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Heatmap: Cluster_158 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
-0.13 -0.13 -0.08 -0.16 -0.14 0.2 0.11 0.21 -0.23 -0.05 -0.03 -0.11 -0.03 0.29 0.29 0.44 0.29 -0.42 0.04 0.06 0.15 0.07 -0.35 -0.04 -0.01 0.1 0.07 -0.33 -0.31 -0.24
-0.12 -0.17 -0.1 -0.15 0.05 0.08 0.19 0.29 -0.12 -0.17 -0.04 -0.03 0.18 -0.43 0.33 0.2 0.25 -0.08 -0.13 -0.06 -0.04 0.02 0.21 -0.3 -0.1 0.03 0.06 -0.06 -0.19 0.1
-0.19 -0.13 -0.11 0.01 -0.05 -0.06 0.12 0.24 -0.12 -0.29 0.02 0.0 0.19 -0.08 0.22 0.2 0.31 -0.05 -0.13 0.03 0.03 0.06 0.07 -0.21 -0.05 0.02 0.02 -0.17 -0.35 0.19
-0.51 -1.88 -0.94 -0.99 -0.05 1.05 1.44 0.17 -0.4 -1.48 0.3 -0.17 1.12 -3.08 0.86 0.63 0.77 -2.56 -0.49 0.36 -0.77 0.4 -2.56 -0.29 -0.02 -0.49 -0.44 -0.77 -0.11 0.62
-0.18 -0.26 -0.08 0.1 -0.18 0.3 0.26 0.3 -0.16 -0.42 -0.01 -0.06 0.07 -0.05 0.66 0.58 0.6 -0.4 -0.14 -0.01 0.11 0.06 -0.81 -0.28 -0.03 0.01 0.13 -0.46 -0.57 -0.21
-0.94 -0.84 -1.17 -1.68 -0.81 0.23 0.22 0.42 -0.43 -0.44 -0.08 0.11 0.36 -0.01 1.0 0.77 0.72 0.17 -0.03 0.34 0.25 0.23 -0.4 0.12 -0.09 -0.07 -0.22 -1.11 -0.4 0.31
0.49 -0.1 0.39 0.54 0.23 0.27 0.15 -0.17 -0.28 -0.43 -0.35 -0.52 -0.49 -0.97 0.5 0.13 0.37 0.41 0.06 -0.06 -0.21 -0.2 -0.32 -0.19 -0.23 -0.43 -0.53 -0.13 -0.13 0.69
-0.44 -1.18 0.11 0.79 0.08 0.74 0.62 0.68 0.01 -0.7 -0.7 -1.08 -0.21 -0.74 -0.01 -0.2 0.1 0.92 -0.17 0.06 -1.0 -0.42 -2.35 -0.79 -0.81 -0.87 -0.82 -0.21 0.76 1.56
-0.2 -0.44 -0.37 -0.08 0.02 -0.09 0.45 0.2 -0.49 -0.16 -0.03 -0.05 0.03 -0.84 0.48 0.47 0.2 0.69 -0.4 -0.21 -0.3 0.03 0.69 0.1 -0.07 -0.0 -0.16 0.13 -0.5 -0.41
0.14 -0.6 -0.08 0.25 -0.28 0.46 0.43 -0.06 0.05 -0.53 0.27 0.05 0.49 -0.38 0.35 0.4 0.5 -0.29 -0.02 0.19 -0.23 -0.05 -1.17 -0.21 0.13 -0.21 -0.14 -0.23 -0.56 -0.02
Spov3_chr2.01069 (PP2-A11)
 -0.01 -0.32 0.24 0.37 -0.0 0.04 0.05 -0.08 0.11 0.05 0.02 -0.17 0.12 -0.03 0.24 0.29 0.42 0.19 -0.11 -0.2 -0.25 -0.08 0.03 -0.44 -0.29 -0.09 -0.07 -0.25 -0.33 0.08
-0.19 -0.07 -0.31 -0.41 0.36 0.06 0.46 0.08 -0.04 -0.18 0.35 -0.06 0.58 -0.85 0.49 0.73 0.61 0.41 0.03 -0.32 -0.22 -0.24 -0.75 -0.39 -0.29 -0.44 -0.02 -0.45 -0.38 -0.2
-0.67 -0.96 -0.66 -0.74 -0.77 0.82 0.92 0.6 -0.39 -0.59 -0.15 -0.38 0.96 -0.27 0.17 0.38 0.08 -0.27 0.24 0.51 0.33 0.38 0.6 -0.77 -0.32 -0.14 -0.25 -0.73 -1.72 -0.05
