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Heatmap: Cluster_157 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.06 -0.09 0.1 0.13 -0.08 0.25 0.13 -0.39 0.25 0.06 0.2 0.13 -0.28 -0.29 0.13 0.25 0.18 -1.37 0.09 0.01 0.07 0.1 -0.46 0.05 0.05 0.04 0.02 0.18 -0.03 -0.32
0.1 -0.02 0.26 0.44 0.35 0.16 0.14 -0.21 0.41 0.18 0.06 -0.09 -0.36 -1.08 0.07 0.12 0.12 -1.16 -0.02 -0.18 0.11 -0.03 -0.08 -0.12 -0.04 -0.06 -0.05 -0.04 0.21 -0.23
0.24 0.05 0.01 0.19 -0.88 -1.48 -0.42 0.68 -0.03 -0.09 -1.5 -0.68 0.16 -0.36 0.07 -0.95 0.68 0.3 -0.06 0.9 0.46 0.21 0.57 -0.73 -1.76 -0.31 0.74 -1.38 0.73 -0.12
0.06 -0.22 -0.17 -0.34 0.17 0.22 0.18 -0.07 0.03 -0.04 0.18 0.27 0.09 -0.85 0.13 0.19 0.17 -1.66 0.06 -0.05 0.02 -0.03 -0.23 0.22 0.15 0.15 0.11 0.07 -0.05 0.12
-0.02 0.03 0.53 0.56 -0.45 -0.98 -0.52 0.58 0.62 0.44 0.18 0.11 -0.12 -0.89 -0.85 -0.72 -0.66 0.38 -0.09 -0.0 -0.03 -0.02 -0.31 -0.27 -0.08 -0.1 0.02 0.35 0.4 -0.08
0.4 0.12 0.38 0.41 0.67 0.15 -0.06 -0.34 0.56 0.37 0.02 0.03 -0.89 -0.8 -0.09 -0.01 -0.09 -1.16 -0.18 -0.31 -0.09 -0.19 -0.05 -0.08 -0.22 -0.13 -0.23 0.32 0.33 -0.45
0.41 0.15 0.4 -0.05 0.43 0.58 0.35 -0.32 0.29 0.08 -0.0 0.15 -0.63 -0.38 -0.08 0.01 -0.11 -2.01 -0.13 -0.1 -0.17 -0.05 -0.26 0.15 -0.27 -0.26 -0.41 0.16 0.35 -0.02
0.14 -0.11 0.27 0.14 0.12 0.41 0.13 -0.47 0.35 0.26 0.06 0.22 -0.71 -1.0 -0.27 -0.21 -0.29 -0.5 -0.09 0.04 0.09 0.17 0.55 0.43 -0.09 -0.16 -0.3 0.09 -0.02 -0.42
-0.05 -0.06 -0.04 0.01 0.13 0.16 0.2 -0.14 0.32 0.25 0.2 0.21 -0.09 -0.52 0.17 0.22 0.24 -1.38 -0.2 -0.25 -0.07 0.02 -0.56 0.14 0.03 0.11 0.02 0.07 0.09 -0.1
-0.01 -0.24 0.11 0.36 -0.01 -0.08 0.15 0.14 0.32 0.11 0.16 0.13 -0.12 -1.51 0.17 0.17 0.14 -1.57 -0.1 -0.16 -0.04 -0.11 0.03 0.26 0.02 0.01 0.08 0.28 0.22 -0.42
1.09 0.14 1.06 0.72 -2.07 0.46 0.1 0.62 0.88 0.38 0.77 0.49 -1.27 -2.03 -0.4 -0.79 -1.46 -0.62 0.04 0.08 0.28 -0.77 -0.76 -0.34 -0.26 -0.82 -0.48 -0.81 0.45 -2.0
0.26 0.06 0.25 0.51 0.56 -0.47 -0.35 -0.41 0.4 0.32 0.23 0.17 -1.01 -2.12 -0.42 -0.2 -0.18 -1.55 -0.07 -0.18 0.06 -0.14 -0.01 0.16 -0.05 0.25 0.25 0.53 0.48 -0.16
