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Heatmap: Cluster_160 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.04 0.09 0.17 0.07 -0.15 -0.57 -0.45 -0.24 0.26 0.49 0.18 -0.38 -0.15 0.19 -0.01 -0.09 0.16 -0.39 0.03 -0.01 0.18 0.03 0.0 0.27 0.54 -0.28 0.11 0.37 -0.19 -1.4
-0.97 -0.2 -0.13 -0.32 0.47 -0.29 -0.77 0.07 -0.34 0.26 -0.27 0.08 0.11 0.2 0.2 0.44 0.71 -0.34 -0.36 -0.53 -0.15 -0.25 -0.15 0.18 0.08 0.38 0.35 0.36 0.18 -0.42
0.36 0.02 -1.08 0.26 -0.6 0.36 -1.91 0.61 0.78 -0.09 -0.97 - 0.35 1.13 0.36 0.81 -0.09 0.53 - - 1.05 -2.17 -1.06 -0.2 1.16 -0.62 -0.57 -0.83 0.63 -0.11
-0.05 0.13 0.13 0.29 0.27 0.41 -0.44 -0.16 -0.42 -0.63 -0.36 -0.05 0.36 0.27 -0.8 0.19 0.61 -0.27 -0.2 0.32 -0.18 0.04 -0.26 0.06 -0.4 0.15 0.09 -0.21 0.05 -0.0
-0.53 - 1.1 -0.72 -0.83 -1.97 - 0.41 - 0.56 0.32 -0.85 - 0.43 -1.95 -0.87 -0.92 0.16 -1.09 0.62 0.96 0.93 -1.88 0.02 1.09 0.79 1.01 0.43 0.37 0.75
2.02 - - - - 0.17 - - 0.37 1.42 - - 0.47 - - - 0.49 1.74 - - 1.33 1.13 - 1.23 - - - 1.43 1.97 0.1
-1.06 -0.86 - -0.84 -1.21 1.32 0.83 -0.99 0.37 - 0.82 - -0.95 - - 2.36 -0.94 -1.35 - 0.93 1.31 - - 0.57 0.51 0.32 -1.35 1.41 0.99 -
1.68 0.5 0.32 -0.45 0.7 1.39 -1.23 0.44 - -0.33 - -1.31 -0.11 1.66 -0.34 -1.12 0.83 - -0.26 - -0.58 1.02 -1.27 0.27 - -0.46 0.75 0.57 - -
- 0.05 0.83 -0.3 1.44 - - 0.93 - - - 1.49 -0.44 1.07 - 0.74 - 1.13 - -0.44 2.67 - - - - - 0.65 0.05 -0.07 0.64
-0.05 -0.01 0.2 0.12 0.46 -0.17 -0.07 0.33 0.05 0.1 -0.03 -0.02 -0.23 -0.15 0.02 -0.02 -0.16 -0.11 -0.17 -0.21 -0.07 -0.02 -0.02 -0.2 0.04 0.08 0.16 0.08 0.01 -0.18
-0.01 0.04 0.02 -0.07 -0.01 -0.02 0.05 0.12 -0.16 -0.05 0.02 0.1 0.21 0.23 0.2 -0.03 0.06 -0.46 -0.06 -0.0 -0.04 -0.02 -0.04 -0.01 -0.02 -0.07 0.01 0.11 -0.06 -0.19
-1.99 -1.75 -1.1 - 1.57 -0.06 - -0.02 0.25 1.13 -1.59 0.82 - 1.14 - - - 2.14 -1.73 -0.32 - 0.39 0.23 0.15 -0.91 0.83 0.22 -0.22 -0.32 1.1
-0.17 -0.04 0.07 -0.08 -0.12 -0.24 -0.23 -0.24 0.01 0.24 -0.13 -0.07 -0.33 0.22 -0.08 -0.14 0.0 0.01 0.1 -0.08 0.15 0.12 -0.0 0.05 0.16 0.25 0.21 0.0 0.13 -0.03
