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Heatmap: Cluster_131 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.08 0.01 -0.33 -0.3 0.08 -0.26 -0.23 -0.13 -0.27 -0.04 -0.3 -0.25 -0.01 0.68 0.23 0.07 0.1 0.31 -0.31 -0.24 0.04 -0.11 1.18 -0.13 -0.22 -0.17 -0.14 -0.23 -0.27 -0.04
0.05 0.01 -0.27 -0.36 0.05 0.17 -0.12 -0.11 -0.29 -0.27 -0.19 -0.33 0.05 0.85 0.26 0.19 0.02 0.41 -0.29 -0.33 -0.25 -0.21 0.97 -0.34 -0.31 -0.33 -0.27 0.21 -0.21 -0.03
-0.23 -0.64 -1.54 -1.19 -0.18 -0.97 -0.37 -0.15 -1.38 -1.1 -1.31 -0.88 1.94 1.59 -0.44 -0.6 -0.85 1.41 -0.53 -0.83 -0.59 -0.35 2.09 -0.92 -0.37 -1.1 -0.6 -0.7 -0.79 -0.29
0.28 0.45 -1.83 - 0.9 -0.48 -1.42 -1.77 - -0.71 - - 1.55 1.73 0.42 -1.55 - 0.46 -3.31 -3.48 -0.67 - 3.4 -1.4 -3.44 - - 1.07 - -
Spov3_C0030.00046 (SULTR3;5)
 -0.63 -0.54 -0.66 -0.46 -0.54 0.52 0.32 -0.09 -0.27 -0.4 -0.25 -0.28 -0.07 0.71 0.51 0.26 0.19 -0.78 -0.06 -0.1 -0.07 -0.0 1.86 -0.44 -0.36 -0.2 -0.33 -0.61 -0.48 -0.35
-0.66 -1.1 -1.29 -0.79 -1.37 -0.35 0.06 -1.06 -1.47 -1.25 -0.51 -0.88 1.73 1.44 0.41 -0.22 0.05 -0.29 -1.01 -0.77 -1.16 -0.56 2.59 -1.06 -0.82 -1.18 -0.77 -0.96 -1.03 0.86
-0.21 -0.07 -0.42 -0.55 -0.18 -0.29 -0.23 -0.34 -0.47 -0.42 -0.51 -0.23 -0.01 0.57 0.18 -0.24 0.01 0.58 -0.13 -0.1 -0.2 0.08 2.01 -0.19 -0.26 -0.2 -0.34 -0.29 -0.37 -0.55
-0.07 -0.08 -0.2 -0.39 -0.11 0.12 0.05 -0.48 -0.24 -0.09 -0.05 -0.11 0.01 0.41 0.14 -0.03 0.06 0.51 -0.07 -0.19 0.02 -0.09 1.06 -0.45 -0.14 -0.12 -0.05 -0.1 -0.13 -0.13
-0.02 -0.02 0.06 -0.02 0.01 -0.03 -0.05 -0.02 -0.16 -0.22 -0.11 -0.13 0.07 0.17 0.25 0.08 0.1 0.34 -0.16 -0.08 -0.06 -0.03 0.6 -0.2 -0.2 -0.07 -0.08 -0.1 -0.18 -0.07
- - -0.63 0.16 - -1.22 -1.93 -0.86 - -3.22 -0.87 -0.73 1.31 -2.41 -1.11 -0.54 -0.55 0.98 - -1.19 0.07 0.71 3.85 -2.93 -0.31 - -0.32 - - -
-0.02 -0.14 -0.62 -1.28 -0.57 0.01 0.43 0.35 -0.4 -0.09 -0.15 -0.23 0.56 0.89 0.15 0.11 -0.24 0.38 -0.04 -0.05 -0.11 -0.01 0.72 0.21 -0.27 -0.13 -0.2 -0.34 -0.44 -0.26
-0.07 -0.28 -0.59 -0.74 -0.27 0.19 0.48 0.29 -0.14 -0.11 -0.2 -0.11 0.07 0.48 0.41 0.17 0.24 0.23 -0.04 -0.0 -0.19 -0.11 0.88 0.02 -0.18 -0.11 -0.2 -0.65 -0.42 -0.34
-0.04 0.1 -0.15 -0.39 0.38 0.01 -0.34 -0.33 -0.37 -0.22 -0.32 -0.34 -0.06 0.68 0.44 0.03 0.1 0.39 -0.26 -0.24 -0.1 -0.24 1.34 -0.6 -0.53 -0.11 -0.11 -0.4 -0.31 0.11
