Heatmap: Cluster_114 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0002.00034 (SRD2)	-0.02	-0.09	-0.09	-0.39	-0.07	-0.1	0.08	0.35	0.15	0.39	0.04	0.13	-0.45	0.41	0.17	0.06	0.15	-0.58	0.04	-0.28	0.01	-0.14	-0.23	0.2	-0.12	-0.04	-0.08	0.0	0.16	-0.18
Spov3_C0011.00068	-0.12	-0.01	-0.11	-0.22	-0.2	0.01	0.15	0.28	0.11	0.18	-0.02	0.05	-0.31	0.35	0.05	0.1	0.18	-0.2	0.06	0.05	0.05	0.01	-0.38	-0.07	-0.18	0.15	0.03	0.13	-0.12	-0.29
Spov3_C0035.00014	0.25	0.35	0.01	-0.21	-0.02	0.04	-0.0	0.02	0.13	0.09	-0.09	0.05	-0.36	0.37	-0.11	-0.08	-0.23	-0.12	-0.24	-0.19	0.04	-0.04	-0.33	0.18	-0.19	0.0	0.03	0.24	0.16	-0.12
Spov3_C0036.00022 (AtOCT1)	0.52	0.5	-0.01	0.25	-0.08	-0.16	-0.34	0.3	-0.24	0.18	-0.27	-0.37	-0.27	0.85	0.06	-0.16	-0.06	-0.28	-0.76	-0.49	-0.85	-0.46	-0.45	0.05	-0.51	-0.39	0.23	0.47	0.52	0.44
Spov3_C0052.00004	0.38	0.3	-0.12	-0.71	-0.03	0.04	0.53	0.81	0.39	0.21	0.04	0.35	-0.89	-0.42	0.06	-0.29	-0.3	-1.74	-0.16	-0.04	-0.24	-0.01	-0.78	-0.17	-0.01	-0.01	-0.13	0.52	0.53	-0.44
Spov3_C0247.00001 (PATROL1)	-0.07	0.12	-0.17	-0.06	0.15	-0.05	-0.14	0.01	-0.23	0.01	-0.14	-0.07	-0.04	0.78	-0.1	0.41	0.17	0.35	-0.39	-0.29	0.01	-0.09	-0.01	-0.06	-0.13	-0.3	-0.27	-0.08	0.06	0.03
Spov3_chr1.00043 (HOG1)	0.06	0.49	0.11	-0.0	-0.02	-0.54	-0.21	0.67	-0.03	0.23	-0.11	-0.12	0.08	0.12	0.06	-0.13	0.01	-0.43	0.05	0.04	-0.0	0.06	-0.21	-0.49	-0.15	0.05	0.29	0.11	-0.41	-0.28
Spov3_chr1.00079	0.28	0.38	0.09	-0.44	-0.05	-0.18	-0.1	0.19	0.15	0.5	0.03	0.15	-0.9	0.77	-0.63	-0.58	-0.84	-0.9	0.06	-0.06	0.05	-0.19	-0.4	0.05	-0.21	0.15	0.05	0.51	0.54	-0.24
Spov3_chr1.00190 (ROQH)	0.09	0.16	-0.07	-0.28	-0.26	0.02	0.35	0.39	0.21	0.04	0.1	0.11	-0.29	-0.24	-0.2	-0.15	-0.23	-0.84	0.12	0.13	-0.08	0.01	-0.49	0.16	0.17	-0.0	0.12	0.2	0.25	-0.14
Spov3_chr1.00205	0.27	0.19	-0.01	-0.18	0.2	-0.05	-0.07	0.18	0.13	0.25	-0.07	-0.08	-0.85	0.6	-0.07	-0.16	-0.51	-0.51	-0.13	-0.28	0.12	-0.06	-0.12	0.06	-0.13	0.04	0.03	0.18	0.41	-0.17