-0.55 0.66 -0.58 0.17 0.01 0.23 -0.24 -0.22 0.48 -0.18 -2.34 0.9 -2.35 0.72 0.69 0.75 -0.09 1.18 -2.61 0.16 1.24 -1.56 -0.62 - -0.1 -1.48 0.06 -2.48 0.71 -0.73
0.23 0.22 0.21 0.86 - - 0.86 - 1.09 -0.79 1.6 - - -1.02 -1.02 - -1.0 0.89 - 1.25 -1.31 -0.13 - 1.52 - 0.62 0.74 1.27 - 0.67
- - 0.43 - -0.59 0.17 - -0.49 - 0.98 -0.62 0.37 1.09 0.4 1.32 - 0.89 0.22 -0.45 - -0.62 1.47 -0.77 2.59 - - 0.77 -0.32 - -
-0.06 -0.21 -0.22 -0.12 0.12 -0.15 0.01 0.16 -0.09 0.02 0.11 -0.05 0.05 0.12 0.02 0.08 -0.01 0.06 0.01 -0.18 0.11 0.05 -0.15 -0.04 0.07 0.14 0.11 0.14 0.0 -0.22
0.72 0.24 -0.12 -0.46 0.15 0.1 -1.03 0.12 0.21 0.37 -0.0 -0.26 -0.24 0.94 -0.13 0.3 -0.76 0.04 -0.17 -0.97 -0.35 -0.26 0.41 -0.82 0.41 0.25 -0.55 0.47 -0.11 -0.89
0.05 0.11 -0.13 -0.05 0.11 -0.15 -0.11 0.07 -0.02 -0.01 0.05 -0.03 -0.1 0.28 -0.0 -0.01 -0.09 0.02 -0.11 -0.05 0.02 -0.15 0.01 0.14 0.23 0.07 0.19 0.06 -0.23 -0.38
-1.14 -1.22 - 0.78 -0.39 -0.25 0.95 0.98 -0.15 0.86 -0.14 0.68 0.56 -0.08 0.56 0.54 - -2.29 0.45 0.54 -2.49 0.17 0.47 -0.05 -1.2 -1.29 0.85 -1.87 -0.42 -0.03
-0.62 -0.7 -0.3 - -1.88 -0.1 1.11 -0.11 1.2 0.68 -0.25 0.34 -0.81 1.24 1.03 -0.13 - 0.52 - 0.46 -1.31 1.84 - 1.38 0.57 -1.85 - - -1.65 -1.89
- - - - - 0.92 - 0.77 2.67 1.06 1.24 - - 1.26 - 1.14 2.13 - - - 1.17 - - - - - - 1.31 0.92 -
-0.0 -0.24 -0.1 -0.14 -0.06 0.2 0.36 0.4 -0.11 0.12 -0.02 -0.01 0.3 -0.1 0.04 0.18 -0.07 -0.42 -0.05 -0.21 -0.36 -0.07 -0.13 0.01 -0.13 -0.01 -0.09 0.08 0.1 0.16
-0.28 0.05 0.17 -0.25 -0.05 0.2 0.25 0.13 -0.4 0.17 0.02 0.34 -0.13 0.04 -0.4 0.48 0.11 -0.02 -0.31 -0.13 -0.11 -0.51 -0.66 0.36 -0.31 0.14 -0.04 -0.06 0.19 0.27
-0.15 - 0.26 -0.72 0.58 0.92 - 0.3 -1.72 1.51 -0.45 -0.15 -0.48 1.14 -0.18 0.23 0.58 0.7 0.45 -0.23 - -0.8 -0.56 0.69 - 0.21 -0.47 0.76 0.18 -
0.83 - - -0.59 - 0.57 -0.33 - 0.1 1.56 - -0.12 - - -0.28 - 0.9 2.03 0.92 - - - -0.2 -0.21 - 1.45 -0.51 0.88 0.73 1.58
-0.12 0.14 0.28 0.06 0.32 0.55 -0.18 0.26 -0.45 0.4 -0.43 0.22 0.09 -0.32 -0.19 0.04 -0.26 0.25 0.11 -0.47 0.01 -0.33 -0.69 0.34 -0.21 -0.08 -0.42 -0.04 0.15 0.07
