Heatmap: Cluster_49 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- - - 3.52 - - - - - 2.51 - - - - - 1.73 - - - - - - 2.27 - - - - - - 2.23
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - - - - - - - 4.18 - - -
- 2.87 - 4.03 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - 1.93 - - - 3.15 - 2.13 - - - - - - - - - - 1.87 - - - - - 3.21 - -
2.28 - - - - - - - 2.03 2.07 - - - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - - - - 3.39 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
3.21 - - - - 1.93 - - 1.62 - - 1.34 - 2.48 - - - 1.19 - - - - - - - 1.8 - - - -
- - 1.25 - - 2.84 - - - 2.43 - - 1.15 2.82 -0.61 - - - - - - - 1.31 1.39 - - - -11.48 - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
-0.37 -0.98 -0.32 -0.35 0.56 - -0.64 -0.33 0.82 1.48 0.58 0.51 2.45 0.65 0.38 -0.98 - -1.24 - - - -0.53 -1.14 -1.23 -1.24 - 2.16 -1.0 -0.88 -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.89 - - 1.85 2.05 - 0.74 - 0.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - 2.49 0.72
-0.37 -0.98 -0.32 -0.35 0.56 - -0.64 -0.33 0.82 1.48 0.58 0.51 2.45 0.65 0.38 -0.98 - -1.24 - - - -0.53 -1.14 -1.23 -1.24 - 2.16 -1.0 -0.88 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
- - - 4.3 - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - 4.31 - - -
2.16 - - - - - 2.01 - 2.7 - - - - - - - - - - 1.91 - - 2.03 - - - - 2.84 - -
- - 1.3 - 1.0 - - - - - - - - - 1.33 - - 1.16 2.82 3.46 - - - - - - 1.43 - - -
-1.5 -0.54 -1.16 1.91 -1.37 1.83 -0.41 1.14 -1.07 1.0 - -1.24 - - -0.12 -0.0 - - - 1.86 1.42 - 0.62 - 1.96 - 0.39 - - -
2.69 - - - 1.33 - - - - - 2.74 - - - - - - - - 3.44 - - 1.8 - - - - - - -
2.08 - - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - 3.92 - - - - - - - - - -
- - - 4.16 - - - - 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - 3.45
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.09 - - -
- - - 3.85 - - - - - - - - - - - 3.06 2.86 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
Spov3_chr1.03469 (AtEAF1B)
-0.14 -0.11 -0.28 2.45 - 1.57 - 0.73 0.98 - - - - -0.16 - 2.1 - - 0.92 2.48 - - - - - - - 0.94 - -0.5
- - - - - - - - - - - - - - - - - -8.74 - 4.58 0.63 - -5.69 -3.48 -5.99 -3.5 2.11 - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.6 - - - - - 2.76 - - - - - - - - - - - - - 2.61 - 2.31 - - - -
1.33 - 0.21 - 0.01 - - 1.59 - 2.27 - - - - 0.15 - - - - 3.29 - 0.32 - 0.5 - 0.34 0.39 0.43 - -
- - - - - - - - - - - - -15.87 - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
1.34 -1.33 0.58 -1.83 - 0.31 -0.59 -1.67 1.42 0.04 0.71 -1.47 -0.42 -0.57 1.26 0.06 1.12 - -0.52 -0.72 -0.48 - -1.14 -0.98 -0.73 -0.27 -3.0 1.64 1.2 -1.4
- - - - - - - - - - - - - - 1.94 - - - 3.19 4.09 - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -19.37 - - - - -4.09 - -0.81 - - - - -5.45 - - -7.38 -5.8 - 3.38 - 2.31 -1.23 -2.31 - 3.71 - -1.88 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.64 - 2.32 - - - - - - - -
Spov3_chr2.02625 (PLDGAMMA3)
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.59 - - - - - - - 4.17 - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.12 - - - - - 4.41 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- 2.07 - - - - - - - - - - - - - - 2.73 - - 4.26 - - - - - - - - - -
- - - - 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.33 - - -
- - - - 1.25 - 1.72 - 2.68 1.77 1.6 1.57 - - - - - - - 1.44 - - - - - - - 1.59 1.47 -
2.44 - - - - 2.01 1.31 1.22 - 1.21 - 2.09 - 1.22 - - - - - - - - - - - - 2.77 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - 4.85 - - - - - - - - - -
- - - 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - 3.82 - - -
- 2.06 -0.64 - - 0.28 -2.87 - - 2.34 - - - - - 2.6 - - - - - - - 0.9 1.43 - 2.95 - - -1.17
