1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_82 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.26 0.25 0.2 0.27 0.27 0.29 0.27 0.26 0.25 0.25 0.29 0.24 0.3 0.28 0.27 0.28 1.0 0.24 0.23 0.25 0.25 0.25 0.25 0.26 0.26 0.27 0.25 0.29 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.21 0.23 0.22 0.25 0.23 0.24 0.27 0.21 0.22 0.24 0.23 0.22 0.16 0.2 0.2 0.21 1.0 0.22 0.22 0.22 0.21 0.18 0.21 0.23 0.23 0.25 0.23 0.21 0.2
0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.04 0.04 0.03 0.05 0.07 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.04 0.09 0.05 0.05 0.06 1.0 0.04 0.04 0.05 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.05
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01
0.05 0.04 0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.05 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.18 0.17 0.17 0.15 0.2 0.19 0.23 0.2 0.18 0.17 0.2 0.2 0.23 0.17 0.22 0.2 0.2 1.0 0.23 0.22 0.2 0.22 0.16 0.2 0.2 0.2 0.21 0.17 0.16 0.15
0.05 0.05 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01
0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 1.0 0.02 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.06 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.1 0.06 0.06 0.05 1.0 0.05 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.04 0.05 0.05 0.06 0.05 0.03
Spov3_chr2.00413 (AtHMP23)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
Spov3_chr2.00835 (UGT79B3)
 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.09 0.03 0.02 0.02 0.02 1.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.08 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02
0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.1 0.11 0.08 0.06 0.1 0.07 0.08 0.08 0.08 0.09 0.07 0.07 0.06 0.16 0.07 0.07 0.06 1.0 0.07 0.07 0.07 0.07 0.09 0.07 0.07 0.08 0.08 0.09 0.09 0.07
0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.06 0.02 0.02 0.02 1.0 0.03 0.03 0.02 0.02 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04
0.12 0.12 0.09 0.09 0.11 0.14 0.13 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.09 0.16 0.13 0.12 0.11 1.0 0.09 0.09 0.11 0.1 0.12 0.12 0.1 0.11 0.11 0.12 0.12 0.1
0.08 0.08 0.07 0.06 0.1 0.08 0.07 0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.05 0.11 0.08 0.08 0.08 1.0 0.08 0.06 0.07 0.06 0.06 0.07 0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.05
0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.12 0.09 0.09 0.09 0.06 0.05 0.06 0.06 0.07 0.06 0.06 0.05 0.13 0.07 0.06 0.07 1.0 0.06 0.06 0.08 0.07 0.08 0.07 0.07 0.07 0.07 0.11 0.09 0.09
0.11 0.13 0.12 0.11 0.14 0.13 0.1 0.15 0.1 0.12 0.1 0.11 0.08 0.14 0.11 0.13 0.1 1.0 0.09 0.09 0.1 0.1 0.16 0.12 0.11 0.11 0.11 0.13 0.11 0.08
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 1.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01
0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 0.01 0.02 0.03 0.03 1.0 0.03 0.03 0.03 0.03 0.08 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03
0.04 0.04 0.03 0.03 0.07 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02 0.02 0.06 0.03 0.02 0.03 1.0 0.03 0.03 0.03 0.02 0.05 0.04 0.04 0.03 0.03 0.06 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.04 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.09 0.05 0.08 0.09 0.09 0.09 0.06 0.06 0.08 0.06 0.08 0.1 0.09 0.1 0.1 0.1 1.0 0.05 0.05 0.07 0.06 0.05 0.09 0.1 0.07 0.07 0.08 0.09 0.05
0.15 0.14 0.15 0.12 0.13 0.13 0.18 0.14 0.19 0.16 0.17 0.19 0.09 0.09 0.16 0.14 0.14 1.0 0.15 0.14 0.15 0.16 0.1 0.14 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.1
0.19 0.17 0.15 0.13 0.18 0.22 0.23 0.17 0.18 0.18 0.18 0.19 0.19 0.23 0.2 0.19 0.18 1.0 0.17 0.17 0.16 0.18 0.14 0.19 0.17 0.17 0.17 0.19 0.2 0.19
0.03 0.04 0.03 0.02 0.04 0.03 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03 0.02 0.03 0.05 0.02 0.02 0.02 1.0 0.03 0.02 0.03 0.03 0.08 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02
0.05 0.03 0.03 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.12 0.07 0.05 0.04 1.0 0.04 0.03 0.02 0.03 0.09 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.04
0.21 0.2 0.22 0.2 0.25 0.21 0.24 0.23 0.22 0.21 0.23 0.21 0.21 0.2 0.23 0.22 0.22 1.0 0.22 0.21 0.21 0.22 0.22 0.2 0.23 0.22 0.24 0.23 0.2 0.16
0.09 0.08 0.06 0.07 0.09 0.1 0.11 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.1 0.13 0.1 0.09 0.09 1.0 0.08 0.08 0.08 0.09 0.12 0.11 0.09 0.09 0.09 0.09 0.08 0.07
0.05 0.05 0.04 0.04 0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.04 0.03 0.03 0.04 0.03 0.03 0.02 0.03 1.0 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.04 0.04 0.04 0.05 0.05 0.04 0.03
0.05 0.05 0.05 0.06 0.07 0.07 0.04 0.03 0.06 0.05 0.05 0.05 0.02 0.05 0.05 0.05 0.04 1.0 0.04 0.04 0.03 0.04 0.07 0.05 0.03 0.03 0.03 0.07 0.06 0.04
0.06 0.04 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.06 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.14 0.03 0.03 0.02 0.02 0.06 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 0.07 0.04 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.12 0.03 0.04 0.03 1.0 0.02 0.03 0.04 0.02 0.04 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01
0.05 0.05 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.06 0.03 0.03 0.03 1.0 0.03 0.03 0.03 0.03 0.08 0.05 0.03 0.03 0.03 0.06 0.05 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.13 0.15 0.14 0.15 0.14 0.16 0.17 0.15 0.14 0.16 0.15 0.14 0.14 0.14 0.14 0.15 1.0 0.15 0.15 0.15 0.14 0.11 0.14 0.16 0.15 0.17 0.15 0.12 0.11
0.07 0.06 0.06 0.05 0.07 0.05 0.05 0.06 0.06 0.06 0.04 0.05 0.04 0.08 0.05 0.05 0.04 1.0 0.05 0.04 0.05 0.04 0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.06 0.06 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)