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Heatmap: Cluster_26 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
1.33 1.34 -0.48 0.96 -1.43 -1.6 - -1.48 - -1.34 1.25 - -1.38 -0.48 -0.52 - - 1.03 -0.07 -1.51 0.21 0.02 -1.22 0.05 0.8 0.4 -0.01 - 1.72 1.22
-0.2 -0.05 -0.19 -0.09 0.77 0.19 0.03 0.05 -0.37 0.01 -0.13 -0.25 0.36 0.74 -0.0 -0.21 0.06 -0.07 -0.22 -0.49 -0.17 -0.23 -0.76 -0.23 -0.22 -0.07 0.04 0.18 0.2 0.28
0.07 -0.16 -0.18 -0.86 0.49 0.5 0.29 0.23 -0.11 -0.18 -0.26 -0.06 0.13 0.87 0.25 -0.03 0.14 -0.27 -0.26 -0.07 -0.44 -0.24 -0.82 -0.07 -0.58 -0.32 -0.41 0.16 0.09 0.56
0.2 0.03 -0.18 -0.53 0.52 0.37 -0.2 -0.19 -0.37 -0.22 -0.41 -0.38 0.23 0.91 0.29 0.22 0.25 0.26 -0.24 -0.56 -0.39 0.04 -0.17 -0.39 -0.24 -0.47 -0.45 0.01 -0.26 0.76
-0.05 0.19 -0.18 -0.56 0.45 -0.44 -0.51 -0.22 -0.53 0.17 -0.26 -0.2 0.52 0.2 -0.34 -0.18 -0.05 0.83 -0.01 -0.17 -0.02 -0.09 -0.56 -0.15 -0.35 0.27 0.25 0.39 -0.07 0.36
-0.04 -0.04 -0.14 -0.06 1.26 0.27 -0.23 -0.27 -0.21 -0.17 -0.08 -0.2 0.11 -0.18 0.01 -0.0 0.01 -1.66 -0.39 -0.39 -0.29 -0.17 -0.23 -0.08 0.01 -0.12 -0.07 0.53 0.38 0.49
-1.34 -0.89 -0.89 -3.07 1.25 2.13 -0.54 -2.31 -0.91 -0.02 -1.36 -0.61 -1.14 2.27 0.51 -0.83 -0.94 -1.42 -0.52 -0.65 -0.26 -0.46 -1.95 -0.29 -0.66 -0.28 0.14 -0.38 -1.05 1.17
-0.41 -0.8 -0.21 -0.52 1.07 0.57 0.25 0.48 -0.45 -0.37 -0.26 -0.34 0.08 0.85 -0.35 -0.39 -0.33 0.28 -0.64 -0.18 0.33 -0.38 -0.09 -0.37 -0.14 -0.03 -0.21 0.3 -0.31 0.43
0.66 -0.45 0.68 -1.0 0.54 -0.05 0.03 0.24 -0.02 0.18 -0.09 -0.63 -0.34 0.25 -0.45 -1.91 -0.24 -0.62 -0.33 -1.09 -0.99 -0.18 -0.14 0.27 0.42 0.62 0.69 -0.0 0.62 0.02
0.28 0.98 -0.7 -0.52 -0.14 0.26 -0.75 0.87 -0.31 0.55 0.45 -0.61 -0.31 0.83 0.39 0.13 -0.18 -0.53 -0.62 -0.05 -0.06 -0.43 0.42 -0.3 -0.48 -1.08 -0.38 -0.41 -0.29 0.13
0.02 -0.36 0.49 0.55 -0.26 0.04 0.19 0.12 -0.71 -1.07 -0.98 -0.36 0.14 0.25 -0.57 0.18 0.01 0.19 0.15 -0.78 0.14 0.07 -0.52 -0.05 -0.14 -0.2 0.38 0.37 0.21 0.67
0.11 -0.2 0.39 0.2 0.98 -1.06 -1.88 1.07 0.43 -0.28 0.18 0.12 - 1.46 -3.2 - -3.97 -1.94 -0.26 -1.5 -0.69 -0.62 -1.62 -0.79 -2.54 0.38 0.08 1.41 1.58 0.7
- - - - 4.35 3.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.06 0.02 -0.09 -0.13 0.37 0.11 0.24 0.15 0.12 -0.1 -0.05 -0.01 -0.04 0.11 -0.09 -0.04 -0.17 0.07 0.12 0.05 -0.04 0.06 -0.51 -0.05 0.07 0.17 0.04 -0.3 -0.07 -0.22
