1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_7 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
56.65 48.78 96.64 86.11 52.83 55.96 65.23 44.82 94.86 57.98 58.84 47.03 57.34 31.09 47.06 62.88 60.05 988.76 91.73 86.19 80.28 76.08 78.36 26.82 45.86 57.87 63.83 52.11 40.38 52.91
0.28 0.63 0.23 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.3 0.11 0.12 3.11 0.14 0.08 0.08 0.01 20.19 0.32 0.05 0.47 0.18 3.37 0.23 0.43 0.23 0.33 0.43 0.13 0.01
0.18 0.56 0.28 0.05 0.22 0.11 0.03 0.09 0.1 0.45 0.12 0.06 5.41 0.16 0.1 0.15 0.07 42.25 0.31 0.07 0.39 0.43 5.75 0.16 0.32 0.27 0.32 0.71 0.1 0.05
0.07 0.04 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.48 0.02 0.15 0.0 0.0 3.41 0.0 0.0 0.08 0.0 0.52 0.05 0.12 0.03 0.09 0.06 0.05 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 4.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
8.84 10.37 5.39 4.89 8.41 10.59 6.24 3.61 4.97 6.24 5.14 6.5 11.78 5.82 5.13 5.76 5.34 192.4 5.18 5.22 4.04 5.25 9.24 14.01 5.69 6.24 5.19 6.99 7.5 8.44
0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.04 0.02 0.01 0.01 0.12 0.01 0.02 0.01 0.01 0.09 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.03
0.39 0.3 0.14 0.15 0.34 0.11 0.18 0.13 0.1 0.2 0.13 0.15 0.23 0.27 0.12 0.06 0.16 20.88 0.17 0.16 0.21 0.11 1.0 0.21 0.26 0.1 0.14 0.09 0.15 0.19
0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.02 0.17 0.05 0.0 0.01 0.0 1.11 0.0 0.0 0.01 0.05 0.13 0.01 0.02 0.02 0.04 0.05 0.03 0.01
1.65 1.34 1.18 0.35 1.89 0.09 0.03 0.08 0.48 1.39 0.35 0.29 6.27 0.84 0.47 0.25 0.17 52.94 0.51 0.13 1.43 1.06 9.15 0.62 1.39 0.74 1.29 1.61 1.19 0.14
4.48 4.86 5.04 5.81 4.62 3.55 4.21 5.31 4.14 4.57 4.84 4.34 5.25 5.02 6.18 5.48 5.55 37.06 4.51 4.72 5.34 5.23 9.89 4.22 5.15 4.28 5.21 3.92 3.88 3.87
4.1 4.16 4.1 5.1 5.93 7.03 6.1 5.87 4.28 3.8 6.05 5.09 8.98 5.58 8.54 6.66 8.04 30.1 4.76 5.95 4.94 5.3 7.97 5.45 5.7 5.43 5.56 4.43 4.37 5.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.02 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.4 1.31 0.35 0.0 0.8 0.16 0.36 1.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 4.09 0.37 0.19 0.0 89.18 0.94 0.19 0.22 0.0 8.35 0.0 0.0 0.44 0.0 0.41 0.2 0.17
1.62 1.22 0.3 0.93 1.71 0.69 1.46 0.81 1.83 3.1 1.57 2.55 1.98 1.81 0.86 0.55 1.79 273.95 2.33 2.53 0.84 1.75 2.53 0.83 1.35 1.77 1.52 1.85 1.57 1.94
4.85 5.28 4.82 3.82 6.49 6.78 6.98 6.24 9.57 8.84 8.51 8.06 12.89 5.49 8.5 7.14 8.14 68.73 6.29 7.34 9.04 7.53 12.45 8.02 8.44 7.23 7.43 6.08 5.04 3.9
Spov3_chr2.04146 (CYP81D2)
 0.03 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01
0.05 0.16 0.15 0.09 0.09 0.02 0.02 0.09 0.05 0.21 0.05 0.13 6.17 0.05 0.04 0.07 0.01 36.04 0.06 0.04 0.28 0.22 5.96 0.04 0.12 0.08 0.2 0.31 0.1 0.07
0.14 0.58 0.41 0.45 0.36 0.91 0.34 0.53 0.24 0.38 0.51 0.41 0.52 2.41 0.59 0.54 1.44 6.68 0.68 0.36 0.93 0.34 0.56 0.79 0.55 0.65 0.34 0.57 0.43 1.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.47 0.4 0.39 0.33 0.29 0.17 0.33 0.37 0.19 0.41 0.3 0.22 0.51 0.19 0.31 0.34 0.23 5.16 0.3 0.42 0.43 0.42 0.98 0.45 0.49 0.37 0.36 0.61 0.52 0.33
0.14 0.14 0.13 0.1 0.24 0.05 0.13 0.15 0.1 0.13 0.15 0.04 0.19 0.13 0.13 0.08 0.12 2.57 0.08 0.07 0.08 0.07 0.34 0.15 0.09 0.09 0.12 0.18 0.12 0.19
