Heatmap: Cluster_141 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 260 uE m-2 s-1	Light: 195 uE m-2 s-1	Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 65 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L18D6	Photoperiod: L13D11 (Control)	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C (Control)	Temperature: 25°C	Temperature: 30°C
Spov3_C0005.00106	-	-	-	-	-2.84	-1.46	-	-1.83	-	-	-	-	-2.78	-1.8	-	-1.75	-1.77	2.93	2.45	0.38	0.92	0.62	1.14	0.57	0.78	1.82	-0.16	-2.75	-	-1.32
Spov3_C0022.00004 (ARAF)	-0.32	-0.72	-0.15	-0.43	-0.49	-0.29	-0.04	0.17	0.4	-0.02	-0.42	-0.07	0.01	-1.09	0.07	0.05	0.07	-1.02	0.78	0.61	0.54	0.24	-0.08	0.53	0.67	0.11	0.15	-0.77	-0.09	-0.67
Spov3_C0035.00017	-0.32	-0.22	-0.06	-0.03	-0.14	-0.48	-0.41	-0.03	-0.38	-0.18	-0.19	-0.25	-0.01	-0.55	-0.16	-0.24	-0.17	0.55	0.36	0.29	0.39	0.23	0.88	0.21	0.23	0.08	0.24	-0.2	-0.45	-0.15
Spov3_C0045.00001 (PMP)	-0.12	-0.1	0.0	0.0	0.22	-0.13	-0.02	0.13	0.02	0.0	0.05	-0.04	0.05	-0.5	0.05	-0.07	0.02	0.05	0.06	-0.03	0.0	0.02	0.47	-0.25	-0.03	0.06	0.14	0.07	-0.13	-0.26
Spov3_C0048.00022	-0.19	-1.82	0.0	-1.84	-0.16	-	-1.84	-0.89	-3.07	-1.92	-	-2.0	-0.52	-0.38	-1.17	-1.44	-	2.07	0.83	-0.18	1.05	1.79	0.67	-1.45	0.88	1.86	0.03	-1.19	0.46	-2.06
Spov3_C0085.00003	-3.28	-3.29	-3.54	-4.63	-2.91	-0.66	-2.89	-3.24	-3.27	-2.76	-1.93	-1.91	-3.31	-2.17	-1.11	-1.61	-2.35	3.35	1.07	-0.4	0.89	0.81	0.74	-1.55	0.51	2.21	-0.09	-2.62	-2.03	-1.04
Spov3_C0475.00001 (NPH3)	0.2	0.18	-0.22	-0.25	-0.05	-0.8	-0.57	-0.59	-0.4	0.02	-0.41	-0.33	-0.2	0.57	-0.1	-0.18	0.29	0.78	0.13	0.19	0.29	0.36	-0.04	-0.07	0.1	0.57	-0.11	-0.61	-0.37	0.19
Spov3_C0857.00005	-0.79	-1.4	-0.45	-0.4	-1.69	-1.98	-1.7	-1.45	-0.01	0.23	-0.16	-0.43	0.04	-0.41	-0.41	-0.15	-0.63	0.75	0.99	0.74	0.82	0.23	0.91	0.72	0.17	0.62	0.88	-0.32	-0.66	-0.5
Spov3_chr1.00142	-0.16	-0.26	-0.13	-0.09	-0.1	-0.27	-0.06	-0.02	-0.23	-0.18	-0.09	-0.06	0.12	-0.3	-0.06	-0.2	-0.06	0.3	0.33	0.31	0.24	0.16	0.59	0.11	0.14	0.08	0.13	-0.27	-0.19	-0.31
Spov3_chr1.00237	0.04	0.07	-0.1	-0.02	0.22	-0.5	-0.39	-0.22	0.01	0.06	-0.01	-0.17	-0.41	-0.24	-0.13	-0.19	-0.1	0.37	0.18	0.1	-0.03	0.05	0.52	0.11	0.09	0.25	0.22	-0.04	-0.02	-0.24
Spov3_chr1.00300 (BGLU42)	0.42	0.17	0.12	-0.25	0.65	-0.17	-0.01	-0.26	-0.14	-0.03	-0.02	-0.13	0.03	-0.16	-0.35	-0.35	-0.46	-0.01	-0.1	-0.17	-0.09	-0.12	0.73	-0.17	0.16	0.01	0.1	0.29	0.05	-0.59
Spov3_chr1.00302 (VHA-H)	-0.17	-0.29	-0.07	-0.15	0.06	-0.05	0.18	0.18	0.07	-0.06	0.07	0.03	0.12	-0.65	0.04	-0.09	0.01	-0.21	0.07	0.16	0.1	0.12	0.15	-0.16	0.12	0.12	0.14	0.09	-0.17	-0.08
