Heatmap: Cluster_67 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0001.00093 (PLIP3)	-0.09	-0.45	-2.48	0.16	-	0.47	-0.28	-1.05	-0.26	-2.33	-0.11	-1.56	-0.06	-0.99	1.29	-0.12	1.45	-	-0.09	-0.33	-0.33	-0.69	-1.37	0.91	1.29	1.68	-1.87	-1.33	0.78	0.03
Spov3_C0001.00210	1.76	1.43	-1.41	0.39	-0.47	0.17	-0.74	-0.88	0.36	-	0.68	-	-1.29	-	-0.45	-1.13	2.18	-	-	-1.45	-1.33	-	-0.16	-	-0.39	-	0.2	1.57	1.88	-
Spov3_C0002.00012 (GSDA)	-	-	2.28	-	-	-	2.19	-	0.68	-	0.99	-	-	-	-	-	3.02	-	-	-	-	-	2.43	-	-	-	-	-	-	1.78
Spov3_C0002.00170 (DUT1)	1.43	0.03	0.33	-0.75	0.46	0.13	0.2	-0.7	-0.39	0.58	-0.6	-0.26	-0.48	-0.71	0.21	-0.92	-0.57	0.36	-0.59	0.71	0.38	-1.13	-0.44	-1.42	-1.3	-0.15	-0.36	1.06	0.08	0.1
Spov3_C0003.00038 (PNH)	0.86	0.83	1.69	-	0.43	-	-	-	-	2.0	-	-	2.57	-	-	-	2.45	-	-	-	0.59	-	0.78	-	-	-	-	-	-	1.69
Spov3_C0004.00122 (LOH3)	-	-	-	2.09	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.46	-	-	-	-	-	-	-	2.92	-	-	-	-	2.85
Spov3_C0005.00103	-	-	-	-	1.86	-	2.83	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.71	-	-
Spov3_C0006.00086	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0012.00035 (REM16)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.41	-	-	-	-	4.28	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0013.00001 (WSS1B)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0013.00014 (FBA6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.11	2.68	2.66	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0014.00005 (GA2ox10)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.35	-	-	-	-	-	-	-	-	3.27	-	-	-	-
Spov3_C0022.00005	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0026.00014	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0034.00025	0.89	-	-	0.91	-	-1.25	-19.19	-	-	-0.07	-	-	-	2.64	-	-	0.66	2.61	-	-	-	2.52	-	-	1.14	0.48	-	-	-	0.71
Spov3_C0040.00009	2.44	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.11	-	-	-	-	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0041.00005	-	-	-	-	-	2.57	-	-11.41	-	1.81	-	-	-	1.72	-	-	-	3.5	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0070.00003 (FRS3)	-	-	-	-	-	-	-	2.98	1.9	2.94	-	-	2.91	-	-	-	-	-	-	-	-	1.67	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0077.00014 (TPPF)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_C0290.00007 (NDHH)	2.1	-	-	-	-	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	2.0	-	1.9	2.11	-	2.49	-	-0.85	-	-	-	-	-	2.17	-	-
Spov3_chr1.01247 (NHL2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01307	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01377	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.01617 (ML1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02319	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.71	-	-	-	-	-	4.08	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.02465 (LBD39)	2.57	-	-	2.38	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.16	-	-	-	-	-	-	-	-	2.28	-	2.35	-	-
Spov3_chr1.02613	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.34	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.98	-	-	-	2.02	-	-	-	-
Spov3_chr1.02811 (EXP2)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr1.03983 (CRR42)	-0.18	-	1.4	-0.25	-0.47	0.63	-	0.26	-	-0.62	-	0.78	0.76	0.63	0.14	-	1.07	1.17	0.98	0.7	-	-	-	-	-0.45	-0.88	-0.06	1.92	0.57	-
Spov3_chr2.00215 (MYB107)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.39	-	-	-	-	-	-	-	3.86	-	-	2.32	2.39	-	-	-	-
Spov3_chr2.01200	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.01225	-	3.36	-	-	-	-	1.85	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.01552 (ATO)	-0.13	-1.5	-0.05	0.69	0.16	-0.21	-0.66	0.06	-2.15	-0.19	-0.75	-0.74	0.29	0.14	0.34	1.18	1.58	0.83	-3.29	-0.13	-0.93	-0.39	-0.37	-1.06	-0.93	-0.02	0.59	-0.5	0.18	0.25
