Heatmap: Cluster_87 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.05 -0.04 -0.26 -0.51 0.03 0.2 0.33 0.11 -0.11 0.01 0.08 0.14 0.29 0.14 0.17 0.12 0.12 -0.28 -0.1 -0.1 -0.05 -0.09 0.02 0.12 -0.06 -0.07 -0.07 0.02 -0.16 -0.4
-0.27 -0.24 -0.48 -0.54 -0.29 0.15 0.45 0.17 -0.23 -0.13 0.13 0.02 0.21 0.37 0.57 0.19 0.39 -0.44 0.06 0.06 0.09 0.02 -0.12 0.07 -0.06 0.13 0.06 -0.18 -0.59 -0.5
-0.05 -0.07 -0.66 -0.95 0.15 0.35 0.2 -0.24 -0.58 -0.33 -0.2 -0.1 0.33 0.57 0.61 0.35 0.35 -0.32 -0.27 -0.38 -0.08 -0.02 0.09 0.24 -0.03 0.07 -0.03 0.04 -0.06 -0.16
-0.06 0.05 -0.21 -0.29 -0.0 0.2 0.23 0.17 -0.02 -0.09 -0.07 -0.06 -0.22 0.39 0.25 0.27 0.21 -0.27 -0.03 -0.03 -0.08 -0.05 -0.54 0.14 -0.0 -0.01 -0.0 -0.1 0.01 -0.17
-0.91 -0.88 -0.3 -0.21 -0.88 0.4 0.89 0.68 -0.08 -0.57 0.29 0.1 0.21 -1.09 0.32 0.14 0.25 -1.34 0.35 0.43 0.36 0.45 -0.32 0.0 0.21 0.3 0.31 -0.69 -1.05 -0.65
0.13 -0.06 -0.33 -0.42 -0.09 0.36 0.23 -0.28 -0.24 -0.31 -0.1 0.0 0.01 0.46 0.47 0.35 0.31 -0.32 -0.18 -0.2 -0.02 -0.04 -0.4 0.07 -0.04 0.01 -0.07 0.05 -0.05 0.08
0.15 0.0 -0.22 -0.54 -0.2 0.02 0.41 0.39 0.02 -0.2 0.04 0.09 0.25 0.35 -0.04 -0.06 -0.03 -0.14 -0.03 0.04 -0.2 -0.02 -0.18 0.3 0.15 -0.03 -0.13 0.02 -0.12 -0.62
-0.3 -0.29 -0.46 -0.5 -0.04 0.2 0.16 -0.25 -0.22 -0.25 0.05 0.05 0.29 0.57 0.59 0.38 0.44 -0.39 -0.09 0.0 0.04 -0.06 -0.36 -0.02 -0.03 -0.0 -0.12 -0.39 -0.14 0.26
-0.07 -0.15 -0.33 -0.57 -0.63 0.24 0.36 0.18 -0.05 -0.11 0.16 0.22 0.06 0.25 0.4 0.27 0.2 -1.0 -0.06 0.01 -0.05 0.1 -0.33 0.37 0.17 -0.01 0.02 -0.1 -0.11 -0.36
-0.18 -0.45 -0.84 -1.23 -0.75 0.56 0.7 0.14 -0.55 -0.51 -0.03 0.02 0.57 0.87 0.42 0.39 0.19 0.05 -0.23 0.05 -0.11 0.22 -0.62 0.25 -0.01 -0.05 -0.13 -0.18 -0.58 -0.24
-0.17 -0.49 -0.94 -1.37 -0.91 1.0 0.57 -0.88 -0.45 -0.43 -0.14 0.14 0.62 1.09 1.05 0.76 0.48 -1.49 -0.25 -0.19 -0.05 0.09 -0.77 0.12 -0.25 -0.07 -0.25 -1.01 -0.51 0.04
-0.52 -0.56 -0.66 -0.96 -0.51 0.34 0.71 0.38 -0.41 -0.65 0.09 0.19 0.34 0.45 0.34 0.18 0.18 -0.88 0.15 0.22 0.07 0.2 0.16 0.32 0.19 0.01 -0.03 -0.2 -0.58 -0.36
