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Heatmap: Cluster_176 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.1 0.18 -0.07 -0.25 0.57 -0.09 -0.31 -0.32 -0.03 0.14 -0.05 -0.18 -0.36 0.53 -0.15 -0.04 -0.13 0.22 -0.13 -0.17 -0.09 -0.28 0.49 -0.01 -0.24 0.01 -0.02 0.04 0.14 -0.15
0.01 0.0 -0.42 -0.86 1.14 0.32 -0.36 -0.46 -0.28 0.04 -0.32 -0.51 -0.2 1.5 0.08 -0.35 -0.09 0.31 -0.45 -0.49 -0.3 -0.56 1.05 -0.62 -0.78 -0.18 -0.13 -0.26 -0.11 -0.23
-0.11 -0.02 -0.13 -0.28 0.32 -0.1 -0.31 -0.24 -0.1 -0.06 -0.37 -0.3 -0.27 0.98 0.21 -0.01 -0.09 0.85 -0.26 -0.27 -0.16 -0.26 0.84 -0.1 -0.47 -0.15 -0.18 -0.17 -0.08 -0.2
0.46 0.14 -0.19 -0.47 -0.02 -0.56 -0.67 -0.8 -0.42 -0.25 -0.45 -0.32 0.1 0.93 0.15 -0.25 -0.28 1.53 -0.25 -0.41 -0.21 -0.19 0.83 -0.48 -0.25 -0.29 -0.22 0.08 -0.19 0.07
Spov3_C0021.00002 (LecRK-IV.4)
 0.53 0.39 0.08 0.02 0.05 -0.47 -0.61 -0.34 -0.41 -0.26 -0.39 -0.37 0.09 0.91 -0.11 -0.47 -0.25 1.38 -0.52 -0.34 -0.41 -0.57 1.13 -0.49 -0.54 -0.57 -0.38 0.12 -0.12 -0.23
0.18 0.16 -0.31 -0.29 0.21 0.01 0.0 -0.1 -0.25 -0.21 -0.26 -0.14 -0.06 0.74 0.12 0.05 0.02 0.55 -0.22 -0.45 -0.15 -0.18 0.53 -0.12 -0.31 -0.14 -0.16 0.06 -0.03 -0.02
0.34 0.36 -0.65 -1.08 0.21 -0.05 -0.67 -0.56 -0.74 -0.43 -0.76 -0.71 -0.43 1.48 -0.25 -0.38 -0.61 1.88 -0.92 -0.93 -0.55 -0.56 1.87 -0.79 -0.79 -0.64 -0.66 -0.14 -0.18 -0.74
0.35 0.25 -0.04 -0.19 0.21 -0.02 -0.35 -0.36 -0.24 -0.07 -0.41 -0.39 -0.55 1.2 0.09 -0.27 -0.2 0.55 -0.49 -0.39 -0.14 -0.53 0.62 -0.19 -0.2 -0.16 -0.28 0.23 0.19 0.05
0.52 0.32 -0.16 -0.65 0.35 0.22 -0.08 -0.52 -0.52 -0.36 -0.34 -0.4 -0.17 1.14 0.06 -0.11 -0.31 0.88 -0.34 -0.36 -0.15 -0.3 0.42 0.04 -0.24 -0.17 -0.27 -0.19 0.04 -0.24
0.44 0.19 -0.26 -0.21 0.51 0.22 0.01 -0.33 -0.43 -0.36 -0.43 -0.41 -0.14 0.87 0.1 0.07 0.05 0.72 -0.25 -0.44 -0.31 -0.28 0.52 -0.27 -0.29 -0.2 -0.28 0.01 0.04 -0.28
0.34 0.09 -0.18 -0.24 0.37 0.2 0.07 -0.24 -0.42 -0.13 -0.54 -0.53 -0.18 1.09 -0.01 0.07 -0.19 0.87 -0.56 -0.29 -0.22 -0.39 0.54 -0.08 -0.3 -0.25 -0.16 -0.13 0.07 -0.36
0.82 0.66 -0.19 -0.85 0.75 -0.66 -0.95 -1.1 -0.97 -0.64 -1.27 -1.2 -0.93 2.01 -0.23 -0.98 -0.93 2.19 -1.26 -1.31 -1.24 -1.35 0.99 -1.05 -1.09 -1.1 -1.01 0.58 0.16 -0.42
0.47 0.25 -0.11 -0.89 1.13 0.31 -1.27 -0.9 0.14 0.54 -0.39 -0.25 -0.23 1.19 -0.37 -0.63 -1.25 1.52 -0.79 -0.61 -0.35 -1.04 0.92 -0.61 -0.89 0.07 -0.21 0.05 -0.42 -1.73
