Heatmap: Cluster_118 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00092 (YSL7)	-0.04	-0.34	-0.25	-0.47	-0.73	-0.16	0.19	-0.23	-0.24	-0.04	0.08	0.11	0.31	0.37	0.61	0.33	0.29	-0.28	-0.29	-0.16	0.17	0.1	0.06	0.06	0.13	0.04	0.14	0.01	-0.26	-0.33
Spov3_C0005.00003	-0.39	-0.53	-0.48	-0.81	0.53	0.64	0.47	-0.67	0.02	-0.34	0.06	-0.04	0.13	0.33	0.66	0.33	0.36	-1.52	0.09	-0.04	0.01	0.08	-1.13	0.18	0.04	0.01	0.03	0.08	-0.12	-0.17
Spov3_C0006.00018 (ACR12)	-0.13	-0.02	-0.05	-0.35	0.28	0.29	0.24	-0.0	0.01	-0.14	0.06	0.18	0.09	0.18	0.26	0.03	0.08	-0.62	0.11	0.06	-0.06	0.16	-0.61	0.11	-0.1	-0.12	-0.12	0.01	-0.04	-0.25
Spov3_C0015.00030 (TDT)	-1.0	-1.1	-0.25	-0.28	-0.95	1.2	0.66	-0.79	0.22	-0.07	0.24	0.08	-0.38	-0.12	0.7	0.81	0.74	-3.0	0.38	0.09	0.42	0.51	-0.3	0.16	-0.17	-0.11	-0.09	-0.84	-1.25	-1.29
Spov3_C0016.00030 (GOX1)	0.14	0.07	0.12	-0.06	-0.29	0.41	0.49	0.25	0.09	-0.21	0.02	0.12	-0.21	0.06	0.22	0.21	0.1	-1.78	-0.0	-0.0	-0.05	0.1	-1.04	0.13	-0.01	-0.05	-0.09	-0.01	-0.05	-0.07
Spov3_C0017.00002 (LARP1a)	-0.14	-0.13	-0.01	0.03	-0.03	0.09	0.11	0.14	0.01	-0.1	0.13	0.12	0.15	-0.18	0.27	0.21	0.26	-0.77	-0.1	-0.03	-0.07	0.03	-0.15	-0.08	0.02	0.01	0.05	-0.0	-0.1	-0.04
Spov3_C0021.00023 (OSA1)	-0.16	-0.31	-0.22	-0.37	-0.73	0.38	0.68	0.27	-0.01	-0.2	0.26	0.29	0.33	-0.43	0.38	0.28	0.28	-1.2	-0.09	0.06	0.03	0.18	-0.65	0.04	0.17	0.08	0.09	-0.07	-0.4	-0.42
Spov3_C0048.00005 (SCY1)	0.03	0.12	-0.0	-0.06	-0.04	0.17	0.17	0.12	0.06	-0.05	0.08	0.15	0.07	0.16	0.2	0.15	0.18	-1.04	-0.12	-0.07	-0.12	0.03	-0.46	0.13	-0.02	-0.08	-0.13	0.13	-0.01	-0.25
Spov3_C0062.00016 (HCF101)	-0.05	-0.01	-0.1	-0.28	-0.61	0.07	0.37	0.08	0.12	0.01	0.19	0.23	0.06	-0.07	0.19	0.13	0.12	-1.01	-0.02	0.05	0.01	0.1	-0.26	0.24	0.18	0.09	0.09	0.11	-0.28	-0.49
Spov3_chr1.00206 (SWA2)	-0.24	-0.09	-0.72	-1.36	-0.76	0.44	0.09	-1.19	-0.37	-0.41	0.14	0.04	-0.64	-0.4	0.52	0.53	0.6	-1.12	0.43	0.35	0.71	0.55	-0.25	0.39	0.38	0.5	0.28	-0.63	-0.62	-0.42
