1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_176 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000963 (MCTP9)
 0.02 0.06 0.12 0.02 0.09 0.12 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.03 0.01 0.07 0.14 0.03 0.02 0.07 0.02 0.01 0.01 0.06 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.01
Bra002423 (ADT5)
 0.11 0.13 0.18 0.12 0.19 0.21 0.13 0.11 0.19 0.19 0.17 0.15 0.13 0.24 0.33 0.22 0.14 0.25 0.22 0.19 0.17 0.17 1.0 0.2 0.16 0.17 0.16 0.17 0.23 0.2 0.14
0.1 0.01 0.01 0.01 0.12 0.05 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.01 0.02 0.06 0.16 0.08 0.04 0.04 0.05 0.02 0.05 0.05 0.08 0.09 0.07 0.05 0.19 0.06 0.05 0.05 0.05 1.0 0.06 0.05 0.02 0.07 0.03 0.05 0.02 0.04
Bra003724 (PBL31)
 0.05 0.07 0.15 0.04 0.15 0.16 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.06 0.1 0.05 0.02 0.1 0.04 0.05 0.03 0.02 1.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.03 0.01 0.03 0.0
Bra005027 (BIK1)
 0.03 0.05 0.06 0.04 0.08 0.1 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.07 0.1 0.02 0.03 0.13 0.05 0.03 0.02 0.02 1.0 0.05 0.03 0.03 0.02 0.08 0.09 0.05 0.02
Bra006449 (ANAC087)
 0.03 0.03 0.05 0.03 0.08 0.18 0.07 0.03 0.06 0.05 0.03 0.05 0.07 0.1 0.13 0.1 0.07 0.1 0.04 0.08 0.06 0.04 1.0 0.04 0.04 0.05 0.05 0.07 0.07 0.05 0.03
0.07 0.0 0.04 0.0 0.1 0.17 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.04 0.02 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02
Bra009036 (PICALM10b)
 0.04 0.04 0.06 0.01 0.07 0.1 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.07 0.02 0.03 0.11 0.03 0.02 0.01 0.11 1.0 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 0.06
Bra009925 (CBP60G)
 0.09 0.13 0.13 0.06 0.12 0.21 0.06 0.03 0.07 0.07 0.06 0.06 0.03 0.11 0.15 0.07 0.05 0.07 0.08 0.08 0.06 0.11 1.0 0.05 0.04 0.04 0.04 0.04 0.07 0.09 0.04
0.15 0.2 0.23 0.13 0.24 0.23 0.11 0.08 0.14 0.13 0.09 0.1 0.07 0.17 0.22 0.13 0.11 0.14 0.12 0.12 0.13 0.13 1.0 0.09 0.1 0.16 0.1 0.13 0.19 0.1 0.08
Bra013669 (UTR2)
 0.04 0.06 0.05 0.03 0.11 0.24 0.04 0.02 0.07 0.05 0.06 0.05 0.04 0.13 0.15 0.06 0.05 0.11 0.05 0.04 0.05 0.07 1.0 0.14 0.11 0.06 0.09 0.12 0.13 0.09 0.06
0.08 0.1 0.08 0.04 0.16 0.14 0.01 0.01 0.05 0.05 0.03 0.05 0.01 0.08 0.09 0.03 0.03 0.07 0.05 0.02 0.03 0.07 1.0 0.05 0.03 0.05 0.04 0.05 0.09 0.09 0.02
Bra014237 (RLP31)
 0.02 0.03 0.03 0.01 0.17 0.16 0.01 0.01 0.03 0.06 0.03 0.05 0.03 0.08 0.11 0.06 0.06 0.05 0.06 0.04 0.04 0.1 1.0 0.03 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.04 0.02
0.02 0.09 0.09 0.02 0.07 0.09 0.0 0.02 0.04 0.04 0.02 0.04 0.02 0.09 0.12 0.02 0.02 0.06 0.02 0.03 0.03 0.02 1.0 0.04 0.05 0.05 0.01 0.07 0.07 0.12 0.02
0.02 0.06 0.16 0.03 0.03 0.05 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.08 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.1 1.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.01 0.03 0.03 0.01 0.12 0.09 0.01 0.01 0.03 0.07 0.03 0.03 0.03 0.06 0.15 0.06 0.05 0.12 0.03 0.04 0.03 0.03 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03
Bra015704 (TOL4)