-0.32 - - - - - -0.44 - 0.63 - - 0.26 1.44 0.49 0.26 - - - - - -0.66 -0.85 4.13 - - - 0.02 - -0.62 -
-0.01 -0.1 -0.41 -0.47 0.21 0.1 0.04 -0.27 -0.6 -0.51 -0.09 -0.28 0.11 0.86 0.24 0.26 0.12 0.55 -0.12 -0.02 -0.19 -0.14 1.05 -0.18 -0.31 -0.18 -0.23 -0.28 -0.4 -0.31
-0.14 -0.11 -0.16 -0.18 0.06 -0.2 -0.35 -0.1 -0.15 -0.08 -0.07 -0.05 -0.01 0.6 0.18 0.15 0.16 0.44 -0.16 -0.07 -0.12 0.0 0.72 -0.08 -0.14 -0.14 -0.06 -0.25 -0.24 -0.11
-0.31 -0.36 -0.52 -0.63 -0.29 0.24 -0.25 -0.18 -0.1 -0.11 -0.15 -0.17 -0.17 0.89 0.14 0.3 0.04 0.68 -0.47 -0.29 -0.14 -0.67 1.77 -0.29 -0.51 -0.18 -0.22 -0.29 -0.44 -0.48
-0.69 -0.64 -0.6 -0.38 -0.53 -0.06 0.11 0.35 -0.49 -0.45 -0.14 -0.18 0.94 0.82 0.04 0.02 0.19 -0.15 -0.13 -0.11 -0.18 -0.12 1.23 -0.38 -0.1 -0.09 0.01 -0.26 -0.6 0.25
-0.32 -0.37 -0.39 -0.46 0.07 -0.02 0.01 -0.06 -0.06 -0.07 0.05 -0.04 0.19 0.64 0.03 0.08 0.06 0.06 -0.14 0.01 -0.05 -0.02 1.18 -0.12 -0.23 -0.1 -0.21 -0.25 -0.48 -0.17
-0.65 -0.1 -1.24 -1.5 -0.77 -0.11 -0.3 -1.0 -0.79 -0.48 -0.97 -0.59 1.18 1.44 0.41 -0.37 -0.08 0.67 -1.14 -0.12 -0.72 -0.52 2.51 -0.77 -0.79 -0.45 -0.62 -1.52 -0.69 -0.24
Spov3_chr2.02448 (LecRK-II.1)
 0.56 0.65 -1.58 -1.47 1.36 -2.61 -2.16 -0.79 -2.53 -0.09 -2.02 -0.93 -0.54 2.2 -0.12 -2.05 -2.71 0.64 -0.74 -0.95 -0.96 -1.84 3.11 -1.75 -3.22 -1.68 -3.39 -0.79 -1.34 -1.49
-0.22 -0.29 -0.3 -0.31 -0.09 0.04 0.16 0.22 -0.28 -0.32 -0.15 -0.14 0.22 0.56 0.35 0.17 0.14 0.26 -0.15 -0.06 -0.16 0.03 0.62 -0.18 -0.16 -0.17 -0.04 -0.25 -0.24 0.05
-0.14 -0.21 -0.18 -0.12 -0.16 -0.14 -0.05 0.06 -0.03 -0.09 -0.0 -0.07 0.09 0.55 0.28 0.26 0.23 0.04 -0.03 -0.05 -0.03 0.01 0.55 -0.13 -0.1 -0.05 -0.0 -0.32 -0.37 -0.28
-0.49 -0.49 -0.95 -0.87 0.19 0.36 0.07 -0.11 -1.32 -1.33 -0.65 -0.76 0.29 0.92 0.58 -0.05 0.03 0.65 -0.53 -0.34 -0.69 -0.28 2.45 -0.85 -0.96 -0.65 -0.78 -0.77 -0.87 0.17
0.35 0.07 -0.16 -0.39 0.15 0.01 0.07 -0.27 -0.32 -0.16 -0.29 -0.25 0.23 0.75 0.14 -0.03 0.03 0.43 -0.34 -0.24 -0.13 -0.13 0.93 -0.14 -0.46 -0.24 -0.32 0.04 -0.23 -0.25
Spov3_chr3.00321 (RANGAP2)
 0.31 0.46 -0.75 -0.98 0.04 -0.35 -0.48 -0.29 -0.18 -0.16 -0.55 -0.34 0.27 1.56 0.58 -0.68 -0.64 0.72 -1.43 -1.49 -1.66 0.18 1.86 -1.49 -0.4 -1.12 0.1 -0.12 0.26 -0.82
