1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_68 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.07 1.52 -0.09 - 0.61 - - -0.32 - - 2.93 - 0.88 0.8 -0.35 0.87 1.46 - 1.5 - - -0.43 - 0.83 - - -0.13 - - -
- - - - 1.81 - - - - - 3.73 - - - 3.73 - - - - - - - - - - - - - - -
0.86 - - - 1.05 1.88 0.96 - - 2.1 2.32 - - - - 1.13 - - - - - - - - 2.08 1.0 - - 1.48 -
- - - - 2.65 - - - - - 3.59 - 2.98 - - - - - - - - - - -13.62 - - - - - 1.91
- - - - - - - - - - 3.56 - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - 3.35 - -
0.93 2.61 0.98 1.96 - - - 1.04 - - 2.58 - - 1.76 - - 0.78 - - - - - - - - - - - 1.6 -
- - - - - - - - - - 3.08 3.26 - - 3.58 - - - - - - - - - - - - - - -
2.72 - - - - 3.14 2.07 - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.41 - -1.45 -1.77 1.37 0.29 - - 0.37 -1.61 -0.48 1.54 0.78 0.69 0.65 0.05 -0.55 -0.75 -0.63 -0.71 -0.59 -1.82 0.98 -0.07 -1.75 -0.25 0.75 1.22 -1.42 1.02
-1.08 -0.09 -1.08 0.5 0.57 -0.33 -1.44 0.38 -1.64 0.27 0.54 -0.46 0.92 0.09 -0.42 0.53 0.18 0.08 -1.64 0.99 -1.99 -0.14 1.25 -0.86 -0.76 -0.05 -0.74 0.53 -0.24 -0.2
-0.26 0.58 0.48 -0.13 0.79 0.01 0.38 0.31 0.25 0.66 -3.27 -0.18 -0.05 0.48 -0.58 0.76 0.24 0.16 0.27 -0.65 -0.22 -1.74 -0.6 -0.21 -1.72 0.2 -0.26 -0.4 -1.55 0.48
-0.25 -0.84 -0.32 -0.28 -0.02 -0.63 -0.25 0.22 -0.57 -1.65 1.31 -0.7 0.18 0.02 1.05 0.99 0.73 0.36 -3.18 0.29 -0.51 0.4 0.27 -0.96 -2.35 -0.03 0.26 -0.82 -1.79 0.84
- - - - 0.74 - - - 2.26 - 2.92 2.31 - 0.69 1.68 - - 1.62 - - - - 0.63 - - - 0.64 - - -
- - - - - - - - - - 2.59 - 2.55 - 2.66 - 2.65 - - - - - - - - - - - - 2.46
0.64 - -1.4 -1.0 0.16 0.37 -0.95 -0.16 0.21 0.47 1.14 0.77 -0.62 -0.01 0.64 0.89 0.25 -0.61 -0.06 -0.96 0.88 0.45 -1.05 -0.39 -0.18 0.81 -2.15 -2.64 -0.45 -0.48
-1.17 - 1.18 -0.95 0.28 1.34 0.18 -0.68 0.49 0.88 0.78 -0.98 0.33 -1.33 - 1.0 0.19 -1.01 - - -1.33 0.49 - -0.48 -0.87 1.55 -0.72 0.41 -1.05 1.07
- - - - - - 2.04 - 2.27 - 3.58 - - - - 2.16 - - - - - - - - - - - 2.21 - -
- - - - - - - - 2.24 2.04 2.7 - - - 1.44 - - - - - - - 2.31 - - 2.28 - - 1.09 -
- - - - - - - - - - 4.33 - - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.6 0.62 0.73 - 1.52 - 2.88 - 2.31 - - - 0.26 1.05 0.74 - 0.7 - - - - - - 1.02 - -
- - - 2.56 2.83 - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.2 - - - - - - - 1.77 - 3.19 2.43 - 1.36 - - - 1.22 - - - - - - - 1.32 - - - 1.25
- - - - 2.74 - - - - - 3.11 - - - - - - - - 2.85 - - - - - - - 2.89 - -
- - - 1.92 - - - - - - 2.99 - - 2.75 - - - - - - - - - 3.01 - - - - 1.79 -
- - - - - 3.71 - - - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.56 - - - 2.97 - - - - - 3.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.31 1.29 - 0.33 - 2.73 1.34 -0.36 - - - -0.59 - - 0.41 1.52 - 0.34 - - - - 1.45 -0.56 - 0.42 - - 1.96 -0.39
- - - - - - - - - - 4.01 - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - -
0.47 0.82 0.45 0.55 -1.04 -1.51 -0.93 -0.78 0.59 -1.33 1.16 1.6 0.41 -0.13 -0.72 -0.0 -0.06 -1.12 -0.09 -0.57 -0.54 0.59 0.67 -2.05 -2.04 -0.27 -0.62 -0.37 0.35 -2.06
- - - - 2.08 - - - - - 3.51 - - 2.27 - - 2.29 - - - - - - - - - - - - 2.22
Spov3_chr2.02592 (CYP91A2)
 - - - - - - - 2.32 - - 3.75 - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.18 0.38 - - 1.28 - 2.49 - - 0.27 - - 2.5 - 0.36 2.43 - - - - 1.12 - - - - 0.39 0.43 -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.93 - 2.32 - - 1.14 2.55 2.03 - - - - - - - - 0.76 - - - - - - 1.96 - 0.85 0.72