 0.09 0.21 0.18 0.1 0.21 0.28 0.12 0.08 0.17 0.14 0.13 0.17 0.11 0.21 0.32 0.18 0.17 0.24 0.14 0.13 0.12 0.16 1.0 0.15 0.16 0.14 0.15 0.14 0.15 0.2 0.12
0.01 0.09 0.09 0.01 0.09 0.18 0.03 0.01 0.03 0.08 0.03 0.04 0.01 0.09 0.15 0.07 0.05 0.03 0.03 0.02 0.03 0.11 1.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.03 0.04 0.03 0.0
0.01 0.03 0.03 0.0 0.2 0.14 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.19 0.14 0.03 0.03 0.14 0.04 0.02 0.03 0.04 1.0 0.04 0.03 0.04 0.02 0.04 0.09 0.06 0.05
0.03 0.17 0.16 0.03 0.11 0.12 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.04 0.0 0.11 0.19 0.03 0.06 0.11 0.03 0.02 0.01 0.08 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.05 0.02
0.08 0.1 0.19 0.05 0.15 0.17 0.08 0.06 0.09 0.08 0.05 0.06 0.06 0.18 0.15 0.08 0.1 0.11 0.08 0.12 0.07 0.07 1.0 0.11 0.09 0.07 0.07 0.11 0.11 0.07 0.06
Bra020546 (WRKY50)
 0.04 0.1 0.04 0.0 0.09 0.14 0.04 0.02 0.08 0.1 0.03 0.04 0.04 0.11 0.09 0.09 0.06 0.24 0.06 0.05 0.05 0.1 1.0 0.04 0.03 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.0
Bra020591 (CNI1)
 0.01 0.08 0.11 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.03 0.04 0.03 0.02 0.06 0.01 0.01 0.01 0.05 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01
Bra020705 (BIR1)
 0.06 0.1 0.19 0.04 0.2 0.27 0.06 0.04 0.08 0.11 0.06 0.08 0.06 0.15 0.2 0.15 0.17 0.18 0.09 0.1 0.07 0.15 1.0 0.13 0.09 0.14 0.1 0.11 0.12 0.16 0.07
0.12 0.16 0.14 0.14 0.27 0.22 0.16 0.14 0.11 0.12 0.1 0.11 0.22 0.23 0.21 0.16 0.13 0.19 0.12 0.11 0.1 0.14 1.0 0.13 0.12 0.13 0.11 0.16 0.15 0.16 0.13
0.05 0.1 0.14 0.01 0.06 0.08 0.01 0.0 0.02 0.04 0.03 0.04 0.01 0.1 0.06 0.03 0.05 0.11 0.03 0.02 0.03 0.05 1.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.04 0.01
0.0 0.03 0.1 0.05 0.0 0.13 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.06 0.06 0.09 0.09 0.02 0.0 0.0 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.05 0.1 0.1 0.04 0.1 0.14 0.03 0.02 0.05 0.08 0.04 0.04 0.06 0.13 0.1 0.05 0.07 0.27 0.05 0.02 0.04 0.06 1.0 0.02 0.02 0.1 0.03 0.04 0.05 0.03 0.02
0.1 0.19 0.15 0.09 0.19 0.19 0.06 0.05 0.07 0.07 0.07 0.08 0.07 0.19 0.16 0.11 0.07 0.15 0.07 0.07 0.08 0.11 1.0 0.08 0.08 0.12 0.06 0.07 0.09 0.17 0.08
0.04 0.13 0.05 0.03 0.12 0.08 0.03 0.01 0.07 0.08 0.04 0.06 0.05 0.17 0.2 0.08 0.05 0.16 0.09 0.04 0.06 0.04 1.0 0.03 0.04 0.05 0.04 0.06 0.05 0.07 0.04
Bra026515 (ALA10)
 0.04 0.09 0.1 0.02 0.14 0.12 0.03 0.02 0.05 0.05 0.03 0.04 0.02 0.15 0.13 0.05 0.04 0.18 0.06 0.04 0.02 0.04 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.05 0.05 0.03
0.11 0.12 0.14 0.13 0.23 0.19 0.07 0.07 0.09 0.1 0.07 0.1 0.1 0.15 0.16 0.1 0.09 0.16 0.08 0.08 0.09 0.09 1.0 0.09 0.09 0.12 0.08 0.07 0.1 0.12 0.08
Bra027252 (PFU1)
 0.1 0.07 0.12 0.06 0.18 0.19 0.05 0.04 0.08 0.09 0.1 0.09 0.06 0.14 0.23 0.09 0.09 0.11 0.08 0.08 0.05 0.13 1.0 0.18 0.13 0.11 0.15 0.18 0.2 0.21 0.16
0.07 0.1 0.14 0.06 0.17 0.17 0.06 0.04 0.09 0.09 0.08 0.09 0.06 0.2 0.25 0.09 0.09 0.21 0.09 0.07 0.06 0.08 1.0 0.06 0.06 0.04 0.04 0.08 0.08 0.1 0.04
Bra027700 (LACS3)
