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Heatmap: Cluster_127 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.05 0.06 0.02 -0.48 -0.13 0.4 0.17 -0.81 -0.29 0.1 0.13 -0.29 0.2 -0.11 0.23 0.56 0.67 -1.63 -0.11 -0.46 -0.23 0.13 -0.51 0.07 -0.42 0.32 0.14 0.65 -0.22 -0.06
1.19 0.44 -0.05 -0.32 -0.85 -0.16 0.15 -0.8 0.36 0.21 0.32 0.42 -0.63 -1.55 -0.23 -0.03 -0.3 -2.32 0.25 0.33 0.48 0.25 -2.21 0.32 -0.19 0.34 -0.11 0.45 -0.04 -0.49
0.77 0.33 0.01 -0.11 0.6 0.34 0.22 -1.17 -0.05 -0.18 0.01 0.04 -0.83 -0.75 0.01 0.02 -0.24 -0.87 0.08 -0.04 0.11 -0.08 -0.59 0.12 -0.09 0.3 0.21 0.35 0.05 -0.3
0.26 0.09 -0.36 -0.32 0.34 0.09 0.13 -0.21 -0.26 -0.16 0.04 -0.12 0.23 -0.02 0.11 0.04 0.17 -0.66 -0.13 -0.01 0.12 0.02 -0.1 0.12 0.04 0.05 0.08 0.11 -0.07 -0.04
1.24 0.69 1.74 1.19 -0.17 -0.35 -0.48 -0.93 0.47 0.18 -1.93 -1.09 -1.26 -0.2 0.37 -1.01 -1.97 -2.26 -0.28 - -1.19 -1.3 -2.32 -2.19 -0.48 -3.13 -0.84 1.49 0.77 1.43
0.45 0.27 -0.1 -0.43 0.47 0.28 0.07 -0.35 -0.15 0.23 -0.18 0.01 -0.72 -0.57 -0.06 -0.08 0.24 -1.33 0.01 -0.08 0.04 -0.28 -1.18 0.34 0.18 0.2 -0.11 0.44 0.53 0.09
-0.19 0.77 -0.74 -1.41 0.44 0.72 -0.21 -0.58 -0.94 0.25 -0.65 -0.39 0.24 1.37 0.01 0.19 0.0 0.02 -0.29 -0.29 0.07 -0.06 -0.74 0.12 -0.51 0.2 -0.05 -0.36 -0.77 0.42
-0.09 0.22 -0.03 0.49 0.11 -0.74 -0.4 0.06 -0.3 -0.11 0.05 -0.38 0.21 -0.14 0.04 -0.08 0.36 -0.14 0.07 0.02 0.13 0.07 0.08 -0.05 -0.03 0.22 0.19 -0.13 -0.35 0.06
1.4 1.15 0.91 -1.53 0.72 -0.05 -0.86 -1.83 -0.48 -0.48 -1.83 -1.33 -1.12 -0.15 -1.21 -0.92 -1.0 1.05 -0.86 -1.94 -1.22 -0.8 -0.52 0.87 0.51 -0.07 -1.1 1.35 0.65 0.24
2.5 1.82 - - 0.98 - -0.13 - 1.58 0.59 - - - - - - - 2.2 - - 0.03 - - -0.03 1.44 - - 1.23 0.28 -0.86
1.49 1.2 -0.0 -1.08 1.16 0.14 -0.81 -0.97 -0.43 0.45 -0.88 -3.72 0.87 -2.15 -0.24 -2.61 -1.03 0.22 -0.62 -0.18 0.62 -1.3 -1.67 1.04 -0.36 -0.76 -2.56 0.94 0.68 -0.62