0.06 -0.07 -0.4 -0.83 -0.31 0.55 0.5 -0.33 -0.15 -0.19 -0.01 0.14 -0.15 0.32 0.4 0.38 0.24 -0.96 -0.1 -0.09 0.07 0.19 -0.38 0.41 0.12 0.08 -0.06 -0.08 -0.17 -0.36
-0.69 -0.33 -0.91 -1.32 0.04 0.58 0.54 0.47 -0.44 -0.34 -0.0 0.1 -0.19 0.93 0.45 0.33 0.52 -1.71 -0.04 0.04 -0.05 0.05 -0.92 0.06 0.03 0.13 0.09 0.03 -0.16 -0.18
-0.41 -0.43 -0.38 -0.39 -0.35 0.15 0.47 0.28 -0.04 -0.14 0.07 0.07 0.34 0.05 0.43 0.49 0.46 -0.88 0.04 -0.06 -0.23 0.14 -0.39 0.38 0.12 0.03 -0.1 -0.53 -0.2 -0.1
-0.09 0.06 -0.54 -1.1 0.14 0.42 0.4 0.16 -0.27 -0.1 -0.13 -0.04 0.09 0.58 0.54 0.44 0.26 -0.34 -0.37 -0.22 -0.19 0.03 -0.34 0.17 -0.07 0.05 -0.17 -0.0 -0.07 -0.49
-0.59 -0.58 -0.48 -0.46 0.12 0.6 0.39 -0.13 -0.3 -0.13 -0.09 0.05 -0.03 0.73 0.32 0.18 0.21 -0.3 -0.1 -0.02 0.09 0.05 0.55 -0.06 -0.24 0.03 0.1 -0.14 -0.5 -0.46
-0.4 -0.54 -1.11 -1.63 -0.64 0.9 0.77 -0.34 -0.51 -0.48 -0.22 0.02 0.3 0.97 0.72 0.53 0.33 -0.08 -0.17 -0.07 -0.1 0.0 0.06 0.32 0.02 0.09 -0.22 -0.45 -0.64 -0.73
-0.01 -0.31 -0.31 -0.45 -0.35 0.54 0.49 -0.16 0.04 -0.19 0.13 0.28 -0.02 0.14 0.42 0.23 0.24 0.01 -0.18 -0.11 -0.14 -0.06 -0.53 -0.09 -0.06 -0.03 0.02 -0.02 -0.05 -0.16
-0.1 -0.24 -0.1 -0.2 -0.58 0.12 0.39 0.23 -0.18 -0.33 0.05 0.06 0.28 -0.39 0.12 0.23 0.19 -0.57 0.04 0.14 0.1 0.18 -0.41 0.16 0.19 0.11 0.1 -0.1 -0.29 0.17
0.05 0.09 -0.11 -0.35 -0.19 0.26 0.3 0.08 -0.11 -0.25 0.01 0.06 0.08 0.42 0.46 0.39 0.4 -1.22 0.02 0.0 0.07 0.1 -0.33 0.15 0.07 0.1 -0.01 -0.25 -0.75 -0.76
-0.39 -0.44 -0.68 -0.9 -0.58 0.57 0.44 -0.1 -0.39 -0.49 -0.08 0.03 0.31 0.73 0.76 0.55 0.43 -0.14 -0.2 -0.09 -0.07 0.1 -0.1 0.26 0.01 -0.02 -0.1 -0.37 -0.54 -0.38
-0.01 -0.08 -0.3 -0.52 -0.59 0.71 0.55 0.03 -0.21 -0.35 -0.04 0.09 -0.1 0.54 0.56 0.43 0.25 -0.32 -0.12 -0.08 -0.05 0.01 -0.29 0.0 -0.14 -0.07 -0.15 -0.44 -0.31 -0.13
-0.57 -0.53 -0.77 -0.77 -0.38 0.79 0.52 0.07 -0.46 -0.49 -0.22 -0.11 0.32 0.93 0.57 0.51 0.43 -0.2 -0.16 -0.0 0.03 0.1 -0.36 -0.06 -0.19 -0.01 -0.08 -0.31 -0.55 -0.1
