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Heatmap: Cluster_178 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.32 0.57 -0.08 0.29 0.41 -0.28 -0.82 -0.17 -0.22 -0.04 -0.31 -0.21 -0.19 0.77 -0.42 -0.25 -0.04 0.97 -0.22 -0.46 -0.4 -0.71 0.67 -0.17 -0.37 -0.35 -0.63 -0.2 0.48 -0.02
1.31 1.27 0.2 0.39 -0.14 -3.41 -1.86 -0.38 0.01 0.42 -0.91 -1.53 -0.19 -0.93 -2.62 -3.63 -2.87 2.33 -0.44 -0.86 -1.08 -1.18 1.24 -1.26 -1.04 -0.93 -0.77 0.45 0.85 -0.27
1.4 0.95 0.08 -0.21 -0.25 -0.61 -0.41 -0.24 -0.9 -0.6 -0.92 -1.04 0.88 -0.08 0.13 -0.53 -0.7 1.41 -0.31 0.1 -0.26 0.12 1.04 -0.53 -0.57 -0.59 -0.67 -1.44 -1.1 0.0
0.41 0.46 0.14 0.17 0.16 -0.19 -0.05 -0.08 -0.31 -0.17 -0.42 -0.27 -0.23 0.48 -0.14 -0.11 -0.09 0.69 -0.15 -0.26 -0.1 -0.22 0.34 -0.37 -0.37 -0.24 -0.15 0.09 0.13 0.03
0.52 0.71 0.39 0.13 0.63 -0.29 -0.36 -0.09 -0.12 -0.03 -0.54 -0.51 -0.71 0.8 -0.28 -0.46 -0.54 0.86 -0.3 -0.29 -0.2 -0.21 0.29 -0.54 -0.56 -0.38 -0.35 0.2 0.32 -0.24
1.46 1.05 0.46 0.59 0.16 -1.38 -1.33 -2.63 -0.87 -1.09 -2.05 -2.02 -0.93 -0.1 -1.0 -1.39 -1.54 2.84 -0.51 -0.33 -0.36 -0.42 1.95 -2.79 -3.07 -1.95 -2.24 -1.19 -1.07 -1.52
1.48 1.23 -0.39 -0.45 0.65 -0.67 -0.77 -0.67 -0.45 -0.38 -0.73 -0.8 -0.18 1.34 -0.16 -1.0 -0.52 1.04 -0.75 -0.57 -0.93 -1.09 1.65 -0.9 -0.48 -0.95 -1.17 -0.24 -0.13 -1.58
2.1 1.79 -0.21 -0.4 0.95 -0.87 -0.88 -0.6 -0.85 -1.46 -1.6 -1.61 -0.41 1.42 -0.04 -1.51 -1.71 0.96 -1.17 -0.75 -1.74 -1.34 1.4 -1.65 -0.96 -2.43 -1.72 0.27 0.13 -1.4
0.55 0.44 0.1 -0.07 0.2 -0.09 -0.18 -0.41 -0.15 -0.07 -0.44 -0.2 -0.48 0.28 -0.04 -0.09 -0.09 0.75 -0.33 -0.4 -0.19 -0.18 0.79 -0.2 -0.32 -0.16 -0.12 -0.04 0.08 -0.08
-0.62 1.09 -2.19 -3.1 -0.4 -1.69 - -2.11 - -1.93 -0.77 -2.19 -0.38 0.46 -1.67 -3.05 -0.97 3.23 - - - -1.63 2.7 -2.28 -1.55 -1.49 -0.73 -0.36 -0.81 1.23
0.56 0.19 0.47 0.36 0.54 -0.14 -0.22 0.25 0.35 0.37 -0.27 -0.49 -0.09 -0.18 0.23 -0.02 0.0 0.36 -0.45 -0.3 -0.31 -0.43 0.58 -1.19 -0.73 -0.35 -0.2 -0.29 0.08 -0.37
0.49 0.2 0.13 0.06 0.02 -0.23 0.2 0.27 0.06 -0.11 -0.05 -0.1 -0.07 -0.76 -0.23 -0.1 -0.03 -0.31 -0.07 -0.02 -0.08 0.11 0.0 -0.21 -0.12 -0.16 -0.07 0.2 0.26 0.23
0.63 -0.04 -0.18 0.12 0.12 -0.06 -0.2 -0.61 -0.02 -0.2 -0.24 -0.2 -0.27 0.34 -0.26 -0.37 -0.11 1.41 -0.17 -0.18 0.08 -0.45 0.53 -0.22 -0.25 -0.11 -0.18 -0.23 -0.33 -0.13