0.04 0.09 0.06 0.09 0.07 0.06 0.08 0.21 0.03 -0.05 -0.06 -0.12 0.18 0.23 0.07 -0.07 -0.01 -0.24 -0.2 -0.08 -0.15 -0.11 0.0 -0.04 -0.02 -0.07 -0.05 0.07 -0.06 -0.09
-0.56 -0.26 -0.25 -0.28 0.28 -0.2 -0.17 0.19 0.13 0.35 0.25 0.1 0.25 -0.8 -0.16 0.11 0.03 -0.48 0.1 -0.03 0.27 0.15 -0.94 0.07 0.16 0.26 0.5 0.03 0.3 -0.55
-0.11 0.09 -0.19 -0.05 0.3 0.02 -0.04 0.02 -0.07 0.11 -0.0 -0.22 0.05 -0.02 0.09 0.13 0.07 0.11 -0.13 -0.13 0.09 -0.0 -0.4 0.05 -0.02 0.09 0.11 -0.08 0.03 -0.07
-2.39 1.07 -0.61 -2.48 -0.78 0.67 -1.51 -2.52 -0.47 1.37 1.08 -1.01 -0.81 0.02 -1.64 0.69 0.29 -2.53 -1.61 0.55 0.78 -0.25 -1.46 -0.04 -0.25 0.48 -0.41 -0.02 0.87 0.89
1.4 0.87 - -1.13 1.02 -1.14 -0.92 -0.74 - - -0.74 1.02 -0.85 - -0.01 - 0.08 1.21 -0.2 - 1.65 -1.17 1.43 -1.01 - 0.12 -0.83 -0.82 1.26 0.74
-0.38 -0.16 -0.19 0.25 -0.32 -0.5 -0.48 0.32 -0.01 -0.3 0.07 0.07 0.59 0.45 0.36 0.37 0.53 0.03 -0.22 -0.05 0.02 0.04 -0.04 -0.2 -0.29 -0.31 -0.04 -0.25 -0.27 0.02
0.01 0.16 -0.1 0.0 0.38 -0.0 -0.06 0.21 -0.36 -0.13 -0.05 -0.21 0.36 -0.17 -0.03 0.1 -0.08 -0.1 -0.06 -0.17 -0.02 -0.16 0.01 0.07 0.05 -0.03 0.08 0.14 0.05 -0.17
Spov3_chr1.01201 (rps15ab)
 -0.23 -0.27 -0.16 0.05 -0.13 -0.23 -0.23 0.34 -0.09 -0.14 0.16 -0.0 0.17 0.06 0.21 0.2 0.36 -0.34 0.0 0.01 -0.11 0.07 0.15 0.01 0.13 -0.08 -0.03 0.01 -0.1 -0.1
- -13.64 - 2.12 - - - - 1.49 2.24 2.73 1.13 - - 1.03 - - - - 0.76 - 0.56 - - - 0.97 1.09 - - -
-0.28 0.07 0.49 0.48 -0.05 -0.33 -0.34 -0.08 -0.74 -0.05 -0.53 -0.18 -0.03 0.56 -0.19 -0.03 0.18 0.25 -0.29 -0.85 0.26 -0.1 -0.1 -0.08 -0.13 0.29 0.47 0.29 -0.03 -0.09
-0.08 -0.03 0.01 0.18 0.04 -0.36 -0.17 0.21 0.03 0.04 0.03 -0.09 0.2 -0.01 0.0 -0.05 0.08 0.16 0.05 -0.02 -0.01 0.02 -0.33 -0.05 0.18 0.0 0.21 -0.03 0.0 -0.47
0.49 0.58 -0.78 -0.34 0.07 -0.31 -0.9 -0.31 -1.03 -0.23 -0.51 0.25 0.21 0.67 -0.45 0.79 0.18 -0.31 -0.31 -0.23 -0.1 -1.09 -0.07 0.53 0.1 -0.76 0.09 0.47 0.39 0.32
-1.03 0.37 -0.96 -3.04 -0.2 -0.2 0.17 -1.33 -1.26 0.77 -0.61 0.56 -0.8 0.6 -0.14 0.68 0.85 -0.32 -0.08 -0.54 -1.97 0.36 0.49 -0.16 0.9 -1.6 0.61 1.31 -1.94 -0.11