Spov3_chr1.00621	0.23	0.07	0.11	0.21	0.02	-0.18	-0.13	0.15	-0.02	-0.11	0.05	-0.03	0.05	0.56	0.24	0.14	0.19	-0.26	-0.15	-0.23	-0.03	-0.05	-0.48	-0.25	-0.09	-0.14	-0.02	-0.01	-0.22	-0.03
Spov3_chr1.00905 (VETH1)	0.23	0.05	0.14	0.3	0.32	-0.09	0.11	0.22	0.03	-0.11	0.02	-0.01	-0.35	0.22	0.16	-0.03	0.13	-0.69	-0.22	-0.15	-0.07	-0.17	-0.11	-0.15	-0.14	-0.12	-0.0	0.25	0.02	-0.23
Spov3_chr1.00935 (ATI1)	-0.62	-0.44	-0.84	-0.77	0.02	0.25	0.1	0.96	-0.18	-0.19	-0.02	-0.09	0.25	0.14	0.18	0.53	0.12	0.06	0.27	0.11	-0.24	-0.07	-0.11	0.08	0.18	0.07	0.03	-0.07	-0.68	-0.47
Spov3_chr1.01695	0.25	0.17	0.03	0.18	0.03	0.04	-0.01	0.27	-0.08	0.05	-0.1	0.08	-0.1	0.34	-0.11	0.17	0.08	0.12	-0.6	-0.65	-0.23	-0.34	-0.41	-0.18	-0.21	-0.13	-0.07	0.37	0.18	0.26
Spov3_chr1.02130	0.11	0.14	0.02	-0.19	0.27	0.02	0.07	0.34	0.33	0.22	-0.16	-0.08	-0.06	0.27	-0.23	-0.13	-0.4	0.09	-0.19	-0.17	-0.23	-0.22	-0.39	-0.02	-0.22	0.04	-0.03	0.34	0.29	-0.33
Spov3_chr1.02157 (NLP1)	0.03	0.26	-0.01	-0.03	0.09	0.06	0.06	0.3	0.01	0.08	0.05	-0.01	-0.13	0.05	-0.28	0.12	-0.09	0.06	-0.02	-0.37	-0.21	-0.06	-0.52	-0.1	-0.02	-0.05	0.1	0.26	0.24	-0.17
Spov3_chr1.02652	0.12	0.16	-0.01	-0.01	0.08	-0.08	-0.1	0.34	0.02	-0.05	-0.13	-0.12	-0.07	0.49	0.15	0.24	0.13	-0.11	-0.26	-0.21	-0.1	-0.17	-0.15	-0.03	-0.16	-0.14	-0.07	0.17	-0.17	-0.05
Spov3_chr1.02742 (XIE)	0.04	-0.48	-1.35	-0.18	-0.46	0.02	0.19	1.2	0.95	1.27	-1.51	-0.11	1.27	1.1	-3.38	-0.9	-0.02	0.93	-1.59	-0.75	-2.24	-0.16	-1.62	0.7	-0.63	-0.54	-2.58	0.31	-0.86	-0.25
Spov3_chr1.02854	0.41	0.54	0.18	-0.62	-0.55	-0.13	0.42	0.38	0.03	0.06	-0.03	0.25	-0.31	0.36	0.02	-0.05	-0.0	-1.69	0.25	0.29	0.23	0.18	-1.61	-0.07	-0.32	-0.08	-0.14	-0.08	-0.19	0.15
Spov3_chr1.02876 (mCSF2)	0.24	0.21	-0.17	-0.18	-0.07	-0.23	-0.07	0.54	-0.12	0.05	-0.21	0.02	0.2	0.45	0.08	-0.29	-0.37	0.14	0.0	-0.25	-0.02	0.01	-0.66	0.09	-0.14	-0.19	-0.09	-0.05	0.13	0.34
Spov3_chr1.03428	-0.11	-0.2	0.03	-0.36	-0.46	-0.47	-0.15	0.63	-0.18	0.13	-0.25	-0.1	-0.19	0.37	-0.29	-0.45	-0.58	0.56	0.28	-0.04	0.18	-0.05	-0.76	-0.07	0.16	0.09	0.17	0.24	0.32	0.41
