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Heatmap: Cluster_58 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.23 0.25 0.26 0.37 0.13 -0.98 -0.4 0.11 0.04 0.37 0.02 -0.21 0.07 -0.77 -0.45 -0.38 -0.15 -0.32 -0.02 -0.34 0.01 -0.01 0.12 -0.02 0.19 0.09 0.39 0.38 0.3 -0.4
0.24 0.31 -0.61 -0.9 0.9 -0.82 -0.61 -0.82 -0.2 0.59 -0.12 -0.11 0.06 -0.34 -0.71 -0.41 -0.74 0.19 -0.22 -0.62 -0.16 -0.25 0.74 0.32 0.19 -0.12 0.12 0.85 0.8 -0.48
0.17 0.06 0.09 0.06 0.45 -0.63 -0.49 0.14 -0.09 0.19 -0.02 -0.15 0.02 -0.3 -0.31 -0.15 0.07 -0.14 -0.14 -0.28 -0.03 -0.12 0.09 -0.01 0.13 0.1 0.21 0.46 0.22 -0.19
0.5 0.02 0.35 0.65 0.28 -1.22 -0.99 -0.04 0.19 0.26 0.17 -0.08 0.18 -1.65 -0.6 -0.5 -0.34 -0.07 0.01 -0.27 -0.07 -0.14 0.2 -0.14 0.19 0.04 0.33 0.57 0.03 -0.05
-0.27 -0.11 -0.12 0.23 0.02 -0.79 -0.27 0.23 -0.3 0.07 -0.2 -0.47 0.35 -0.65 -0.4 -0.19 -0.33 0.66 -0.11 -0.08 -0.07 -0.1 0.75 0.04 0.3 0.11 0.32 0.13 0.14 -0.06
0.06 0.08 0.03 0.12 0.17 -0.2 0.02 0.09 -0.16 -0.13 -0.09 -0.13 -0.0 -0.24 0.07 -0.01 0.25 -0.16 -0.02 0.14 0.13 0.05 -0.36 -0.15 -0.04 0.09 0.22 0.01 -0.03 0.03
0.23 0.15 0.09 0.35 0.61 -0.74 -0.39 -0.25 0.01 0.45 -0.09 -0.42 0.08 -0.37 -0.59 -0.41 -0.35 -0.61 -0.18 -0.47 -0.14 -0.14 0.51 -0.06 0.15 0.08 0.22 0.62 0.27 0.03
0.15 0.08 -0.09 0.17 0.42 -0.57 -0.24 0.09 -0.62 0.26 -0.31 -0.51 0.42 -0.33 -0.38 -0.5 -0.56 0.23 -0.31 -0.34 -0.01 -0.22 0.42 0.04 -0.01 -0.09 0.31 0.73 0.18 0.33
0.15 0.25 0.04 -0.15 0.73 -0.66 -0.62 -0.37 -0.33 0.44 0.03 -0.03 -0.43 -0.05 -0.68 -0.2 -0.02 -0.43 0.24 -0.38 -0.13 0.0 0.36 0.29 0.09 -0.1 0.05 0.66 0.25 -0.32
0.33 0.35 -0.07 -0.07 0.83 -0.77 -0.35 -0.29 -0.3 0.33 -0.27 -0.43 0.14 -0.15 -0.51 0.13 -0.57 -0.18 -0.15 -0.56 -0.23 -0.21 0.29 0.05 0.21 0.19 0.17 0.62 -0.04 0.16
0.14 -0.03 0.17 -0.28 0.17 -0.33 -0.45 -0.2 -0.55 -0.39 -0.44 -0.68 0.29 0.33 0.22 -0.11 -0.13 0.74 -0.15 -0.2 -0.07 -0.39 0.92 -0.42 0.07 0.02 0.11 0.19 -0.69 0.54