1.99 0.72 -1.0 -1.02 0.18 -2.5 -2.11 -1.61 -0.81 -0.52 -1.65 -0.61 2.13 0.67 -1.7 -2.39 -1.07 1.84 -2.47 -1.14 -0.67 -1.58 1.89 -1.11 -0.98 -2.22 -1.61 -0.74 0.04 -1.71
1.18 1.28 -0.95 -0.92 0.43 -0.28 -1.81 -3.15 -1.81 -0.5 -1.84 -1.81 0.02 -0.16 -2.14 -1.48 -2.62 2.39 -1.79 -1.85 -2.14 -1.28 2.05 0.55 -1.48 -1.24 -1.7 0.31 0.72 0.53
0.35 0.39 0.03 -0.23 0.07 -0.31 -0.12 -0.09 -0.22 -0.24 -0.33 -0.36 -0.12 0.56 -0.43 -0.28 -0.33 1.03 -0.28 -0.38 -0.38 -0.38 0.72 -0.3 -0.3 -0.31 -0.16 0.24 -0.03 0.56
0.73 0.52 0.25 0.13 0.5 -0.57 -0.45 -0.12 -0.1 -0.13 -0.29 -0.3 -0.16 0.19 -0.34 -0.43 -0.29 0.95 -0.62 -0.53 -0.42 -0.5 0.98 -0.51 -0.26 -0.33 -0.19 0.23 0.27 -0.47
1.47 0.63 0.57 0.56 0.09 -1.15 -0.7 -0.62 -0.22 -0.37 -0.55 -0.86 -0.39 0.78 -0.56 -1.2 -0.93 1.83 -0.97 -0.83 -0.88 -0.97 0.96 -0.91 -0.69 -0.92 -0.63 0.17 0.23 -0.51
1.45 0.07 -0.26 -0.59 0.08 -0.08 -0.28 -0.34 -0.31 0.04 -1.01 -0.33 -0.44 0.38 -0.98 -1.12 -1.22 2.28 -0.53 -0.3 -0.58 -0.32 1.31 -1.58 -1.55 -1.2 -0.69 0.07 -0.27 -0.68
0.67 0.68 0.21 -0.22 0.42 -0.48 -0.34 0.07 -0.02 0.04 -0.31 -0.29 -0.72 0.28 -0.55 -0.75 -0.82 1.02 -0.33 -0.34 -0.19 -0.23 0.49 -0.2 -0.4 -0.24 -0.29 0.42 0.49 -0.27
0.21 0.29 -0.02 0.07 0.2 -0.12 -0.2 -0.0 -0.07 -0.13 -0.08 -0.1 -0.08 0.03 0.08 0.06 -0.13 0.36 -0.22 -0.27 -0.17 -0.04 0.35 -0.03 -0.33 -0.06 0.02 -0.05 -0.01 0.13
0.92 0.65 -0.01 0.08 0.07 -0.25 -0.19 -0.16 -0.29 -0.47 -0.2 -0.37 0.05 -0.1 -0.44 -0.6 -0.35 0.79 -0.25 -0.02 -0.31 -0.05 1.24 -0.26 -0.16 -0.55 -0.43 -0.19 -0.46 0.06
1.68 1.12 0.01 -0.97 0.79 -0.37 0.62 -0.34 -1.44 -0.77 -0.75 -0.75 0.39 0.09 -0.17 -0.89 -0.98 -0.03 -0.7 -0.49 -0.58 -0.66 0.69 0.3 -1.54 -0.4 -1.46 -0.35 0.36 0.88
2.07 1.31 0.95 1.09 -3.49 -0.32 -2.59 -1.53 -1.68 -0.57 -1.75 -1.94 -1.21 0.58 -1.96 -1.17 -1.85 1.93 -1.71 0.13 -1.99 -0.37 1.83 -0.64 -2.75 -0.91 -2.09 -0.84 -1.14 0.05
0.62 0.42 0.29 0.16 0.15 -0.18 -0.46 -0.04 -0.09 0.04 -0.33 -0.15 -0.27 0.05 0.05 -0.12 -0.09 0.52 -0.48 -0.27 -0.05 -0.29 0.52 -0.36 -0.38 -0.28 -0.2 -0.02 -0.01 0.33
0.34 0.35 0.22 -0.03 0.31 -0.52 -1.05 -0.74 -0.23 0.17 -0.29 -0.3 -0.29 0.19 -0.35 -0.27 -0.27 1.43 -0.27 -1.03 0.11 -0.6 0.28 -0.31 -0.5 -0.22 0.03 0.18 0.64 0.3
0.22 0.39 0.07 -0.11 0.51 -0.05 -0.38 -0.19 -0.04 -0.01 -0.31 -0.42 -0.16 0.63 -0.25 -0.23 -0.42 1.05 -0.06 -0.24 -0.01 -0.42 0.38 -0.56 -0.52 -0.39 -0.46 -0.08 0.32 0.17