-0.13 0.07 -0.07 0.03 0.4 -0.51 -0.24 -0.29 -0.32 -0.18 -0.12 -0.23 0.45 0.09 -0.29 -0.2 -0.35 0.8 -0.11 -0.1 -0.14 -0.16 0.22 -0.07 0.11 0.06 0.25 0.16 0.12 -0.03
-0.3 -0.43 -0.33 -0.6 0.53 0.02 -0.12 -0.04 -0.07 0.08 0.12 -0.0 0.41 0.22 0.01 0.16 -0.04 -0.04 -0.07 -0.04 0.01 -0.12 -0.32 -0.01 -0.05 0.16 0.32 -0.06 -0.14 0.2
0.0 -0.02 -0.13 -0.02 0.56 0.22 0.09 0.14 -0.37 -0.0 -0.29 -0.0 -0.19 0.49 -0.04 -0.2 -0.11 -0.35 -0.03 0.05 0.12 0.11 -1.13 0.09 -0.08 0.06 -0.03 0.26 0.1 -0.09
-0.43 -0.07 -0.39 0.1 -0.28 -0.62 -0.77 -0.62 0.24 0.24 -0.61 -0.86 -0.45 0.93 0.2 0.08 0.71 0.41 -0.21 -0.55 0.29 -0.59 0.2 -0.77 -0.69 -0.47 -0.69 -0.96 1.0 1.45
-0.3 -1.03 -0.96 -1.28 0.54 0.37 -0.62 0.2 0.35 -0.34 -0.9 -0.99 -0.37 1.17 -0.06 0.48 0.04 0.65 -1.86 -0.79 0.31 -0.62 0.04 -1.12 -2.16 -0.76 -0.25 0.57 0.53 1.74
-0.04 0.18 -0.16 -0.15 0.34 0.34 -0.4 0.3 0.01 0.19 0.03 0.02 -0.01 0.2 0.17 0.29 0.11 -0.25 -0.13 -0.36 0.18 -0.17 -0.18 0.16 -0.11 -0.17 -0.27 -0.3 -0.39 0.08
-0.31 -0.42 -0.18 -0.08 0.06 -0.17 -0.01 0.18 -0.13 0.18 -0.06 -0.1 0.24 0.08 0.16 0.07 -0.04 -0.84 -0.02 -0.2 0.14 0.16 -0.17 0.06 0.15 0.19 0.36 0.03 0.1 0.06
-0.28 -0.18 -0.1 -0.12 0.75 0.15 0.04 0.16 -0.28 0.01 -0.12 -0.26 0.17 0.47 -0.14 -0.42 -0.27 -0.26 -0.05 -0.26 -0.08 -0.11 -0.36 -0.0 0.03 0.05 0.12 0.33 0.16 0.16
-0.26 -0.07 -0.08 -0.45 0.97 0.34 0.06 0.06 -0.47 0.14 -0.3 -0.35 0.28 0.7 -0.19 -0.37 -0.28 -0.5 -0.71 -0.5 -0.18 -0.11 -0.29 0.04 0.15 0.02 0.24 -0.06 0.02 0.62
-0.22 -0.52 -0.3 -0.67 0.64 0.61 0.07 -0.52 -0.26 -0.2 -0.26 -0.31 0.14 1.31 0.56 0.04 0.4 -0.82 -0.16 0.02 -0.21 -0.04 -1.24 -0.19 -0.05 0.08 0.19 -0.23 -0.3 -0.04
-0.06 0.44 -0.38 0.1 0.81 -0.12 -0.52 -0.39 -0.78 -0.05 -0.1 -0.33 -0.28 1.42 -0.6 -0.19 -0.16 -0.1 -1.05 -1.01 -0.11 -0.6 0.4 -0.05 0.17 0.21 0.14 0.33 0.09 0.02
-0.39 0.28 -1.59 0.39 2.17 0.69 -2.76 -2.05 -1.74 -0.15 -0.04 -0.16 -1.04 2.27 0.04 0.47 -0.94 -1.66 -1.57 -3.58 -0.4 -0.14 -2.47 -1.54 0.39 0.05 -0.97 -0.17 0.23 -0.46
- - - 1.07 3.42 3.68 0.19 - - - - - 1.03 - - - - - - 0.2 - - - - - - - - - -
0.13 0.59 -0.59 -0.82 0.84 0.23 -0.49 0.02 0.7 0.34 0.1 0.08 -0.51 -0.08 -0.11 -0.22 0.24 -0.35 -0.21 -0.49 -0.35 -0.2 -0.5 -0.01 -0.58 0.28 0.22 -0.44 0.14 0.31
-0.17 -0.11 -0.41 -0.55 0.8 0.28 -0.11 -0.12 -0.22 -0.2 -0.07 -0.34 0.09 0.35 0.02 0.11 0.26 0.04 -0.07 -0.4 -0.21 0.0 0.11 -0.05 0.09 -0.12 0.01 0.05 0.12 0.11
2.67 1.56 - - - 2.38 - 1.67 - - - - - - - 1.99 - - - - - - - 1.57 1.54 - - - - 1.31