0.44 0.26 -0.17 -0.57 0.95 0.5 -0.04 -1.92 -0.18 -0.02 0.02 0.17 -0.67 -0.62 -0.03 0.05 0.08 -2.61 0.24 -0.08 0.18 0.09 -0.65 0.37 0.21 0.18 0.11 0.37 0.04 -0.24
0.29 0.02 -0.45 -1.21 0.99 0.14 0.25 -0.62 -0.15 0.01 0.09 -0.11 0.19 -0.69 0.35 -0.08 0.08 -1.98 -0.12 0.0 0.01 -0.07 -0.52 0.38 0.15 0.21 0.15 -0.2 0.51 -0.11
1.01 1.44 0.67 0.68 -0.74 -1.16 -0.58 -0.41 -1.36 -1.05 -0.65 -1.31 0.78 -0.23 0.03 0.04 -0.04 0.57 -0.13 -0.0 0.4 0.52 0.01 -0.47 0.02 -0.38 -0.2 -0.77 -1.09 -0.92
-0.38 0.2 -1.08 -1.77 0.54 0.33 -0.18 -0.55 -0.76 0.02 -0.22 -0.02 -0.66 1.26 -0.39 0.22 0.13 -0.17 0.16 -0.07 0.32 0.18 -0.62 0.27 -0.04 0.41 0.2 -0.04 -0.13 0.0
0.34 0.15 -0.01 -0.12 0.21 0.02 0.17 -0.1 -0.01 -0.08 -0.11 -0.12 0.01 0.05 0.13 0.04 -0.19 -0.43 -0.06 -0.21 -0.02 -0.08 0.1 0.0 0.11 -0.04 0.03 0.06 0.12 -0.15
-0.23 0.11 -0.71 -2.29 0.54 1.68 0.33 -0.97 -0.7 0.27 -0.36 -0.11 -0.07 -0.27 -0.29 0.11 -0.35 1.1 0.13 -0.02 0.49 0.11 -2.39 -0.92 -1.37 0.7 0.2 -0.49 -1.17 0.15
2.54 2.45 0.58 -1.78 1.68 -0.84 -2.11 -2.66 -1.63 -1.83 -3.73 -2.22 - 1.41 -1.69 -1.84 -2.13 -1.75 - -3.65 -4.68 -0.72 0.48 -0.94 -3.66 -1.25 -1.73 1.16 0.28 0.24
0.92 0.84 0.59 -1.52 -0.18 -0.61 0.38 -1.02 0.09 -0.14 -0.5 0.37 -2.45 -2.89 -1.46 -0.39 -0.5 -3.09 0.09 -0.6 0.4 0.52 -0.45 0.1 0.45 0.79 0.59 1.22 -0.15 -0.35
0.15 -0.14 -0.07 0.17 0.42 0.36 0.38 -1.14 0.26 0.13 0.17 0.23 -0.79 -0.24 0.23 0.09 0.06 -1.46 0.07 0.05 0.48 0.22 -0.1 0.22 -0.45 0.07 0.04 -0.4 -0.18 -0.56
0.06 -0.04 -0.13 -0.38 0.1 0.26 0.23 -0.1 -0.13 -0.19 -0.02 0.06 -0.24 -0.1 0.09 -0.0 0.09 0.4 -0.09 -0.02 0.01 0.03 -0.12 0.11 -0.07 0.02 -0.09 -0.08 -0.0 0.12
0.44 0.33 0.2 -0.31 0.42 -0.05 -0.03 -0.72 -0.12 0.04 -0.22 -0.3 -0.18 -0.02 0.19 0.21 0.17 -0.71 0.24 0.09 0.11 0.14 0.07 0.14 -0.01 -0.01 -0.06 -0.08 -0.14 -0.64
0.28 0.15 -0.04 0.16 0.08 -0.15 -0.12 -0.08 -0.11 -0.0 -0.03 -0.05 0.16 -0.02 -0.09 0.07 0.02 -0.46 -0.24 -0.34 -0.09 -0.22 -0.04 -0.11 0.07 0.08 0.13 0.25 0.23 0.21