-0.25 -0.21 -0.15 0.26 0.76 -0.22 -0.43 -0.08 -0.47 0.16 -0.19 -0.43 0.52 -0.27 -0.4 -0.23 -0.21 0.23 0.01 -0.38 -0.08 -0.16 0.17 0.11 0.06 0.08 0.39 0.4 -0.1 0.13
0.12 0.44 0.19 0.38 0.07 -2.17 -1.56 -0.7 -0.36 0.7 0.0 -0.39 0.52 -1.73 -1.25 -0.84 -0.71 0.07 -0.02 -0.7 -0.06 -0.02 0.87 0.23 0.42 0.04 0.31 1.2 0.32 -0.68
0.05 0.15 0.27 0.7 0.16 -0.7 -0.61 -0.47 -0.31 0.15 -0.17 -0.49 0.58 -0.27 -0.3 -0.56 -0.39 0.28 -0.14 -0.37 0.03 -0.06 0.43 -0.08 0.06 0.0 0.42 0.43 0.1 -0.25
0.45 0.34 0.19 0.71 -0.41 -0.86 -0.63 -0.06 -0.25 0.09 -0.25 -0.31 0.56 -0.73 -0.39 -0.2 -0.09 0.6 -0.24 -0.42 0.09 0.03 0.55 0.18 -0.08 -0.04 -0.06 -0.01 0.11 -0.44
0.73 0.93 0.62 0.59 0.41 -2.44 -1.47 -0.27 -0.44 0.26 -0.06 -0.67 -0.23 -0.8 -1.35 -0.9 -0.81 -0.7 -0.21 -0.57 -0.19 -0.03 -0.01 -0.1 0.53 -0.23 -0.0 1.19 0.66 0.2
-0.07 0.15 -0.01 0.14 0.19 -0.34 -0.46 -0.27 -0.2 0.18 -0.44 -0.44 0.58 0.49 -0.49 -0.43 -0.76 0.5 0.04 -0.3 0.0 -0.11 0.56 -0.06 0.01 -0.08 0.23 0.45 -0.06 -0.21
0.12 0.31 0.35 0.76 -0.16 -2.04 -1.18 -0.23 -0.43 0.24 0.01 -0.23 0.42 -0.86 -0.7 -0.55 -0.41 -0.66 -0.02 -0.46 -0.18 -0.12 0.55 0.43 0.62 -0.09 0.41 0.82 0.29 -0.32
-0.1 0.01 -0.37 0.07 0.52 -0.7 -0.36 0.01 -0.19 0.3 -0.36 -0.29 0.6 -0.8 -0.47 -0.51 -0.29 0.15 -0.48 -0.11 0.09 0.23 0.53 -0.45 -0.08 0.29 0.23 0.49 0.35 0.22
0.01 0.11 0.01 0.26 0.15 -0.38 -0.18 0.16 -0.0 0.1 0.1 -0.0 0.14 -0.3 -0.06 -0.15 -0.13 -0.11 -0.18 -0.17 -0.15 -0.08 0.21 -0.05 -0.08 0.05 0.15 0.39 0.03 -0.15
0.37 0.25 0.03 0.28 -0.06 -0.2 -0.15 -0.12 -0.02 0.02 -0.1 -0.11 -0.01 -0.22 -0.16 -0.05 -0.09 0.31 -0.06 -0.12 -0.01 -0.02 0.03 -0.01 -0.03 -0.12 -0.11 0.29 0.18 -0.28
0.01 0.32 0.11 0.85 0.08 -0.28 -0.73 -0.23 -0.41 -0.11 -0.28 -0.25 0.3 -0.31 -0.23 -0.03 0.07 0.35 -0.18 -0.38 0.08 -0.12 0.11 -0.08 -0.06 0.16 0.2 0.28 0.07 -0.24
