Heatmap: Cluster_71 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0030.00011 (RHA1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0047.00003 (FZF)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0159.00002	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.00113 (RRM)	1.07	-	2.36	-	-	-	-	-	-	-	0.72	0.42	-	2.69	-	-	-	1.54	-	-	1.46	-	-	0.64	-	-	1.46	0.82	-	0.67
Spov3_chr1.01025	-	-	-	-	-	2.68	-	1.21	-	-	-	-	1.48	4.02	1.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02242 (ATL51)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02534	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02551 (PMIR2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02622 (flot2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.57	-	2.66	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.02524	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.02987 (ACT12)	-	-	2.56	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.56	-	-	-	-	-	-	-	-	2.5	-	-	-	-	-	-	2.75
Spov3_chr2.03018 (EYE)	-	-	-	-	-	-	-	-	2.53	-	-	-	-	4.07	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.89	-	-	-
Spov3_chr2.03293	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.04213 (E2FB)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.04330	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.04362 (ASK2)	-	-	-	-	2.58	-	-	-	-	-	-	-	-	4.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-
Spov3_chr2.04468	1.68	-	-	2.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.14	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.09	-	-	-	-
Spov3_chr2.04482	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.00036	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01005	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01587	-	-	-	-	-	-	-	1.89	-	-	-	2.73	-	3.69	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.76
Spov3_chr3.02142 (APO2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02634	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.61	-	-	-	-	-	-	-	2.47	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.03687	-	-	-	3.79	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.03945 (PAN)	-1.27	-0.4	-0.85	-1.52	-0.39	-0.53	-0.62	-1.48	-0.05	0.42	-1.19	-0.88	-1.71	2.59	-0.54	-0.57	0.61	0.98	0.11	-0.41	0.54	0.38	-0.79	-0.53	0.29	-0.05	0.36	-0.16	-0.9	-2.03
Spov3_chr3.04265 (ELI3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.96	-	3.82	-	-	-	-	-	-	2.11	-	-	-	-	-	1.9	-	-	-
Spov3_chr3.04516 (ENODL18)	-	-	-	-	0.58	-	-	1.57	0.58	-	-	-	3.07	2.05	-	0.66	-	0.37	0.71	-	-	1.97	-	-	0.53	-	-	-	0.69	-
Spov3_chr4.01087 (BET9)	-1.87	-0.6	-2.66	-6.17	0.28	-0.75	-3.5	-5.95	-2.45	0.71	-0.96	-1.81	-2.11	3.32	-2.81	-1.12	-0.7	-0.02	0.38	-1.59	0.27	-0.15	-6.91	-1.11	-1.31	1.25	0.99	-1.05	-2.69	1.22
Spov3_chr4.02441 (RLP48)	2.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.19	-	-	4.01	-	-	-	2.12	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.02499	-	-	-	2.95	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.73	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.16
Spov3_chr4.03406	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.29	-	-	-	-	-	-	-	-	3.39	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.03460	-0.64	0.05	-0.62	-0.84	0.64	-0.41	-1.38	-1.89	-0.36	0.77	-0.34	-0.91	0.47	1.94	-0.71	-0.54	-0.05	0.16	0.12	-0.25	0.17	-0.3	-0.29	0.02	-0.09	0.54	0.36	0.01	-0.89	-0.26
Spov3_chr5.03186	-	-	-	-	-	-	3.26	-	-	-	-	-	-	4.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03654 (MCTP8)	1.64	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.4	-	-	-	1.29	1.56	1.36	3.06	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03736	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.00470 (SOS6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01698	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.38	-	4.29	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02381	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02611 (SIGA)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02956	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S01.00019 (ABCG43)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.04	3.76	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S05.00036	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S07.00047 (LOH3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.42	4.27	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S09.00011	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S11.00048	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.48	-	-	-	-	-	-	-	-	2.93	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S13.00038 (TET13)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.58	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.6	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.