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Heatmap: Cluster_1 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.37 -0.33 -0.1 0.22 -0.37 -0.28 -0.23 0.54 0.01 -0.04 0.09 -0.23 0.54 -0.44 0.11 0.2 0.25 -0.13 -0.12 -0.18 0.32 0.04 0.55 -0.09 0.19 0.04 -0.09 -0.28 -0.38 -0.29
-0.93 -0.72 -1.07 0.05 0.87 -1.76 -1.08 -0.24 -0.71 -0.81 -0.25 -1.01 0.89 0.05 -0.33 0.08 -0.07 1.39 0.19 -0.71 0.01 -0.19 2.08 -0.19 -0.09 -0.22 0.03 -0.64 -0.66 -1.96
-0.13 -0.17 0.07 0.07 -0.1 -0.3 -0.1 0.5 -0.21 -0.25 -0.15 -0.36 0.23 0.04 0.07 -0.01 0.09 0.52 -0.06 -0.12 -0.02 -0.07 0.34 -0.19 -0.0 -0.14 0.07 -0.1 -0.22 0.24
-0.01 -0.17 -0.16 0.17 -0.39 -0.31 -0.01 0.46 -0.44 -0.34 0.04 -0.35 0.78 -0.28 0.28 -0.01 0.19 0.37 -0.33 -0.43 -0.31 -0.15 0.65 -0.05 0.15 -0.2 -0.1 0.01 -0.23 0.11
Spov3_C0012.00085 (E1-OGDH1)
 -0.17 -0.1 0.13 0.38 -0.1 -0.4 -0.14 0.33 -0.1 -0.21 0.07 -0.14 0.21 -0.59 0.05 -0.07 0.12 -0.13 -0.06 -0.02 -0.08 0.02 0.63 -0.33 0.04 -0.04 0.2 -0.02 -0.11 0.08
-0.77 -0.44 -0.25 0.16 -0.24 -0.58 -0.49 0.69 -0.31 -0.34 0.2 -0.02 0.57 -0.7 0.18 0.14 0.22 -0.02 -0.11 0.22 0.05 0.14 0.82 -0.44 0.17 0.15 0.34 -0.18 -0.53 -0.24
-0.22 -0.12 -0.02 0.18 -0.32 -0.25 -0.14 0.28 -0.16 -0.27 -0.01 -0.13 0.39 0.15 0.11 -0.02 0.18 0.01 -0.23 -0.24 -0.07 -0.1 1.04 -0.19 -0.03 -0.21 0.04 -0.06 -0.26 -0.14
0.08 0.09 0.03 0.19 0.02 -0.16 -0.21 -0.22 -0.05 -0.05 0.08 -0.18 0.0 -0.04 0.12 0.03 0.07 0.48 -0.12 -0.25 -0.13 -0.16 0.45 -0.19 -0.15 -0.14 -0.15 0.14 -0.08 0.17
0.11 0.08 0.25 0.12 -0.35 -0.94 -0.73 -0.02 -0.46 -0.52 -0.55 -0.66 -0.12 -0.43 -0.14 -0.5 -0.4 0.8 0.12 0.01 0.04 -0.15 1.91 -0.38 -0.13 -0.18 0.02 -0.07 -0.27 0.07
-0.09 -0.02 0.05 0.17 -0.1 -0.37 -0.27 0.15 -0.2 -0.14 -0.03 -0.11 0.15 0.04 0.16 0.09 0.15 0.2 -0.2 -0.18 -0.1 -0.05 0.81 -0.16 -0.08 -0.14 0.01 -0.08 -0.16 -0.0
0.13 0.09 0.1 0.33 -0.29 -0.45 -0.37 0.01 -0.27 -0.17 -0.12 -0.19 0.03 -0.19 0.13 0.07 0.16 0.51 -0.16 -0.19 -0.05 -0.15 0.94 -0.21 0.07 0.02 0.12 -0.13 -0.33 -0.29
-0.05 -0.09 0.05 -0.08 -0.13 -0.27 -0.4 -0.25 -0.13 -0.15 -0.03 -0.12 0.23 -0.17 0.17 0.27 0.18 0.5 -0.39 -0.13 -0.02 -0.05 0.73 -0.24 -0.23 -0.0 -0.08 -0.16 -0.24 0.52