Spov3_chr1.03753 (PEX19A)	0.13	0.15	0.15	0.24	0.03	-0.31	-0.14	0.45	0.06	-0.04	-0.04	-0.02	-0.23	0.41	0.05	-0.04	0.09	-0.31	-0.03	-0.08	-0.01	-0.21	-0.27	-0.06	-0.04	-0.08	-0.02	0.07	-0.05	-0.18
Spov3_chr1.04027	0.15	-0.01	-0.05	-0.45	-0.49	0.28	0.29	0.31	0.04	-0.14	-0.06	0.14	-0.23	0.55	-0.03	-0.05	-0.23	-0.46	0.09	0.18	-0.08	-0.04	-0.69	0.17	-0.03	0.03	0.06	-0.24	-0.01	0.31
Spov3_chr2.00167	-0.02	0.03	0.14	0.17	0.22	0.37	-0.1	0.54	0.14	-0.06	-0.29	-0.07	-0.59	0.65	0.06	-0.08	-0.02	-0.57	-0.12	-0.31	-0.07	-0.24	-0.01	-0.19	-0.47	-0.2	-0.32	0.13	0.38	0.03
Spov3_chr2.00924 (CYP76C5)	-0.96	-0.4	-0.48	-0.32	-0.72	-0.05	0.57	1.27	1.04	0.74	1.06	0.72	-0.36	0.41	-0.46	-0.29	-0.46	-0.67	-0.17	0.17	-0.49	-0.28	-2.28	-1.0	-0.6	-0.66	-0.56	0.15	0.57	-1.16
Spov3_chr2.01235 (CKL2)	0.09	0.02	0.06	0.2	-0.09	-0.13	-0.12	0.11	0.06	0.04	0.09	-0.03	-0.02	0.45	0.03	0.04	0.22	-0.2	-0.2	-0.18	-0.02	-0.1	-0.11	-0.16	-0.07	-0.1	0.02	0.15	-0.12	-0.15
Spov3_chr2.01258 (PRT1)	0.19	0.1	0.04	-0.26	-0.2	-0.23	0.19	0.68	0.12	0.14	0.11	0.1	-0.13	0.31	-0.13	-0.17	-0.13	-0.5	-0.05	0.11	-0.02	0.06	-0.27	-0.16	-0.15	0.05	0.03	0.04	-0.07	-0.32
Spov3_chr2.01296 (PG18)	-0.03	-0.05	-0.07	-0.28	-0.5	-0.13	0.1	0.42	-0.05	-0.06	0.07	0.16	0.17	0.25	0.03	0.04	0.04	-0.21	0.03	0.23	0.12	-0.03	0.02	-0.05	-0.03	0.08	0.11	-0.18	-0.33	-0.18
Spov3_chr2.01348	-0.08	0.13	0.04	0.15	0.16	-0.05	0.07	0.34	-0.03	-0.06	-0.18	-0.15	-0.02	0.22	0.18	-0.02	0.09	-0.01	-0.27	-0.03	-0.2	-0.05	0.05	-0.0	-0.16	-0.12	-0.07	-0.08	0.0	-0.05
Spov3_chr2.01519	0.09	0.1	0.04	0.07	0.26	-0.02	-0.11	0.22	0.0	-0.05	-0.05	-0.08	-0.11	0.44	-0.08	0.11	0.18	0.01	-0.34	-0.28	0.01	-0.18	-0.34	-0.22	-0.18	-0.12	-0.02	-0.01	0.2	0.14
Spov3_chr2.01802 (FL5)	0.06	0.26	-0.21	-0.23	0.22	-0.26	-0.17	-0.03	0.11	0.28	-0.04	0.05	-0.25	0.45	-0.07	-0.18	0.07	0.13	0.03	-0.07	0.07	-0.06	-0.49	0.2	-0.05	0.15	-0.08	-0.1	0.12	-0.3