Spov3_chr1.00340	0.07	0.06	-0.02	-0.2	-0.25	0.28	0.37	-0.17	0.11	0.0	0.04	0.15	-0.19	-0.34	0.2	0.22	0.11	-1.16	0.14	0.04	0.12	0.17	-0.8	0.13	0.12	0.18	0.12	-0.06	-0.09	-0.21
Spov3_chr1.00356 (WRKY2)	-0.03	-0.01	0.1	-0.07	-0.2	0.19	0.26	0.03	-0.12	-0.32	-0.1	0.08	-0.08	0.37	0.45	0.28	0.42	-0.34	-0.31	-0.24	-0.13	0.07	-0.55	-0.01	-0.06	0.01	0.03	-0.0	-0.12	-0.13
Spov3_chr1.00423	0.19	-0.03	-0.02	-0.2	0.11	0.13	0.29	-0.11	0.24	0.11	0.07	0.15	-0.02	-0.02	0.29	0.15	0.21	-0.7	-0.31	-0.06	-0.1	-0.02	-0.43	-0.15	-0.17	0.08	0.02	0.08	0.05	-0.3
Spov3_chr1.00771 (RSL2)	-0.43	-0.59	-0.34	-1.03	0.34	0.67	0.68	0.11	0.77	0.34	0.11	-0.05	-0.39	-0.5	-0.25	0.0	-0.22	-1.14	-0.14	0.09	-0.17	0.34	-1.11	0.5	0.4	0.2	0.09	0.25	-0.4	-0.61
Spov3_chr1.00824 (FBA1)	0.04	0.11	-0.0	-0.32	-0.44	0.18	0.3	0.09	0.01	-0.16	0.15	0.2	0.03	-0.16	0.23	0.19	0.28	-1.14	0.14	0.14	0.11	0.21	-0.79	0.13	0.1	0.11	0.07	-0.09	-0.33	-0.31
Spov3_chr1.03140 (FBP)	-0.09	-0.23	-0.38	-0.97	0.35	0.43	0.54	-0.24	0.09	-0.02	0.16	0.22	0.04	-0.13	0.24	0.16	0.19	-1.03	0.05	0.06	-0.06	0.09	-0.7	0.23	0.08	0.02	-0.07	0.16	-0.01	-0.38
Spov3_chr1.03231	-0.18	-0.25	-0.18	-0.35	-0.01	0.0	0.33	0.38	0.25	0.06	0.2	0.18	0.08	-0.19	-0.01	0.03	-0.01	-0.88	0.14	0.22	0.02	0.1	-0.46	0.17	0.16	0.11	0.08	-0.01	-0.09	-0.57
Spov3_chr1.03249 (BPP3)	-0.16	-0.22	0.01	0.17	-0.34	-0.15	0.09	0.35	-0.09	-0.15	0.01	0.08	0.16	-0.13	0.18	0.23	0.21	-0.45	0.06	-0.1	0.01	0.0	-0.13	0.04	0.06	0.04	0.18	0.1	-0.37	-0.05
Spov3_chr1.04063 (BLP1)	-0.04	-0.16	-0.1	0.04	-0.26	-0.06	0.22	0.38	0.18	-0.0	0.25	0.2	0.17	-0.27	0.05	0.03	0.1	-1.13	0.05	0.08	-0.05	-0.02	-0.46	0.03	0.18	0.0	0.03	0.2	-0.04	-0.3
Spov3_chr1.04526 (APX3)	0.08	0.06	-0.02	-0.18	0.13	0.12	0.18	-0.07	0.14	0.12	0.09	0.14	-0.05	-0.01	0.09	0.05	0.08	-0.58	-0.0	0.02	-0.06	-0.0	-0.56	-0.03	0.02	-0.03	-0.03	0.05	0.04	-0.07