-0.25 -0.29 -0.15 0.12 -0.22 -0.39 -0.08 0.5 -0.11 -0.32 0.05 -0.11 0.52 -0.74 0.33 0.2 0.41 -0.25 -0.11 -0.01 -0.08 -0.01 0.46 -0.25 0.14 -0.05 0.25 -0.28 -0.43 0.22
-0.1 -0.17 -0.09 0.05 -0.18 -0.05 -0.05 0.18 -0.08 -0.14 0.02 -0.03 0.13 0.06 0.15 0.11 0.09 -0.24 -0.13 -0.05 -0.06 -0.03 0.69 -0.1 -0.0 -0.14 0.03 -0.14 -0.13 0.09
-0.59 -0.5 -1.28 -1.51 -1.38 0.22 0.15 0.19 -1.7 -1.52 -0.58 -0.66 0.99 0.43 0.67 0.34 0.52 1.13 -0.38 -0.25 -0.3 -0.13 1.83 -0.34 -0.27 -0.37 -0.34 -0.95 -1.31 0.36
-0.08 -0.1 0.09 0.38 -0.37 -0.47 -0.06 0.43 -0.21 -0.1 0.02 -0.23 0.29 -0.44 0.01 0.04 0.16 -0.18 0.0 -0.1 -0.03 0.1 0.61 -0.23 0.05 0.0 0.12 0.05 -0.17 -0.16
-0.13 0.21 -0.02 0.09 0.03 -0.33 -0.16 0.19 -0.09 -0.24 0.09 -0.16 0.09 -0.23 0.15 -0.02 0.29 0.47 0.06 -0.29 -0.09 0.01 0.74 -0.23 -0.24 -0.2 -0.1 -0.36 -0.3 0.12
Spov3_chr1.00125 (AtSEC62)
 0.0 -0.03 -0.0 0.12 0.12 -0.35 -0.09 0.18 -0.19 -0.13 0.02 -0.11 0.1 -0.21 0.04 -0.02 -0.04 0.29 -0.03 -0.04 -0.01 -0.02 0.48 -0.15 0.03 -0.06 0.14 -0.01 -0.12 -0.19
-0.18 -0.09 0.21 0.72 0.01 -0.3 -0.68 0.4 -0.23 -0.2 -0.07 -0.11 -0.04 -0.53 0.03 -0.02 0.23 -0.17 -0.27 -0.26 0.02 -0.14 0.89 -0.28 -0.03 0.03 0.14 0.11 -0.12 -0.11
-0.3 -0.24 0.09 0.27 0.03 -0.12 0.08 0.52 -0.24 -0.42 -0.15 -0.16 0.28 -0.58 0.21 0.04 0.05 0.47 -0.24 -0.11 -0.23 -0.02 0.66 -0.22 -0.14 -0.17 -0.06 -0.08 -0.17 0.16
-0.21 -0.2 -0.15 0.02 0.03 -0.23 -0.13 0.31 -0.03 0.03 0.09 -0.06 0.32 -0.31 0.3 0.1 0.16 0.15 -0.04 -0.09 0.0 -0.14 0.44 -0.16 0.06 -0.01 0.09 -0.14 -0.36 -0.22
0.06 0.2 0.18 0.59 -0.07 -0.23 -0.28 0.34 -0.27 -0.36 -0.08 -0.2 -0.07 -0.01 -0.09 -0.11 -0.09 -0.08 -0.39 -0.25 -0.14 -0.32 1.12 -0.3 -0.27 -0.03 -0.22 -0.04 0.05 0.23
-0.23 -0.36 -0.3 -0.06 0.09 -0.13 -0.02 0.2 -0.11 0.06 0.0 -0.1 0.17 -0.11 0.33 0.06 0.13 0.3 -0.21 0.0 -0.02 -0.12 0.74 -0.16 0.04 0.02 0.08 -0.46 -0.32 -0.07
-0.12 -0.29 -0.01 -0.03 -0.37 -1.11 -0.83 -0.51 0.19 0.21 0.37 0.19 0.38 -0.37 -0.32 -0.25 -0.46 -2.68 -0.36 -0.33 -0.19 -0.11 1.5 -0.27 0.07 0.44 0.57 0.74 0.37 -0.84
-0.01 0.03 -0.03 0.08 0.07 -0.2 -0.26 0.02 -0.2 -0.02 -0.16 -0.17 0.28 0.1 0.08 -0.05 -0.03 0.35 -0.04 -0.16 -0.03 -0.02 0.21 -0.1 -0.07 -0.03 0.08 0.02 0.01 0.06
-0.32 -0.36 -0.17 -0.14 -0.05 -0.31 -0.13 0.22 -0.32 -0.18 -0.05 -0.11 0.27 -0.34 0.12 -0.08 0.13 0.74 -0.03 -0.04 0.06 0.04 1.02 -0.36 -0.03 -0.05 0.12 -0.24 -0.42 -0.1