Spov3_chr2.02083	0.39	0.19	-0.17	-0.23	0.61	0.04	-0.19	0.09	-0.22	0.16	-0.19	-0.37	-0.03	0.59	0.08	0.05	0.07	-0.66	-0.17	-0.24	-0.09	-0.06	-0.18	-0.18	-0.22	-0.17	-0.11	0.32	0.31	-0.2
Spov3_chr2.02468 (ATSMO1)	0.15	0.02	-0.06	-0.28	-0.55	-0.17	0.04	0.53	0.15	0.1	-0.15	0.11	0.09	0.96	-0.08	-0.2	-0.31	0.15	-0.15	0.06	-0.23	-0.13	-0.13	0.03	-0.31	-0.1	-0.26	-0.25	0.15	-0.04
Spov3_chr2.03909 (METS1)	-0.2	-0.03	-0.24	-0.34	-0.19	0.14	0.04	0.69	-0.29	0.07	-0.05	-0.03	0.25	0.29	0.01	-0.01	-0.01	-0.2	0.05	0.05	0.17	0.19	-0.14	-0.2	-0.1	0.18	0.22	0.07	-0.58	-0.43
Spov3_chr2.04229	-0.25	-0.49	-0.28	0.02	0.37	-0.51	0.03	0.4	0.23	0.11	0.18	-0.12	0.34	0.14	-0.29	-0.21	-0.19	0.17	0.21	0.18	-0.05	-0.18	-0.84	-0.19	0.14	0.07	0.31	-0.05	-0.25	0.22
Spov3_chr2.04518 (GGL28)	-1.38	-2.26	-1.73	-0.85	0.68	-0.51	0.07	1.95	1.09	1.25	0.87	0.65	0.5	-0.81	0.19	-0.12	-0.98	-1.88	-1.5	-0.5	0.07	-1.19	-1.35	-0.75	0.09	-0.69	-0.69	0.68	0.06	-2.71
Spov3_chr2.05292 (TPS14)	0.02	-0.23	0.04	-0.45	-1.15	0.66	0.93	0.87	0.51	0.3	0.19	0.33	-0.23	-0.75	0.04	-0.18	-0.28	-2.92	-0.17	0.27	-0.01	0.18	-2.41	-0.07	-0.27	0.15	-0.24	0.05	0.49	-0.6
Spov3_chr2.05550 (CRK34)	0.02	0.43	0.26	-0.11	0.29	-0.47	-0.16	0.1	0.52	0.5	0.03	-0.09	-0.91	0.59	-0.61	-0.59	-0.2	0.4	-0.38	-0.36	-0.26	0.03	-0.76	0.27	-0.19	0.21	-0.25	-0.34	0.29	0.2
Spov3_chr3.00845	-0.01	-0.03	0.01	0.06	0.02	-0.02	0.05	0.65	0.23	0.01	0.01	-0.02	0.02	0.16	0.11	-0.02	0.0	-0.68	-0.19	-0.14	-0.1	-0.13	-0.36	-0.19	-0.21	-0.13	-0.03	0.06	0.25	0.13
Spov3_chr3.01003 (KAI2)	0.31	0.14	0.1	-0.11	-0.6	-0.23	0.11	0.17	0.18	0.27	0.13	0.16	-0.4	0.05	-0.16	-0.2	-0.24	-0.28	0.06	0.07	0.11	0.06	-0.6	0.21	0.1	0.12	0.09	0.15	-0.01	-0.33
Spov3_chr3.01474	0.36	0.55	0.3	0.05	-0.01	0.07	-0.08	-0.11	0.07	0.14	0.33	0.02	-0.33	-0.14	-0.13	-0.27	-0.22	0.06	-0.26	-0.39	-0.1	0.06	-0.73	-0.12	0.02	0.02	0.1	0.17	0.12	-0.17
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Spov3_chr3.02258 (TTM2)	0.04	-0.13	0.04	-0.01	-0.11	-0.25	0.19	0.62	0.1	0.07	-0.15	-0.06	-0.34	0.36	0.02	-0.12	-0.2	-0.64	0.12	-0.11	0.1	0.04	-0.01	-0.05	-0.14	-0.03	0.02	0.02	0.16	-0.04