0.5 -3.75 -0.68 -0.74 -0.79 0.33 0.56 0.25 -4.68 0.15 0.27 -0.71 1.21 - 1.08 -0.82 -0.13 - 0.74 -2.23 1.78 -0.68 1.24 0.55 -1.63 0.38 -2.74 -0.29 -1.79 0.38
- - 1.98 - - - - - 1.06 - 1.19 2.55 2.13 - - - - - 1.79 - 2.65 - - - - 0.81 - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.08 - -0.44 - - -0.2 -1.38 0.29 0.94 -1.48 2.12 -1.37 2.1 0.34 1.64 0.01 -1.43 - 1.08 0.09 - -1.54 0.58 0.15 -0.63 - - -0.3
1.22 - 1.06 - - 2.22 - - 1.79 0.15 2.48 - 0.1 - - - - - -0.24 - - - 0.96 - - - - - 0.06 2.55
- - - - 1.33 - - - - 1.68 3.23 - - -0.56 - - - - - - - - 2.52 - - - 2.51 - - 1.47
- - 3.76 - - - - - - - 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.52 - 1.48 - - 1.19 - 2.5 - - 2.45 - - - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.01 - - - - - - 3.2 3.05 3.07 - - - - - - - - - - - - - 1.12 - - -
- - 1.69 - - 2.47 2.5 - - 2.66 1.74 - - - - 1.62 - - - - - - - - - 1.5 - - - -
0.99 0.95 0.94 - 0.8 - - - 1.79 - 3.02 - - - - - - - - - 2.81 - - - - - 0.95 0.94 - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.75 - 1.6 0.11 - 1.56 - - 0.67 2.67 - - 2.09 0.48 - 0.6 - - - - - - 0.86 - 1.4 0.74 - - -
-2.04 -0.86 -1.66 0.42 0.11 0.73 0.0 0.29 -0.12 0.28 0.27 -0.32 0.98 -1.56 0.19 0.98 1.06 -0.24 -0.04 -0.19 0.46 -0.11 -0.74 -1.65 -0.13 -0.45 0.29 -0.64 -0.87 -0.04
- - - - - - - - - - 3.54 3.33 - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - -
- - 1.49 - 1.97 -0.64 - -0.23 - - 2.54 -0.19 - - - -0.1 - -0.21 - - - 0.26 - - 1.56 - - 0.41 2.06 1.87
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.05 2.01 - - - - - - 2.33 - - 3.04 2.1 - 2.09 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 1.95 - - - - 3.21 1.97 - - - - - - - - - - 2.97 - - - - 2.36 - -
- - - - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 3.81 - - - - - - - - 4.0 - - - - - - - - - -
- - - - - 3.81 - - - - 4.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_chr5.00379 (AtFDB11)
 - - - - - - - - - - 4.03 - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - 2.25
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.08 -1.32 -0.93 -0.32 -0.99 -0.15 0.57 -0.51 0.4 -0.12 -0.25 -0.26 1.58 0.5 0.76 0.01 -0.1 -0.2 -0.59 0.57 -0.36 -0.92 -1.04 -0.32 0.45 0.66 -0.49 -0.46 -0.56 -0.01
- - - - 3.29 - - - - - - 3.33 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.09 -1.8 -0.33 -0.26 -2.22 -0.27 -1.31 -0.25 -0.05 1.22 -0.48 -0.79 -0.74 0.88 0.89 -0.13 -0.13 0.5 -0.56 -0.32 0.87 -0.31 0.78 -0.61 -0.25 0.06 -0.93 0.92 0.34 -0.81
2.8 - - - - - - - - - 3.65 - 2.52 - - - - - - - - - - - - 2.25 - - - -
- - - - - 3.13 - - - - 3.55 - - - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.97 - - - -0.68 0.09 - -0.57 - 1.52 -0.31 0.45 0.7 1.33 0.38 -0.62 0.54 - 0.82 0.28 1.57 0.89 1.74 - - 0.35 - -0.61 - -
- 1.83 - - - -0.16 1.92 - 1.54 1.62 - -0.04 - -0.02 1.54 0.06 - - - -0.15 - 0.0 0.9 - - 0.96 0.91 0.37 - -0.0
1.24 - - 1.17 - - - - 0.08 1.7 2.21 - 0.25 0.2 - - 2.16 - 1.23 - - - 0.01 2.31 - 0.45 - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.85 - 1.23 - - - 3.41 1.24 - - - - 1.2 - - - - - - - - - - - 2.37 -
- - - - - - - - - - 3.55 - - 2.94 - - 2.91 - - - - - - - 1.64 - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.