- -0.27 - 0.32 2.13 2.01 1.32 0.65 - - - 2.18 0.66 - 1.5 -4.15 -1.02 - - 1.5 - - - - 0.64 - - - 0.65 -
-1.67 -1.35 -1.6 -1.08 3.03 -0.8 -0.92 0.84 -2.28 -1.35 -1.0 -0.74 -0.72 0.38 -0.36 -0.63 -0.02 1.17 -0.9 -1.38 -1.76 -1.64 0.01 -0.94 -1.76 -1.66 -1.63 1.09 0.86 0.31
0.16 -0.28 -0.3 -0.26 0.24 0.11 0.1 -0.13 -0.19 -0.12 -0.21 -0.32 0.05 0.91 0.02 0.35 0.05 -0.18 -0.09 -0.34 0.11 -0.0 -0.1 0.31 0.07 0.02 0.07 0.02 -0.38 -0.49
-0.21 -0.52 -0.26 -2.11 2.86 0.33 0.75 0.55 -0.34 -0.52 -0.71 0.5 -1.11 0.3 -1.25 -0.5 -1.25 0.15 -0.27 -1.92 -0.05 -2.04 -0.63 -1.2 -0.69 -1.31 -1.08 -0.04 0.51 -0.89
-0.16 -1.71 -2.2 -2.83 3.7 -0.29 -0.9 -0.7 -4.6 -1.54 -1.07 0.26 -0.47 1.95 -0.59 - -0.95 -0.63 -4.69 -1.23 -4.63 -2.75 0.14 -2.46 -3.0 - -3.75 0.67 0.13 -2.41
0.03 -0.01 -0.03 -0.06 0.27 0.08 0.07 0.19 -0.14 -0.17 -0.08 -0.1 0.01 0.47 -0.03 0.03 0.08 0.19 -0.16 -0.21 -0.12 -0.09 -0.38 -0.03 -0.08 -0.13 -0.15 0.17 0.01 0.09
-0.73 0.01 -0.54 -0.27 2.05 0.35 -0.2 0.54 -0.21 -0.14 0.07 0.25 -0.91 -1.46 -1.47 -1.12 -0.89 -0.93 -0.71 -1.2 -0.87 -0.99 -1.07 -0.82 -0.77 -0.89 -0.73 1.27 1.45 1.23
Spov3_chr1.01004 (SWEET16)
 0.12 0.08 -0.45 -0.25 0.5 0.24 0.16 0.31 -0.17 0.21 -0.11 -0.05 0.14 0.27 -0.17 -0.11 0.05 0.13 -0.2 -0.22 -0.22 -0.29 0.19 -0.22 -0.21 0.01 -0.08 0.1 -0.19 -0.03
1.93 1.0 -0.6 - - 0.8 - -0.5 1.16 1.69 1.6 -0.49 - 2.35 0.36 - 0.55 - - -0.6 - -0.68 - - -0.76 - - - -0.64 0.59
-0.26 -0.73 -0.29 -0.98 0.98 0.37 0.07 -0.06 -0.07 0.4 -0.1 -0.31 0.2 1.05 -0.26 -0.5 -0.03 -0.26 -0.2 -0.16 -0.12 0.02 -0.93 -0.14 0.09 0.1 0.16 -0.08 -0.11 0.19
-0.01 -0.13 -0.21 -0.42 0.35 0.06 0.03 0.44 0.03 0.07 -0.12 -0.09 0.04 0.4 0.04 0.07 -0.03 -0.23 -0.13 -0.11 -0.17 -0.15 -0.42 -0.07 -0.02 -0.11 -0.1 0.21 0.27 0.11
-0.52 -0.28 -0.37 -0.57 2.88 0.31 -1.07 0.35 -0.28 -0.54 -0.93 -0.48 -1.06 -0.29 -0.27 -0.94 -0.53 0.06 -1.57 -1.49 -1.18 -1.33 -0.44 -1.04 -0.6 -1.15 -1.02 1.03 0.94 0.28
-0.16 -0.57 -0.35 -0.45 0.87 0.08 -0.35 -0.28 -0.02 0.12 0.02 -0.26 0.49 0.41 -0.01 0.11 -0.14 0.58 -0.0 -0.12 0.02 -0.09 -0.1 0.01 0.02 0.1 0.29 -0.23 -0.39 -0.89
-0.22 - -0.34 -0.66 - - - -0.07 2.2 1.76 -1.23 -0.45 - 0.99 - - 0.13 -0.55 -1.28 0.35 0.17 0.37 1.68 0.83 1.14 1.11 - - -1.32 -
2.67 1.56 - - - 2.38 - 1.67 - - - - - - - 1.99 - - - - - - - 1.57 1.54 - - - - 1.31
0.14 0.0 -0.23 -0.52 0.2 0.4 0.13 0.25 -0.18 -0.16 -0.18 -0.01 0.02 0.67 0.11 -0.08 -0.08 -0.07 0.03 -0.25 -0.38 -0.21 -0.54 -0.03 -0.43 -0.24 -0.51 0.2 0.35 0.62
