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Heatmap: Cluster_112 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.41 -1.85 0.56 - 2.2 -1.39 - -1.1 -0.85 - -3.49 -3.78 0.55 - -0.2 - -2.43 2.84 -0.05 -0.38 - 0.21 0.76 - -0.47 -0.97 - -0.85 - 2.4
0.57 -0.2 -0.13 0.26 -0.78 -0.12 0.03 -0.54 0.14 0.13 0.36 0.16 -0.1 -0.97 -0.03 -0.08 -0.03 -1.24 -0.07 0.26 0.07 -0.17 -0.3 -0.19 0.07 0.11 0.17 0.15 0.1 0.81
0.14 0.05 -0.1 0.36 0.29 -0.22 -0.37 0.05 -0.45 0.01 -0.36 -0.49 0.63 -0.69 -0.13 -0.22 0.09 0.68 -0.05 -0.48 -0.23 -0.16 -0.4 -0.82 -0.49 -0.18 -0.09 0.11 0.79 0.85
0.07 0.19 -0.05 -0.12 -0.25 -0.14 -0.13 -0.12 -0.28 -0.1 -0.5 -0.53 -0.74 -0.13 0.24 0.12 0.01 0.91 -0.25 -0.45 0.04 -0.32 -0.42 -0.4 0.33 -0.08 0.12 -0.03 0.0 1.23
-2.59 -0.59 -1.75 -2.63 -0.01 1.48 -1.19 0.0 0.1 0.38 0.62 - 1.26 -1.71 -0.45 0.37 0.65 -0.28 -0.08 -2.93 0.04 -2.91 -1.81 -0.45 -2.63 -1.24 0.97 -1.47 0.05 2.4
0.65 0.31 -0.17 0.09 0.69 -0.26 0.37 -0.18 -0.64 0.02 -1.45 -0.72 0.64 0.36 0.6 -0.64 0.35 -0.32 -1.17 -0.51 -0.59 -0.48 -0.32 -0.25 -1.26 -0.42 -0.04 0.74 -0.34 1.11
-0.03 0.3 0.08 0.3 -0.01 -0.13 -0.48 0.11 -0.07 -0.69 -0.01 -0.21 -0.9 0.1 -0.22 -0.44 -0.11 1.1 -0.08 0.03 0.02 -0.49 -0.3 0.12 -0.39 -0.01 -0.13 -0.19 0.32 0.79
-0.62 -1.31 -1.04 -0.62 -3.77 -1.19 -0.23 -0.18 -1.27 -1.57 -0.32 -0.14 0.93 -1.64 -1.57 -0.74 -0.93 2.19 -1.29 -0.74 -0.48 -1.25 -1.48 -1.74 -0.7 -0.56 -0.54 -1.17 0.15 3.09
0.35 0.2 0.34 0.43 -0.24 -0.07 -0.21 -0.56 0.5 0.28 -0.05 0.27 -0.3 -0.34 0.3 -0.2 0.19 -1.87 -0.18 -0.15 0.12 0.19 -1.21 -0.17 -0.03 -0.12 -0.05 0.17 0.43 0.05
-0.0 -0.12 -0.17 0.1 0.26 0.17 0.05 0.3 -0.37 -0.28 -0.21 -0.25 -0.35 0.19 0.4 0.4 0.19 -0.71 -0.19 -0.34 0.09 -0.22 -0.03 -0.41 -0.28 -0.2 -0.12 -0.17 0.45 0.78
-0.42 -0.18 0.06 0.71 -0.45 -0.72 -0.7 0.4 -0.13 -0.27 -0.9 -0.23 -0.18 -0.87 0.1 0.53 0.68 1.01 -0.77 -0.66 -0.07 -1.11 -0.24 -1.02 -1.39 -0.34 -0.08 -0.54 0.47 1.83
0.06 0.09 -0.33 -0.14 -0.94 0.29 -0.15 -0.47 -0.31 -0.54 -0.56 -0.56 0.3 0.32 -0.2 0.32 -0.22 1.68 -0.55 -0.58 -0.75 -0.39 -0.51 -0.33 -1.32 -0.71 -0.89 -0.94 0.56 1.83
