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Heatmap: Cluster_174 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.15 0.27 0.6 0.67 1.0 -0.65 -0.95 -1.39 -0.05 0.0 -0.05 -0.86 0.4 -1.19 0.26 0.17 0.02 1.18 0.47 0.15 0.01 0.0 0.34 -0.54 -0.17 -0.17 -0.08 -0.99 -1.64 -2.4
- - 0.99 0.83 - 1.72 1.37 0.89 1.69 0.87 - - - - 1.76 -0.06 - - -0.21 -0.44 0.82 1.6 - - -0.19 -0.42 - 0.15 - -
-1.11 -0.98 0.35 0.79 -0.0 -2.29 -0.13 2.11 0.2 -0.97 -0.27 -0.14 0.52 -3.64 -0.83 -0.64 0.18 -3.79 0.2 0.47 -0.5 0.24 -0.86 -1.74 -0.4 -0.74 0.15 0.91 0.39 0.45
-0.68 0.66 0.85 1.55 -0.63 -2.11 -0.22 -0.86 1.07 1.09 0.82 -0.29 -1.5 - -0.2 -0.16 -0.18 -3.73 -0.46 1.62 -0.99 0.74 -1.96 -0.64 - -0.11 -0.1 -0.2 0.01 -1.68
-0.44 -0.53 0.09 0.33 -0.79 -0.56 0.17 0.53 0.67 0.34 0.44 0.5 0.63 -3.16 -0.54 -0.94 -0.3 -1.89 0.41 0.98 0.42 0.21 -1.0 -0.07 0.0 0.19 0.15 0.22 -0.58 -1.05
0.1 -0.03 0.51 0.61 0.17 -0.98 -0.66 0.43 0.54 0.52 0.12 -0.02 -0.35 -0.48 -0.77 -0.7 -0.76 -0.28 -0.07 -0.11 0.06 -0.2 0.06 -0.33 0.11 -0.08 0.28 0.48 0.35 -0.37
0.03 -1.49 0.12 0.23 0.08 -0.09 -0.05 0.42 -0.97 -0.38 -0.1 -0.58 0.09 0.36 -0.67 -0.64 0.52 -0.52 0.59 -0.05 -0.21 0.43 -1.96 -0.57 -0.54 0.48 0.07 0.69 0.14 0.99
-0.12 -0.22 0.48 0.63 0.78 -0.58 -0.62 -0.09 0.64 0.86 0.38 -0.02 -0.12 -1.45 -0.93 -0.69 -0.88 -0.02 -0.09 -0.29 0.22 -0.26 -0.51 -0.34 -0.09 -0.05 0.36 0.23 0.27 -0.2
-0.13 0.09 0.61 0.29 -0.46 -0.13 0.24 0.47 0.72 0.25 0.03 0.38 -1.09 -0.28 -0.45 -0.8 -0.94 -1.17 0.48 0.26 -0.15 0.45 -1.4 -0.4 -0.28 -0.24 0.13 1.32 -0.16 -2.34
0.77 - 1.38 1.29 - - - 0.66 -0.54 - - -0.58 - 0.33 -0.57 -0.5 -0.46 - -0.1 - - 1.17 -0.13 1.54 - - 1.52 1.44 0.36 1.62
-0.61 -0.79 0.39 0.98 0.58 -0.17 -0.96 -0.55 0.47 0.47 0.37 -0.69 0.28 -0.63 -0.5 -0.56 0.1 0.86 0.01 0.16 0.34 -0.55 -0.12 -1.19 -0.12 -0.06 0.3 -0.39 -0.56 0.15
-0.09 -0.13 0.44 0.54 -0.2 -0.32 0.16 0.48 0.65 0.48 0.15 0.19 -0.63 -1.96 -0.52 -0.7 -0.66 -2.26 0.52 0.55 -0.05 0.24 -1.9 -0.26 0.12 0.19 0.41 0.32 0.3 -0.54
-0.04 -0.32 0.2 0.36 0.46 -0.25 -0.54 -0.11 0.05 0.12 0.13 -0.05 0.01 -0.25 -0.11 0.06 0.17 -0.37 0.01 -0.11 -0.05 -0.07 -0.25 -0.11 0.19 0.06 0.41 0.1 -0.14 -0.07
0.44 0.6 0.41 0.32 0.27 -0.97 -0.67 -0.16 0.27 0.36 0.18 0.03 -0.25 -0.78 -0.97 -0.93 -0.54 0.27 0.09 -0.21 -0.28 -0.22 -0.45 0.07 0.13 -0.05 0.09 0.64 0.43 -0.18
-0.01 -0.18 0.39 0.45 -1.64 -1.03 -0.21 0.6 0.63 0.34 0.65 0.39 -0.32 -1.88 -0.66 -0.63 -0.22 -0.85 0.36 0.23 -0.0 0.03 -0.34 -0.33 0.33 0.32 0.51 0.11 -0.36 -0.08
