1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_240 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.07 0.07 0.0 0.09 0.04 0.0 0.08 0.21 0.0 0.2 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.03 0.11 0.02 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.17 0.11 0.12 0.07 0.11 0.0
0.13 0.18 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.14 0.07 0.04 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.03
1.3 0.74 0.99 0.77 0.91 0.58 1.01 0.59 0.62 1.34 0.52 0.56 0.5 0.92 0.27 0.0 0.79 0.26 0.0 0.0 0.41 0.27 0.59 1.0 0.45 0.39 0.88 1.03 0.68 1.02
0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.19 0.62 0.36 0.27 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.6 0.13 0.15 0.05 0.0 0.0 0.56 0.07 0.15 0.0 0.0 0.14 0.0 0.68 0.0 0.15 0.0 0.2 0.0 0.0
0.0 0.19 0.62 0.36 0.27 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.6 0.13 0.15 0.05 0.0 0.0 0.56 0.07 0.15 0.0 0.0 0.14 0.0 0.68 0.0 0.15 0.0 0.2 0.0 0.0
0.03 0.06 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.03 0.01 0.01 0.05 0.05 0.03 0.0
0.1 0.12 0.03 0.08 0.14 0.08 0.11 0.06 0.04 0.08 0.07 0.05 0.04 0.11 0.05 0.12 0.04 0.06 0.06 0.05 0.1 0.06 0.14 0.12 0.07 0.1 0.1 0.12 0.06 0.06
0.3 0.29 0.22 0.32 0.11 0.11 0.11 0.3 0.11 0.14 0.35 0.2 0.28 0.18 0.36 0.25 0.29 0.14 0.26 0.2 0.23 0.39 0.13 0.18 0.14 0.14 0.31 0.2 0.15 0.24
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.15 0.22 0.2 0.28 0.21 0.2 0.17 0.25 0.13 0.18 0.17 0.14 0.17 0.21 0.22 0.18 0.25 0.14 0.18 0.13 0.14 0.16 0.21 0.18 0.25 0.14 0.16 0.2 0.19 0.18
0.05 0.02 0.03 0.03 0.06 0.1 0.0 0.1 0.02 0.03 0.0 0.01 0.03 0.03 0.11 0.06 0.0 0.04 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.12 0.0 0.05 0.03 0.08 0.02
0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.89 5.04 1.45 7.26 2.89 1.43 1.53 0.98 1.12 1.43 0.0 1.31 4.19 2.19 1.59 2.57 0.78 0.94 1.41 1.13 1.85 2.38 3.54 0.76 1.86 1.58 2.94 2.29 1.66 1.75
0.09 0.42 0.22 0.0 0.08 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.17 0.0 0.09 0.0 0.38 0.0 0.08 0.26 0.0 0.28 0.08 0.0 0.0 0.21 0.41 0.0 0.14
0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01
0.07 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.11 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.0 0.21 0.12 0.0 0.12 0.0 0.25 0.07 0.0
0.12 0.07 0.0 0.04 0.06 0.01 0.03 0.07 0.06 0.01 0.04 0.1 0.04 0.1 0.11 0.04 0.05 0.03 0.0 0.02 0.05 0.04 0.0 0.08 0.01 0.05 0.07 0.03 0.05 0.11

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)