-0.43 -1.46 0.06 0.89 -0.19 -0.64 -0.55 -0.59 0.44 -0.09 0.59 -0.37 0.23 -0.7 -0.15 -0.36 0.63 0.95 -0.03 -0.16 -0.29 -0.51 0.06 -0.28 -0.36 0.1 0.51 -0.36 -0.35 0.58
0.04 -0.15 -0.18 -0.17 -0.41 -0.48 -0.25 0.02 -0.63 -0.4 -0.71 -0.64 -0.02 0.83 -0.05 -0.13 -0.19 1.15 -0.08 -0.38 -0.43 -0.19 0.43 -0.18 -0.33 -0.25 -0.12 -0.16 0.57 1.06
-0.01 -0.09 -0.06 -0.06 -0.1 -0.08 0.06 0.17 -0.14 -0.14 0.11 0.05 0.24 0.08 0.15 0.07 0.28 -0.34 -0.2 -0.06 -0.1 -0.07 -0.2 0.07 -0.05 -0.11 -0.05 0.08 -0.03 0.3
-1.46 1.81 -0.97 -1.53 1.75 -1.21 -0.42 - -2.35 1.71 -1.54 -0.04 -1.6 -2.71 - -1.52 -1.05 1.21 -0.15 -0.89 -2.62 -0.48 -1.02 0.3 -1.78 -1.18 -1.52 -1.42 1.19 2.18
0.04 -0.22 -0.68 -0.91 0.17 -0.08 0.2 -0.36 -0.55 -0.43 -0.42 -0.26 0.67 0.16 -0.32 -0.21 -0.34 1.75 -0.29 -0.16 -0.1 -0.02 -1.43 -0.65 -0.78 0.17 0.14 -0.33 -0.16 1.17
0.74 1.13 - 0.09 -1.07 -2.12 -1.59 -0.11 -1.08 0.76 0.33 -0.02 1.2 1.37 -1.41 -0.09 -4.16 1.57 - -1.67 0.1 -2.68 0.3 -0.81 -0.33 -1.38 -0.8 -0.14 -0.88 1.56
-0.28 0.03 -0.13 -0.05 0.05 -0.14 -0.23 0.51 0.17 -0.03 -0.1 0.13 -0.43 -0.11 0.23 0.15 0.39 -0.6 -0.03 0.01 -0.04 -0.12 -1.01 -0.33 -0.13 0.06 -0.15 0.2 0.21 0.75
-0.11 0.3 0.15 0.12 -0.07 0.12 0.09 0.41 -0.01 -0.07 -0.17 -0.06 -0.13 -0.05 0.13 0.2 0.1 -0.55 -0.14 -0.24 -0.19 -0.27 -0.65 -0.52 -0.32 -0.2 -0.2 0.03 0.52 0.81
-0.04 0.22 0.2 0.23 0.33 -0.17 -0.01 0.66 -0.23 0.02 -0.24 -0.18 -0.43 -0.36 -0.23 0.23 0.05 0.01 -0.44 -0.23 -0.47 -0.41 -0.71 -0.23 -0.42 -0.22 0.03 0.09 0.55 0.98
-0.03 -0.51 0.3 0.2 -0.66 -0.13 0.33 -0.28 0.11 -0.03 0.08 0.07 0.56 -0.37 0.22 0.16 0.03 -0.31 -0.27 0.19 -0.06 -0.15 -2.49 -0.28 -0.08 -0.1 -0.26 -0.69 0.42 1.18
0.01 0.09 0.02 0.08 0.08 -0.26 0.1 0.0 -0.07 0.01 -0.1 -0.15 0.14 0.21 0.18 0.24 0.46 -0.15 -0.33 -0.29 -0.19 -0.23 -0.63 -0.23 0.02 -0.06 0.03 -0.14 -0.05 0.64
-0.11 0.01 0.07 0.4 -0.23 0.19 -0.26 0.01 0.1 -0.04 0.07 0.03 -0.09 -0.28 0.12 0.04 0.16 -0.3 -0.07 0.14 0.08 0.09 -0.54 -0.09 -0.01 0.1 0.09 -0.01 -0.02 0.03
0.09 -0.33 0.03 0.72 -0.87 0.09 0.02 -0.43 0.2 0.12 0.07 0.35 -0.38 -0.17 0.3 -0.04 0.07 -1.68 0.05 0.12 0.32 -0.06 -2.13 -0.16 -0.43 0.25 -0.02 -0.24 0.56 0.69