-0.5 -0.55 -0.65 -0.69 -0.62 0.38 0.54 0.38 -0.46 -0.71 -0.14 -0.04 0.77 0.01 0.65 0.53 0.49 -0.85 0.01 0.16 -0.05 0.14 0.39 -0.02 -0.12 -0.14 -0.11 -0.74 -0.58 0.31
-0.31 -0.6 -0.4 -0.43 -0.75 0.33 0.47 0.46 0.18 -0.13 0.38 0.38 0.28 -0.53 0.41 0.32 0.46 -1.59 0.18 0.33 -0.01 0.23 -1.37 0.07 0.2 0.14 0.02 -0.37 -0.39 -0.35
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-0.22 -0.33 -0.61 -1.06 -0.32 0.87 0.82 -0.08 -0.3 -0.33 -0.12 0.11 -0.04 -0.17 0.28 0.27 0.01 -1.2 0.33 0.36 0.23 0.5 -1.13 0.58 0.12 0.09 -0.05 -0.27 -0.23 -0.58
0.16 -0.08 -0.04 -0.12 0.05 -0.03 0.18 0.16 0.13 -0.01 0.05 -0.07 0.26 -0.16 -0.11 0.05 -0.06 -0.28 0.02 0.1 -0.03 0.04 -0.34 0.26 0.04 -0.17 -0.1 0.1 0.14 -0.43
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-0.42 -0.4 -0.31 -0.18 -0.31 0.14 0.45 0.4 -0.17 -0.16 0.2 0.15 0.31 0.07 0.16 0.22 0.2 -0.5 -0.02 0.14 -0.06 0.14 -0.43 0.13 0.0 0.09 0.03 -0.14 -0.26 -0.09
-0.3 -0.58 -0.76 -0.59 -2.24 0.27 0.54 -0.14 -0.49 -0.59 -0.19 -0.23 0.66 1.14 0.94 0.88 0.68 -0.37 -0.29 -0.19 -0.1 0.03 -0.18 0.24 0.08 -0.11 -0.16 -0.79 -0.88 -0.44
-0.29 -0.21 -0.3 -0.41 -0.28 0.35 0.37 0.1 -0.4 -0.3 -0.11 -0.08 0.46 0.38 0.59 0.59 0.55 -1.0 -0.0 0.0 0.03 0.07 -0.09 -0.1 -0.1 -0.04 -0.07 -0.47 -0.51 -0.03
0.08 -0.24 -0.24 -0.67 0.04 0.65 0.32 -0.61 -0.4 -0.11 -0.04 -0.05 -0.29 0.83 0.28 0.3 0.13 -0.15 -0.02 -0.31 -0.05 -0.1 0.61 0.08 0.07 -0.14 -0.07 -0.48 -0.41 -0.29
-0.11 -0.14 -0.36 -0.55 -0.57 0.16 0.25 -0.36 0.05 -0.01 0.14 0.22 0.16 0.93 0.42 0.28 0.14 -0.98 0.01 0.15 0.06 0.11 -0.55 0.17 0.02 0.04 -0.05 -0.2 -0.37 -0.38
-0.52 -0.54 -0.52 -0.39 0.14 0.67 0.43 -0.38 -0.18 -0.26 -0.03 0.03 0.08 -0.06 0.93 0.78 0.77 -0.61 -0.33 -0.31 -0.1 -0.05 0.18 0.18 -0.1 -0.05 -0.2 -0.4 -0.45 -0.75
-0.85 -0.58 -0.82 -1.24 0.19 1.14 0.6 0.49 -0.51 -0.21 -0.15 0.06 -1.36 1.57 0.33 0.33 -0.08 -0.91 0.01 -0.17 0.11 -0.02 1.2 -0.91 -1.05 -0.52 -0.92 -0.3 -0.42 -0.69
-0.41 -0.56 -0.75 -0.91 -0.63 0.49 0.75 0.32 -0.44 -0.52 -0.04 0.06 0.58 0.83 0.63 0.46 0.36 -0.55 -0.13 -0.03 -0.13 0.08 0.14 0.16 -0.02 -0.15 -0.24 -0.42 -0.72 -0.55