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Spov3_chr5.02913 (SL1)	0.0	0.28	-0.04	-0.12	0.08	-0.12	0.06	0.16	0.11	0.25	-0.09	-0.01	-0.28	0.44	-0.27	-0.2	-0.38	-0.44	-0.29	-0.46	0.02	-0.04	-0.24	-0.15	-0.22	-0.09	-0.05	0.28	0.6	0.48
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Spov3_chr6.00238 (AIB)	-0.04	-0.26	-0.12	0.1	0.23	-0.08	0.2	0.47	-0.12	-0.07	-0.01	-0.05	0.21	0.0	0.2	0.18	0.17	-0.81	-0.25	-0.05	-0.11	-0.04	-0.05	-0.02	0.01	-0.16	-0.03	0.11	0.01	-0.07
Spov3_chr6.00600 (FIP37)	0.18	0.15	-0.03	0.29	0.17	-0.08	-0.16	0.17	-0.08	-0.03	-0.01	-0.06	-0.08	0.11	0.11	0.04	0.04	-0.15	-0.18	-0.22	-0.11	-0.08	-0.03	-0.1	-0.06	0.09	0.09	0.15	-0.03	-0.28
Spov3_chr6.00834 (LCR70)	-0.3	-0.21	-0.25	-0.39	-0.01	0.22	0.33	0.33	-0.2	-0.04	-0.18	-0.09	-0.25	-0.14	-0.05	0.02	-0.09	-0.08	0.23	0.18	0.19	0.18	-0.25	0.12	0.07	0.36	0.46	-0.1	-0.3	-0.33
Spov3_chr6.01244	0.18	0.21	0.08	0.06	-0.02	0.09	0.04	0.24	-0.19	0.03	-0.11	-0.22	0.08	0.52	-0.08	0.12	0.16	0.13	-0.71	-0.35	-0.16	-0.35	-0.35	-0.18	-0.24	-0.2	-0.04	0.15	0.32	0.19
Spov3_chr6.01565 (CYP81D4)	-0.05	-0.1	0.04	0.14	0.06	0.04	0.03	0.43	-0.1	-0.06	-0.06	-0.11	0.14	0.12	0.06	0.16	0.08	-0.32	-0.19	-0.22	-0.13	-0.02	0.07	-0.07	0.03	-0.1	0.02	0.13	-0.14	-0.07
Spov3_chr6.01983 (ATB' BETA)	0.09	0.11	0.04	0.08	0.03	-0.12	0.09	0.4	0.02	-0.06	-0.09	-0.12	-0.08	0.19	0.07	0.11	0.11	-0.28	-0.09	-0.16	-0.03	-0.12	-0.01	0.08	-0.09	-0.12	-0.07	-0.04	-0.02	-0.07
Spov3_chr6.02915 (MSL6)	0.01	0.11	-0.02	-0.36	-0.11	-0.0	0.0	0.62	0.07	0.03	-0.16	0.01	-0.57	1.11	-0.13	-0.21	-0.35	0.04	-0.26	-0.25	-0.07	-0.13	-1.13	-0.36	-0.44	-0.02	-0.13	0.3	0.44	0.36
Spov3_S01.00126 (TCX3)	0.13	0.2	0.18	0.25	0.32	-0.07	-0.08	0.08	-0.01	0.15	-0.02	-0.08	-0.49	0.35	0.21	0.16	0.24	-0.99	-0.07	-0.15	0.05	-0.08	-0.57	-0.1	-0.18	-0.13	0.04	0.21	-0.03	-0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.