Spov3_chr1.04657	-0.18	-0.29	-0.24	-0.78	-0.04	0.45	0.68	0.03	-0.11	-0.18	0.11	0.24	0.07	-0.71	0.55	0.39	0.42	-2.43	0.1	0.16	0.09	0.27	-0.5	0.21	0.13	0.03	-0.06	-0.03	-0.21	-0.67
Spov3_chr1.05102 (NPL1)	-0.06	0.06	-0.08	-0.35	-0.11	0.43	0.18	-0.31	0.14	0.15	0.06	0.16	-0.43	-0.11	0.29	0.2	0.15	-1.06	0.02	-0.13	0.1	0.13	-0.57	0.18	0.05	0.18	0.13	0.0	0.01	-0.17
Spov3_chr2.00305	-0.36	-0.37	-0.21	-0.12	-0.38	-0.09	-0.08	-0.16	0.13	0.02	0.21	0.16	0.05	-0.45	0.42	0.37	0.52	-0.84	0.02	0.09	0.2	0.25	-0.18	0.45	0.29	0.13	0.06	-0.47	-0.32	-0.32
Spov3_chr2.00538	-0.02	-0.23	-0.17	-0.42	-0.12	0.23	0.58	0.03	0.24	-0.01	0.27	0.29	0.31	-0.6	-0.04	0.04	-0.0	-0.89	0.22	0.2	0.03	0.12	-0.88	0.16	0.03	0.02	-0.02	-0.04	-0.25	-0.07
Spov3_chr2.00706	-0.35	-0.32	-0.42	-0.87	-0.56	0.56	0.35	-0.8	0.05	-0.27	0.22	0.23	-0.11	-0.34	0.48	0.54	0.29	-1.54	0.27	-0.07	0.26	0.22	-0.39	0.5	0.27	0.15	0.23	-0.15	-0.05	-0.47
Spov3_chr2.00934	-0.21	-0.23	-0.11	-0.26	-0.31	0.06	0.31	0.54	-0.12	-0.2	0.12	0.09	0.12	-0.32	0.43	0.23	0.35	-0.94	0.09	-0.05	0.04	0.15	-0.39	0.11	0.06	-0.02	0.04	-0.01	-0.24	-0.09
Spov3_chr2.01549 (RSH1)	-0.08	-0.04	0.12	-0.04	0.02	0.11	0.31	0.48	0.13	-0.02	0.08	0.22	0.01	-0.98	0.02	0.07	0.15	-1.21	-0.19	-0.13	-0.07	0.05	-0.27	-0.11	-0.02	0.08	0.04	0.2	0.05	0.1
Spov3_chr2.02117 (SLP1)	0.12	-0.03	-0.12	-0.43	0.15	0.3	0.48	0.1	0.04	-0.02	0.08	0.23	0.07	0.08	0.1	0.04	-0.0	-0.64	-0.03	0.01	-0.12	0.06	-0.42	0.04	-0.17	-0.2	-0.23	0.19	0.06	-0.21
Spov3_chr2.02458	-0.43	-0.18	-0.61	-1.69	0.11	0.62	0.75	0.68	0.44	0.36	0.29	0.58	-0.44	0.32	-0.28	0.06	-0.2	-2.55	-0.05	0.03	-0.12	0.18	-1.49	0.19	-0.08	0.11	0.02	0.39	-0.29	-0.89
Spov3_chr2.02714 (ZKT)	-0.01	-0.25	-0.11	-0.27	-0.2	0.13	0.49	0.2	0.25	0.13	0.19	0.22	0.05	-0.26	-0.07	-0.0	-0.1	-0.43	-0.01	0.09	0.02	0.08	-0.68	0.13	0.16	-0.0	0.02	0.12	-0.04	-0.32
Spov3_chr2.03735 (STM)	0.08	0.07	-0.03	-0.35	-0.19	0.31	0.39	0.1	0.08	-0.1	0.1	0.24	-0.01	-0.09	0.16	0.08	-0.01	-0.83	0.03	0.06	-0.04	0.14	-0.78	0.15	-0.01	-0.01	-0.07	0.1	-0.01	-0.16