0.53 0.81 -0.05 -0.64 0.09 0.08 -0.58 -0.91 -0.73 -0.3 -0.96 -0.72 0.22 0.43 -0.14 -0.21 -0.26 1.24 -0.49 -0.48 -0.41 -0.5 1.49 0.69 -0.59 -0.5 -0.65 -0.47 -0.32 0.03
0.3 0.28 -0.1 0.04 -0.36 -0.1 -0.34 0.11 -0.27 -0.31 -0.77 -0.59 0.02 0.68 0.24 -0.22 -0.27 1.47 -0.35 -0.08 -0.05 -0.12 1.05 -0.47 -0.88 -0.81 -0.84 0.07 -0.2 -0.22
0.87 0.49 0.31 0.52 -0.04 -0.64 -0.61 -0.98 -0.22 -0.3 -0.47 -0.65 0.06 0.78 0.22 -0.37 -0.25 1.59 -0.26 -0.17 -0.27 -0.53 0.78 -1.04 -0.87 -0.65 -0.73 -0.29 -0.28 -0.23
0.41 0.41 0.28 0.59 -0.52 -0.29 -0.53 -0.62 -0.08 -0.69 -0.45 -0.69 -0.15 0.81 0.38 -0.09 -0.08 1.83 -0.27 -0.04 -0.35 -0.24 0.68 -1.16 -1.11 -0.81 -0.71 -0.73 -0.51 0.01
0.95 0.95 0.68 0.22 0.82 -0.64 -0.93 -1.04 0.09 0.39 -0.64 -0.75 -0.5 -0.41 -0.31 -0.52 -0.67 0.85 -0.26 -0.6 -0.14 -0.21 1.0 -0.64 -0.54 -0.58 -0.22 -0.07 0.3 -0.64
1.21 1.19 0.69 0.34 0.44 -1.46 -1.26 -0.32 -0.75 -0.08 -1.06 -1.33 -0.54 0.44 -1.08 -1.63 -1.5 1.51 -0.65 -0.79 -0.93 -0.72 1.98 -1.09 -0.8 -0.73 -1.16 0.18 0.24 -1.24
0.88 0.64 0.22 -0.28 0.4 -0.39 -0.69 -0.49 -0.22 -0.01 -0.27 -0.3 -0.74 -0.06 -0.76 -0.5 -0.69 1.15 -0.33 -0.54 -0.2 -0.34 1.17 -0.11 -0.22 -0.31 -0.31 0.47 -0.07 -0.16
1.15 1.11 0.36 0.06 0.75 -0.54 -0.73 -1.09 -0.21 0.32 -0.46 -0.45 -1.81 0.38 -0.87 -0.88 -1.06 1.53 -0.43 -0.73 -0.21 -0.38 1.07 -0.34 -0.57 -0.18 -0.65 -0.15 -0.03 -1.86
0.45 0.26 0.35 0.47 -0.07 -0.15 0.09 0.11 -0.1 -0.22 -0.23 -0.39 0.07 -0.68 -0.0 -0.16 -0.08 0.0 -0.0 0.05 0.05 0.18 0.28 -0.49 -0.31 -0.37 -0.27 0.24 -0.05 0.24
Spov3_chr4.04386 (CYP71B10)
 0.61 0.42 0.63 0.81 -0.27 -0.35 -0.05 -0.68 0.0 -0.61 -0.11 -0.3 -0.07 -0.72 0.07 -0.04 0.08 0.49 -0.19 -0.18 -0.48 -0.33 0.92 -0.6 -0.46 -0.56 -0.39 -0.59 0.28 0.39
0.45 0.31 -0.02 -0.21 -0.13 -0.24 -0.18 -0.32 0.02 0.02 -0.06 -0.15 -0.36 0.4 -0.05 -0.15 -0.13 0.55 -0.24 -0.22 -0.08 -0.2 0.88 -0.19 -0.29 -0.14 -0.13 0.15 -0.1 -0.05
0.55 0.14 -0.14 0.05 0.33 -0.3 -0.32 -0.24 -0.19 -0.25 -0.19 -0.4 -0.25 0.34 0.0 -0.13 0.09 1.22 -0.31 -0.34 -0.23 -0.31 0.72 -0.29 -0.27 -0.27 -0.13 0.06 -0.25 -0.27
1.59 0.73 1.48 1.45 1.03 -1.2 -2.02 -0.96 -0.56 -0.36 -1.55 -2.07 0.79 0.26 -0.26 -0.95 -1.86 1.39 -0.64 -0.67 -0.31 -1.71 1.58 -1.56 -2.42 -1.89 -1.64 -1.4 -1.1 -4.59
1.76 1.42 0.65 -0.42 0.28 -0.36 -1.25 -1.21 -1.04 -0.68 -1.17 -1.2 -0.49 1.16 -0.52 -1.29 -1.12 2.14 -1.43 -0.92 -0.58 -0.82 0.54 -1.13 -1.17 -1.14 -0.87 -0.79 -0.37 0.02