-1.44 -1.35 -1.89 -2.95 -1.42 1.43 1.14 0.15 -0.69 -0.58 -0.39 0.07 0.49 1.57 0.92 0.59 0.28 -0.29 -0.28 0.07 -0.05 0.21 -0.02 0.18 -0.42 -0.52 -0.98 -1.51 -1.77 -0.22
-0.42 -0.65 -0.47 -0.48 -0.34 0.22 0.48 0.34 -0.12 -0.26 0.18 0.17 0.45 -0.17 0.26 0.25 0.2 -0.69 0.14 0.24 0.1 0.18 -0.44 0.27 0.22 0.1 0.11 -0.11 -0.52 -0.39
-0.5 -0.59 -0.81 -1.04 -0.6 0.61 0.63 -0.12 -0.4 -0.62 -0.04 0.1 0.18 1.23 0.66 0.48 0.41 -0.72 0.01 0.16 0.02 0.16 -0.16 0.18 -0.08 -0.05 -0.2 -0.58 -0.73 -0.45
-0.32 -0.83 -0.61 -0.17 -0.91 0.57 0.49 0.33 -0.34 -0.74 0.05 -0.14 1.0 0.69 0.56 0.66 0.49 -1.27 0.15 0.21 -0.09 0.11 -1.27 -0.48 0.19 -0.08 0.09 -0.73 -1.29 -0.0
0.29 0.24 -0.37 -1.07 -0.7 0.01 0.73 0.68 -0.2 -0.23 0.12 0.13 0.42 0.48 -0.2 0.02 -0.02 -1.04 0.21 0.2 -0.06 -0.0 -0.04 0.52 0.09 -0.1 -0.08 -0.16 -0.84 -1.3
-0.27 -0.41 -0.52 -0.56 0.18 0.29 0.44 0.48 -0.03 -0.29 -0.04 0.02 0.43 0.15 0.28 0.24 0.2 -0.53 -0.19 0.02 -0.15 0.0 -0.2 0.2 -0.0 -0.11 -0.2 -0.15 -0.07 -0.04
-0.33 -0.41 -0.9 -1.55 -0.28 0.4 0.61 0.28 -0.47 -0.48 -0.27 0.04 0.28 0.86 0.44 0.46 0.17 -0.06 0.12 0.22 0.08 0.22 -0.12 0.44 0.04 0.03 -0.18 -0.76 -0.79 -0.52
0.03 -0.21 -0.13 -0.3 -0.41 0.32 0.47 0.01 0.05 -0.19 0.17 0.19 0.07 -0.07 0.36 0.27 0.2 -0.68 0.02 0.06 -0.03 0.09 -0.27 -0.05 -0.12 0.0 -0.05 -0.03 -0.16 -0.12
-0.65 -0.59 -0.68 -1.53 -1.11 0.29 0.71 -0.09 -0.05 -0.13 0.26 0.36 0.22 0.01 0.43 0.73 0.71 -1.2 0.12 0.29 0.05 0.29 -1.11 0.02 -0.08 0.23 0.11 -0.41 -0.41 0.15
Spov3_chr2.00066 (CYP71A20)
-0.27 -0.1 -0.69 -1.42 -0.69 0.7 0.7 -0.17 -0.18 -0.01 0.02 0.25 0.36 0.66 0.29 0.51 0.27 -0.48 -0.09 -0.05 -0.13 0.07 -1.13 0.1 -0.22 0.15 -0.25 -0.51 -0.33 0.36
-0.05 -0.08 -0.44 -0.65 -0.15 0.39 0.38 -0.04 -0.19 -0.17 -0.02 0.07 0.16 0.57 0.26 0.24 0.18 -0.04 -0.04 -0.07 0.0 0.03 -0.29 0.17 -0.1 -0.03 -0.13 -0.15 -0.25 -0.2
Spov3_chr2.00619 (THRUMIN1)
0.07 -0.49 -0.43 -0.45 -0.12 0.75 0.57 -0.09 -0.25 -0.44 0.02 0.02 0.3 -0.32 0.79 0.66 0.49 -1.45 -0.11 -0.09 -0.06 0.16 -0.89 0.1 -0.09 -0.15 -0.21 -0.2 -0.26 0.1