0.07 0.07 -0.08 -0.05 -0.07 -0.12 0.11 0.01 0.16 0.13 0.2 0.26 -0.01 -0.63 0.06 0.08 0.28 -1.24 -0.01 -0.06 -0.01 0.07 -0.38 0.07 0.11 0.19 0.14 0.19 -0.15 -0.16
0.19 -0.02 0.02 0.15 0.22 0.41 0.15 -0.39 0.24 0.03 -0.03 -0.04 -0.46 0.14 -0.02 0.02 -0.05 -0.52 -0.15 -0.25 -0.17 -0.22 0.64 -0.01 -0.15 -0.17 -0.29 0.23 0.08 -0.18
0.42 0.51 0.39 0.41 0.31 -0.48 -0.45 -0.3 0.61 0.26 0.25 0.13 -1.15 -0.89 -0.44 -0.19 -0.1 -0.34 -0.04 -0.37 -0.11 -0.2 -0.53 -0.25 -0.28 0.0 -0.1 0.39 0.51 0.24
0.44 0.31 0.33 -0.62 -1.05 0.76 0.4 -0.71 0.8 0.4 0.43 0.77 -1.83 -2.03 0.41 0.4 0.28 -5.55 0.54 0.31 0.24 0.24 -4.27 -0.37 -0.55 0.04 0.23 0.67 -1.51 -2.58
-1.07 -0.03 -0.6 -1.03 1.13 0.54 -2.2 0.89 0.24 -0.67 -0.04 -0.55 -1.86 -0.23 0.17 -1.85 0.54 - 0.28 -0.36 0.32 - 1.31 0.0 0.63 -0.47 0.6 0.59 0.63 -0.56
0.14 -0.01 1.33 1.76 -0.92 -0.02 -0.32 -0.0 1.19 0.5 0.33 -0.1 -1.28 -0.09 0.34 -0.75 -0.84 -1.75 -0.03 -0.49 0.45 -1.19 -0.77 0.02 -0.83 -0.48 -0.66 -0.08 -0.47 -3.82
-0.05 0.14 0.32 0.14 0.18 0.17 0.42 -0.57 0.37 0.51 0.22 0.29 -1.05 -0.88 0.43 0.16 0.0 -3.03 0.28 0.24 -0.11 0.05 -1.29 -0.14 -0.21 -0.07 0.09 0.56 0.35 -1.76
-0.99 -1.48 0.57 1.53 -1.24 0.95 0.2 0.52 0.39 -0.12 0.51 0.17 0.44 -3.74 -0.05 0.04 -0.03 -3.76 -0.42 0.04 -0.77 -0.36 -1.14 -0.83 -0.95 -0.63 -1.13 0.35 0.58 1.0
-1.39 -1.63 0.7 1.56 -1.21 0.8 0.22 0.48 0.64 -0.05 0.57 0.29 0.21 -4.91 -0.38 -0.21 -0.19 -4.34 -0.28 0.13 -0.61 -0.38 -0.74 -0.8 -0.97 -0.54 -0.94 0.48 0.61 0.89
-1.53 -1.58 0.7 1.75 -1.62 0.86 0.21 0.46 0.55 -0.36 0.4 0.15 0.34 -3.77 -0.03 0.06 -0.03 -4.08 -0.4 0.19 -0.67 -0.26 -0.89 -0.89 -1.08 -0.57 -0.99 0.17 0.36 1.05
-2.76 -2.22 -0.33 2.42 - -1.09 -0.93 1.21 1.08 0.52 -0.85 -1.52 -0.56 -1.88 0.5 0.35 0.18 0.65 -1.62 -0.18 -1.0 0.06 0.04 -1.64 -1.65 -1.47 -0.85 -3.47 -0.76 1.75
-0.18 0.01 0.46 0.57 -0.28 -0.29 -0.22 0.1 0.7 0.53 0.16 0.2 -0.76 -1.39 -0.52 -0.2 -0.32 -0.92 -0.19 -0.15 -0.09 -0.25 0.55 -0.15 -0.12 0.15 0.16 0.46 0.21 -0.18
0.04 -0.06 0.16 0.41 -0.34 0.18 0.09 0.52 0.44 -0.06 0.01 0.21 0.18 -0.39 0.21 0.21 0.06 -0.44 -0.52 -0.14 -0.54 -0.26 0.33 -0.47 -0.46 -0.52 -0.4 -0.15 0.3 0.34
