Heatmap: Cluster_30 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.21 0.29 0.07 0.11 0.24 -0.13 -0.23 -0.05 -0.15 0.06 -0.36 -0.16 -0.73 1.29 -0.08 -0.14 -0.12 0.79 -0.4 -0.37 0.07 -0.12 -0.65 -0.09 -0.45 -0.05 -0.27 0.17 -0.17 -0.34
0.27 0.37 -0.01 -0.26 0.44 0.16 -0.49 0.02 -0.57 -0.34 -0.41 -0.13 -0.09 1.14 -0.2 -0.02 0.09 0.61 -0.1 -0.52 -0.23 -0.09 -0.24 -0.17 -0.29 -0.16 -0.24 0.14 -0.1 -0.01
0.27 0.17 -0.17 -0.17 0.5 -0.06 -0.53 -0.32 -0.42 -0.21 -0.28 -0.29 -0.22 1.04 0.08 0.25 0.19 0.71 -0.3 -0.46 -0.16 -0.28 0.21 -0.16 -0.18 -0.04 -0.23 -0.17 -0.11 0.02
0.15 0.17 -0.08 -0.03 0.4 -0.03 -0.1 -0.26 -0.1 -0.02 -0.11 -0.11 -0.22 0.55 0.11 0.05 0.05 0.07 -0.11 -0.26 -0.03 -0.1 -0.14 -0.0 -0.13 -0.04 0.06 0.01 0.08 -0.15
0.51 0.52 0.01 -0.02 0.38 -0.03 -0.33 -0.25 -0.31 0.01 -0.45 -0.35 -0.39 1.08 -0.05 0.01 -0.07 0.48 -0.37 -0.55 -0.3 -0.4 -0.1 -0.09 -0.44 -0.27 -0.33 -0.01 0.29 0.31
0.21 0.33 0.05 -0.04 0.43 0.09 -0.35 0.03 -0.18 -0.08 -0.49 -0.35 -0.18 0.87 0.08 -0.01 0.01 0.66 -0.49 -0.41 -0.24 -0.23 -0.11 -0.21 -0.41 -0.26 -0.3 0.2 0.23 0.03
0.17 0.34 -0.22 -0.22 0.38 0.39 -0.05 -0.27 -0.2 -0.07 -0.44 -0.18 -0.46 1.14 0.13 0.09 -0.15 0.45 -0.35 -0.45 -0.17 -0.21 0.14 0.09 -0.27 -0.16 -0.37 -0.04 -0.04 -0.34
0.03 0.05 -0.26 -0.58 0.47 0.33 0.03 -0.36 -0.25 -0.19 -0.11 -0.01 -0.16 0.91 0.36 0.16 0.15 0.07 -0.0 0.01 -0.1 -0.05 -0.08 0.04 -0.23 -0.03 -0.17 -0.23 -0.28 -0.4
-0.24 -0.01 -0.43 -0.91 0.65 -0.28 -0.53 -0.81 -0.17 0.16 -0.01 -0.16 -0.29 1.26 0.26 0.16 0.34 0.8 -0.02 0.04 0.32 0.02 -0.6 0.14 -0.35 0.11 0.0 -0.64 -0.7 -0.61
-0.06 -0.05 -0.22 -0.4 0.29 -0.13 -0.2 -0.27 -0.2 -0.2 -0.24 -0.14 -0.34 1.25 0.14 0.06 0.01 0.59 -0.1 -0.21 -0.12 -0.1 0.07 0.39 -0.34 -0.17 -0.15 0.04 -0.28 -0.24
0.27 0.2 -0.1 -0.33 0.19 0.27 -0.11 -0.54 -0.08 -0.13 -0.22 -0.04 -0.36 1.1 0.28 0.13 -0.01 0.35 -0.31 -0.42 -0.39 -0.19 0.22 -0.22 -0.42 -0.35 -0.45 0.26 0.14 -0.0
0.06 0.35 -0.27 -0.54 0.68 0.5 -0.1 -0.11 -0.5 -0.15 -0.43 -0.36 -0.18 1.32 0.12 0.11 -0.07 -0.16 -0.41 -0.59 -0.19 -0.15 -0.25 0.04 -0.31 0.03 -0.21 0.15 -0.0 -0.15
0.07 0.2 -0.22 -0.33 0.32 0.13 -0.14 -0.11 -0.3 0.02 -0.27 -0.2 -0.15 1.0 -0.04 0.12 0.11 0.73 -0.33 -0.25 -0.23 -0.24 0.17 -0.19 -0.35 -0.15 -0.32 -0.38 0.01 0.2
0.25 0.32 -0.18 -0.17 0.26 0.12 -0.12 0.13 -0.3 -0.1 -0.38 -0.07 -0.26 0.88 0.01 -0.05 -0.07 0.54 -0.26 -0.33 -0.09 -0.36 -0.11 -0.12 -0.34 -0.2 -0.08 -0.0 0.17 0.07