Spov3_chr1.00331 (mtACP2)	-0.24	-0.36	-0.16	0.13	-0.48	-0.49	-0.35	-0.03	-0.12	-0.15	0.11	-0.03	0.56	-0.4	0.27	0.21	0.36	0.03	-0.01	0.09	0.13	0.09	0.69	-0.08	0.1	0.02	0.13	-0.35	-0.36	-0.17
Spov3_chr1.00452	-0.11	-0.22	-0.08	0.06	0.07	-0.08	0.04	0.23	-0.12	-0.1	-0.03	-0.18	0.14	-0.23	-0.08	-0.09	-0.09	0.06	0.13	0.19	0.12	-0.01	0.59	-0.04	0.2	0.0	0.14	-0.2	-0.26	-0.44
Spov3_chr1.00798 (AVA-P3)	-0.29	-0.42	-0.12	0.01	-0.12	-0.19	0.07	0.22	-0.0	-0.11	0.15	-0.04	0.45	-0.69	0.25	0.23	0.3	-0.14	0.06	0.15	-0.01	0.07	0.36	-0.16	0.15	0.07	0.15	-0.25	-0.49	-0.34
Spov3_chr1.01010	-	-3.14	-4.45	-	-	-20.74	-4.45	-3.43	-	-	-2.19	-4.42	-	-	-	-	-1.75	3.07	1.21	-0.31	1.7	1.13	1.69	0.25	0.76	2.49	-1.62	-4.11	-3.48	-
Spov3_chr1.01128	-	-1.7	-1.02	-0.22	-	-2.15	-1.72	-2.02	-0.99	-1.83	-	-	-0.9	0.09	-	-1.75	-0.93	2.65	0.75	1.11	0.82	0.55	1.18	0.56	1.27	1.66	-0.12	-	-	-0.37
Spov3_chr1.01441 (PFD4)	-0.13	-0.12	-0.18	0.04	0.19	-0.21	-0.27	-0.01	-0.14	-0.06	-0.14	-0.05	-0.03	0.3	-0.05	-0.04	-0.04	0.41	-0.03	0.07	0.07	0.11	0.47	0.1	0.03	-0.06	0.05	-0.05	-0.26	-0.3
Spov3_chr1.02333	-1.1	-1.34	-1.38	-0.75	-0.78	-0.17	-0.59	-0.14	-1.01	-1.14	-0.28	-0.52	0.63	0.71	0.18	-0.54	-0.29	1.09	0.73	0.45	0.52	0.43	0.44	0.25	0.13	1.06	-0.26	-1.39	-0.61	0.37
Spov3_chr1.03146	-0.16	-0.21	-0.14	-0.0	0.35	-0.1	0.01	-0.01	-0.01	0.03	0.01	0.04	0.06	-0.22	-0.01	0.05	0.01	0.21	-0.01	0.12	0.0	-0.04	0.38	-0.15	0.1	0.14	0.17	-0.35	-0.25	-0.32
Spov3_chr1.03971 (GLI1)	0.08	-0.03	0.04	0.3	0.29	-0.27	-0.12	-0.45	0.04	0.1	-0.11	-0.27	-0.28	0.03	-0.03	-0.47	-0.32	0.09	0.06	-0.19	-0.18	-0.1	0.61	-0.01	0.23	0.05	0.02	0.41	0.16	-0.28
Spov3_chr1.04079	-0.12	-0.23	-0.04	0.1	-0.01	-0.19	-0.07	0.11	-0.04	-0.18	0.09	-0.04	0.24	-0.26	0.11	0.1	0.12	-0.16	0.11	0.16	0.07	0.17	0.29	-0.11	0.06	0.04	0.14	-0.06	-0.33	-0.38
Spov3_chr2.00041 (CRK23)	-	-0.7	-0.88	-1.41	0.51	-1.36	-0.99	-1.09	-1.25	-1.21	-2.73	-	-	-1.97	-0.97	-1.13	-2.8	2.38	1.43	0.08	0.43	1.31	1.39	-0.76	0.63	1.96	0.35	-2.67	-	-1.2
Spov3_chr2.00138 (VAB2)	-0.08	-0.15	-0.08	-0.06	-0.02	-0.19	-0.06	0.16	0.01	-0.04	0.07	0.0	0.06	-0.2	0.16	0.04	0.19	-0.25	0.06	0.1	0.11	0.11	0.27	-0.22	0.01	0.08	0.11	0.09	-0.27	-0.23
Spov3_chr2.00194 (IRP3)	0.1	0.0	-0.09	0.05	0.03	-0.47	-0.12	-0.11	-0.28	-0.16	-0.3	-0.23	0.19	-0.35	-0.18	-0.11	-0.02	0.24	0.15	-0.02	0.16	0.05	0.88	-0.14	0.2	0.04	0.16	-0.0	-0.18	-0.15