Spov3_chr2.01579 (BIR6)	-	-	-	-	-	3.88	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.02271	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-3.21	-	-	-	-	4.9	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.02589	-	-	-	-	-	-	-	2.19	-	2.13	-	-	3.7	-	-	-	2.01	-	-	-	-	-	-	2.0	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.03588 (NANMT)	-	-	2.81	2.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.92	3.93	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.04319 (SUB1)	-	1.35	-	3.22	2.16	-	-	-	-	-	-	-	1.24	-	-	-	2.08	-	-	-	-	-	1.3	1.0	-	-	-	1.41	-	-
Spov3_chr2.04414 (UBC11)	-	-	1.41	-	-	-	-	-	-	-	0.26	-	1.6	-	2.52	-	2.58	0.16	-	1.98	0.66	0.26	-	-	1.15	-	0.38	-	-	-
Spov3_chr2.04416 (WRKY9)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.04644 (REM35)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.72	-	-	-	-	-	2.78	-	-	-	-	-	4.05	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.04951	-	-	-	1.83	-	-	-	-	-	-	2.13	-	-	-	-	-	2.9	2.76	-	-	-	-	-	-	1.93	-	-	2.02	-	-
Spov3_chr2.05153	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.91	-	-	-	-	-	4.49	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.05268 (MTV17)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr2.05508 (PARP3)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.58	-	-	-	-	-	-	2.62	-
Spov3_chr3.00469	-	0.27	-	0.65	-0.01	-0.06	-	0.95	-	1.53	-	0.03	-	0.48	-0.1	-	2.28	-	-	0.56	-	-	-	-	-	0.09	-0.11	1.35	2.36	0.13
Spov3_chr3.01183 (ROPGAP4)	0.47	-1.56	0.54	-0.56	0.88	-0.46	-2.86	0.58	-1.73	0.71	-2.68	0.08	-0.03	0.12	-0.45	-0.93	1.25	-	-	-0.48	-0.36	-1.9	0.17	-2.5	0.59	-0.55	0.95	1.55	1.01	-0.06
Spov3_chr3.01211 (PHT4;5)	-	-	-	4.0	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.81	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01289 (ACI1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.81	-	-	3.04	-	-3.39	-	-	-	-	-	-	-	2.94
Spov3_chr3.01374 (SOB5)	-	-	-	1.4	-	-	-	-	1.58	-	0.87	0.67	1.73	-	-	-	1.79	1.48	-	-	-	2.95	-	-	-	-	-	0.95	0.81	-
Spov3_chr3.01489	-	-	0.87	1.38	0.48	1.9	0.82	-	-	0.2	-	-	-	-	2.46	-	1.14	1.16	-0.95	-	0.9	0.86	-	0.29	-	-	-0.23	0.4	-	-
Spov3_chr3.01578	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.91	-	-	-	3.9	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01657 (ANT)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01715 (DME)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.95	3.86	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.01723 (DCL4)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02167 (E2FB)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02348 (BIM1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.69	-	-	-	3.59	2.46	-	-	-	-	-	2.57	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.02402 (MRP11)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr3.04976	-	-	-	-	-	-	-	-	1.27	2.3	-	-	-	-	-	-	3.79	-	-	-	-	2.63	-	-	-	-	-	1.37	-	-
Spov3_chr3.04978 (B5 #1)	-	-	1.56	-	-0.19	-0.3	-0.16	-	-	-	-	1.09	0.3	0.02	1.89	-	0.97	0.9	-	1.62	-	-0.14	-	-	1.05	-	0.69	1.17	-0.28	0.85
Spov3_chr4.00200	-	-	-	1.07	-	-	-	-	-	-	-	-	2.83	-	-	1.16	3.1	-	-	-	-	1.91	-	-	-	-	-	-	2.64	-
Spov3_chr4.00467	-	-	-	-	1.7	-	-	-	-	-	-	0.1	2.64	0.2	-	-	3.72	1.57	1.13	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.00626	-1.27	1.38	0.88	-1.36	-	-	-	-1.43	-0.25	-	-1.41	1.13	-1.31	1.42	-1.63	-0.3	1.95	0.14	1.29	-	0.8	-	-0.22	0.93	-	-0.43	-	0.3	0.58	0.47
Spov3_chr4.00700 (TTN7)	-	-	2.36	3.43	-	-	-	-	-	-	-	-	1.61	-	-	1.53	3.02	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.00812 (MRP15)	-	-	1.58	-	0.22	-	-	1.7	-	-	-	0.46	-	2.61	-	1.55	2.11	-	-	-	-	-	0.59	-	-	1.67	-	-	0.74	0.58
Spov3_chr4.01557	2.77	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.27	-	-	-	-	-	-	-	-	1.84	-	-	-	-1.56
Spov3_chr4.01600	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.1	-	-	-	-	-	-	3.68	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.02045	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.02370 (PDE331)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.02605	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.16	-	-	-	-	-	3.43	-	-	-	2.0	-	-	-	-	-	-	-	-	3.43