2.27 1.69 -0.3 -2.62 1.37 -2.6 -1.88 -3.5 -2.71 -1.91 -1.77 -4.04 -1.25 1.2 -0.58 -2.96 -3.35 2.39 -3.24 -3.22 -2.85 -3.51 2.22 -4.75 -2.3 -3.21 -4.7 0.88 -0.47 -2.34
Spov3_chr5.02322 (LecRK-I.11)
 2.98 2.61 -0.74 -1.65 0.25 -0.82 - - - - - - - -0.76 - - - 1.95 - -1.79 0.52 -1.9 2.65 -1.83 - - - -1.46 - -
0.44 0.4 0.06 0.16 0.3 0.1 -0.15 -0.22 -0.1 -0.16 -0.16 -0.19 -0.13 0.26 -0.06 0.07 -0.04 0.37 -0.33 -0.51 -0.21 -0.21 0.24 -0.18 -0.29 -0.22 -0.19 0.07 0.07 0.22
2.0 1.39 -0.2 -0.66 -0.05 -1.37 -0.74 -2.03 0.08 -0.02 -0.07 -0.05 -2.73 -1.17 -1.98 -2.59 -3.12 2.15 -1.57 -1.17 -1.35 -0.96 2.01 -1.72 -2.58 -1.34 -1.46 -0.12 0.54 -0.25
0.15 0.37 0.2 0.18 0.18 -0.21 -0.41 0.13 0.04 -0.11 -0.3 -0.21 -0.18 0.17 -0.01 -0.15 -0.15 0.9 -0.23 -0.28 -0.24 -0.21 0.79 -0.29 -0.32 -0.33 -0.32 0.05 0.02 -0.34
1.24 0.78 -0.07 -0.39 0.99 -1.46 -2.28 -1.83 -2.09 -0.35 -2.62 -3.09 -1.05 0.9 -2.11 -1.25 -2.58 2.87 -4.53 -1.71 -2.1 -2.35 2.12 -1.26 -2.96 -1.73 -2.49 0.56 0.16 -0.21
1.23 0.75 0.1 -0.38 -1.11 -0.39 -1.07 -1.1 -0.17 -0.15 -0.79 -0.5 -0.21 0.32 -0.14 -0.82 -0.82 2.03 -0.67 -0.88 -0.9 -0.85 1.97 -1.04 -1.76 -1.38 -1.51 -1.21 -0.21 0.73
0.09 0.26 -1.02 -2.06 0.16 0.87 -1.47 -2.18 -1.36 -0.23 -2.01 -0.45 0.34 -0.38 -1.59 -1.14 -1.52 2.54 -1.79 -1.17 -1.74 -1.35 2.39 0.36 -1.8 -1.14 -2.0 -0.79 -0.29 0.96
Spov3_chr6.02086 (AtHMP20)
 0.92 0.5 0.11 0.22 0.41 0.42 -0.23 -0.29 -0.17 -0.61 -0.92 -1.06 -0.12 0.73 -0.13 -0.21 -0.82 1.29 -0.99 -1.1 -1.25 -1.02 1.83 -1.16 -1.34 -1.6 -2.16 0.36 0.25 -0.19
1.08 0.75 0.81 1.0 0.52 -1.65 -1.65 -0.66 -0.83 -0.75 -1.38 -1.69 0.09 -0.11 0.36 -0.46 -0.57 1.55 -0.13 0.08 -0.05 -0.41 0.97 -0.81 -0.69 -0.67 -0.53 -0.64 0.16 -1.43
0.93 1.52 0.7 0.9 1.0 -1.28 -1.76 -0.77 -0.36 -0.53 -1.55 -1.41 -1.73 0.81 -0.4 -0.62 -0.28 1.55 -0.87 -0.98 -0.25 -0.98 1.36 -1.06 -1.62 -0.87 -1.31 -0.77 -0.18 -0.25
0.77 0.59 0.24 0.08 0.18 -0.6 -0.42 0.02 -0.47 -0.4 -0.38 -0.62 0.11 0.44 -0.09 -0.27 -0.24 1.11 -0.28 -0.27 -0.18 -0.2 0.69 -0.58 -0.29 -0.51 -0.29 0.06 -0.29 -0.01
0.26 0.32 0.02 0.03 0.16 -0.08 -0.19 -0.26 0.0 -0.08 -0.2 -0.14 -0.15 0.31 0.23 0.01 -0.02 0.31 -0.54 -0.48 -0.2 -0.2 0.75 -0.14 -0.23 -0.11 -0.03 0.12 -0.01 -0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.