Heatmap: Cluster_53 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00154	-0.06	-0.25	-0.04	-0.06	0.14	-0.77	-0.52	-0.28	-0.13	0.24	0.17	-0.12	0.38	-1.46	-0.27	-0.18	0.05	0.88	0.16	-0.02	0.18	0.06	-0.18	-0.19	0.07	0.27	0.42	0.07	-0.54	0.4
Spov3_C0008.00016 (CtpC)	0.12	0.06	0.03	-0.01	0.38	-0.05	0.05	0.13	-0.16	-0.02	0.03	-0.0	0.04	-0.42	-0.3	-0.27	-0.19	1.0	-0.22	-0.12	-0.24	-0.05	-0.32	-0.06	-0.06	-0.1	-0.05	0.32	0.14	-0.47
Spov3_C0010.00026 (ARP1)	-1.54	-1.11	-0.35	0.23	0.17	-0.98	-1.14	-1.01	-0.04	0.14	0.41	-0.57	1.7	-1.96	-0.99	0.12	-0.42	0.94	0.34	-0.64	0.31	0.13	0.74	-0.97	0.61	-0.27	1.04	0.16	-1.72	-0.84
Spov3_C0030.00050 (LRX3)	-0.35	-0.6	0.21	0.44	-0.6	-0.44	-0.18	0.13	0.31	0.07	0.41	0.11	0.47	-1.21	0.23	0.2	0.33	-0.09	0.04	0.08	-0.03	-0.04	0.15	-0.21	0.08	-0.12	0.08	-0.12	-0.36	-0.17
Spov3_C0043.00024	0.26	0.22	-0.0	0.04	0.19	-0.3	-0.26	0.12	-0.02	0.08	-0.14	-0.05	-0.24	-0.36	-0.35	-0.25	-0.17	0.9	-0.15	-0.29	-0.15	-0.06	-0.37	-0.03	-0.0	0.0	0.03	0.35	0.3	-0.05
Spov3_chr1.00137	-0.66	0.14	-0.56	0.74	-0.21	-3.69	-1.27	-0.64	-1.75	0.3	-0.28	-0.66	1.7	-2.2	-2.47	-0.61	-2.12	1.22	0.72	-0.49	-0.03	-0.28	1.41	0.28	0.22	-0.54	0.63	0.42	-0.24	-1.13
Spov3_chr1.00304	-0.83	-0.78	-0.38	0.37	-0.69	-1.77	-0.31	0.34	-0.12	-0.15	0.42	-0.07	1.74	-1.35	-0.19	-0.32	0.04	0.01	0.42	0.45	-0.11	0.09	-0.22	-0.09	0.55	-0.15	0.55	-0.23	-1.1	-0.69
Spov3_chr1.01113 (CRT1)	0.03	0.0	0.13	0.16	-0.13	-0.5	-0.18	0.3	0.03	0.02	0.08	-0.02	-0.01	-0.82	0.01	-0.09	0.05	0.31	0.09	0.02	0.15	0.09	-0.13	-0.22	0.04	0.14	0.28	0.06	-0.18	-0.18
Spov3_chr1.01259	-0.15	-0.14	0.01	0.35	-0.06	-0.38	-0.06	0.31	-0.19	-0.03	0.03	-0.08	0.24	-0.25	-0.04	-0.11	0.06	0.22	0.01	-0.1	0.15	-0.1	0.06	-0.08	0.07	-0.08	0.12	0.08	-0.12	-0.02
Spov3_chr1.01352 (EXP13)	-0.42	-0.3	-0.16	0.08	0.49	-0.37	-0.43	0.1	-0.21	-0.01	-0.24	-0.34	0.53	-0.2	0.34	0.32	0.41	0.24	-0.26	-0.25	-0.0	-0.2	0.36	-0.22	-0.3	0.05	0.18	0.03	-0.22	0.15
