1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_193 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0
Bra002525 (GASA10)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 13.6 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.29 0.0
Bra004511 (GulLO2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.02 0.01 0.15 0.07 0.02 0.0 0.07 2.39 0.0 0.01 0.01 0.03 0.03 0.06 0.0 0.05
Bra004833 (BGLU27)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.01 6.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra004869 (DAD1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra005197 (ZAT11)
 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.51 0.03 0.25 0.14 0.0 0.0 0.07 0.03 0.76 0.0 0.0 0.0 0.57 18.34 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
2.31 0.82 11.64 3.63 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.14 0.0 3.91 0.0 0.0 0.0 0.25 82.86 0.13 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08
Bra007332 (ADPG1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.02 0.01 19.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.03
Bra007510 (SRG2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.01 42.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra009233 (TGA10)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
3.27 0.0 0.0 0.83 0.13 0.0 0.0 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.46 1.17 0.27 2.57 0.0 0.43 0.41 0.0 62.1 1.96 0.44 0.67 0.15 0.9 0.25 0.47 0.87
Bra011710 (MCU4)
 0.08 0.2 0.21 0.06 0.07 0.08 0.02 0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.04 0.08 0.15 0.02 0.02 0.26 0.07 0.06 0.04 0.07 2.64 0.06 0.0 0.21 0.0 0.04 0.02 0.12 0.02
Bra011761 (CYP91A2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.01 2.15 0.0 0.01 0.0 0.0 76.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 2.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Bra013366 (AtS40-3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.15 0.19 0.0 0.56 0.39 0.0 0.17 0.08 0.86 0.0 0.0 0.08 0.7 46.02 0.58 0.48 0.24 0.23 0.0 0.0 0.08 0.07
Bra013920 (AtCAPE4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra014588 (MTP8)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.16 0.23 0.38 0.01 0.02 0.28 0.02 0.03 0.0 0.0 5.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 11.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra015841 (PUP14)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra015987 (ORRM6)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 5.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
Bra017132 (JOX4)
 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 0.0 0.01 0.0 0.04 11.6 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03
Bra017153 (ATG1c)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra018069 (CYP71A22)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020092 (BCB)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020981 (AtS40-3)
 0.0 0.0 0.53 0.1 0.37 0.42 0.21 0.0 0.32 0.16 0.39 0.19 0.42 0.34 0.0 0.22 0.79 1.02 0.1 0.0 0.18 0.17 32.76 0.0 1.13 0.0 0.27 0.09 0.26 0.17 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 2.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06
Bra021791 (ABS7)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra021827 (CSLD1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Bra022142 (TDT)
 0.02 0.03 0.16 0.02 0.11 0.09 0.25 0.07 0.1 0.23 0.04 0.05 0.22 0.06 0.31 0.08 0.17 0.22 0.16 0.19 0.4 0.58 11.81 0.22 0.21 0.18 0.16 0.07 0.15 0.06 0.01
Bra023122 (AtBBE8)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.25 0.0 0.0 0.01 0.0 3.05 0.0 0.01 0.0 0.01 38.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra024368 (MYB53)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra024719 (AtBBE4)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.0 0.01 0.38 0.13 0.35 0.17 0.0 0.01 0.01 0.02 1.69 0.0 0.06 0.0 1.15 46.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra025004 (TET1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra026320 (OMT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 7.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029117 (CYP715A1)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.05 0.01 0.13 0.02 0.27 0.04 0.14 0.26 0.07 0.22 0.51 0.12 0.58 0.45 0.34 0.4 0.41 0.7 0.1 0.13 0.1 0.24 15.8 0.25 0.22 0.22 0.23 0.14 0.34 0.4 0.47
Bra030273 (WRKY59)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0
Bra031392 (BGLU46)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 6.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Bra031646 (HTA5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra031949 (SHG)
 0.03 0.12 0.0 0.03 0.85 1.35 0.11 0.0 0.46 0.29 0.4 0.2 0.6 1.14 1.41 0.08 0.14 1.68 0.3 0.2 0.53 0.25 30.51 0.65 0.17 0.09 0.38 0.71 0.61 0.14 0.23
Bra035627 (MIOX5)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 2.08 0.0 0.0 0.0 0.0 129.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra037219 (CYP71B2)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.01 9.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra038569 (GES)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.06 0.08 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.17 0.01 0.05 0.03 0.01 3.22 0.13 0.13 0.01 0.15 0.18 0.2 0.03 0.03
Bra039087 (LHT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra039216 (IDS4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra039433 (SRP3)
 0.53 0.77 0.82 0.39 0.16 0.59 0.4 0.53 0.33 0.6 0.24 0.22 0.58 0.2 0.42 0.24 0.04 1.05 0.2 0.24 0.3 0.34 8.19 0.0 0.07 1.05 0.03 0.18 0.65 0.38 0.15
Bra040338 (OFP14)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.67 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)