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Spov3_chr5.00829 (NPF5.10)
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Spov3_chr5.01340 (NTMC2T5.2)
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-0.48 -0.86 -1.31 -1.91 -1.02 1.07 0.93 -0.5 -0.79 -0.88 -0.12 -0.17 0.59 1.1 1.09 0.86 0.59 -0.71 -0.23 -0.11 0.04 0.1 -0.33 0.22 -0.04 0.02 -0.32 -0.76 -1.23 -0.8
-0.29 -0.37 -0.25 -0.23 -0.14 0.03 0.33 0.18 0.09 0.05 0.17 0.26 0.3 -0.15 0.12 0.03 0.09 -0.41 0.03 0.11 0.07 0.11 -0.31 -0.08 0.1 0.07 0.1 0.14 -0.18 -0.36
0.14 -0.09 -0.27 -0.46 -0.01 0.29 0.46 0.23 0.17 0.13 0.11 0.25 0.09 0.18 -0.08 -0.07 -0.2 -0.31 -0.08 0.11 -0.19 0.04 -0.35 0.16 0.04 -0.12 -0.21 0.12 0.02 -0.64
-0.9 -0.58 -0.9 -1.5 -0.09 0.8 0.52 0.11 -0.89 -0.68 -0.21 0.01 0.21 1.21 0.81 0.59 0.44 -1.07 -0.13 0.02 0.06 0.13 -0.99 0.24 -0.19 0.1 -0.17 -0.89 -0.63 0.43
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Spov3_chr5.03661 (GLXI-like;11)
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-0.56 -0.68 -0.78 -0.85 -0.44 0.21 0.4 -0.07 0.02 -0.17 0.23 0.19 0.47 0.48 0.56 0.45 0.46 -0.28 0.04 0.11 0.04 0.24 -0.14 0.2 0.09 0.07 -0.15 -0.41 -0.67 -0.74
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Spov3_chr6.01130 (ER-ANT1)
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-0.29 -0.5 -0.61 -0.63 -0.28 0.52 0.52 -0.0 -0.26 -0.38 -0.08 -0.08 0.29 1.15 0.46 0.29 0.29 -0.3 -0.11 -0.09 -0.17 0.09 -0.6 0.17 0.01 -0.09 -0.17 -0.16 -0.28 -0.42
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Spov3_chr6.02491 (AtHMP09)
0.24 -0.33 -0.45 -0.6 -0.1 0.25 -0.01 -1.17 -0.12 -0.4 0.18 0.01 0.66 0.6 0.52 0.28 0.3 0.75 -0.0 0.22 -0.2 0.02 -0.5 -0.42 -0.19 -0.15 -0.23 -0.63 -0.63 0.24
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Spov3_S08.00017 (DUF177B)
-0.23 -0.34 -0.34 -0.43 -0.16 0.47 0.36 -0.22 -0.07 -0.13 0.02 0.04 0.1 -0.15 0.64 0.62 0.58 -1.1 -0.06 -0.0 0.04 0.05 -0.44 0.23 0.05 0.06 -0.1 -0.38 -0.28 -0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.