Heatmap: Cluster_83 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00089	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0010.00105 (ERF022)	-	-0.06	2.44	2.21	-0.53	-	-	-	1.71	0.96	-	-	0.89	-	-	0.04	-	-	2.11	-	-0.58	-	-	-	-	-	-0.41	-0.03	-0.07	1.34
Spov3_C0011.00065 (H3.3)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0028.00012 (E2FB)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0037.00013	-	-	2.95	0.28	0.44	-	0.69	-	1.46	2.16	-	-	-	-	1.97	-	-	0.3	-	1.37	0.49	-	-	-	-	-	-	0.77	-	-
Spov3_C0040.00001	-	-	2.48	-	1.26	1.09	-	-	-	-	-	-	-	1.2	-	-	1.22	-	-	-	-	2.06	3.47	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0076.00001	-	-	3.01	2.07	-	-	-	0.74	-	-	-	-	1.25	-	-	-	-	-	2.35	-	-	-	2.85	-	-	-	-	-	-	0.51
Spov3_C0563.00001 (PAL2)	-	-	3.08	-	-	-	-	-	2.35	-	1.35	-	-	3.51	-	-	-	-	-	-	1.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C1055.00001	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01816 (CRK8)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01932 (AtDOA1)	-	-	3.33	-	-	2.16	-	-	-	-	-	-	2.51	3.28	-	-	-	-	-	-	-	-12.39	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02830	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.89	-	3.23	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.04038 (FGT3)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.00868	-	-	4.04	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.76
Spov3_chr2.01854	-	0.81	2.87	-	1.41	-	-	-	-	-	-	0.57	-	-	-	-	1.37	-	-	-	-	-	3.57	-	-	1.21	-	-	-	-
Spov3_chr2.02206 (NTF2)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.02373 (COX2)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.03339 (GCP2)	-	-	4.15	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.61	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02770	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.03055 (CRR22)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.03469 (SAP18)	-	-	0.65	1.27	-	-	-	-	-0.38	1.54	-	0.37	-	0.6	0.46	-	-0.3	-	-	1.57	2.17	-	-	-	-	0.98	0.22	-	1.88	1.61
Spov3_chr3.03603	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.00369	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.00491 (AGAL2)	-	-	4.11	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.67	-	-
Spov3_chr4.00509 (CIP8)	-	-	3.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.22	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.01770 (FAR1)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.02812 (CNGC9)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.03759 (CuAO1)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.03874	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.00448	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.00716	2.24	-	3.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.13	-	-	-	-	3.43	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.02403	-	-	4.06	-	-	-	-	-	-	2.13	-	2.18	-	2.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.02657 (HAP8)	-	-	3.45	-	-	-	-	-	-	2.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.18	-	-	1.25	-	-	-	-	3.16	-	-
Spov3_chr5.03760	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.04340 (PICALM5A)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01738 (RECA2)	-	-	3.45	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.33	1.51	-	-	-	1.48	1.78	-	-	-
Spov3_chr6.01780	0.03	1.05	1.66	1.64	0.53	-	-0.22	-	1.24	-0.19	-	-	-	-0.13	-	-	-	-	0.96	-0.29	2.12	1.29	-	-	-	1.42	-	0.02	-0.07	-
Spov3_chr6.01862	-	-	4.01	-	-	-	2.73	-	2.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02755	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02869	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S01.00061 (MEE11)	-	-	4.32	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.32	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S03.00036 (UMAMIT32)	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S05.00010	-	-	4.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.74	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.