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.68 - 1.33 - 1.19 - - - - - 1.45 - 1.06 - 3.54 1.22 - - - - - - - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
0.62 1.52 - - 1.14 1.28 1.97 - 0.57 1.48 - - - - - 0.87 - - 0.43 2.0 - - - - - - 2.13 - 0.28 -
0.85 0.75 - 2.32 0.55 0.41 0.35 - 2.8 - - - - 0.55 - 0.74 - - - - - - - 0.45 - 0.44 - 2.22 - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.72 - 1.9 - - - - - - - 3.24 3.76 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.62 - - - - - 2.35 - - - 3.65 - - -
- - - - - - - 1.13 -0.57 2.97 0.27 - 1.97 - 2.07 - - - - 3.17 0.0 - - - - - - - - -
- -1.96 0.56 2.85 -0.2 - 1.62 - -0.85 - - 0.58 1.52 1.17 - - - -0.34 1.0 -0.87 - - 1.56 1.23 - -2.2 0.12 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
-25.08 - - - -7.61 -22.65 -13.05 -14.7 -9.56 -5.22 -3.21 -12.08 -5.58 -11.51 -16.57 -15.39 -25.18 -3.03 -9.41 4.83 0.2 -7.92 -11.74 -14.96 -13.12 -5.92 -6.94 -15.43 -23.08 -23.97
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.79 0.33 0.21 - -0.11 -0.07 -0.13 -1.05 0.92 1.82 -0.27 - -1.1 0.4 -0.31 - -0.76 0.43 - 0.88 -0.93 1.25 -0.77 - -0.96 -0.8 -0.38 1.35 0.09 -0.0
- - - 3.74 - - - - - - - - - - 2.8 - - - - - - - - 3.28 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - 3.93 - - -
1.99 - - - - 1.81 - - - - - - - - - - 0.94 - 1.76 4.11 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - 2.94 - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - 3.74 - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.43 - - 1.21 - - - - - - - 3.03 - - - - - - 3.85 - - - - - - - - - 1.28
2.96 - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 2.92 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
1.14 - - - 1.72 - 1.07 - 2.17 1.97 2.12 0.91 - - - - - - - - - - - - - - - 2.58 0.83 -
-0.13 -0.39 -1.17 -0.43 -1.36 1.4 0.25 -1.15 1.42 -0.01 -1.74 - -2.8 0.99 -0.94 0.8 -1.21 -2.07 -0.37 -1.01 0.54 0.29 -0.14 -0.04 -0.93 0.29 1.2 0.51 -0.18 0.34
0.74 0.75 - -0.64 0.58 -0.56 - 1.18 - 1.31 - -0.42 -0.28 - - - - - 1.96 2.0 0.64 - -0.46 - - 1.1 0.39 1.68 - -0.56
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - 3.94
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - 4.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.02 - - - - 1.81
- - 2.81 - - - - - - - - - - 2.65 - - - - - 4.07 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
Spov3_chr5.03006 (HSP17.6)
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.62 - - - 2.99 - - - - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - -
- 1.84 - - - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.68 2.54 2.96 1.82 - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.69 - - - - - - 2.17 2.03 - 2.14 - - - - - - - - - - - 2.05 - - - -
- - - 4.03 - - - 1.33 - 1.53 - - - - - - - - - - - 1.18 - - - - - - 2.58 -
- - - 3.31 - - - - 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.29 - - -
- - 0.89 -0.29 0.14 1.05 0.79 - -1.54 1.92 0.71 0.06 0.62 2.08 - -1.42 -0.31 -1.6 1.19 - - - - - - 0.11 - 1.75 -0.21 -0.41
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - -
3.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - 3.41 - -
1.6 - 2.47 - - - - - - - - 1.37 1.44 - - - 1.45 - - - - - - - - - 3.74 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- 2.05 - 1.7 2.37 0.26 0.59 - 1.81 - - 1.53 - 1.56 0.43 - - - - - - - - - - - - 0.48 0.44 0.35
- - - - - - - 2.89 - - - - - - - 1.65 2.07 - - - - - -0.56 2.08 - - 3.37 - - -
- - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.77 - - 1.79 - - 3.6 - - - - - - - 2.95 - 1.73
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
2.15 - - - - - - - - 1.61 1.5 - 1.42 2.51 - - -0.1 - - - - - - - 0.55 - 3.16 - - -
2.66 - 2.49 - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.91 - - -
- - - - - - - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - 2.96 2.59 2.53 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.