0.32 -0.29 0.65 1.08 -0.33 -0.22 -0.02 -0.19 1.25 0.61 0.12 0.19 -1.27 -1.83 -0.43 -0.38 -0.65 -1.28 -0.15 -0.47 -0.35 -0.49 0.74 -0.16 -0.13 -0.13 -0.3 0.42 0.11 -0.73
-0.04 0.04 0.08 0.4 -0.23 -0.04 0.23 0.18 0.37 0.24 0.1 0.06 -0.3 -1.19 -0.17 -0.1 -0.02 -0.8 0.07 -0.07 -0.3 -0.02 0.57 -0.18 -0.05 0.01 -0.07 0.1 0.2 -0.04
0.6 0.41 0.48 0.38 0.52 -0.32 -0.16 0.12 0.43 0.22 0.06 0.03 -0.95 -1.02 -0.47 -0.46 -0.33 -0.75 -0.04 -0.11 -0.1 -0.16 -0.2 0.0 -0.19 -0.18 -0.17 0.36 0.41 -0.06
-0.09 -0.15 0.04 0.08 -0.15 0.07 0.24 0.26 0.35 0.23 0.17 0.24 0.11 -0.31 -0.15 -0.15 -0.16 -0.64 -0.04 -0.0 -0.2 -0.01 0.26 -0.02 -0.12 -0.11 -0.04 0.08 0.13 -0.36
-0.13 -0.12 0.03 0.33 -0.0 0.12 0.03 0.0 0.14 0.12 0.06 0.0 -0.12 0.09 0.05 0.06 -0.01 -0.67 -0.2 -0.24 -0.15 -0.05 0.24 0.13 0.05 -0.06 -0.09 0.17 0.13 -0.23
-0.1 -0.42 0.17 0.12 0.28 0.2 0.1 -0.06 0.3 0.23 -0.02 -0.05 -0.41 -0.08 0.17 0.19 0.13 -0.87 -0.08 -0.04 0.07 -0.13 0.24 -0.13 -0.04 0.01 -0.01 0.27 -0.11 -0.6
0.12 -0.02 0.17 0.03 0.06 -0.3 -0.05 0.07 0.28 0.21 0.13 0.16 0.04 -0.46 -0.25 -0.21 -0.18 0.0 0.02 0.11 0.06 -0.04 -0.52 -0.29 -0.09 0.02 0.07 0.21 0.18 0.09
-0.28 -1.57 0.14 1.47 0.69 -0.01 -0.72 -0.98 -0.06 0.1 0.08 -0.22 -0.81 -1.96 0.07 -0.44 0.21 -0.39 -0.12 0.29 0.4 0.25 1.45 -0.19 0.22 -0.36 -0.13 -0.94 -1.09 -0.56
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0.54 -0.49 0.56 0.57 0.13 -0.55 -0.52 -0.17 0.29 -0.14 0.2 0.02 0.16 -1.2 -0.35 -0.37 -0.16 -0.56 -0.04 0.01 -0.15 0.13 -0.14 -0.06 0.09 -0.14 0.24 0.19 0.21 0.32
0.28 -0.66 0.37 0.64 -0.09 0.07 0.01 -0.65 0.51 -0.03 0.17 0.01 0.08 -0.7 0.15 0.07 0.08 -0.81 -0.15 -0.32 -0.18 -0.05 0.46 -0.18 -0.06 -0.18 -0.0 -0.1 0.15 -0.02
0.39 0.11 0.06 0.28 0.39 0.11 0.16 -0.59 -0.1 0.02 0.1 -0.04 -1.12 0.03 -0.02 0.19 -0.2 -0.7 -0.0 -0.62 -0.08 -0.04 0.73 0.4 -0.28 -0.22 -0.09 0.16 0.14 -0.51
0.2 0.14 -0.05 0.18 0.13 -0.34 -0.11 0.03 0.12 0.17 0.15 0.15 -0.18 -0.65 -0.1 -0.13 -0.02 -0.39 -0.09 -0.24 0.02 0.09 0.07 -0.01 0.05 0.04 0.15 0.27 0.21 -0.26
0.65 0.45 0.53 0.55 -0.39 -0.87 -0.23 0.34 0.63 0.47 0.07 0.1 -0.34 -0.4 -0.8 -0.67 -0.76 0.08 -0.14 -0.16 -0.22 -0.27 0.01 -0.18 -0.11 -0.34 -0.06 0.31 0.34 -0.51