Spov3_chr4.03077 (RAD7a)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.03252 (CYP705A28)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr4.04142 (CPK28)	-	-	-	1.71	1.24	-	-	-	-	-	1.14	-	1.26	-	1.5	-	2.79	-	-	0.84	-	-	-	0.58	1.12	2.19	-	-	-	-
Spov3_chr4.04145 (TET4)	0.92	0.96	-1.43	-2.12	0.87	-0.43	-1.36	0.48	-0.15	-2.93	-0.19	0.18	-0.48	1.39	-3.0	0.34	0.42	0.83	-0.29	-1.06	-2.28	-0.05	0.58	-0.79	-0.58	0.69	-3.06	-0.67	0.22	0.65
Spov3_chr5.01488 (MyoB1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.01869	0.29	-1.03	1.35	0.46	0.92	-0.55	-1.36	0.86	-0.27	-0.08	-0.04	-0.25	-2.75	-0.11	-0.88	-1.08	1.14	0.64	-0.33	0.42	0.48	-0.98	-	-2.58	-1.21	-0.12	0.57	0.45	-0.0	-0.46
Spov3_chr5.01979	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.02211 (CYP78A8)	1.74	-	-	-	-	2.39	-	1.62	1.65	1.74	-	-	2.78	-	-	-	-	-	-	-	1.49	1.13	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.02303 (ACL5)	-	-	-	-	-	-	-	-	2.19	1.53	-	-	-	-	1.42	-	-	-9.84	-	-	-	3.54	-	-	-	-	-	-	0.9	2.67
Spov3_chr5.02686 (PI)	-	-	-	-	-	-	-	1.84	-	-	-	1.6	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.79	1.83	-	-	-	-	-	1.65	1.53
Spov3_chr5.03018	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03211	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03223 (LecRK-S.7)	-	-	-	-	-	-	1.9	-	-	2.12	-	1.96	-	-	-	-	3.43	-	-	1.75	-	-	-	-	-	1.97	-	-	-	-
Spov3_chr5.03549	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03563	-	3.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.31	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.03583	-4.53	-	-	2.78	-2.48	-	-	-8.35	1.4	-0.4	-6.94	-7.55	-2.62	-6.79	1.68	-6.09	3.16	-	1.61	-	-2.53	-	-	-	-	-	-8.01	0.51	1.32	-6.05
Spov3_chr5.04103 (MED23)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.04344	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr5.04365	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.00201	-0.63	0.25	0.39	1.42	-0.54	-0.2	-1.07	0.69	-1.06	0.61	-0.25	0.43	1.11	-0.41	0.08	-0.42	1.12	0.01	-0.18	-2.53	-2.41	0.17	0.29	-0.82	-0.31	-0.69	-0.39	-0.17	-0.24	-1.42
Spov3_chr6.01682	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01735 (BIR6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01763 (HEXO3)	-	2.44	-	2.35	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.37	-	-	3.18	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01903	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.8	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.01	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.01927 (SRS)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.02380 (PMES)	-2.07	-	-1.32	1.31	-2.34	0.52	0.81	0.93	0.04	-0.15	-0.17	-	-1.53	0.56	-0.83	1.58	2.02	-1.62	-1.55	-2.73	-2.82	-0.59	-1.37	-0.41	1.08	0.86	0.31	-2.5	-0.19	-1.48
Spov3_chr6.02487 (CWC15)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.4	3.68	-	-	-	-	2.96	-	-	-	-	-	-	-	2.04
Spov3_chr6.02939	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.03011 (HIP1)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_chr6.03031	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.3	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.37
Spov3_S01.00056 (UGT76E11)	1.98	2.01	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.69	-	-	-	3.8	-	0.7	-	-	-	-	-	-
Spov3_S01.00169	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S03.00001 (UPF2)	-	3.2	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.38	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S04.00072 (MSH6)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-
Spov3_S05.00006 (DRB5)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.91	-	-	-	-	-	-	-	-

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.