-0.34 -0.49 -0.02 -0.0 -0.18 -0.46 0.03 0.35 -0.16 -0.36 0.07 -0.06 0.44 0.03 0.13 -0.1 0.09 -0.02 0.03 -0.01 -0.15 -0.2 1.24 -0.32 0.02 -0.12 0.03 -0.32 -0.36 0.01
0.0 0.03 -0.04 0.14 -0.03 -0.18 -0.13 0.15 -0.18 -0.1 -0.11 -0.15 0.06 0.2 0.07 -0.0 0.01 0.16 -0.11 -0.22 -0.05 -0.06 0.59 -0.1 -0.03 -0.08 0.04 0.09 -0.07 -0.18
-0.03 -0.0 0.02 0.14 -0.0 -0.37 -0.15 0.2 -0.11 -0.03 -0.02 -0.13 0.11 -0.08 0.11 0.01 0.08 0.02 -0.13 -0.2 -0.07 0.03 0.52 -0.21 -0.05 -0.04 0.14 0.06 -0.04 -0.01
-0.25 -0.32 -0.04 -0.43 -0.75 0.19 0.25 0.35 -0.07 -0.27 0.18 0.09 0.29 0.13 0.45 0.27 0.4 0.68 -0.38 -0.22 -0.21 -0.15 0.25 -0.53 -0.19 -0.04 0.08 -0.36 -0.57 0.02
-0.17 -0.03 0.3 0.63 -0.31 -0.41 -0.62 0.71 -0.36 -0.3 -0.16 -0.25 0.4 -1.61 -0.05 -0.15 -0.02 -0.13 -0.18 -0.23 0.03 -0.03 0.78 -0.37 0.07 0.04 0.26 0.16 -0.05 0.24
0.02 -0.07 -0.5 -0.25 0.21 -0.09 -0.06 0.25 -0.51 -0.34 -0.17 -0.35 0.34 0.58 0.27 0.16 0.1 0.71 -0.4 -0.32 -0.31 -0.24 0.91 -0.09 -0.06 -0.26 -0.23 -0.1 -0.28 -0.22
0.17 0.18 0.06 0.17 0.1 -0.24 -0.18 -0.03 -0.19 -0.14 -0.16 -0.29 0.03 -0.16 -0.02 -0.16 -0.1 0.39 -0.22 -0.22 -0.15 -0.17 1.04 -0.31 -0.17 -0.2 -0.03 0.0 -0.01 0.2
-0.43 -0.45 -0.38 -0.39 -0.01 -0.03 -0.02 0.09 -0.19 -0.18 -0.14 -0.19 0.29 -0.02 -0.02 0.02 -0.02 1.14 -0.2 -0.19 -0.18 -0.21 1.33 -0.15 -0.18 -0.23 -0.22 -0.19 -0.35 -0.23
0.12 0.02 0.06 0.54 -0.05 -0.51 -0.71 0.28 -0.27 -0.12 -0.14 -0.47 0.02 0.06 0.05 0.03 -0.04 0.93 -0.54 -0.54 -0.17 -0.48 0.56 -0.42 -0.16 -0.24 -0.1 0.06 0.16 0.59
0.08 -0.01 0.1 0.07 -0.2 -0.29 -0.16 0.3 -0.42 -0.31 -0.16 -0.24 0.33 -0.23 0.14 -0.05 0.17 0.17 -0.09 -0.13 -0.08 -0.0 0.23 0.27 0.11 -0.16 -0.01 0.03 -0.09 0.24
-0.1 -0.03 0.25 0.33 -0.02 -0.4 -0.13 0.44 -0.09 -0.19 -0.04 -0.22 0.03 -0.76 0.07 -0.1 0.07 0.0 -0.16 -0.1 0.02 -0.02 0.68 -0.33 -0.17 0.07 0.1 0.08 -0.15 0.19
-0.36 -0.28 0.02 0.67 -0.28 -0.28 -0.75 0.69 -0.31 -0.41 -0.26 -0.03 0.17 -0.66 -0.01 -0.13 0.25 0.03 -0.37 -0.29 -0.11 -0.18 1.17 -0.55 -0.13 0.04 0.07 -0.01 -0.11 0.52
0.06 0.05 0.06 0.24 0.18 -0.32 -0.37 0.12 0.11 -0.13 -0.14 -0.19 0.26 -0.49 -0.09 0.19 0.08 -0.35 -0.18 -0.3 -0.09 -0.02 0.87 -0.11 -0.0 -0.11 0.14 0.03 0.0 -0.2