-0.16 -0.49 -0.22 -0.27 -0.76 0.2 0.19 0.05 0.02 -0.03 0.09 0.15 0.36 -0.34 0.35 0.38 0.52 0.0 -0.06 -0.08 -0.03 0.07 0.21 0.11 -0.09 0.03 -0.09 -0.32 -0.51 -0.04
-0.19 -0.26 -0.09 0.18 -0.28 -0.01 -0.11 0.25 -0.05 -0.12 0.21 0.09 0.02 0.08 0.31 0.4 0.5 -0.5 -0.04 0.04 0.19 0.01 -0.53 -0.18 0.11 0.15 0.05 -0.32 -0.38 -0.16
0.01 -0.26 -0.36 -0.41 -0.18 0.4 0.08 -0.35 -0.11 -0.28 0.23 0.2 0.52 -0.35 0.21 0.54 0.34 0.36 -0.01 -0.7 0.04 -0.08 -0.46 0.07 -0.49 0.02 -0.06 -0.03 -0.32 0.39
-0.24 -0.3 -0.32 -0.45 0.0 0.15 0.14 0.25 -0.04 -0.09 -0.01 0.1 0.39 -0.07 0.34 0.25 0.34 -0.32 0.02 -0.1 -0.02 -0.06 -0.12 0.25 0.09 -0.04 0.0 -0.09 -0.32 -0.21
Spov3_chr2.04129 (DES-1-LIKE)
 0.17 -0.08 0.01 0.17 0.01 -0.1 -0.08 0.0 0.03 -0.24 0.04 -0.06 0.19 -0.97 0.25 0.27 0.46 -0.07 0.03 0.16 0.15 0.07 -0.86 -0.01 0.01 0.07 0.04 -0.26 -0.27 0.11
-0.55 -0.55 -0.29 0.02 -0.02 0.28 0.29 0.14 0.27 0.12 0.23 0.19 0.0 0.08 0.29 0.28 0.39 -0.63 0.01 0.11 0.06 -0.0 -0.48 -0.03 -0.07 0.08 0.1 -0.41 -0.44 -0.28
-0.45 -0.71 -1.27 -1.97 0.41 1.12 0.62 -0.35 -0.27 0.27 0.28 -0.15 0.33 -0.8 0.49 0.52 0.45 -1.75 0.05 0.31 -0.25 0.22 -3.37 -0.16 -0.14 -0.4 -0.13 -1.29 0.44 1.04
-0.4 -0.4 0.01 -0.14 0.22 0.18 0.04 0.17 0.05 0.2 0.15 0.03 0.11 0.03 0.22 0.08 0.07 -0.3 -0.02 -0.02 0.01 -0.13 -0.67 -0.11 -0.09 -0.12 0.02 0.04 0.19 0.19
-0.05 0.04 -0.5 -0.69 -0.35 0.66 0.49 0.17 -0.57 -1.13 0.11 -0.12 0.96 -1.61 0.34 0.06 0.05 0.52 -0.08 0.32 -0.22 -0.25 -0.03 0.21 -0.54 -0.42 -0.56 -1.17 0.36 0.79
-0.47 -0.35 -0.03 -0.07 -1.12 -0.44 0.09 0.44 0.14 -0.21 0.2 0.17 0.08 -1.03 0.34 0.42 0.6 -0.0 0.12 0.25 0.15 0.06 0.08 -0.25 0.03 0.09 0.17 -0.43 -0.55 0.08
-0.08 -0.32 -0.53 -0.42 -0.61 -0.04 0.34 0.13 0.01 -0.19 0.2 0.08 -0.07 -0.33 0.29 0.35 0.1 0.38 -0.11 0.1 -0.07 0.08 0.36 0.34 0.21 0.03 0.07 0.14 -0.52 -0.86
Spov3_chr3.03630 (CYCT1;4)
 -0.23 -0.17 -0.17 0.09 -0.23 0.25 0.11 0.35 -0.27 -0.35 -0.07 -0.14 0.2 0.1 0.46 0.38 0.38 0.03 -0.21 -0.17 -0.13 -0.05 0.16 0.04 -0.06 -0.13 -0.11 -0.27 -0.31 -0.02
-0.29 -0.22 -0.22 0.02 0.06 0.03 0.01 0.52 -0.12 -0.16 -0.14 -0.19 0.32 -0.39 0.27 0.22 0.28 0.0 -0.0 -0.05 -0.09 -0.04 0.19 -0.17 -0.09 0.04 0.04 -0.3 -0.1 0.14
-1.35 -1.33 -0.41 -0.52 -1.68 0.29 0.4 0.76 0.17 -0.08 0.14 -0.08 -0.39 -0.47 0.69 0.8 0.76 0.85 0.29 0.29 0.37 0.25 -0.06 -0.63 -0.69 0.33 0.14 -1.23 -1.97 -0.84