0.23 0.11 -0.14 -0.04 0.83 -0.77 -0.49 -0.38 0.0 0.57 -0.12 -0.37 0.13 -0.12 -0.71 -0.24 -0.36 -0.41 -0.23 -0.56 -0.1 -0.15 0.48 0.21 0.2 0.06 0.27 0.54 0.13 -0.03
0.26 0.41 0.23 -0.0 0.5 -0.12 -0.32 -0.22 -0.1 0.15 -0.32 -0.32 0.01 -0.49 -0.42 -0.56 -0.31 -0.02 -0.07 -0.43 -0.09 -0.03 0.24 0.13 -0.05 -0.06 0.19 0.62 0.44 -0.17
0.34 0.28 0.16 0.15 0.54 -0.72 -0.52 -0.42 -0.04 0.22 -0.17 -0.36 -0.06 -0.03 -0.45 -0.33 -0.13 -0.11 -0.24 -0.43 -0.06 -0.13 0.25 0.05 0.08 -0.04 0.0 0.61 0.21 0.34
0.19 0.12 0.18 -0.03 -0.05 -0.41 -0.18 -0.15 0.11 0.35 -0.01 0.04 0.12 -0.38 -0.49 -0.37 -0.32 0.04 0.08 0.14 0.13 0.28 -0.18 0.02 0.04 -0.01 0.15 0.11 0.28 -0.3
-0.33 -0.35 -0.45 -0.62 0.73 -0.55 -0.28 0.31 -0.41 0.54 0.32 0.06 0.43 -0.79 -1.0 -0.69 -0.2 0.36 0.19 -0.26 -0.26 0.17 -0.18 0.36 0.19 -0.18 0.53 0.54 0.37 -0.66
-0.01 0.2 -0.01 0.14 0.47 -0.22 -0.4 0.07 -0.15 0.24 0.12 -0.05 -0.13 -0.57 -0.17 -0.11 0.12 -0.26 -0.17 -0.24 0.18 0.04 -0.47 -0.23 0.08 0.14 0.09 0.52 0.09 0.1
0.38 0.11 -0.17 -0.25 0.84 -0.51 -0.36 -0.29 -0.31 0.21 -0.41 -0.86 0.12 -0.06 -0.41 -0.41 -0.43 0.7 -0.13 -0.58 -0.0 -0.12 0.02 -0.07 0.05 0.02 0.29 0.25 0.26 0.58
0.07 0.23 0.16 0.08 0.65 -0.38 -0.34 -0.1 0.12 0.31 -0.01 0.0 0.1 -0.51 -0.55 -0.58 -0.51 0.07 -0.04 -0.09 -0.13 -0.15 -0.26 0.01 0.15 -0.04 0.1 0.54 0.36 -0.2
0.15 0.13 0.31 0.56 0.4 -0.49 -0.58 0.05 0.1 0.26 0.02 -0.0 -0.01 -0.8 -0.26 -0.58 -0.23 0.04 -0.18 -0.3 -0.11 -0.77 -0.21 -0.05 0.08 -0.05 0.13 0.49 0.37 0.34
-0.02 0.1 0.13 0.45 0.04 -0.4 -0.24 0.24 -0.15 -0.04 -0.14 -0.12 0.12 -0.26 0.01 -0.05 0.06 0.02 -0.11 -0.14 -0.03 -0.01 0.49 -0.07 0.16 -0.09 -0.05 0.27 -0.21 -0.42
-0.06 -0.06 0.12 0.58 -0.2 -0.47 -0.14 0.36 0.2 0.22 0.17 0.33 0.03 -1.38 -0.77 -0.48 -0.27 -0.45 0.06 -0.03 0.16 0.04 -0.56 -0.22 0.17 0.12 0.25 0.42 0.31 0.11
0.41 0.8 0.59 0.52 -0.25 -3.13 -2.02 -0.42 -0.78 0.5 -0.1 -0.5 0.02 -0.81 -1.19 -0.89 -0.52 -0.56 0.1 -0.6 0.2 0.24 0.7 0.33 0.63 -0.15 0.25 1.12 0.13 -0.7