Spov3_chr1.01779	-0.38	-0.35	-0.34	0.13	-0.18	-0.8	-0.0	0.52	-0.19	-0.1	0.39	0.08	0.28	-2.61	-0.14	0.04	0.36	-1.17	0.07	0.16	0.09	0.1	0.13	0.38	0.39	0.36	0.28	0.11	-0.02	-0.19
Spov3_chr1.02373 (PDCB5)	-0.34	-0.39	-0.44	-0.04	0.33	-0.86	-0.6	-0.8	-0.36	0.18	-0.13	-0.06	1.09	-0.68	-0.42	-0.2	-0.48	0.57	0.06	-0.38	-0.09	-0.21	0.86	-0.01	0.62	0.24	0.56	0.15	-0.0	-0.67
Spov3_chr1.03017	-0.01	-0.01	0.14	0.29	-0.07	-0.4	-0.11	0.17	-0.2	-0.4	-0.14	-0.36	0.03	-0.9	-0.11	-0.12	0.01	0.15	0.36	0.13	0.2	0.06	0.23	-0.02	0.31	0.28	0.4	-0.15	-0.15	-0.37
Spov3_chr1.03075	-1.09	0.17	0.52	0.85	0.73	-1.02	-3.53	-0.15	-0.03	0.06	-0.96	-1.17	0.41	-2.27	-1.83	-1.2	-0.62	2.3	0.65	-0.14	0.61	0.04	-2.04	-2.27	-0.92	0.14	0.64	0.27	-0.35	-0.79
Spov3_chr1.03308	-0.1	-0.08	0.02	0.08	0.0	0.01	0.14	0.21	0.15	0.02	0.08	0.1	0.01	-0.91	0.02	-0.02	-0.01	0.24	-0.09	-0.03	-0.14	-0.1	-0.31	-0.0	0.03	-0.03	-0.01	0.09	0.2	0.09
Spov3_chr1.03584 (GH9B8)	-0.96	-0.98	-0.72	-0.92	0.3	-0.75	-0.66	-0.85	-0.3	0.34	0.22	-0.31	1.31	-0.29	-0.05	0.07	-0.06	0.84	0.02	-0.28	0.28	0.09	0.39	-0.16	0.36	0.19	0.73	-0.0	-0.36	-0.89
Spov3_chr1.03615 (CAP-H)	-0.07	0.17	0.07	0.44	0.2	-0.5	-0.54	-0.22	-0.03	0.15	-0.05	-0.33	0.57	-0.08	-0.31	-0.34	-0.1	-0.07	-0.44	-0.15	-0.01	0.12	-0.08	0.08	0.08	0.0	0.32	0.31	0.11	0.03
Spov3_chr1.03738	0.04	-0.08	0.08	0.18	0.0	-0.21	-0.03	0.05	-0.05	-0.1	-0.01	-0.09	-0.0	-0.38	-0.11	-0.04	-0.04	0.23	0.07	0.05	0.05	0.06	0.19	-0.08	0.08	0.06	0.18	-0.03	-0.01	-0.18
Spov3_chr1.03867 (PRPL19)	0.34	-0.09	-0.03	-0.41	0.38	-0.11	0.35	0.48	0.01	0.08	-0.28	-0.24	0.66	0.31	0.23	-0.17	-0.19	0.76	-0.23	-0.01	-0.24	-0.2	-0.15	-0.14	-0.25	-0.12	-0.22	-0.03	-0.46	-1.78
Spov3_chr1.04089 (BOR4)	0.35	0.08	0.07	0.81	-0.45	-0.74	-0.39	0.49	-0.1	-0.05	-0.07	-0.14	0.33	-0.52	-0.06	-0.26	-0.12	0.68	-0.12	-0.14	-0.14	-0.23	0.11	-0.33	0.02	-0.08	0.26	0.12	-0.3	-0.27