0.02 -0.15 -0.03 0.16 0.04 0.08 0.14 0.22 -0.15 -0.31 -0.05 -0.1 0.27 -0.19 0.31 0.21 0.18 0.13 -0.18 -0.05 -0.09 -0.08 0.18 -0.18 -0.09 -0.17 -0.11 -0.08 -0.1 -0.11
0.03 -0.03 -0.1 -0.32 -0.03 0.09 0.25 0.02 -0.01 -0.13 -0.03 -0.11 0.13 -0.49 0.31 0.16 0.19 0.03 -0.14 -0.01 -0.02 0.04 0.29 -0.0 -0.06 0.02 -0.02 -0.05 -0.21 -0.07
-0.01 -0.12 -0.06 -0.05 -0.21 -0.07 0.01 0.06 0.26 0.1 0.32 0.27 0.2 -0.96 0.02 0.18 0.26 -0.14 -0.07 0.09 0.09 0.04 -0.53 -0.09 0.05 0.08 0.07 -0.11 -0.3 0.03
-0.07 -0.26 -0.02 -0.13 -0.26 0.09 -0.05 0.1 -0.02 -0.12 0.02 0.09 0.13 -0.97 0.22 0.43 0.56 0.13 -0.1 -0.05 -0.06 0.07 -0.02 0.1 0.0 0.04 0.05 -0.28 -0.33 0.09
-0.21 -0.25 -0.08 0.02 -0.18 0.03 0.14 0.27 0.02 -0.12 0.02 0.01 0.22 -0.11 0.34 0.22 0.25 -0.0 -0.14 -0.14 0.01 -0.06 -0.03 0.03 -0.03 0.01 0.02 -0.11 -0.28 -0.12
0.01 -0.63 -0.22 -0.37 0.27 1.02 0.71 -0.26 0.11 -0.23 -0.42 0.4 0.12 -0.66 0.12 0.03 0.01 -0.29 -0.56 -0.26 -0.29 -0.22 -2.65 -0.89 -0.18 -0.63 -0.09 0.03 0.37 1.43
-0.52 -0.32 -0.19 -0.32 -0.11 0.05 0.2 0.46 -0.38 -0.61 -0.06 -0.19 0.51 -0.34 0.38 0.22 0.43 0.07 0.22 0.38 0.14 0.33 -0.06 -0.24 0.1 0.09 -0.04 -0.54 -0.6 -0.14
0.05 0.04 -0.09 0.01 -0.11 0.04 0.02 0.07 -0.33 -0.28 -0.15 -0.23 0.18 0.15 0.38 0.37 0.38 -0.04 -0.16 -0.18 0.1 0.0 -0.08 -0.19 -0.02 0.02 0.03 -0.15 -0.23 0.06
-0.28 -0.85 -0.72 -0.6 -0.52 0.27 0.29 0.19 0.11 0.18 0.41 0.31 0.51 -0.58 0.61 0.41 0.71 -1.21 -0.29 0.08 -0.1 0.02 -0.31 0.02 0.05 0.07 -0.24 -0.33 -0.35 0.16
-1.33 -1.62 -0.53 -0.34 -0.32 0.99 0.38 0.4 0.1 -0.19 0.48 -0.06 1.15 -3.4 0.29 0.6 1.01 -0.09 0.14 0.11 -0.28 -0.27 -0.81 -1.08 -0.22 -0.14 -0.11 -0.95 -1.09 0.62
-0.07 -0.11 0.09 0.17 -0.15 0.14 0.1 0.33 -0.15 -0.24 -0.0 -0.09 0.17 -0.56 0.37 0.33 0.43 -0.36 -0.08 -0.16 0.19 0.07 -0.37 -0.2 0.03 0.11 0.17 -0.21 -0.5 -0.07
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-0.41 -0.15 -0.35 -0.31 -0.95 0.28 0.37 0.24 -0.54 -0.88 -0.1 -0.16 0.47 -0.95 1.01 0.95 0.95 0.27 -0.26 -0.08 0.13 0.1 -0.54 -0.09 -0.18 -0.12 -0.18 -1.01 -1.03 0.32
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-0.28 -0.12 -0.38 0.28 -1.15 0.3 0.05 0.44 -0.99 -1.61 -0.28 -0.71 1.4 -1.58 1.06 1.06 0.94 -0.87 -0.22 0.15 -0.29 -0.06 -1.02 -0.15 -0.22 -0.25 -0.07 -0.9 -1.26 0.66