0.04 0.16 -0.13 -0.06 -0.28 -0.09 -0.15 -0.28 -0.4 -0.18 -0.06 0.04 0.08 0.91 0.22 0.26 0.26 0.16 -0.52 -0.21 -0.05 -0.01 0.05 -0.04 -0.1 -0.14 -0.19 -0.34 0.0 0.27
0.15 0.39 -0.66 -1.39 1.05 0.69 -0.14 -0.38 -0.39 -0.12 -0.68 -0.32 -0.44 1.64 0.15 -0.13 -0.26 0.09 -0.7 -0.83 -0.35 -0.22 0.11 -0.1 -0.71 -0.41 -0.51 0.36 0.48 -0.39
0.11 0.27 -0.32 -0.74 1.12 0.16 -0.28 -0.21 -0.25 0.02 -0.53 -0.21 -1.46 1.91 -0.18 -0.34 -0.09 0.72 -0.54 -0.36 -0.38 -0.35 -1.03 -0.48 -0.52 -0.19 -0.34 0.33 0.17 -0.81
0.12 0.18 -0.19 -0.57 0.43 0.4 -0.04 -0.13 -0.16 -0.03 -0.22 -0.03 -0.64 1.2 0.17 0.16 0.08 0.5 -0.4 -0.38 -0.24 -0.25 -0.56 -0.12 -0.52 -0.09 -0.29 -0.03 -0.1 0.17
0.28 0.44 0.01 -0.34 0.13 -0.03 -0.24 -0.01 -0.03 0.2 -0.19 -0.09 -0.42 0.79 -0.03 -0.07 -0.04 0.11 -0.17 -0.25 0.06 -0.11 -0.62 -0.17 -0.31 -0.01 -0.07 0.24 0.16 0.02
0.18 0.13 0.01 -0.11 0.33 -0.02 -0.05 0.06 0.01 0.04 -0.16 -0.12 -0.23 0.64 0.25 0.07 0.07 -0.25 -0.34 -0.33 -0.11 -0.18 0.01 -0.06 -0.2 -0.14 -0.06 0.28 0.15 -0.34
0.37 0.54 0.15 0.05 0.84 0.07 -0.43 -0.54 -0.12 -0.08 -0.41 -0.39 -0.65 1.11 0.17 0.16 0.13 0.14 -0.42 -0.63 -0.31 -0.34 -0.59 0.09 -0.34 -0.18 -0.28 -0.04 0.09 -0.06
0.35 0.28 -0.26 -0.54 0.66 -0.0 -0.24 -0.04 -0.19 0.07 -0.2 -0.31 -0.36 1.09 -0.39 -0.34 -0.19 0.35 -0.51 -0.4 -0.47 -0.22 0.1 0.24 -0.39 0.09 -0.16 0.22 0.23 0.02
Spov3_chr1.01049 (AtDiL9-6)
0.1 -0.01 -0.22 -0.22 0.43 0.01 -0.03 -0.1 -0.04 -0.02 -0.13 -0.11 0.04 0.79 0.09 0.1 -0.06 0.45 -0.14 -0.2 -0.07 -0.19 -0.22 -0.02 -0.0 -0.13 -0.12 -0.14 -0.2 -0.21
0.28 0.19 -0.15 -0.4 0.52 -0.02 -0.07 0.03 -0.23 -0.07 -0.23 -0.16 -0.06 0.73 -0.15 -0.06 -0.1 0.2 -0.15 -0.29 -0.23 -0.06 -0.03 -0.06 -0.3 -0.02 0.03 -0.04 0.15 0.15
-0.09 0.14 -0.13 -0.07 0.03 -0.04 -0.17 -0.09 -0.1 -0.09 -0.04 -0.04 -0.11 0.64 0.07 0.06 0.16 0.2 -0.21 -0.12 -0.02 -0.01 -0.03 0.06 -0.17 -0.01 -0.04 0.02 -0.04 -0.03
0.35 0.26 -0.22 -0.5 0.3 0.4 -0.15 -0.8 -0.11 -0.06 -0.25 -0.05 -0.31 0.81 0.15 0.34 0.14 0.71 -0.32 -0.3 -0.14 -0.24 -0.61 0.01 -0.34 -0.16 -0.25 -0.18 0.05 0.13
-0.64 -0.48 -0.98 -1.36 0.99 0.74 0.09 -0.31 -0.39 -0.15 -0.5 -0.1 -0.3 1.55 0.33 0.27 0.22 0.32 -0.37 -0.23 -0.22 -0.29 -0.27 0.1 -0.36 -0.11 -0.45 -0.07 -0.03 -0.45
0.15 0.03 -0.19 -0.21 0.25 0.02 -0.07 -0.09 -0.18 -0.11 -0.05 -0.07 -0.07 0.6 0.2 0.16 0.17 0.08 -0.09 -0.04 -0.03 -0.02 -0.33 -0.02 -0.0 -0.06 -0.06 -0.12 -0.08 -0.08