0.15 0.21 -0.19 -0.27 0.3 0.01 -0.23 -0.33 -0.19 0.05 -0.22 -0.12 -0.26 1.0 -0.06 -0.01 -0.14 0.44 -0.19 -0.5 -0.23 -0.23 0.57 0.08 -0.18 -0.21 -0.19 0.08 0.09 -0.27
0.2 0.31 -0.11 -0.52 0.38 -0.16 -0.34 -0.06 -0.33 0.0 -0.29 -0.27 -0.33 1.07 -0.18 -0.29 -0.2 0.89 -0.32 -0.46 -0.2 -0.2 0.63 -0.29 -0.27 -0.13 -0.18 0.13 0.05 -0.13
-0.05 0.38 -0.21 -0.81 0.99 -0.37 -1.07 -0.42 -0.42 -0.16 -1.01 -0.75 -1.25 2.25 -0.13 -0.49 -0.43 1.34 -0.89 -0.74 -0.62 -0.74 1.0 -0.73 -1.21 -0.69 -0.81 0.06 0.08 -0.3
0.05 0.15 -0.35 -0.44 0.29 -0.04 -0.42 -0.5 -0.32 -0.03 -0.41 -0.43 -0.46 1.43 0.04 -0.05 -0.12 1.06 -0.49 -0.44 -0.35 -0.49 0.66 -0.04 -0.3 -0.21 -0.47 0.01 0.08 0.04
-0.14 0.68 -1.04 -1.3 0.8 -0.1 -1.08 -1.88 -1.78 -0.61 -1.4 -0.85 -0.71 1.66 -2.27 -1.12 -1.74 2.28 -1.73 -1.12 -0.94 -1.45 2.22 -0.26 -1.61 -0.86 -1.89 0.03 0.24 0.25
0.39 0.12 -0.19 -0.48 0.4 0.09 -0.03 -0.3 -0.13 0.04 -0.17 -0.1 -0.2 0.87 -0.04 -0.2 -0.41 0.71 -0.32 -0.41 -0.35 -0.25 0.34 0.03 -0.25 -0.13 -0.14 0.17 0.2 -0.43
0.55 0.27 -0.3 -0.57 0.08 -0.14 0.02 -0.31 -0.59 -0.12 -0.3 -0.23 0.28 0.67 -0.09 -0.18 -0.35 0.81 -0.43 -0.36 -0.35 -0.25 0.85 -0.06 -0.28 -0.26 -0.25 0.32 0.09 -0.1
-0.19 0.34 -0.68 -1.25 1.0 0.47 -0.45 -0.06 -1.57 -0.26 -1.48 -0.7 -1.08 1.63 -0.82 -0.7 -1.06 -1.0 -0.48 -0.54 -0.24 -0.44 1.93 0.27 -0.87 -0.35 -0.59 0.58 -0.08 0.51
0.34 0.07 -0.16 -0.25 0.04 0.32 -0.29 -0.7 -0.32 -0.27 -0.48 -0.43 -0.45 1.67 -0.06 -0.31 -0.43 1.36 -0.48 -0.36 -0.4 -0.65 0.99 -0.51 -0.58 -0.47 -0.82 -0.56 -0.24 0.11
-0.06 -0.03 -0.19 -0.09 0.66 -0.05 -0.22 -0.07 -0.11 -0.07 -0.07 -0.1 -0.11 0.62 -0.21 -0.32 -0.22 0.18 -0.26 -0.21 -0.22 -0.26 0.94 -0.12 -0.16 -0.06 -0.04 0.1 0.0 -0.17
-0.08 0.2 -0.32 -0.45 0.37 -0.18 -0.5 -0.7 -0.35 -0.15 -0.31 -0.41 -0.15 1.64 0.18 0.05 -0.07 1.12 -0.37 -0.33 -0.19 -0.47 0.65 -0.18 -0.58 -0.2 -0.25 -0.39 -0.41 -0.32
0.15 0.35 -0.46 -0.97 0.88 0.12 -0.27 -0.46 -0.54 -0.34 -0.4 -0.58 -0.03 0.9 0.27 0.18 0.02 1.28 -0.43 -0.58 -0.3 -0.41 0.55 -0.39 -0.4 -0.26 -0.34 -0.25 0.2 -0.36
-0.06 0.11 -0.92 -1.21 0.55 0.14 -0.89 -1.02 -0.92 -0.66 -1.11 -0.97 -1.12 2.41 -0.21 -0.51 -0.72 1.92 -1.18 -0.59 -0.92 -0.97 1.71 -0.63 -1.69 -0.84 -1.29 -0.53 -0.25 -0.64