-0.48 -0.17 -0.0 0.26 -0.03 -1.32 -0.57 -0.64 -0.27 -0.29 -0.05 -1.39 0.56 -1.71 -0.33 -0.12 -0.08 1.55 0.16 -1.61 0.27 -0.63 0.29 -0.2 -0.3 -0.53 0.49 0.34 0.26 1.25
Spov3_chr2.00704 (CYP76C6)
 -0.39 -0.23 0.02 -0.2 -0.29 -0.02 -0.19 -0.12 0.42 0.2 0.25 0.14 -0.83 -0.57 -0.14 0.03 0.23 0.18 -0.0 0.0 0.2 0.03 -1.54 -0.16 -0.23 0.32 0.2 -0.04 0.15 0.95
0.27 0.19 -0.04 -0.09 -0.12 -0.03 0.08 0.07 -0.03 0.01 -0.1 0.07 0.14 -0.08 0.12 0.08 0.18 -0.27 -0.2 -0.26 -0.08 -0.08 -0.31 -0.04 -0.06 -0.03 -0.04 0.25 0.15 0.01
0.27 -0.04 -0.28 0.12 0.15 0.45 -0.4 0.6 -0.53 0.24 0.12 -0.18 0.19 0.14 0.43 -0.33 -0.15 0.22 -0.03 -0.66 -0.44 -0.3 -0.71 -0.98 -0.98 -0.22 -0.66 0.14 0.52 1.04
-3.26 -0.76 -2.41 0.11 - -3.61 - -2.49 - - - -3.49 -3.25 -1.44 - - - 3.63 -2.52 -0.96 - - 1.7 - - -3.56 -2.07 - -1.48 3.35
-0.22 -0.22 -0.05 0.07 -0.21 0.23 0.3 0.53 -0.07 -0.05 0.08 -0.01 0.39 -0.11 0.21 0.26 0.24 -0.3 -0.12 -0.03 -0.08 -0.13 -0.65 -0.09 -0.2 -0.07 -0.05 -0.15 -0.2 0.17
-1.88 -2.55 -2.28 -1.38 -1.45 1.1 1.34 1.1 0.05 -0.6 0.14 -0.83 2.01 0.06 -0.4 0.25 -1.25 -0.9 -1.58 -1.14 -1.95 -0.34 -2.76 -0.84 -0.3 -0.91 -0.98 -2.16 0.1 2.25
-0.97 -2.01 -2.35 -1.08 -0.99 1.48 1.27 -0.3 -0.18 -1.26 -0.37 -0.73 2.09 0.09 -0.53 -0.41 0.04 -2.92 0.01 -0.21 -0.42 -2.29 -3.73 -0.56 -0.74 -1.52 -1.22 -2.99 -0.12 2.45
-2.01 -2.68 -1.76 -1.38 -1.86 1.23 0.97 0.83 -0.79 -1.07 -0.88 -0.9 1.86 -0.0 0.4 0.13 -0.62 -1.51 -1.37 -0.62 -0.65 -0.24 -3.11 -0.53 -0.03 -0.64 -1.35 -1.42 -0.07 2.52
-0.79 -0.35 -1.04 0.68 -0.01 0.14 -0.73 0.12 0.9 1.02 0.27 0.8 -0.89 -1.62 -0.54 0.06 -0.11 -2.12 0.16 -0.48 0.67 -0.37 - -1.04 -1.13 -0.05 0.54 0.35 0.46 0.97
-0.39 -0.13 -0.53 -0.73 -0.36 0.34 0.06 -0.72 -0.09 -0.45 0.02 0.09 1.02 -0.68 0.6 0.67 0.36 -0.91 -0.07 0.04 -0.03 -0.04 -0.94 0.17 -0.13 -0.09 -0.19 -0.34 -0.29 1.08
0.32 -0.05 -0.26 -0.33 -0.08 -0.42 -0.29 -0.09 -0.69 -0.36 -0.2 -0.45 0.32 0.15 -0.15 -0.23 -0.35 1.29 -0.36 -0.4 -0.54 -0.34 0.22 0.07 0.08 -0.18 -0.04 -0.15 0.3 1.06
-0.6 0.01 -0.01 0.37 -1.03 -0.02 -0.05 0.28 0.07 0.32 -1.04 0.89 0.43 -2.05 0.92 0.81 0.23 -3.14 0.63 -1.57 0.33 0.16 -2.23 -1.29 0.49 -0.6 -0.68 -1.18 -1.02 1.45