Spov3_chr1.04221 (DHS2)	0.14	0.07	0.04	0.1	-0.1	-0.12	-0.01	0.14	-0.13	-0.23	-0.06	-0.08	0.09	-0.27	0.07	-0.03	0.05	0.59	-0.1	-0.07	-0.1	-0.06	-0.02	-0.08	-0.02	-0.14	-0.15	0.13	0.07	0.02
Spov3_chr1.04438 (IDH1)	-0.83	-0.82	-0.04	0.84	-0.13	-1.19	-0.8	0.41	0.26	-0.14	0.19	-0.23	1.3	-1.68	-0.05	-0.09	0.14	-0.1	0.15	0.12	-0.21	0.13	-0.1	-0.58	-0.23	-0.18	0.27	0.08	-0.46	0.63
Spov3_chr1.04677 (CGR2)	-0.05	-0.08	-0.08	0.26	-0.27	-0.44	-0.24	0.2	-0.01	0.06	0.1	-0.11	0.31	-0.54	0.04	0.08	0.06	0.07	0.02	-0.22	0.08	-0.1	0.18	-0.09	0.16	0.11	0.12	0.19	-0.14	-0.02
Spov3_chr1.05064	0.11	0.18	-0.5	-0.34	0.1	-0.12	-0.14	0.65	-0.26	-0.11	-0.51	-0.04	0.42	0.41	-0.02	0.27	0.17	0.73	-0.44	-0.55	-0.39	-0.15	-0.08	-0.14	0.13	-0.15	0.13	-0.13	-0.39	0.05
Spov3_chr1.05143 (PPC1)	-0.31	-0.17	0.17	0.06	-0.25	-0.09	0.3	0.37	0.21	-0.1	0.16	0.1	0.36	-0.32	-0.36	-0.14	-0.21	0.71	0.11	0.07	-0.09	-0.01	-0.62	-0.28	0.04	0.02	0.04	0.06	-0.31	-0.29
Spov3_chr1.05253 (TBL42)	-1.45	-0.64	-0.76	-0.38	0.38	-1.03	-0.71	-1.76	-0.29	0.69	0.4	-0.19	0.8	-0.14	-0.57	0.27	-0.56	0.29	0.28	-0.31	0.57	0.18	0.73	0.06	0.31	0.17	0.3	0.77	-0.22	-1.42
Spov3_chr2.00033 (AFO)	0.16	-0.19	0.02	0.4	-0.67	-1.43	-0.58	0.14	0.02	0.07	0.28	0.07	0.58	-1.26	-0.24	-0.08	0.18	0.75	0.05	0.1	0.01	-0.1	-0.01	-0.1	0.29	0.17	0.37	-0.15	-0.29	-0.43
Spov3_chr2.00247 (AGD9)	-0.09	-0.27	-0.07	0.05	-0.05	-0.17	0.14	0.44	-0.16	-0.17	0.02	-0.15	0.13	-0.33	0.07	-0.06	0.02	0.16	-0.03	-0.16	0.06	0.01	0.22	-0.12	0.05	0.07	0.3	-0.07	-0.1	-0.03
Spov3_chr2.00252 (PYR1)	-0.01	-0.73	0.12	0.68	-0.52	-0.84	-0.32	0.1	0.22	-0.3	0.51	0.09	0.78	-1.01	0.01	0.08	0.25	0.29	0.12	0.28	-0.13	-0.13	0.14	-0.14	0.09	-0.23	-0.13	-0.05	-0.27	-0.58
Spov3_chr2.00539	0.61	0.34	0.64	-1.27	0.64	-0.55	0.92	0.5	0.33	0.49	-2.99	-	1.9	1.36	1.55	-	-	2.3	-2.26	-1.53	-1.09	-	-0.73	-2.81	-	-2.95	-2.9	-1.71	-1.31	-
Spov3_chr2.00623	-0.69	-0.49	-0.31	-0.12	-0.26	-0.8	-0.07	0.67	-0.33	-0.38	0.19	-0.01	0.43	-2.5	-0.38	-0.18	-0.06	-0.07	0.29	0.37	0.32	0.37	-0.22	0.36	0.58	0.36	0.63	0.22	-0.16	-0.68