-1.36 - -1.44 0.23 0.08 0.42 0.76 0.08 0.82 -0.22 -1.19 1.23 -1.03 0.39 - 0.19 0.38 0.27 - 0.35 - -1.39 -0.24 0.74 0.64 -0.45 -1.56 - 2.03 0.25
0.47 -0.81 0.08 -0.8 0.56 -1.38 -0.39 1.44 -3.44 -0.84 -0.91 -0.32 -1.26 0.61 0.27 -0.6 -1.1 -0.31 -0.66 0.2 -0.27 -2.06 0.53 -0.56 1.36 0.21 -0.84 0.45 0.12 1.2
1.09 1.27 -0.96 0.02 1.33 - 0.0 -0.91 -0.13 -0.88 0.55 -1.01 0.12 - -1.09 -0.15 -0.37 -0.59 - 0.24 1.13 - -1.08 - - 0.65 1.31 -0.28 1.14 0.73
-0.49 -0.33 -0.17 0.01 0.2 -0.28 -0.24 -0.21 0.0 0.18 0.11 0.05 0.29 0.09 0.05 0.11 0.18 0.55 -0.18 -0.32 -0.06 -0.21 -0.89 -0.47 0.06 0.07 0.33 0.03 0.38 0.29
0.53 -1.03 0.28 -1.17 -0.21 -1.3 -0.14 0.84 1.16 -1.01 1.27 - 0.02 0.52 -0.22 0.11 -0.96 1.3 -1.44 -1.42 -1.47 -1.21 1.64 - 1.33 - -0.36 - -1.17 0.64
0.15 0.14 -0.19 -0.04 0.62 -0.32 -0.23 -0.15 -0.47 0.08 -0.3 -0.18 0.65 0.12 -0.41 -0.6 -0.43 1.17 -0.24 -0.16 -0.15 -0.21 -0.43 -0.09 -0.31 -0.16 0.11 0.1 0.14 0.25
- 2.46 - - 0.62 1.46 - 2.3 2.81 0.79 - - - 0.79 - - - - - - - - - - 0.5 - - 1.77 - -
- 1.39 - 1.3 2.18 1.11 - - - - - 2.18 1.36 - - - - - - - - 2.04 - - 1.22 - - - 1.34 1.09
-0.32 -0.11 -0.41 -0.52 1.51 0.42 -0.29 -0.19 -0.41 -0.1 -0.3 -0.16 -0.04 0.27 -0.52 -0.43 -0.31 -0.01 -0.45 -0.45 -0.39 -0.47 0.02 0.32 -0.36 -0.06 -0.1 0.49 0.5 0.51
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-0.02 0.08 -0.13 -0.33 0.2 0.13 0.21 0.2 -0.33 -0.23 -0.11 -0.05 -0.44 0.87 0.12 0.11 0.11 0.23 -0.1 -0.13 -0.28 -0.04 0.09 -0.22 -0.37 -0.34 -0.26 0.02 -0.09 0.33
0.03 0.12 -0.51 -0.43 0.53 0.19 -0.2 -0.74 -0.31 -0.17 -0.29 0.09 0.18 0.67 0.37 0.02 -0.21 -1.04 -0.27 -0.4 -0.3 -0.45 0.51 0.02 0.24 -0.11 0.28 -0.3 0.1 0.74
-0.2 -0.07 -0.18 -0.09 0.2 -0.02 -0.09 0.08 -0.15 -0.01 -0.05 -0.02 0.12 0.52 0.09 0.03 0.12 0.13 -0.16 -0.17 -0.05 -0.2 -0.11 -0.05 -0.0 -0.0 -0.02 0.05 -0.04 0.13
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-0.63 -0.24 -0.56 -0.32 1.18 0.47 0.42 0.13 -0.18 0.33 -0.88 -0.76 -0.34 1.05 0.07 -0.58 0.14 -2.17 -0.25 0.03 -0.13 -0.03 -0.88 -0.1 0.1 0.08 0.3 0.36 -0.16 -0.01
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Spov3_chr6.02489 (MAP70-5)
 0.06 -0.02 0.19 -0.16 0.62 0.28 0.14 0.25 -0.36 -0.01 -0.04 -0.39 -0.17 0.58 -0.09 -0.67 -0.37 0.24 -0.29 -0.27 -0.08 -0.31 -0.41 -0.34 -0.14 -0.05 -0.04 0.13 0.23 0.49
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.