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.63 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.43 0.3 0.28 0.08 0.05 0.01 0.18 0.04 0.42 0.14 0.12 19.55 0.14 0.25 0.08 0.08 134.46 0.25 0.19 0.37 0.38 17.61 0.21 0.35 0.18 0.71 1.04 0.23 0.18
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31.11 0.02 0.0 0.02 0.0 0.15 0.05 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0
0.35 0.21 0.31 0.18 0.3 0.19 0.2 0.13 0.18 0.25 0.16 0.33 0.24 0.6 0.17 0.29 0.16 7.03 0.23 0.19 0.06 0.55 0.19 0.14 0.12 0.18 0.12 0.23 0.14 0.06
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.13 0.14 0.15 0.2 0.14 0.07 0.03 0.13 0.16 0.1 0.11 0.07 0.04 0.14 0.07 0.09 0.1 1.23 0.07 0.07 0.12 0.09 0.09 0.1 0.04 0.11 0.12 0.15 0.18 0.22
1.04 0.98 0.77 0.53 0.85 3.56 2.98 1.16 1.07 0.79 1.63 2.07 6.15 2.21 2.77 1.98 1.83 30.72 1.44 1.98 1.53 2.03 3.92 1.35 1.44 1.52 1.53 0.89 0.74 1.44
0.88 0.54 0.37 0.16 0.24 0.19 0.2 0.0 0.06 0.21 0.21 0.29 0.17 0.49 0.19 0.11 0.0 3.99 0.22 0.0 0.0 0.27 0.42 0.0 0.37 0.42 0.0 0.06 0.18 0.11
0.94 0.88 0.47 0.26 0.21 0.08 0.0 0.07 0.22 1.21 0.45 0.19 5.34 0.44 0.04 0.17 0.1 34.52 0.66 0.16 0.67 0.58 3.54 0.37 0.62 0.55 0.78 1.19 0.61 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.71 0.46 0.23 0.06 0.06 0.04 0.12 0.18 1.02 0.13 0.15 11.06 0.06 0.11 0.04 0.02 49.77 0.18 0.16 0.46 0.29 6.74 0.24 0.3 0.2 0.49 0.88 0.36 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.15 0.11 0.02 0.22 0.14 0.06 0.09 0.03 0.05 0.04 0.02 3.86 0.21 0.53 0.08 0.08 36.41 0.04 0.06 0.08 0.07 21.46 0.07 0.04 0.06 0.11 0.1 0.05 0.09
0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.68 4.02 3.42 3.89 3.94 3.85 4.18 4.51 3.76 4.02 3.58 3.87 3.92 4.9 4.39 4.54 4.45 35.42 3.51 3.33 3.65 4.05 2.84 4.04 3.8 4.04 3.37 4.17 3.78 3.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
5.67 3.9 5.92 16.16 1.02 0.92 0.76 1.52 2.66 3.29 1.3 1.03 18.34 1.42 1.61 1.79 1.1 173.25 2.1 1.06 3.47 1.92 35.65 1.55 2.23 1.85 2.43 2.59 1.9 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.3 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
Spov3_chr5.04157 (UMAMIT34)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.13 0.19 0.16 0.12 0.07 0.08 0.07 0.16 0.17 0.14 0.13 0.1 0.1 0.15 0.1 0.28 2.07 0.14 0.13 0.16 0.15 0.16 0.23 0.2 0.12 0.15 0.12 0.11 0.03
1.41 1.55 1.72 1.98 1.37 1.23 0.99 1.66 1.18 1.74 1.42 1.35 1.06 1.86 1.57 1.66 1.42 22.12 0.9 1.11 1.42 1.08 1.16 0.94 1.37 1.84 1.65 1.41 2.11 1.85
0.09 0.09 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.2 0.02 0.04 0.0 3.75 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.1 0.04 0.02 0.0 0.0
0.02 0.0 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.07 0.07 0.01 0.09 0.12 0.03 0.03 0.02 0.87 0.16 0.01 0.02 0.04 0.04 0.0 0.03 0.03 0.04 0.06 0.01 0.04
0.19 0.27 0.02 0.08 0.04 0.22 0.08 0.02 0.0 0.07 0.12 0.0 0.17 0.13 0.06 0.12 0.15 0.95 0.0 0.08 0.0 0.1 0.58 0.02 0.04 0.0 0.06 0.18 0.1 0.16
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.35 0.12 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.31 0.27 1.13 0.29 0.31 99.26 0.0 1.33 0.0 0.0 2.66 0.0 0.13 0.12 0.0 0.0 0.33 0.43
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.5 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)