-0.32 -0.44 -0.13 0.09 -0.15 -0.19 0.11 0.42 -0.03 -0.17 0.08 -0.03 0.36 -0.51 0.13 -0.0 0.1 -0.04 -0.1 0.07 0.01 -0.01 0.59 -0.24 0.04 0.01 0.24 -0.06 -0.3 -0.09
0.13 0.2 0.04 0.11 -0.23 -0.34 -0.36 0.08 -0.12 -0.13 -0.18 -0.27 0.1 0.15 0.08 -0.18 -0.06 0.18 -0.3 -0.22 -0.25 -0.09 1.16 -0.23 -0.14 -0.21 -0.07 -0.07 0.03 0.23
0.21 0.25 0.18 0.19 0.2 -0.24 -0.65 -0.33 -0.27 -0.24 -0.33 -0.56 0.08 0.4 -0.02 -0.0 -0.12 0.62 -0.5 -0.38 -0.18 -0.35 1.36 -0.58 -0.24 -0.36 -0.09 -0.04 0.06 0.03
Spov3_chr1.03750 (gamma2-COP)
 -0.17 -0.2 0.05 0.17 -0.23 -0.28 -0.07 0.32 -0.06 -0.08 0.09 0.05 0.24 -0.56 0.2 0.05 0.11 -0.3 -0.09 -0.07 0.03 0.03 0.42 -0.24 0.04 0.07 0.21 -0.06 -0.14 0.09
Spov3_chr1.03752 (E1-OGDH1)
 0.12 0.13 0.18 0.22 0.02 -0.28 -0.16 -0.03 -0.14 -0.33 -0.2 -0.13 0.0 -0.51 0.09 -0.06 0.03 0.12 -0.23 -0.16 -0.1 -0.09 1.28 -0.44 -0.21 -0.16 -0.11 -0.08 -0.08 0.15
-0.03 -0.19 -0.25 0.08 -0.02 -0.37 -0.28 -0.0 -0.37 -0.39 -0.19 -0.23 0.26 0.22 0.26 0.03 0.28 0.32 -0.24 -0.38 -0.33 -0.26 1.62 -0.33 -0.17 -0.17 -0.08 -0.14 -0.35 -0.29
-0.32 -0.19 -0.02 0.82 -0.13 -0.55 -0.61 0.88 -0.52 -0.37 -0.27 -0.5 0.45 -0.51 -0.1 -0.33 0.14 0.43 -0.57 -0.42 -0.12 -0.15 1.24 -0.57 -0.29 -0.31 -0.02 -0.07 -0.07 0.51
-0.01 -0.07 -0.02 0.09 0.04 -0.23 -0.11 0.28 -0.11 -0.08 0.04 -0.11 0.09 -0.17 0.04 -0.09 0.03 -0.14 -0.09 -0.13 -0.04 0.03 0.53 -0.16 0.04 -0.03 0.15 0.07 -0.03 -0.06
-0.08 0.03 -0.19 0.55 0.14 -0.07 -0.63 0.83 -1.03 -0.22 -0.36 -0.38 0.16 -0.48 0.04 -0.09 0.1 -0.02 -0.41 -0.32 -0.28 -0.38 1.66 -0.56 -0.47 -0.31 -0.23 -0.0 0.02 0.1
-0.07 -0.06 -0.02 0.04 -0.11 -0.18 -0.16 0.09 -0.19 -0.19 -0.05 -0.09 0.05 0.18 0.01 0.06 0.05 0.34 -0.11 -0.16 0.06 0.04 0.48 -0.16 -0.06 0.05 0.15 -0.18 -0.1 0.04
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Spov3_chr4.03388 (ELONGATION FACTOR-TU FAMILY)
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Spov3_chr5.00362 (EF-1alpha)
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Spov3_chr6.00830 (CYP77A9)
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Spov3_chr6.02858 (MPPalpha)
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Spov3_S10.00031 (PAM18-1)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.