0.37 -0.55 -0.69 -0.51 0.58 -1.97 -1.49 -1.12 -0.07 0.33 0.58 -1.09 1.08 -0.37 -0.32 -0.9 -0.5 -0.24 0.51 0.55 0.24 0.02 -0.33 -0.3 1.17 0.71 0.74 0.32 -1.67 -1.36
-0.64 -0.67 0.51 1.04 0.28 -1.43 -1.34 -0.14 0.52 0.88 0.53 -0.06 0.16 -3.25 -0.99 -0.53 -0.73 0.14 0.17 -0.2 0.37 -0.07 -0.15 -0.46 0.3 0.23 0.76 -0.15 -0.19 -0.3
0.05 -0.09 -0.16 -0.34 -0.24 -0.26 0.3 0.12 0.4 0.11 0.1 0.31 -0.27 0.04 0.05 -0.09 -0.01 -0.64 -0.07 0.0 -0.0 0.0 -0.49 0.24 0.27 0.1 0.09 0.01 0.16 -0.25
-0.08 -0.17 -0.01 0.15 -0.26 -0.08 0.04 0.21 0.3 0.2 0.33 0.19 -0.05 -0.99 -0.39 -0.02 -0.03 -1.12 0.06 -0.14 -0.02 -0.1 -0.11 0.1 0.19 0.11 0.35 0.29 0.23 -0.14
0.33 0.59 0.93 1.16 0.67 -2.32 -0.9 -0.74 -0.14 0.49 0.29 -0.66 0.15 -4.04 -1.34 -0.74 -0.23 -1.02 0.36 0.11 0.19 -0.26 -0.79 -0.2 0.63 0.12 0.62 0.34 -0.48 -0.82
0.13 -0.13 0.1 0.34 -0.16 -0.43 -0.14 0.35 0.22 0.37 0.1 0.06 0.18 -0.48 -0.15 -0.01 0.15 -0.22 0.03 -0.17 -0.12 -0.18 -0.01 -0.1 0.12 -0.07 0.18 0.17 -0.2 -0.42
-0.45 -0.55 0.06 0.26 0.56 -0.49 -0.61 -0.45 0.15 0.17 0.35 -0.21 0.04 0.45 -0.59 -0.6 -0.55 -0.11 0.49 0.61 0.24 0.49 -0.2 -0.44 0.32 -0.1 0.54 0.13 -0.68 -0.8
0.08 0.11 0.28 0.13 -0.08 -0.11 0.02 0.37 0.41 0.19 0.09 0.18 -0.12 -0.32 -0.08 -0.38 -0.4 -0.84 0.05 0.12 -0.09 0.03 -0.17 -0.09 -0.18 -0.07 -0.02 0.13 0.24 -0.06
-0.48 -0.2 0.4 0.18 -0.4 -0.98 0.46 1.03 0.83 0.37 0.7 0.54 -0.91 -0.86 -0.9 -0.58 -0.72 -1.06 0.06 0.4 -0.0 -0.11 -1.58 -0.57 -0.09 0.11 0.37 0.35 0.09 -0.31
-0.04 0.01 0.1 0.49 0.0 -0.52 -0.23 0.03 0.1 0.14 0.08 -0.07 0.09 -0.4 -0.06 -0.1 -0.05 0.16 0.02 -0.18 0.01 -0.05 0.07 -0.08 0.09 0.11 0.23 0.04 -0.05 -0.29
0.35 -0.42 0.76 1.32 -0.01 -0.51 -0.82 -0.66 0.43 -0.03 -0.11 -0.32 -0.36 -3.56 -1.8 -0.33 -0.09 1.63 0.42 0.07 -0.22 -0.04 -0.82 -1.71 -0.47 -0.14 -0.32 0.5 -0.69 0.37
-0.1 -0.27 0.39 0.98 -0.37 -0.9 -0.33 0.12 0.47 0.43 0.46 0.13 0.16 -2.34 -0.45 -0.31 -0.22 -0.74 0.07 -0.21 0.08 -0.08 -0.28 -0.41 0.35 0.19 0.58 0.17 -0.05 -0.39
-0.43 -0.31 0.59 0.46 -0.91 -0.29 0.56 0.28 0.97 0.5 0.26 0.35 -0.78 -2.44 -0.2 -0.59 -0.76 -2.29 0.72 0.8 0.02 0.3 -1.12 -0.2 -0.12 -0.03 0.22 0.15 0.12 -1.53
0.2 0.15 0.35 0.35 0.44 -0.3 -0.3 -0.51 0.35 0.36 0.06 0.07 -0.5 -1.24 -0.4 -0.41 -0.35 0.36 -0.05 -0.15 0.03 -0.09 -0.67 0.01 0.07 0.16 0.18 0.4 0.37 -0.36
-0.26 -0.16 0.12 0.09 0.27 -0.3 -0.08 0.5 0.14 0.06 0.09 0.01 -0.01 -0.33 -0.17 -0.36 -0.29 -0.04 0.14 0.13 0.07 0.16 -0.1 -0.06 0.15 0.09 0.2 0.16 -0.15 -0.53