-0.03 -0.06 -0.07 0.1 0.0 -0.2 0.03 0.23 -0.0 0.04 -0.07 -0.01 -0.2 0.11 0.0 -0.06 0.02 -0.09 -0.03 -0.15 -0.02 0.0 0.17 0.03 0.1 0.14 0.25 0.06 -0.19 -0.26
-0.07 -0.1 -0.03 0.01 -0.02 -0.26 -0.12 0.23 -0.17 0.1 0.12 0.06 0.23 -0.12 -0.16 -0.17 0.0 -0.36 0.04 0.01 0.09 0.03 -0.3 0.07 0.19 0.14 0.24 0.26 0.01 -0.22
-0.1 -0.12 -0.01 0.21 0.06 -0.12 0.06 0.27 -0.1 -0.04 -0.05 -0.06 0.14 0.19 0.15 0.04 0.16 -0.01 -0.06 -0.02 -0.01 -0.12 -0.28 -0.04 -0.02 -0.08 0.19 -0.03 -0.2 -0.17
-0.08 -0.16 0.01 0.01 -0.24 -0.04 0.04 0.38 -0.16 -0.23 0.07 -0.1 0.33 -0.03 0.31 0.12 0.19 -0.36 -0.01 0.01 0.02 0.07 -0.28 -0.0 0.15 0.1 0.15 -0.16 -0.36 -0.11
-2.02 -0.45 -2.31 -2.44 -2.43 0.31 0.25 - 0.63 1.31 -1.79 -0.97 0.81 0.95 0.3 - 0.16 1.43 0.84 0.23 2.4 -1.09 - -0.98 -1.91 - 0.83 -0.01 -2.32 -
-0.18 -0.21 -0.15 0.03 -0.04 -0.06 -0.05 0.31 -0.03 0.04 -0.1 -0.14 0.14 0.29 0.23 0.12 0.22 -0.1 -0.08 0.05 0.05 -0.02 0.04 -0.24 -0.08 0.03 0.05 -0.12 -0.2 -0.0
0.12 0.05 -0.18 0.01 0.04 -0.14 -0.14 0.03 -0.1 -0.0 -0.01 -0.05 0.51 0.24 0.06 -0.06 0.09 -0.18 -0.2 -0.25 -0.23 -0.09 0.18 0.07 -0.04 -0.03 -0.06 0.13 0.01 -0.01
Spov3_chr2.00018 (LPPbeta)
 -0.15 -0.36 -0.2 -0.1 -0.15 -0.3 -0.04 -0.04 0.04 0.1 0.19 0.08 0.35 -0.14 0.33 0.17 0.17 -0.15 0.14 0.08 0.19 0.19 -0.51 -0.09 0.17 -0.03 0.09 -0.12 -0.22 -0.08
0.18 0.09 -0.02 0.06 0.14 -0.12 0.07 0.15 -0.23 -0.0 -0.19 -0.11 -0.31 0.11 -0.25 -0.06 -0.03 -0.02 0.15 -0.21 -0.12 -0.07 0.37 -0.01 0.1 0.04 0.23 0.07 0.02 -0.25
-0.13 -0.12 -0.04 0.17 0.01 -0.23 -0.32 0.24 -0.34 -0.07 0.04 -0.07 0.15 0.04 -0.01 0.12 0.18 0.07 0.0 -0.1 0.01 -0.03 0.23 0.18 0.16 -0.04 0.13 -0.03 -0.23 -0.22
-0.16 0.15 -0.03 0.17 -0.03 -0.48 -0.83 0.21 -0.56 -0.11 -0.25 -0.05 0.38 0.14 -0.17 -0.21 0.28 0.34 -0.06 -0.46 0.02 -0.12 0.28 0.37 0.13 0.04 0.29 0.24 -0.15 -0.19
-0.41 -0.39 -0.19 0.63 -1.28 -2.44 -1.39 -2.73 0.09 1.0 0.44 -0.57 0.16 0.53 0.33 0.96 0.86 -0.37 -0.11 1.09 0.76 -0.14 -1.23 -0.74 -0.26 0.79 0.4 -1.72 -2.19 -1.36
-0.18 0.38 -0.08 -0.63 0.2 -0.51 -0.41 -0.37 -2.08 -0.59 -0.46 -0.59 0.32 0.56 -0.7 0.12 0.46 0.57 -0.13 -0.51 0.41 0.56 -0.42 -0.3 0.45 0.13 0.62 0.7 -1.07 0.22