Spov3_chr2.00328	-0.08	-0.11	-0.12	0.01	0.21	-0.28	-0.16	0.04	-0.1	0.09	0.13	0.04	0.2	-0.1	-0.18	-0.1	0.03	0.14	0.08	0.0	0.03	-0.04	0.68	0.05	0.02	0.07	0.1	-0.18	-0.34	-0.57
Spov3_chr2.00331	-0.22	-0.25	-0.11	0.02	-0.08	-0.26	-0.09	0.01	0.01	-0.06	0.09	-0.01	0.23	-0.1	0.05	0.07	0.06	-0.02	0.13	0.09	0.11	0.11	0.24	0.08	0.13	0.08	0.12	0.01	-0.28	-0.38
Spov3_chr2.00801 (KUP8)	-0.91	1.02	-0.85	-	-	-	-1.96	-	-1.94	-0.95	-	-1.06	-1.94	-0.94	-	-	-	2.63	1.98	0.13	-0.38	1.77	1.54	-1.11	-0.49	1.45	-1.86	-0.27	-1.94	0.02
Spov3_chr2.00894	-0.4	0.07	-0.69	-0.35	-0.18	-0.35	-0.74	-0.5	-0.29	-1.0	0.27	-0.64	-0.15	-0.22	-0.2	-0.73	-0.62	1.55	0.76	-0.31	0.34	1.0	0.75	-0.01	0.05	0.75	-0.28	-0.59	-0.6	-0.9
Spov3_chr2.01233	0.1	-0.03	0.05	0.01	0.44	-0.21	-0.1	-0.05	-0.0	0.1	-0.04	-0.21	-0.06	-0.38	-0.11	-0.18	-0.13	0.33	0.07	-0.01	-0.03	0.0	0.3	-0.09	0.12	0.11	0.19	0.03	-0.14	-0.43
Spov3_chr2.01337	-0.06	-0.11	0.04	0.02	0.08	-0.16	-0.17	-0.04	-0.06	-0.11	-0.14	-0.25	-0.14	-0.28	-0.11	-0.09	-0.07	0.43	0.18	0.14	0.18	0.0	0.42	0.1	0.15	0.27	0.18	-0.24	-0.15	-0.41
Spov3_chr2.01388	0.01	-0.08	0.01	0.17	-0.05	-0.22	-0.02	0.07	-0.05	-0.02	0.06	-0.01	0.17	-0.4	0.09	0.08	0.11	-0.16	-0.01	0.06	0.03	0.08	0.27	-0.09	0.05	0.05	0.14	0.03	-0.18	-0.36
Spov3_chr2.01682 (BTL04)	-0.35	-0.12	-0.23	-0.04	-0.27	-0.42	0.09	-0.18	-0.08	-0.16	-0.15	0.03	0.18	0.31	-0.2	-0.06	-0.15	0.2	0.44	0.44	0.33	0.14	0.14	0.23	0.15	0.29	0.23	-0.41	-0.6	-0.57
Spov3_chr2.01912	-0.08	-0.27	-0.24	-0.21	-0.27	-0.02	0.19	0.19	-0.01	-0.14	0.08	0.1	0.32	-0.32	0.01	0.17	0.12	-0.26	0.14	0.21	0.12	0.12	0.26	-0.04	0.23	0.03	0.17	0.06	-0.63	-0.52
Spov3_chr2.02324	0.13	0.08	0.1	0.11	0.35	-0.08	0.0	-0.02	-0.22	-0.06	-0.13	-0.14	0.08	-0.12	-0.29	-0.19	-0.16	0.24	-0.05	-0.02	-0.02	0.05	0.34	-0.02	0.03	-0.09	0.02	0.08	-0.01	-0.28
Spov3_chr2.02710	0.09	0.2	0.05	-0.06	0.47	-0.43	-0.5	-0.29	-0.13	0.12	-0.2	-0.11	-0.69	0.02	-0.48	-0.36	-0.38	0.29	0.13	0.04	0.1	0.06	0.67	0.11	0.15	0.16	0.05	0.22	0.09	-0.3
Spov3_chr2.03043 (CSN6A)	-0.11	-0.17	0.02	0.12	0.03	-0.2	-0.15	0.07	-0.12	-0.17	-0.04	-0.06	0.2	-0.31	0.32	0.24	0.22	-0.14	0.01	0.0	0.07	0.0	0.32	-0.18	-0.03	0.07	0.11	0.04	-0.29	-0.15
Spov3_chr2.03975 (ATDAD1)	-0.25	-0.16	-0.13	0.07	-0.03	-0.36	-0.12	0.23	-0.08	-0.08	-0.03	-0.27	0.06	-0.63	-0.09	0.05	0.08	0.41	0.22	0.08	0.24	0.1	0.51	-0.29	0.17	0.22	0.2	-0.32	-0.34	-0.08
Spov3_chr2.04184 (CHR25)	-1.59	-1.42	-2.78	-2.57	-2.96	-1.01	-2.92	-2.44	-1.17	-0.8	-0.78	-0.88	-0.42	-0.05	-0.75	-0.79	-0.94	2.42	1.26	-0.07	0.94	0.39	0.9	0.56	0.02	0.92	-0.44	-2.61	0.38	1.07