-0.27 -0.45 0.29 0.55 0.08 -0.81 -0.41 0.54 0.43 0.46 0.33 -0.05 0.11 -0.18 -0.29 -0.37 -0.41 -0.43 0.11 0.06 0.13 -0.11 0.03 -0.45 0.14 0.14 0.45 0.15 -0.35 -0.88
0.29 0.19 0.24 0.46 0.26 -0.65 -0.33 0.12 0.61 0.38 0.21 -0.01 -0.57 -0.75 -0.57 -0.04 -0.17 -0.23 -0.06 -0.03 0.11 -0.26 -0.58 -0.19 -0.0 0.01 0.04 0.16 0.27 -0.05
0.26 -0.2 0.12 0.37 0.29 -0.29 -0.11 -0.22 0.17 0.09 0.13 -0.09 0.02 -0.07 -0.26 -0.21 -0.07 -0.21 0.04 -0.03 -0.11 -0.09 0.19 -0.05 0.22 0.04 0.17 0.07 -0.23 -0.28
0.78 0.68 0.86 0.37 0.28 -0.82 -0.4 -0.26 -0.56 -0.32 -0.26 -0.84 -0.08 -0.39 0.01 0.59 0.55 1.14 -0.27 -0.75 -0.04 0.12 -0.2 -0.65 -0.71 0.15 -0.35 -0.18 -1.43 -0.54
- - 3.35 - - - - - 2.61 - - - - - 1.97 - 2.23 1.71 - - - -21.83 -0.18 - -17.16 - -0.15 - - -
1.4 0.87 - 1.13 1.31 0.84 - -0.16 - 0.71 - -0.25 0.32 1.63 -1.42 -1.24 0.89 -0.52 - -0.48 - 1.15 - 0.43 - - -0.49 0.49 0.3 -1.35
-0.0 -0.11 0.44 -0.07 -1.27 -0.26 0.37 0.24 0.37 0.89 0.09 0.67 -0.11 -0.95 -0.6 -0.94 -2.2 -1.18 0.39 1.05 -0.2 0.47 -1.83 0.19 -0.5 0.12 0.26 0.46 0.33 -1.84
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0.13 -0.03 0.23 0.98 -0.31 -0.87 -0.66 0.14 -0.13 0.05 -0.06 -0.36 0.33 -1.63 -0.05 -0.09 0.16 0.52 0.04 -0.45 0.22 -0.11 -0.11 -0.21 0.35 0.04 0.5 -0.1 -0.17 -0.38
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-0.3 0.0 0.07 0.15 0.47 -0.45 -0.55 -0.03 0.25 0.37 0.02 -0.04 -0.36 -0.21 -0.22 -0.31 -0.24 -0.16 -0.01 -0.24 0.21 0.0 -0.18 -0.06 -0.07 0.32 0.26 0.38 0.38 -0.15
0.6 -0.15 0.35 0.11 1.11 -0.71 -1.3 -2.31 0.65 1.26 0.18 0.08 -0.74 0.11 0.01 0.07 -0.24 0.26 -0.21 -0.95 0.22 -0.43 0.41 -0.32 -0.15 0.31 0.59 -1.45 -2.9 -1.6
- - 2.57 0.69 0.37 - - - 1.6 - - - 2.11 -0.5 - - - 3.11 - - - - - 1.03 - - - - -0.36 0.76
0.17 0.21 0.14 0.14 0.07 -0.25 -0.26 0.01 0.19 0.22 0.05 0.08 -0.14 -0.4 -0.13 -0.17 -0.03 0.17 -0.13 -0.19 -0.16 -0.13 -0.19 0.03 0.1 0.01 0.05 0.24 0.14 -0.12
- - 1.41 1.92 - 1.03 - - 1.14 - - - - 0.14 - 0.34 1.16 - - 2.65 - 1.77 - - - - 1.09 1.53 - -
0.15 0.09 0.04 0.16 0.35 -0.37 -0.33 -0.06 0.27 0.45 0.17 0.11 -0.16 -0.71 -0.49 -0.31 -0.19 -0.22 -0.04 -0.14 -0.04 -0.03 -0.5 -0.05 0.14 0.08 0.16 0.25 0.45 0.01
-0.65 -0.22 -0.09 -0.0 -1.19 -0.04 0.82 0.55 0.87 0.36 0.36 0.79 -0.65 -1.81 0.13 0.02 -0.33 -2.65 0.25 0.58 -0.06 0.38 -2.28 0.16 -0.07 0.3 0.29 -0.17 -0.16 -1.52
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.