0.02 -0.09 -0.06 -0.11 -0.03 0.1 0.21 0.07 -0.15 -0.29 -0.06 0.02 0.08 0.1 0.15 0.03 0.13 0.04 -0.12 -0.04 -0.08 -0.0 0.8 -0.2 -0.07 -0.1 -0.07 -0.08 -0.32 -0.32
0.35 0.27 0.16 -1.5 0.67 -0.01 -1.3 -0.08 -0.43 -0.21 -0.32 -0.2 -0.55 1.45 0.34 -0.16 0.19 -0.21 -0.62 -0.72 -0.51 -0.43 1.86 -0.86 -0.54 -0.51 -0.56 -0.47 0.1 -1.06
-0.01 -0.21 -0.34 -0.33 -0.09 -0.29 -0.48 -0.29 -0.21 -0.44 -0.12 -0.28 0.25 0.73 0.31 0.13 0.27 0.51 -0.07 -0.19 -0.22 -0.1 1.08 -0.16 -0.18 -0.26 -0.32 -0.07 -0.26 0.22
0.84 -0.12 -2.44 -1.85 -0.84 0.55 0.22 -0.99 -0.31 -0.08 -1.7 -1.23 0.54 1.64 1.38 -0.23 0.05 0.16 -1.71 -1.9 -1.27 -0.44 2.31 -0.39 -0.66 -1.25 -2.17 -0.8 -0.26 -1.61
-0.54 -0.71 -0.87 -1.24 -0.19 0.79 0.32 -0.26 -0.8 -0.88 -0.5 -0.47 0.19 1.03 0.56 0.46 0.15 0.86 -0.63 -0.44 -0.6 -0.22 1.75 -0.26 -0.64 -0.55 -0.63 -0.39 -0.57 0.03
-0.12 -0.21 -0.42 -0.46 -0.01 -0.21 -0.04 -0.21 -0.18 -0.18 -0.08 -0.18 0.14 0.83 0.21 0.1 0.07 0.45 -0.13 -0.15 -0.07 -0.15 1.01 -0.22 -0.2 -0.05 -0.04 -0.09 -0.35 -0.23
0.02 0.18 -0.95 -1.6 0.8 -0.24 -0.26 -1.6 -1.46 0.01 -0.5 -0.64 0.42 1.42 -0.23 -0.49 -0.35 0.89 -0.33 -0.42 -0.25 -0.23 1.88 -0.56 -0.3 -0.15 0.16 -0.3 -1.12 -0.73
-0.26 -0.25 -0.8 -1.31 0.19 0.29 -0.02 -0.6 -1.04 -0.39 -0.41 -0.45 -0.08 1.32 0.39 0.15 0.21 0.58 -0.29 -0.43 -0.2 -0.18 1.83 -0.34 -0.4 -0.13 -0.12 -0.52 -0.88 -0.78
-0.54 -0.11 -0.92 -1.53 0.04 0.92 -0.1 -1.01 -1.02 -0.81 -0.83 -0.78 -0.25 0.86 -0.2 -0.38 -0.6 0.74 -0.47 -0.63 -0.49 -0.67 2.69 -0.13 -1.18 -0.87 -1.23 -0.71 -0.77 0.7
-0.25 -0.19 -0.41 -0.5 0.0 0.26 0.11 -0.08 -0.49 -0.28 -0.15 -0.14 0.27 0.54 0.4 0.14 0.24 0.37 -0.17 -0.24 -0.13 -0.12 0.84 -0.12 -0.21 -0.06 -0.07 -0.11 -0.2 -0.21
-1.16 -1.19 -2.1 -2.6 -0.31 -2.43 -3.4 -0.52 -2.37 -2.16 - - 1.07 1.99 1.02 -1.22 -4.13 0.75 - -1.85 -3.47 -2.1 3.88 -4.17 -5.22 -2.34 -2.88 - -1.45 -3.09
0.03 -0.25 -0.52 -0.57 0.06 0.5 0.07 -0.67 -0.91 -0.97 -0.4 -0.23 0.39 0.78 0.57 0.08 0.18 0.03 -0.29 -0.19 -0.57 -0.21 1.79 -0.05 -0.37 -0.65 -0.64 -0.51 -0.12 -0.11
-0.08 -0.1 -0.23 -0.21 -0.17 -0.08 0.14 0.08 -0.47 -0.4 -0.14 -0.19 0.31 0.48 0.38 0.08 0.25 0.4 -0.14 -0.04 -0.03 0.05 0.88 -0.23 -0.11 -0.19 -0.24 -0.42 -0.42 -0.14