0.24 0.2 -0.26 -0.48 0.27 0.08 -0.14 -0.37 -0.22 -0.17 -0.22 -0.27 -0.21 0.94 0.11 -0.08 -0.04 0.84 -0.35 -0.27 -0.26 -0.29 0.63 -0.05 -0.34 -0.16 -0.24 0.02 -0.03 -0.23
-0.02 0.14 0.02 -0.19 0.26 -0.31 -0.4 -0.13 0.25 0.28 -0.16 -0.1 -0.23 0.91 -0.01 -0.05 -0.1 0.74 -0.25 -0.33 -0.3 -0.31 0.48 -0.4 -0.46 -0.31 -0.22 0.04 0.14 -0.17
0.07 0.07 -0.32 -0.17 0.09 -0.11 -0.13 -0.1 -0.16 -0.12 -0.22 -0.29 0.02 0.67 0.14 0.01 0.06 0.64 -0.21 -0.24 -0.13 -0.02 0.58 -0.03 -0.17 -0.07 -0.14 -0.04 -0.21 -0.16
Spov3_chr2.00788 (UMAMIT2)
 0.22 0.26 -0.24 -0.25 -0.02 -0.02 -0.16 -0.24 -0.12 -0.12 -0.1 0.03 -0.26 0.56 -0.04 -0.02 0.1 0.86 -0.15 -0.28 -0.19 -0.12 0.7 -0.22 -0.25 -0.25 -0.21 0.02 -0.21 -0.25
-0.23 -0.09 -0.89 -0.87 1.07 1.03 -0.05 0.25 -0.8 -0.66 -1.05 -0.93 -0.47 1.65 0.07 0.07 -0.05 0.16 -1.09 -1.31 -0.88 -0.87 1.45 -0.76 -1.02 -0.59 -0.84 0.66 0.18 -0.22
0.38 0.57 -0.74 -0.94 0.06 0.07 -0.58 -0.37 -1.11 -0.9 -1.06 -0.8 -0.52 1.99 0.08 -0.46 -0.82 1.75 -0.68 -0.73 -0.31 -0.69 1.2 -0.9 -1.2 -0.75 -0.87 0.33 -0.45 0.1
0.19 0.1 -0.18 -0.19 0.66 0.01 -0.14 -0.14 -0.12 -0.17 -0.3 -0.29 -0.17 0.58 0.05 -0.02 -0.07 0.62 -0.24 -0.28 -0.11 -0.1 0.52 -0.35 -0.38 -0.08 -0.06 -0.18 -0.03 0.0
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0.25 0.02 -0.15 -0.38 0.27 -0.0 -0.28 0.09 -0.26 -0.2 -0.3 -0.33 0.02 0.95 -0.03 -0.26 -0.21 0.94 -0.27 -0.27 -0.36 -0.25 0.87 -0.19 -0.46 -0.33 -0.33 -0.13 0.02 -0.05
0.54 0.35 0.04 -0.09 0.35 -0.36 -0.41 -0.29 -0.22 -0.19 -0.46 -0.59 -0.2 1.17 -0.21 -0.2 -0.13 1.19 -0.51 -0.46 -0.35 -0.38 0.67 -0.27 -0.29 -0.49 -0.54 0.17 0.04 -0.5
- -2.99 -2.78 - 0.39 0.71 -2.05 -2.09 -2.41 -2.62 -2.87 -3.71 -0.92 3.18 -0.97 -0.31 -1.62 2.14 -1.68 -5.33 -0.7 -0.94 1.82 -0.71 -2.59 -1.55 -1.88 -0.46 -3.1 1.51
0.18 0.19 -0.12 -0.14 0.46 0.11 -0.13 -0.39 -0.01 0.07 -0.01 -0.14 -0.24 0.48 0.02 -0.09 0.01 0.18 -0.0 -0.22 -0.12 -0.15 0.31 -0.17 -0.23 -0.13 0.11 -0.09 0.01 -0.17
0.01 0.06 -0.07 -0.04 0.42 -0.21 -0.35 -0.23 -0.17 0.03 -0.4 -0.42 -0.14 0.64 0.05 0.13 0.05 0.69 -0.29 -0.24 -0.05 -0.24 0.52 -0.08 -0.24 -0.1 0.03 -0.01 -0.11 -0.09
-1.09 -1.18 -0.54 -0.23 0.72 0.21 -0.45 -0.39 -0.08 -0.3 -0.16 -0.36 0.64 1.46 0.25 -0.05 -0.22 0.51 -0.23 -0.15 -0.36 -0.06 0.57 -0.45 -0.08 -0.46 -0.3 0.02 -0.35 0.13
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0.7 1.01 -0.25 -0.74 0.76 -1.54 -1.47 -1.05 -1.0 0.23 -1.76 -1.63 -1.65 1.8 -1.5 -1.67 -1.96 2.69 -1.33 -1.87 -1.18 -1.75 1.84 -1.37 -2.05 -0.9 -1.26 0.09 -0.34 -2.76