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-0.02 0.04 -0.03 -0.06 0.1 -0.12 -0.04 -0.02 0.1 0.06 0.16 0.13 0.16 -0.16 0.06 -0.09 0.07 -0.25 0.01 -0.12 0.02 0.06 -0.22 -0.02 0.03 0.06 0.18 0.22 0.02 -0.54
-0.31 -0.2 -0.32 -0.05 -0.16 -0.18 0.01 0.57 0.13 -0.18 -0.15 -0.03 0.12 0.12 0.08 0.35 0.36 -0.13 0.01 0.07 0.14 0.13 -0.32 -0.08 0.06 0.08 0.16 -0.34 -0.5 -0.01
-1.28 -1.15 - 0.67 0.6 -0.4 - 0.25 0.52 1.02 1.68 -0.03 - - 1.44 0.18 - 0.35 - 0.48 -0.02 - -0.09 - 1.53 -0.02 -1.35 0.03 0.88 -0.26
0.11 0.16 0.19 0.26 0.17 -0.17 -0.13 0.02 -0.0 -0.08 0.04 0.01 -0.06 0.15 -0.1 -0.07 0.01 0.07 -0.05 -0.17 -0.01 0.0 -0.19 -0.23 -0.11 0.04 0.05 0.12 -0.06 -0.13
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-0.29 -0.12 -0.08 -0.12 0.06 -0.09 -0.08 0.03 0.11 0.25 0.06 0.1 0.08 0.24 0.17 0.17 0.15 -0.0 -0.26 -0.22 0.01 -0.11 -0.39 -0.29 -0.03 0.1 0.14 -0.07 -0.03 0.23
Spov3_chr6.02571 (CDC20.1)
 - 0.07 -0.19 -1.25 -0.97 -1.1 -1.02 -1.05 -0.41 0.81 -0.9 -0.37 -0.53 1.49 0.45 0.0 0.98 0.98 -0.52 - -0.27 0.09 0.47 0.04 0.45 0.74 0.69 0.39 0.13 -
-0.04 0.01 0.01 0.25 -0.11 0.05 -0.27 -0.09 -0.02 -0.12 -0.03 -0.06 0.05 0.14 0.31 0.31 0.32 -0.03 -0.07 -0.19 -0.11 0.01 0.06 -0.29 -0.03 -0.03 0.12 -0.09 -0.11 -0.17
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-0.42 -0.31 -0.27 -0.04 0.24 -0.32 -0.1 0.16 -0.07 0.23 0.2 0.01 0.12 0.26 -0.08 -0.11 0.15 -0.49 0.1 -0.0 0.11 0.06 -0.57 -0.02 0.24 0.12 0.27 0.3 -0.03 -0.29
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Spov3_S06.00043 (CYP87A2)
 -0.07 0.21 -0.06 -0.32 -0.03 0.15 0.15 0.45 0.45 0.57 -0.16 0.08 0.28 -0.05 0.05 0.12 -0.27 -0.44 -0.65 -0.04 0.18 0.04 -0.93 -0.28 -0.33 -0.06 -0.27 -0.04 0.33 -0.06
-0.5 -0.71 -0.61 0.12 -0.58 -0.01 -0.21 0.41 0.01 -0.79 0.5 0.32 -0.51 0.41 -0.77 -0.42 -0.22 0.66 0.46 -0.78 1.22 0.64 0.36 -0.08 -0.9 -0.11 0.02 0.14 -0.09 -1.16
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Spov3_S12.00054 (PP2C52)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.