0.35 0.17 -0.46 -0.99 0.41 0.09 -0.26 -0.31 -0.64 -0.49 -0.52 -0.7 0.02 0.81 0.16 -0.06 -0.3 0.05 -0.65 -0.42 -0.23 -0.24 2.22 -0.09 -0.19 -0.42 -0.4 -0.25 -0.49 -1.39
-0.15 -0.22 -0.33 -0.65 -0.14 -0.08 -0.04 -0.2 -0.1 -0.29 -0.31 -0.22 -0.01 0.71 0.2 0.11 0.18 0.32 -0.41 -0.3 0.01 -0.09 1.79 -0.32 -0.5 -0.1 -0.43 -0.29 -0.51 -0.33
0.03 -0.1 -0.03 -0.07 -0.07 -0.18 0.01 0.12 -0.22 -0.19 -0.02 -0.14 0.13 0.43 0.18 0.05 0.1 0.17 -0.13 -0.17 -0.08 0.04 0.56 -0.14 -0.13 -0.18 -0.06 -0.02 -0.2 -0.04
-1.52 -1.54 -2.12 -3.12 0.57 -0.02 -0.84 -2.24 -1.81 -0.72 -0.91 -0.52 0.4 1.75 0.51 -0.27 -0.33 1.81 -0.42 -0.91 -1.35 -2.39 3.07 -4.33 -1.91 -2.35 -1.98 -0.35 -1.51 -2.32
0.55 -1.78 - - 0.15 -0.79 -0.75 -0.0 -2.7 -1.4 - - 1.33 2.32 0.32 -4.21 - 0.74 -4.28 - - -4.44 3.68 -3.04 -4.2 -2.32 - -3.95 -1.1 -3.34
-0.22 -0.19 -0.27 -0.32 -0.15 0.06 -0.07 0.23 -0.52 -0.43 -0.34 -0.31 0.2 0.72 0.23 0.16 -0.03 0.57 -0.16 -0.19 -0.06 -0.06 1.18 -0.15 -0.23 -0.1 -0.13 -0.27 -0.46 -0.21
-0.03 0.02 -0.0 0.08 0.06 -0.07 -0.03 0.28 -0.31 -0.29 -0.23 -0.19 0.01 0.59 0.07 0.04 0.01 0.32 -0.18 -0.16 -0.19 -0.15 0.84 -0.12 -0.22 -0.2 -0.06 -0.03 -0.22 -0.33
-0.26 -0.33 -0.35 -0.56 0.05 0.13 -0.07 -0.19 -0.26 -0.3 -0.3 -0.2 0.19 0.71 0.38 0.18 0.22 0.39 -0.2 -0.17 -0.2 -0.23 1.21 -0.09 -0.19 -0.17 -0.22 -0.22 -0.2 -0.26
0.5 0.33 -1.18 -1.63 -0.49 -0.55 -0.07 0.7 -0.67 -1.67 -1.92 -1.77 0.64 2.45 0.97 -1.46 -0.83 -2.94 -3.81 -2.66 -2.21 -2.05 2.96 -4.03 -1.5 -2.3 -2.32 -0.34 -1.02 -1.03
-0.56 -0.58 -0.3 -0.33 -0.13 0.52 0.01 -0.28 -0.18 -0.18 -0.29 -0.04 -0.32 -0.09 0.08 -0.2 -0.01 0.2 -0.74 -0.41 -0.35 -0.61 2.26 -0.29 -0.41 -0.43 -0.7 -0.41 -0.15 0.39
-0.21 -0.15 -0.18 -0.25 0.33 -0.0 -0.12 0.26 -0.4 -0.31 -0.2 -0.12 0.28 0.51 0.22 -0.08 0.0 0.14 -0.18 -0.14 -0.04 -0.1 1.02 -0.25 -0.1 -0.11 -0.08 -0.22 -0.46 -0.05
0.05 -0.12 -0.1 0.03 0.07 0.03 -0.17 0.14 -0.25 -0.09 -0.22 -0.22 -0.08 0.66 0.03 0.05 -0.03 0.45 -0.3 -0.1 -0.13 -0.16 0.77 -0.16 -0.13 -0.07 -0.21 -0.15 -0.08 -0.24
0.1 -0.02 -0.03 0.06 0.19 0.07 -0.09 0.17 -0.33 -0.29 -0.31 -0.4 -0.06 0.39 0.11 0.15 0.01 0.32 -0.26 -0.17 -0.1 -0.16 0.86 -0.0 -0.09 -0.19 -0.17 -0.18 -0.17 -0.08
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Spov3_chr5.02533 (PICALM3)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.