 0.07 0.15 0.18 0.02 0.21 0.14 0.03 0.02 0.04 0.05 0.02 0.03 0.03 0.06 0.1 0.05 0.06 0.14 0.05 0.03 0.01 0.04 1.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0
Bra028707 (WRKY26)
 0.03 0.09 0.18 0.03 0.13 0.1 0.02 0.01 0.06 0.06 0.04 0.07 0.01 0.09 0.08 0.04 0.03 0.06 0.04 0.04 0.03 0.08 1.0 0.06 0.02 0.02 0.03 0.05 0.08 0.08 0.02
Bra029278 (CXE20)
 0.03 0.03 0.03 0.01 0.14 0.13 0.03 0.01 0.03 0.03 0.01 0.03 0.02 0.09 0.08 0.03 0.02 0.12 0.04 0.01 0.01 0.04 1.0 0.03 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02
0.07 0.08 0.05 0.04 0.19 0.3 0.03 0.04 0.06 0.09 0.13 0.06 0.07 0.09 0.16 0.07 0.04 0.07 0.12 0.07 0.09 0.07 1.0 0.08 0.1 0.06 0.05 0.1 0.11 0.09 0.04
0.02 0.06 0.08 0.01 0.12 0.09 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.11 0.11 0.03 0.03 0.12 0.01 0.02 0.02 0.05 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02
Bra032174 (WRKY15)
 0.08 0.15 0.21 0.1 0.21 0.15 0.04 0.04 0.08 0.09 0.06 0.08 0.08 0.23 0.16 0.08 0.07 0.23 0.08 0.07 0.07 0.09 1.0 0.05 0.05 0.06 0.04 0.06 0.08 0.12 0.05
Bra035198 (PP2-B11)
 0.04 0.05 0.05 0.03 0.06 0.11 0.02 0.02 0.06 0.07 0.06 0.05 0.06 0.11 0.09 0.07 0.04 0.12 0.07 0.06 0.04 0.08 1.0 0.05 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01
Bra036563 (WRKY50)
 0.0 0.01 0.02 0.0 0.14 0.09 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.04 0.13 0.02 0.02 0.06 0.01 0.01 0.01 0.04 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.09 0.01 0.01 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra037811 (SUPA)
 0.01 0.03 0.04 0.02 0.04 0.07 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.11 0.11 0.02 0.02 0.11 0.03 0.03 0.01 0.03 1.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.05 0.01
0.0 0.04 0.15 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra038509 (NIC1)
 0.06 0.13 0.13 0.06 0.17 0.18 0.07 0.05 0.08 0.13 0.06 0.1 0.08 0.16 0.18 0.1 0.07 0.16 0.06 0.06 0.07 0.09 1.0 0.07 0.05 0.09 0.07 0.05 0.09 0.11 0.07
0.11 0.16 0.16 0.1 0.15 0.11 0.04 0.03 0.06 0.06 0.06 0.07 0.1 0.09 0.11 0.07 0.05 0.14 0.05 0.03 0.03 0.08 1.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02
Bra038824 (BIR1)
 0.06 0.12 0.15 0.05 0.22 0.24 0.06 0.04 0.06 0.07 0.05 0.08 0.04 0.17 0.2 0.12 0.11 0.18 0.1 0.06 0.08 0.12 1.0 0.08 0.06 0.14 0.06 0.09 0.11 0.14 0.04
Bra039027 (ALA10)
 0.01 0.09 0.15 0.01 0.11 0.1 0.02 0.01 0.05 0.0 0.03 0.02 0.02 0.05 0.1 0.05 0.02 0.12 0.06 0.03 0.04 0.07 1.0 0.03 0.02 0.02 0.02 0.04 0.02 0.02 0.01
0.16 0.21 0.18 0.09 0.17 0.17 0.06 0.07 0.06 0.08 0.04 0.05 0.06 0.12 0.1 0.05 0.07 0.08 0.08 0.05 0.05 0.08 1.0 0.03 0.04 0.02 0.03 0.05 0.05 0.05 0.04
Bra039706 (KMS1)
 0.19 0.25 0.25 0.17 0.31 0.29 0.16 0.15 0.17 0.17 0.17 0.17 0.16 0.27 0.31 0.2 0.16 0.21 0.18 0.14 0.12 0.18 1.0 0.15 0.15 0.13 0.15 0.15 0.16 0.17 0.13
Bra040557 (WRKY45)
 0.07 0.08 0.11 0.06 0.16 0.19 0.07 0.08 0.05 0.08 0.08 0.09 0.11 0.2 0.24 0.11 0.09 0.19 0.07 0.09 0.09 0.09 1.0 0.15 0.09 0.1 0.07 0.12 0.11 0.09 0.09
0.06 0.15 0.15 0.06 0.14 0.16 0.05 0.06 0.1 0.1 0.07 0.08 0.08 0.17 0.23 0.12 0.11 0.26 0.12 0.08 0.08 0.14 1.0 0.06 0.05 0.05 0.05 0.04 0.05 0.06 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)