0.05 -0.01 -0.02 0.01 0.16 -0.04 -0.08 -0.14 -0.14 0.11 0.41 0.07 0.02 0.13 -0.23 -0.24 -0.29 -0.18 -0.12 0.39 -0.11 -0.15 -0.1 -0.03 0.1 0.07 -0.0
0.43 0.17 -0.06 -0.11 -0.0 -0.2 -0.13 -0.38 -0.08 -0.0 -0.06 -0.01 -0.15 0.63 0.08 0.01 0.01 -0.39 -0.24 -0.31 -0.15 -0.12 0.19 -0.01 -0.15 -0.04 -0.05 0.39 0.16 0.06
0.04 0.02 0.02 0.03 -0.05 -0.34 -0.42 0.18 -0.0 -0.0 -0.02 -0.03 0.13 0.46 0.12 0.05 0.17 0.25 -0.19 -0.27 0.0 -0.16 0.21 -0.37 -0.06 0.02 0.03 -0.07 -0.06 -0.01
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0.09 0.12 -0.05 0.15 0.01 -0.11 -0.12 0.01 -0.07 0.01 -0.05 -0.03 0.14 0.19 0.18 0.13 0.11 -0.02 -0.18 -0.17 -0.03 -0.05 0.1 -0.1 -0.08 -0.11 0.04 0.09 -0.1 -0.22
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Spov3_chr5.01690 (KINESIN-13A)
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Spov3_chr5.03153 (DYRKP-1)
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Spov3_chr6.02033 (U2AF35B)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.