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0.05 0.16 -0.11 -0.21 0.4 -0.01 -0.22 -0.35 -0.02 0.13 -0.12 0.03 -0.18 0.48 0.06 -0.1 -0.13 0.36 -0.14 -0.21 -0.08 -0.17 0.38 -0.25 -0.22 -0.01 0.03 -0.03 0.12 -0.12
-0.97 -0.8 -0.41 -0.51 1.94 0.5 -1.11 -0.37 -0.43 -0.12 -1.03 -0.88 -0.84 1.94 -0.74 -0.8 -0.7 0.74 -1.75 -1.93 -1.07 -1.35 1.96 -1.08 -1.65 -1.3 -1.11 0.33 0.51 -0.36
0.51 0.4 -0.65 -0.94 0.35 0.57 -0.48 -1.56 -0.67 -0.47 -0.89 -0.57 -0.76 2.11 0.03 -0.29 -0.47 1.55 -0.83 -0.78 -0.58 -0.52 0.94 -0.39 -1.11 -0.83 -1.05 0.12 -0.24 -0.53
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0.9 0.12 -1.49 -2.98 1.78 -1.55 -2.65 -2.06 -1.28 -0.42 -3.4 -3.15 -0.35 2.78 0.04 -1.74 -1.75 2.52 -3.27 -2.44 -2.43 -3.78 2.0 -2.54 -2.71 -3.28 -3.71 -4.26 -0.2 -4.57
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0.18 0.16 -0.5 -0.33 0.78 -0.16 -0.72 -0.68 -0.55 0.03 -0.45 -0.26 -0.22 1.12 -0.48 -0.08 -0.03 1.25 -0.63 -0.62 -0.27 -0.51 0.92 -0.27 -0.01 -0.45 -0.06 0.05 0.11 -0.42
0.47 -0.11 -0.9 -0.8 0.96 -0.23 -0.76 -0.44 -0.92 -0.35 -0.97 -0.68 0.26 1.37 -0.8 -0.66 -1.11 1.43 -0.75 -0.92 -0.61 -0.6 1.61 -0.68 -0.52 -0.39 -0.24 0.29 0.14 0.16
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Spov3_chr4.00858 (ELMOD_E)
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Spov3_chr4.03137 (DYRKP-3)
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0.37 0.32 -0.01 -0.2 0.45 0.02 -0.18 -0.32 -0.14 -0.09 -0.28 -0.21 -0.25 0.45 0.1 -0.04 -0.04 0.54 -0.11 -0.24 -0.21 -0.18 0.3 -0.29 -0.31 -0.12 -0.07 -0.19 0.09 0.18
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0.23 0.25 -0.12 -0.13 -0.03 -0.22 -0.23 -0.34 -0.27 -0.08 -0.2 -0.12 -0.07 0.61 -0.11 -0.06 -0.01 1.01 -0.38 -0.42 -0.33 -0.08 0.57 0.05 -0.19 -0.24 -0.17 0.25 -0.04 -0.29
0.37 0.08 -0.35 -0.65 0.22 -0.05 -0.21 -0.59 -0.24 0.04 -0.36 -0.08 -0.12 0.8 0.02 -0.25 -0.14 0.68 -0.62 -0.62 -0.24 0.01 1.07 0.04 -0.21 -0.23 0.08 0.1 0.08 -0.39
0.14 0.1 -0.15 -0.21 0.32 0.01 -0.06 -0.1 -0.29 0.0 -0.23 -0.33 -0.51 1.1 -0.04 -0.08 -0.09 0.66 -0.19 -0.38 -0.13 -0.33 0.41 -0.01 -0.2 -0.16 -0.15 0.05 0.07 -0.43
0.24 0.08 -0.24 -0.44 0.81 -0.17 -0.76 -1.0 -0.59 -0.23 -0.51 -0.46 0.12 1.4 -0.06 -0.53 -0.56 1.27 -0.59 -0.8 -0.33 -0.53 1.23 -0.25 -0.38 -0.43 -0.38 0.01 -0.18 -0.1