-0.19 -0.41 0.22 -0.19 0.02 0.98 0.1 -0.94 -0.18 -0.5 -0.3 -0.58 0.41 -3.59 0.25 1.09 0.98 0.8 -0.26 0.02 0.22 0.31 -3.09 -1.73 -0.88 0.4 0.37 -0.57 -1.14 0.37
0.46 0.59 0.2 -0.45 -0.41 0.63 0.04 -1.18 -0.45 -0.44 -0.05 -0.27 0.68 -1.66 0.29 0.71 0.65 -0.57 -0.06 0.24 0.18 0.59 -1.87 -0.69 -0.34 0.22 0.56 -0.05 -1.55 -0.35
-0.18 -0.31 -0.0 0.16 0.01 0.08 0.08 0.04 0.1 -0.15 0.14 0.0 0.08 0.0 0.4 0.23 0.37 -0.07 0.08 -0.1 -0.05 0.03 -0.48 -0.12 0.17 0.02 0.15 -0.2 -0.47 -0.47
-0.49 -1.11 -0.22 0.07 -0.56 1.26 -0.99 -0.53 -1.25 -0.79 0.35 -0.88 0.96 -0.12 0.22 0.87 0.5 1.23 0.51 0.88 0.25 -0.23 - -1.71 -0.37 -0.31 -0.56 -1.73 -1.12 0.67
-0.48 -1.11 -0.62 -0.09 -1.93 0.79 0.68 -0.57 -0.38 -0.9 0.2 0.15 0.72 -1.38 1.07 0.9 0.82 -0.59 -0.17 0.19 -0.02 0.09 0.07 -0.41 -0.2 -0.39 -0.49 -1.28 -0.8 0.83
-1.08 -2.42 -0.59 -0.42 -1.41 0.34 -0.43 0.97 -0.92 -0.97 -1.21 -1.42 1.71 -0.77 1.81 1.32 0.74 -0.22 0.56 0.26 0.62 -0.1 -1.55 -0.59 -0.34 -0.59 -0.58 -2.67 -2.4 -0.45
-0.1 -0.23 -0.04 0.44 -0.09 0.24 0.41 0.36 -0.26 -0.24 -0.06 -0.13 0.0 -0.56 0.25 0.49 0.06 -0.39 -0.31 -0.36 -0.13 -0.19 0.02 -0.49 -0.62 -0.4 -0.17 0.0 0.14 1.01
-0.31 -0.45 -0.38 -0.49 -0.23 0.08 0.31 0.22 -0.15 -0.3 0.01 0.02 0.45 -0.08 0.48 0.37 0.33 0.1 0.04 0.01 0.04 0.06 -0.04 -0.24 -0.02 0.17 0.02 -0.38 -0.39 0.05
-1.25 -1.57 -0.3 0.9 -0.14 0.62 0.32 -0.12 0.07 -0.29 0.19 -0.01 0.67 -0.81 0.72 0.13 0.58 0.57 -0.16 -0.21 -0.3 -0.35 -0.56 -0.69 -0.57 -0.3 -0.31 -0.43 -0.44 0.73
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-0.25 -0.08 -0.3 0.01 -0.29 -0.07 -0.14 0.08 0.14 0.04 0.13 0.12 0.13 -0.32 0.25 0.41 0.37 -0.24 -0.02 0.1 0.16 0.14 -0.36 -0.09 0.04 -0.14 0.13 -0.36 -0.13 0.1
-0.06 -0.05 -0.01 -0.01 -0.14 0.12 0.1 0.24 -0.23 -0.17 -0.05 -0.17 0.14 0.02 0.31 0.33 0.25 -0.16 -0.06 -0.03 -0.06 -0.1 0.16 -0.04 -0.06 -0.08 -0.08 -0.04 -0.1 -0.21
-0.13 -0.19 -0.2 -0.09 -0.03 -0.05 0.01 0.28 -0.02 -0.11 -0.07 -0.08 0.27 -0.24 0.19 0.23 0.2 0.11 -0.16 -0.06 0.02 0.0 0.22 -0.26 -0.03 0.01 0.1 -0.08 -0.28 0.18
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-0.34 -1.49 -0.53 0.31 -0.1 0.61 0.89 0.42 0.09 -0.9 0.44 0.19 0.7 0.04 0.42 0.09 0.55 -0.78 0.11 0.1 -0.5 0.13 -0.93 -0.11 0.01 -0.21 0.06 -0.44 -1.04 -0.92
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.