Heatmap: Cluster_75 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00081 (SPL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0005.00026 (ASHR2)	0.13	0.48	0.2	0.12	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.23	0.0
Spov3_C0007.00006 (GPAT9)	0.0	0.0	0.27	0.0	0.37	0.0	0.25	0.0	0.0	0.42	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.79	0.0	0.0	1.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.5
Spov3_C0011.00072 (PG2)	0.15	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.21	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.29	0.37	0.0	0.0	0.0	0.33	0.34	1.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.16
Spov3_C0022.00001	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.0
Spov3_C0022.00009 (PLDBETA2)	0.0	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.59	0.46	0.49	0.0	0.0	0.56	0.55
Spov3_C0052.00010	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0084.00001 (OPL1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0398.00003	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0433.00003 (WOL)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C0530.00002	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C1141.00006	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C1203.00002	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C1268.00001	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_C1368.00001	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.01436	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0
Spov3_chr1.01519	0.31	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.3	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.28	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.0	0.25	0.27	0.0	1.0	0.55
Spov3_chr1.01758 (SBT1.3)	0.12	0.54	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.52	1.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.64	0.23	0.97	0.0	0.29	0.0	0.31	0.18	0.12	0.3	0.32
Spov3_chr1.02460 (GRXC2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.02522	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.02667	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.02681 (ROPGEF5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr1.03499	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.01908	0.55	0.0	1.0	0.0	0.21	0.22	0.0	0.0	0.52	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.43	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.02526 (ORF02)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	1.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.02892 (BSK6)	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr2.05294 (TPS14)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.01305	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.02216 (SMR12)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.02411 (PR2)	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.24	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.02941	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.03005	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr3.03110 (RFO1)	0.92	0.98	0.4	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.4	0.0
Spov3_chr3.03431	0.0	0.0	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.02339	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.17	0.0	0.0	0.21	0.0	0.23	0.6	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.32	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.02505	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	1.0	0.0
Spov3_chr4.03722 (EIF3B)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.04050 (PKSA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr4.04460	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr5.00840 (CYP718)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.24	0.22	0.0	0.0	0.58	0.0	1.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0
Spov3_chr5.01393 (PFA4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.0
Spov3_chr5.03498	0.0	0.16	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.16	0.33	0.14	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.51	0.15
Spov3_chr5.03957	1.0	0.25	0.79	0.33	0.22	0.38	0.35	0.35	0.44	0.0	0.83	0.57	0.75	0.3	0.4	0.14	0.15	0.0	0.54	0.96	0.24	0.0	0.34	0.0	0.1	0.28	0.94	0.71	0.17	0.16
Spov3_chr6.00379 (ORG2)	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.01373 (BIR6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4
Spov3_chr6.02031	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_chr6.02462	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Spov3_S01.00149	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)