0.25 0.19 -0.02 0.23 1.0 -0.37 -0.09 -0.28 -0.01 0.35 -0.24 -0.39 -0.03 -0.17 -0.5 -0.26 -0.2 -0.66 -0.38 -0.51 -0.22 -0.34 0.29 -0.05 -0.05 0.12 -0.06 0.54 0.3 0.25
Spov3_chr1.03554 (MAP65-2)
 0.37 0.32 0.15 0.28 0.1 -0.42 -0.25 0.06 -0.21 0.05 -0.14 -0.19 0.12 -0.17 -0.16 -0.18 -0.03 0.2 -0.25 -0.37 -0.1 -0.12 0.03 -0.18 0.05 0.01 0.2 0.37 0.15 -0.13
0.38 0.28 0.18 0.25 0.42 -0.46 -0.31 0.12 -0.06 0.2 0.01 0.08 -0.1 -0.5 -0.45 -0.37 -0.41 -0.15 -0.03 -0.1 0.01 -0.02 -0.54 -0.09 -0.05 0.1 0.1 0.12 0.5 0.15
-0.12 -0.09 0.02 -0.03 0.43 -0.17 0.07 0.24 0.15 0.35 0.16 0.11 -0.46 -0.37 -0.47 -0.24 -0.15 -0.53 -0.03 -0.3 0.08 0.03 -0.52 0.17 0.23 0.18 0.26 0.44 0.35 -0.7
0.11 0.15 0.25 0.49 0.19 -0.42 -0.31 -0.26 -0.2 0.09 -0.11 -0.41 0.17 0.35 -0.25 -0.11 -0.12 0.43 0.05 -0.39 -0.17 0.04 -0.15 -0.25 0.05 0.0 0.16 0.32 0.04 -0.42
-0.12 0.07 0.36 0.55 0.52 -0.76 -0.7 0.38 0.06 0.51 -0.09 -0.07 -0.08 -1.03 -0.6 -0.53 -0.29 -0.47 -0.18 -0.43 0.02 0.04 0.0 -0.13 0.08 0.04 0.27 0.67 0.49 -0.32
0.0 -0.02 0.17 0.2 0.39 -0.63 -0.13 0.09 0.03 0.3 0.06 -0.0 -0.18 -0.63 -0.41 -0.4 -0.18 -0.34 0.07 -0.14 0.03 0.04 -0.28 0.15 0.22 0.06 0.21 0.52 0.35 -0.35
0.43 0.64 0.3 0.31 0.54 -0.9 -0.71 -0.3 -0.27 0.33 -0.01 -0.23 -0.18 -0.37 -0.62 -0.61 -0.29 -0.35 -0.06 -0.63 0.06 -0.19 -0.11 -0.01 0.08 0.04 0.11 0.84 0.46 -0.1
Spov3_chr1.04490 (ROPGEF1)
 0.22 0.09 -0.07 -0.04 0.52 -0.28 -0.34 0.09 -0.15 0.15 -0.13 -0.13 0.3 -0.66 -0.27 -0.31 -0.24 -0.07 -0.24 -0.36 -0.14 -0.13 0.33 0.13 -0.0 -0.01 0.03 0.61 0.4 -0.1
0.14 0.03 0.17 0.4 0.04 -0.97 -0.81 -0.03 0.25 0.4 0.11 0.03 0.16 -1.64 -0.66 -0.35 -0.1 0.04 -0.04 -0.37 0.05 -0.14 0.04 0.01 0.23 0.24 0.39 0.68 0.3 -0.49
0.16 0.22 -0.11 0.98 0.06 -0.83 -0.83 -0.26 -0.53 0.16 -0.3 -0.39 0.83 -1.42 -1.04 -0.75 -0.69 0.45 -0.41 -0.96 -0.13 0.39 0.35 -0.22 0.35 -0.11 0.6 0.71 0.23 0.1