- - - - - - - - - - - - - - 2.37 - 2.6 - - - - - 2.54 - - - - - - 3.7
-0.15 -0.09 -0.19 -0.21 -0.3 - - -0.19 -0.32 - -0.19 1.63 -0.32 - - - -0.2 - - - 1.25 - 1.94 - 1.58 - -0.46 1.38 - 2.53
Spov3_chr3.01399 (Obg A-1)
 0.07 0.1 0.05 -0.04 -0.25 -0.29 -0.13 -0.36 0.15 0.17 -0.02 0.18 -0.36 -0.57 0.02 0.27 0.27 -0.38 -0.3 -0.09 0.0 -0.08 -0.62 0.12 -0.0 0.27 0.1 0.05 0.36 0.56
0.13 0.02 -0.47 -0.08 -0.48 -0.17 -0.26 -0.63 0.05 0.1 0.3 -0.14 1.02 0.46 -0.39 0.02 -0.3 0.82 -0.1 -0.07 -0.08 -0.15 -0.05 0.24 -0.58 -0.27 0.28 -0.18 -0.51 -0.07
0.11 0.06 -0.46 0.99 -0.14 -0.5 -0.95 0.57 -0.14 -0.0 -0.02 -0.26 0.3 -1.25 -0.19 -0.49 -0.04 0.05 -0.1 -0.92 -0.76 -0.43 -0.31 -1.08 0.26 0.14 0.0 0.43 0.14 1.46
-0.09 -0.2 -0.14 -0.15 -0.16 0.22 0.11 -0.07 -0.24 -0.21 -0.16 -0.11 0.16 -0.07 0.17 0.26 0.24 0.24 -0.09 -0.27 -0.11 0.16 0.02 -0.34 -0.19 -0.05 0.08 -0.23 -0.17 0.81
-0.02 0.17 0.14 0.13 -0.08 0.08 0.12 0.17 -0.08 -0.15 0.08 -0.1 0.17 0.25 0.17 0.12 0.13 -0.4 -0.08 -0.18 -0.27 -0.03 -0.42 -0.05 -0.04 -0.05 -0.21 0.15 0.01 0.03
-0.03 -0.1 0.05 0.32 -0.26 -0.25 -0.03 0.35 -0.02 -0.33 0.01 0.01 0.15 -0.07 0.14 0.27 0.31 -0.45 -0.11 -0.55 -0.21 -0.16 0.03 -0.26 0.03 -0.04 0.05 -0.18 0.06 0.64
0.56 0.54 -0.37 -0.61 -0.35 -0.88 -0.96 -0.54 -1.74 -0.6 -0.24 -0.65 0.01 0.16 -1.21 0.33 0.03 2.1 -0.41 -0.97 -2.04 -0.6 -0.21 -1.9 -2.13 -1.16 -0.4 -1.57 0.41 2.36
-1.28 -0.64 0.28 0.08 -0.44 -0.4 -0.31 -0.14 -1.25 0.73 0.83 -0.36 0.43 -1.73 -0.3 0.09 -0.2 -0.38 0.55 -0.96 -0.17 -0.87 -0.6 -0.21 0.02 0.27 -0.41 -1.32 0.63 1.93
-0.02 -0.1 -0.07 0.08 -0.25 -0.0 0.14 0.33 -0.11 -0.19 0.01 0.1 0.27 -0.21 0.18 0.09 0.28 -0.35 -0.17 -0.09 -0.11 -0.06 -0.34 -0.09 -0.04 -0.01 -0.1 0.04 0.11 0.35
0.09 -0.04 -0.03 0.07 0.13 -0.1 -0.03 -0.11 0.07 0.2 0.15 0.06 -0.04 -0.4 -0.15 0.1 0.16 -0.2 0.0 -0.13 -0.03 0.0 -0.45 -0.05 -0.03 0.09 0.03 0.09 0.07 0.23
-2.0 1.13 -2.43 0.04 0.43 -0.9 - -2.15 -1.07 -1.29 -1.26 -2.42 -2.15 0.49 -0.42 -1.28 -0.62 2.74 -1.49 -0.87 -1.35 -1.47 2.11 -0.09 -0.78 -2.58 -0.53 -1.03 0.05 1.45
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.