0.16 0.28 -0.12 -0.41 0.24 0.16 0.03 0.13 -0.2 -0.07 -0.26 -0.14 -0.16 0.88 0.01 -0.03 -0.06 0.63 -0.34 -0.38 -0.22 -0.14 -0.2 0.02 -0.33 -0.23 -0.35 0.01 0.2 -0.02
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-0.17 -0.06 -0.97 -2.65 1.1 0.98 -0.4 -0.36 -0.56 -0.33 -0.6 -0.28 -0.19 1.63 0.44 -0.1 0.32 0.85 -0.55 -0.79 -0.34 -0.48 -0.67 -0.47 -0.77 -0.06 -0.35 0.38 0.05 -0.4
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0.2 0.3 -0.13 -0.3 0.39 0.06 0.01 -0.13 -0.23 -0.13 -0.19 -0.06 -0.33 0.68 0.05 0.11 -0.03 0.41 -0.24 -0.33 -0.09 -0.09 -0.38 -0.06 -0.25 -0.08 -0.06 -0.03 0.16 0.12
0.37 0.45 -0.09 -0.12 0.72 -0.23 -0.4 -0.48 -0.07 0.08 -0.27 -0.25 -0.52 1.39 -0.04 -0.03 -0.11 0.05 -0.29 -0.48 -0.12 -0.23 -0.44 0.15 -0.32 -0.2 -0.2 0.09 0.07 -0.34
-0.18 -0.33 -0.64 -1.17 1.27 0.78 -0.3 -0.48 -0.12 0.4 -0.49 -0.69 -0.55 1.83 -0.07 0.12 -0.54 0.06 -0.08 -0.3 0.18 -0.4 -1.18 -0.12 -0.72 -0.03 -0.05 0.34 -0.56 -1.04
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0.28 0.17 -0.23 -0.46 0.47 0.19 -0.09 -0.31 -0.25 -0.06 -0.32 -0.1 -0.39 1.09 0.04 -0.16 -0.19 0.42 -0.17 -0.39 -0.19 -0.17 0.17 0.05 -0.17 -0.15 -0.23 0.05 0.22 -0.29
0.32 0.29 -0.31 -0.65 0.69 0.05 -0.19 -0.75 -0.23 -0.13 -0.09 0.04 -0.25 1.4 0.16 -0.02 -0.14 -0.83 -0.32 -0.37 -0.12 -0.21 -0.11 0.11 -0.22 -0.08 -0.07 0.23 0.19 -0.42
0.11 0.24 -0.32 -0.75 0.18 0.02 -0.47 -0.37 -0.93 -0.31 -0.55 -0.5 -0.36 1.65 0.37 0.21 0.25 0.76 -0.36 -0.81 -0.32 -0.48 0.01 -0.22 -0.55 -0.37 -0.41 0.1 0.26 0.62
Spov3_chr1.04795 (U2AF35B)
0.21 0.26 -0.0 -0.2 0.11 -0.2 -0.31 0.0 -0.04 0.15 -0.17 -0.18 -0.14 1.08 -0.08 -0.11 -0.11 0.38 -0.43 -0.5 -0.09 -0.48 -0.23 -0.36 -0.47 -0.24 -0.31 0.04 0.27 0.76
0.56 0.1 -0.09 -0.3 0.52 0.35 0.09 -0.25 -0.27 -0.21 -0.47 -0.29 -0.27 1.34 -0.26 -0.24 -0.17 0.43 -0.15 -0.21 -0.39 -0.41 -0.29 -0.15 -0.55 -0.47 -0.62 -0.03 0.25 0.43
0.46 0.34 -0.23 -0.98 0.7 0.3 -0.07 -0.34 -0.49 0.17 -0.51 -0.25 -0.52 1.27 -0.11 -0.06 -0.28 0.43 -0.52 -0.46 -0.15 -0.15 0.36 -0.09 -0.52 -0.03 -0.5 0.22 -0.08 -0.15
Spov3_chr1.05056 (NRT1.12)
0.06 -0.14 -0.01 -0.16 0.67 0.05 -0.14 -0.1 0.04 0.04 -0.04 -0.21 -0.25 0.83 0.22 0.3 0.23 -0.52 -0.26 -0.34 -0.05 -0.27 -0.07 -0.18 -0.2 0.07 0.07 -0.04 -0.3 -0.15
0.41 0.3 0.03 -0.22 0.56 0.33 -0.06 -0.46 -0.1 -0.14 -0.23 -0.18 -0.15 0.58 0.14 0.24 0.1 0.36 -0.38 -0.33 -0.36 -0.24 -0.28 -0.15 -0.25 -0.13 -0.22 0.04 0.02 -0.04
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.