-0.12 0.32 0.09 0.09 0.46 -0.53 -0.8 -0.14 0.26 0.61 -0.06 -0.1 0.0 -0.51 -0.66 -0.32 -0.35 0.68 -0.24 -0.62 0.17 -0.17 -0.02 -0.4 -0.17 0.09 0.26 0.63 0.26 -0.22
-1.34 -0.45 0.05 -0.25 1.03 0.1 -0.27 -1.67 0.17 0.99 0.54 -1.1 0.54 -1.62 -0.96 -1.96 -0.63 0.42 0.71 -0.41 0.23 -0.0 -0.77 -0.04 -0.12 -0.44 0.92 1.37 -0.76 -1.63
0.32 0.37 0.45 0.67 0.74 -1.52 -1.18 -1.29 -0.46 0.04 0.02 -0.27 0.54 -1.06 -1.28 -0.68 -1.08 0.42 -0.15 -1.09 -0.21 -0.18 0.74 -0.16 0.16 -0.09 0.32 1.26 0.27 -0.59
0.28 0.41 -0.31 -0.26 0.64 -0.14 -0.13 -0.33 -0.26 0.2 -0.15 -0.44 -0.36 0.12 -0.51 -0.34 -0.34 -0.28 -0.23 -0.69 -0.1 0.01 0.24 0.16 0.01 0.05 0.19 0.66 0.31 0.41
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0.33 0.18 -0.07 -0.05 0.74 -0.78 -0.47 -0.18 -0.17 0.51 -0.14 -0.55 -0.04 0.13 -0.77 -0.43 -0.45 -0.17 -0.22 -0.44 -0.17 -0.15 0.2 0.15 0.04 0.1 0.18 0.58 0.23 0.46
0.23 0.31 0.06 -0.1 0.38 -0.18 -0.12 0.04 -0.02 0.3 -0.05 0.01 0.12 -0.37 -0.29 -0.33 -0.33 -0.43 -0.04 -0.15 -0.16 -0.15 0.31 -0.07 0.15 -0.0 -0.02 0.52 0.19 -0.45
-0.18 -0.14 -0.36 0.21 0.58 -0.25 -0.55 -0.31 -0.24 0.23 -0.32 -0.04 0.66 0.11 -0.25 -0.11 -0.09 0.39 -0.07 -0.48 -0.07 -0.27 0.24 0.03 0.09 0.05 0.28 0.26 -0.03 -0.26
0.2 0.21 0.18 0.67 0.09 -0.24 -0.47 0.13 -0.16 0.09 -0.16 -0.18 0.28 -0.13 -0.36 -0.17 -0.02 0.35 -0.39 -0.44 -0.08 -0.09 -0.01 -0.42 -0.11 -0.0 0.17 0.32 0.11 -0.1
0.17 0.21 0.02 0.12 0.31 -0.4 -0.24 0.02 -0.05 0.05 -0.02 0.01 0.04 -0.57 0.03 -0.05 0.06 -0.14 0.05 -0.11 -0.06 -0.03 -0.05 0.09 0.08 0.01 0.07 0.21 -0.02 -0.09
0.15 0.53 -0.03 0.1 0.31 -1.19 -1.01 -0.19 -0.5 0.13 -0.19 -0.44 0.43 -0.27 -0.5 -0.42 -0.1 0.32 0.07 -0.19 0.18 -0.02 0.39 0.12 0.16 0.16 0.29 0.08 0.08 0.13
Spov3_S14.00048 (CSLC12)
 0.35 0.13 0.03 0.22 0.22 -0.69 -0.44 -0.11 -0.16 0.08 0.02 -0.24 0.06 0.17 -0.08 -0.2 -0.05 0.23 -0.11 -0.28 -0.17 -0.1 0.25 -0.06 0.02 -0.11 -0.03 0.44 0.08 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.