1.03 0.28 0.31 0.4 -0.05 0.74 0.18 -1.04 0.96 0.53 0.07 0.11 -1.5 -1.59 -0.1 0.01 -0.46 0.16 -0.24 -0.68 -0.09 -0.33 -0.42 0.02 -0.59 -0.37 -0.39 0.41 0.16 -1.67
0.01 0.04 0.13 0.11 0.28 0.01 0.02 -0.28 0.2 0.1 0.19 0.2 -0.09 -0.67 0.06 0.08 0.11 -1.2 -0.03 -0.02 0.03 0.03 -0.18 0.11 0.09 0.03 -0.05 0.24 0.15 -0.41
-1.36 0.73 - 2.86 - -1.73 0.46 1.61 -0.04 1.41 - - - - -1.59 1.15 1.32 - - - - - - -0.09 - -0.66 0.16 - -0.66 2.0
0.63 -0.47 1.02 1.27 -0.89 0.41 0.13 -0.11 1.35 0.18 0.42 0.44 -2.18 -4.2 0.0 -0.3 -0.11 -3.5 -0.13 -0.17 -0.3 -0.3 -0.08 -0.39 -0.48 -0.39 -0.33 -0.28 -0.07 -0.45
-0.44 0.46 0.36 1.05 0.27 -0.8 -0.16 -0.12 0.86 0.63 0.45 -0.23 -1.03 -1.78 -2.07 -0.2 -0.9 -1.64 0.15 -0.12 0.09 -0.68 1.53 -0.92 -0.48 -0.46 -0.45 0.03 0.24 0.16
-0.01 -0.05 0.31 0.34 0.08 0.05 -0.15 -0.55 0.53 0.37 -0.05 -0.01 -0.54 -0.21 0.01 0.06 0.05 -0.4 -0.04 -0.21 0.05 -0.18 0.52 -0.14 -0.22 -0.0 -0.1 -0.04 0.1 -0.25
-0.01 0.02 -0.1 -0.15 0.3 0.1 -0.02 -0.18 0.17 0.18 -0.05 -0.0 -0.71 -0.02 0.07 -0.0 0.08 -0.71 -0.07 -0.08 -0.02 -0.12 0.34 0.22 0.21 0.16 0.1 0.12 0.13 -0.55
-0.33 -0.4 -0.68 -0.1 -0.13 -0.31 -0.47 0.8 -1.17 0.02 0.14 -0.18 0.04 -0.24 0.25 -0.4 0.06 0.03 -0.12 0.32 0.69 0.24 0.7 -0.0 0.46 -0.36 -0.04 -0.08 -0.11 -0.35
0.19 -0.57 0.49 1.82 0.14 -0.24 -0.44 0.08 0.19 -0.52 0.04 -0.27 -0.08 -0.89 -0.08 -0.33 0.04 -0.14 -0.5 -0.81 -0.84 -0.72 0.86 -0.84 -0.75 -0.88 -0.73 -0.27 0.3 1.03
0.1 0.09 0.15 0.68 0.23 0.4 0.06 -0.64 0.29 -0.25 -0.15 -0.31 -0.59 -0.43 0.05 -0.02 -0.1 -0.94 -0.3 -0.25 -0.27 -0.33 1.12 0.37 -0.16 -0.08 -0.13 -0.24 0.16 -0.25
0.64 0.44 0.41 0.14 0.94 -0.15 -0.03 -0.35 0.5 0.39 -0.1 0.2 -0.76 -0.89 -0.28 -0.52 -0.51 -0.95 -0.58 -0.14 -0.31 -0.3 -0.39 -0.69 -0.37 0.09 -0.25 0.57 0.92 -0.38
0.2 0.14 0.33 0.64 -0.57 -0.24 -0.14 0.62 0.6 0.21 0.12 0.05 -0.65 -0.56 -0.31 -0.38 -0.36 -0.24 -0.11 -0.05 -0.05 -0.06 -0.08 -0.22 -0.17 -0.04 -0.02 0.1 0.06 0.08
0.26 -0.5 0.37 0.74 -0.14 -0.28 0.45 -0.36 0.92 0.62 0.53 0.41 -0.22 -1.44 -0.32 -0.5 -0.63 -1.43 -0.28 0.03 -0.33 -0.09 0.28 -0.09 0.12 -0.38 -0.22 -0.05 0.28 -0.55

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.