Spov3_chr2.03960 (CHUP1)	-0.11	-0.19	-0.16	-0.43	0.09	0.43	0.41	-0.08	0.05	-0.08	0.14	0.23	-0.07	-0.29	0.34	0.2	0.25	-1.53	-0.05	-0.01	0.03	0.15	-0.78	0.23	0.11	0.11	0.06	0.02	-0.02	-0.22
Spov3_chr2.03997	0.31	-0.09	0.09	0.07	-0.41	-0.31	0.28	0.23	-0.06	-0.12	0.09	0.06	0.09	-0.64	0.29	0.26	0.41	-0.67	-0.07	-0.03	-0.01	-0.05	0.1	0.08	0.15	-0.08	0.21	-0.06	-0.36	-0.5
Spov3_chr3.00411 (PGM3)	-0.04	-0.27	-0.06	-0.15	-0.05	0.1	0.48	0.3	-0.01	-0.22	0.17	0.16	0.29	-0.4	0.24	0.08	0.14	-0.99	0.04	0.19	0.01	0.18	-0.32	0.0	0.09	0.01	0.03	-0.07	-0.35	-0.3
Spov3_chr3.00887 (DPG1)	-0.4	-0.41	-0.11	0.17	-0.31	-0.1	0.17	0.23	0.1	-0.05	0.27	0.24	0.42	-0.86	0.08	0.11	0.28	-1.06	0.15	0.12	0.12	0.15	-0.26	-0.24	0.12	0.15	0.27	-0.15	-0.32	0.09
Spov3_chr3.00913 (PMDH2)	0.07	0.07	-0.01	-0.48	0.21	0.23	0.29	-0.21	0.06	-0.05	0.14	0.22	0.03	-0.19	0.25	0.18	0.21	-1.13	0.07	0.05	0.01	0.11	-0.65	0.04	0.0	0.01	0.03	0.13	-0.09	-0.38
Spov3_chr3.01172	-0.05	-0.1	0.03	0.17	-0.35	-0.02	0.12	0.19	0.04	-0.2	0.15	0.06	-0.0	-0.24	0.3	0.24	0.28	-0.57	-0.09	-0.02	-0.02	0.1	-0.29	-0.1	0.1	0.05	0.11	-0.17	-0.17	0.07
Spov3_chr3.01466 (MCA1)	-0.1	-0.26	-0.14	0.06	-0.19	0.1	0.23	0.16	-0.01	-0.0	0.11	0.09	0.1	-0.41	0.18	0.31	0.44	-0.37	-0.01	-0.2	-0.05	-0.03	-0.24	0.05	0.15	0.11	0.21	-0.1	-0.18	-0.47
Spov3_chr3.01748 (DML3)	-0.44	-0.61	-0.41	-0.52	0.06	0.35	0.56	0.13	0.2	-0.05	0.21	0.15	0.34	-0.58	0.16	0.14	0.17	-0.76	0.05	0.25	0.12	0.21	-0.33	0.3	0.29	0.03	-0.03	-0.17	-0.36	-0.64
Spov3_chr3.01851 (F2KP)	0.1	-0.09	-0.07	-0.04	-0.11	0.11	0.42	0.4	0.12	-0.08	0.1	0.15	0.11	-0.34	0.16	0.09	0.04	-1.21	-0.11	0.0	-0.12	0.07	-0.54	0.21	0.11	-0.09	-0.15	0.25	0.08	-0.37
Spov3_chr3.03133 (GOX1)	-0.08	-0.08	-0.1	-0.27	-0.41	0.34	0.43	0.14	0.17	-0.12	0.18	0.29	0.01	0.16	0.27	0.32	0.21	-1.75	-0.0	0.1	0.05	0.15	-0.96	0.13	0.04	0.06	0.01	-0.11	-0.29	-0.29
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.