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0.24 0.18 -0.18 -0.44 0.62 0.09 -0.16 -0.45 -0.15 -0.01 -0.3 -0.33 -0.28 0.95 -0.15 -0.2 -0.16 0.57 -0.33 -0.31 -0.23 -0.16 0.42 -0.06 -0.36 -0.15 -0.23 0.18 0.12 0.06
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Spov3_chr5.03514 (CYP71B3)
 -0.17 1.06 - -3.44 -0.79 -0.77 -1.84 -2.06 -1.04 - - - -0.61 2.99 -1.75 - -2.16 2.58 -1.5 -0.56 -1.01 -2.48 1.75 -1.74 -3.27 -0.83 -1.83 -1.94 -3.2 1.58
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0.42 0.45 -0.1 -0.31 0.23 -0.2 -0.53 -0.33 -0.67 -0.37 -0.64 -0.62 0.12 0.98 -0.22 -0.34 -0.41 1.12 -0.56 -0.68 -0.35 -0.32 1.0 -0.05 -0.24 -0.24 -0.18 0.21 0.1 0.07
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Spov3_chr6.00670 (CASPL4A3)
 0.14 0.09 -0.3 -0.49 0.3 -0.03 -0.19 -0.4 -0.25 -0.13 -0.11 -0.19 -0.07 0.99 0.04 -0.03 -0.06 0.76 -0.22 -0.39 -0.3 -0.21 0.64 -0.09 -0.26 -0.19 -0.29 0.17 -0.05 -0.17
0.38 0.14 -0.11 -0.23 0.39 0.09 -0.08 -0.15 -0.38 -0.28 -0.36 -0.18 -0.47 0.86 0.13 -0.1 -0.17 0.52 -0.28 -0.23 -0.21 -0.19 0.71 -0.26 -0.19 -0.21 -0.14 -0.03 -0.0 -0.05
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0.09 0.26 0.02 -0.06 0.2 0.08 -0.15 -0.1 -0.12 -0.12 -0.23 -0.14 -0.12 0.6 0.08 -0.05 -0.06 0.47 -0.22 -0.24 -0.14 -0.06 0.39 -0.28 -0.29 -0.22 -0.05 -0.06 0.1 -0.1
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0.29 -0.05 -0.5 -0.35 0.5 0.07 -0.2 -0.34 -0.58 -0.24 -0.31 -0.33 0.18 1.09 0.16 0.07 -0.02 0.77 -0.32 -0.31 -0.25 -0.24 0.22 -0.19 -0.15 -0.13 -0.21 -0.03 0.01 -0.04
0.21 0.23 -0.27 -0.31 0.13 -0.22 -0.41 -0.4 -0.33 -0.01 -0.27 -0.31 0.07 1.28 -0.01 -0.06 -0.15 0.77 -0.28 -0.54 -0.17 -0.28 0.6 -0.16 -0.34 -0.18 -0.15 -0.02 -0.06 -0.06
0.25 0.26 -0.48 -0.56 0.08 0.01 -0.21 -0.39 -0.33 -0.02 -0.38 -0.29 -0.13 1.38 0.08 0.16 -0.09 0.9 -0.47 -0.4 -0.25 -0.37 0.43 -0.12 -0.52 -0.14 -0.31 -0.33 0.14 -0.01
0.26 0.14 -0.33 -0.7 0.36 0.04 -0.25 -0.22 -0.21 0.07 -0.28 -0.19 -0.06 1.16 0.19 0.1 -0.07 0.58 -0.33 -0.38 -0.21 -0.22 0.42 -0.18 -0.3 -0.01 -0.2 -0.06 -0.12 -0.42
0.14 -0.04 -0.16 -0.4 0.75 0.21 -0.2 -0.39 -0.39 -0.22 -0.49 -0.47 -0.27 1.02 -0.01 -0.22 -0.19 0.5 -0.44 -0.44 -0.3 -0.14 1.15 -0.37 -0.54 -0.33 -0.35 0.13 0.2 0.05
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.