Spov3_chr2.04843	-0.39	-0.27	-0.06	0.08	-0.04	-0.64	-0.24	0.34	-0.4	-0.3	-0.12	-0.26	0.28	-1.26	-0.2	-0.5	-0.34	0.58	0.45	0.3	0.15	0.25	0.87	-0.07	0.23	0.2	0.34	-0.26	-0.36	-0.07
Spov3_chr2.05355 (CASP)	-0.57	-0.76	-0.46	-0.18	0.6	-1.14	-0.14	0.32	-1.67	-1.26	-0.86	-0.8	-0.38	-1.24	-2.14	-0.43	-1.12	1.54	0.91	-0.1	0.09	0.98	1.72	-0.65	0.01	0.97	0.7	-1.56	-1.0	-1.34
Spov3_chr3.00268 (PUM11)	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.67	0.56	0.41	-0.31	2.38	-0.74	-0.05	1.03	2.0	-0.24	-	-	-
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Spov3_chr6.00690 (DSS1(V))	-0.01	0.02	-0.04	0.1	0.13	-0.27	-0.21	0.14	-0.33	-0.13	-0.11	-0.27	-0.08	-0.17	-0.27	-0.25	-0.06	0.35	0.08	0.01	0.14	0.01	0.58	0.16	0.08	0.04	0.11	0.15	-0.17	-0.14
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Spov3_chr6.00978 (MHP1)	0.15	0.14	-0.21	-0.3	0.49	0.0	-0.03	-0.02	-0.01	-0.06	-0.22	-0.08	-0.14	0.11	-0.36	-0.12	-0.2	0.05	-0.05	-0.08	-0.05	-0.1	0.61	0.14	0.04	0.11	0.02	0.07	0.01	-0.37
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Spov3_chr6.01262	-0.02	-0.2	-0.15	0.11	0.18	-0.36	-0.23	-0.18	0.15	0.29	0.14	0.12	0.06	-0.45	-0.33	-0.26	-0.26	0.4	0.05	0.07	0.03	0.01	0.15	-0.02	0.25	0.12	0.25	0.17	-0.13	-0.46
Spov3_chr6.01632	-0.12	-0.05	-0.03	-0.04	0.04	-0.23	-0.16	-0.05	-0.31	-0.37	-0.34	-0.21	0.1	-0.08	0.09	-0.07	0.07	0.35	0.22	0.19	0.15	0.09	0.43	0.15	0.18	0.0	0.08	-0.02	-0.16	-0.29
Spov3_chr6.02691 (MPC3)	-0.34	-0.39	-0.18	0.02	-0.03	-0.31	-0.16	-0.07	-0.03	-0.07	0.13	-0.12	0.24	-0.94	0.0	0.09	0.01	0.01	0.28	0.35	0.3	0.21	0.61	-0.08	0.24	0.29	0.31	-0.2	-0.53	-0.67
Spov3_chr6.02705 (PMM)	0.04	-0.23	0.12	0.15	0.41	-0.1	0.1	-0.08	0.06	0.02	0.04	-0.16	0.03	-0.98	-0.15	-0.32	-0.13	-0.23	0.22	0.22	0.15	0.19	0.33	-0.26	0.15	0.07	0.2	-0.09	-0.12	-0.29
Spov3_S02.00020	-0.09	-0.14	0.04	0.22	-0.04	-0.24	-0.1	0.08	-0.33	-0.38	-0.22	-0.3	0.03	-0.43	-0.12	-0.19	-0.12	0.29	0.18	0.19	0.19	0.11	0.94	0.09	0.13	0.06	0.24	-0.17	-0.3	-0.45
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Spov3_S06.00051	-0.34	-0.24	-0.09	0.53	-0.16	-0.48	-0.59	0.2	-0.51	-0.12	-0.02	-0.09	0.36	-0.73	-0.2	-0.09	0.46	0.34	-0.04	-0.07	0.55	-0.04	0.23	0.16	0.15	0.18	0.12	-0.15	-0.48	0.1
Spov3_S12.00005 (CHLI2)	-0.49	-0.44	-0.34	0.04	-0.5	-0.5	-0.4	-0.17	-0.12	0.05	0.17	0.07	0.48	-0.62	0.01	0.08	0.12	0.57	0.17	0.11	0.21	-0.07	0.65	-0.01	0.3	0.19	0.23	-0.26	-0.4	-0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.