Spov3_chr2.00753 (COG0354)	-0.0	0.1	-0.05	-0.21	-0.21	-0.12	0.13	0.44	-0.05	-0.14	-0.14	0.03	0.09	0.14	0.22	0.26	0.06	0.16	-0.11	-0.25	-0.16	-0.03	0.02	-0.14	-0.23	-0.09	-0.06	0.01	0.12	-0.03
Spov3_chr2.01150	0.24	0.22	0.18	0.14	0.17	-0.27	-0.23	-0.04	0.07	0.02	-0.11	0.12	-0.05	-0.71	-0.26	-0.25	-0.22	0.72	-0.23	-0.23	0.14	0.02	-0.41	-0.27	0.12	-0.12	0.06	0.32	0.11	0.06
Spov3_chr2.01282 (TMKL1)	-0.33	-0.25	0.03	0.77	0.26	-0.46	-0.49	0.18	-0.16	-0.11	0.01	-0.36	0.75	-0.85	-0.23	0.08	0.08	-0.02	-0.1	-0.27	-0.01	-0.18	-0.13	-0.18	0.0	0.05	0.24	0.22	0.1	0.25
Spov3_chr2.01677 (WEE1)	-0.76	-0.36	0.02	0.89	-0.03	-0.85	-0.75	0.12	-0.24	0.02	-0.05	-0.16	1.14	-1.13	-0.08	-0.33	0.4	0.14	-0.19	-0.35	0.15	-0.1	0.13	-0.34	-0.08	0.11	0.34	0.33	-0.34	0.11
Spov3_chr2.01745 (GRXS1)	0.64	0.04	0.08	0.39	0.37	0.24	-0.0	0.08	0.25	-0.33	-0.01	-0.27	0.1	-2.51	-0.57	-0.2	0.02	1.54	-0.21	-0.02	-0.29	-0.48	-1.8	-0.73	-0.31	-0.53	-0.4	0.09	0.08	0.41
Spov3_chr2.01970 (AtSEC23D)	-0.05	0.01	0.01	0.08	-0.15	-0.4	-0.05	0.27	-0.07	0.01	0.09	0.09	0.04	-0.28	-0.04	-0.04	0.12	0.01	0.08	0.04	-0.01	0.08	0.16	-0.05	0.06	-0.01	0.22	-0.05	-0.12	-0.23
Spov3_chr2.02565	-0.13	-0.19	-0.02	0.07	-0.02	-0.28	-0.06	0.08	0.08	-0.05	0.13	-0.09	-0.01	-0.39	-0.01	-0.11	-0.07	0.3	0.19	0.15	0.1	0.08	0.08	0.02	0.2	0.15	0.18	-0.11	-0.2	-0.32
Spov3_chr2.02913	0.06	0.09	-0.03	-0.09	-0.15	-0.32	-0.08	-0.15	0.03	0.09	0.04	-0.03	0.23	-0.02	-0.09	-0.1	-0.02	0.42	-0.03	-0.12	-0.11	-0.01	-0.23	0.06	0.05	-0.1	0.02	0.29	0.12	-0.06
Spov3_chr2.03417 (SHD)	-0.07	-0.21	0.02	0.19	0.04	-0.57	0.0	0.53	-0.12	-0.09	-0.0	-0.1	0.42	-0.9	-0.33	-0.33	-0.28	0.44	0.06	-0.02	0.04	0.02	0.09	-0.2	0.12	0.01	0.3	0.08	-0.05	0.12
Spov3_chr2.03498	0.12	0.03	0.01	-0.24	0.23	0.14	0.33	0.06	0.1	0.12	0.11	0.16	0.12	-0.86	-0.14	-0.17	-0.16	0.28	0.05	0.1	-0.08	0.08	-0.62	-0.06	0.12	-0.04	-0.01	0.22	-0.01	-0.67
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.