0.68 0.58 0.3 -0.1 0.31 -0.49 -0.19 -0.49 0.15 0.16 -0.21 -0.09 -0.06 -0.53 -0.45 -0.19 -0.27 -0.14 -0.19 -0.34 -0.11 -0.07 -0.58 -0.39 -0.11 0.03 0.17 0.47 0.24 0.64
-0.04 -0.08 -0.08 -0.07 0.2 -0.02 -0.06 0.2 0.06 0.16 0.05 0.06 -0.08 -0.07 -0.02 -0.01 0.05 -0.79 -0.07 -0.05 0.08 -0.02 -0.03 0.11 -0.01 0.12 0.1 0.24 0.09 -0.37
0.28 0.36 0.12 0.06 0.04 -0.1 -0.2 -0.59 -0.17 0.05 -0.18 -0.22 -0.5 -0.02 0.14 0.15 0.14 -0.64 0.15 0.06 0.39 0.03 -0.07 0.17 0.16 0.28 0.23 -0.16 -0.35 -0.29
0.3 0.12 -0.07 0.08 0.14 -0.16 -0.13 -0.18 -0.09 0.04 -0.07 -0.01 0.05 0.24 0.16 0.1 0.06 -0.11 -0.29 -0.25 -0.09 -0.02 0.09 0.13 0.06 0.09 0.04 -0.12 -0.08 -0.24
0.73 0.43 -0.33 -0.37 0.36 0.18 0.18 -0.27 -0.31 0.1 -0.19 -0.35 0.05 0.18 0.29 0.03 -0.03 -0.12 -0.17 -0.46 0.1 -0.01 -0.06 -0.18 0.05 0.09 0.21 -0.18 -0.16 -0.62
0.29 0.15 0.07 0.04 0.02 -0.16 -0.07 -0.12 -0.03 -0.13 -0.04 0.02 -0.05 0.01 0.07 0.15 0.11 -0.64 -0.19 -0.21 -0.12 -0.02 -0.08 0.1 0.03 0.06 0.13 0.19 0.07 0.08
0.09 0.13 -0.35 -0.69 0.34 0.2 0.13 -0.49 -0.37 -0.16 -0.23 -0.07 -0.17 -0.0 0.35 0.36 0.28 0.67 -0.33 -0.47 -0.17 -0.16 0.22 0.24 0.01 0.01 -0.06 0.08 0.0 -0.31
0.27 0.43 -0.1 -0.43 0.08 -0.09 0.29 0.22 0.1 0.19 -0.29 0.1 -0.42 -0.18 -0.24 -0.25 -0.34 0.14 0.03 0.03 0.11 0.28 -0.37 0.0 -0.08 0.36 0.09 0.13 -0.08 -0.65
1.17 1.12 0.55 -2.88 0.46 0.36 0.54 -2.04 0.01 -0.46 -0.67 0.06 -3.1 -1.06 -1.84 -0.42 -1.16 -3.87 -0.24 -1.08 0.21 0.44 -1.46 0.18 0.41 0.84 0.24 1.55 -0.08 -0.78
1.39 0.49 -0.04 -0.77 0.97 -0.05 0.49 -0.38 -0.27 0.07 -0.53 -0.98 -0.35 0.27 0.0 -0.52 0.53 -1.13 -0.59 -1.25 0.18 -1.34 0.26 0.24 -0.42 0.41 -0.09 0.33 -1.17 -0.14
0.47 -0.25 -0.85 -1.73 0.07 1.08 0.88 -1.4 0.24 0.51 0.18 0.6 -0.29 -0.09 0.61 0.11 -0.21 -0.95 -0.41 -0.57 -0.51 0.26 -0.16 0.61 -0.18 -0.24 -0.79 0.21 0.01 -1.56
0.2 0.13 0.03 -0.06 0.1 -0.45 -0.13 -0.11 -0.01 0.04 -0.06 -0.09 0.01 0.03 0.09 0.05 0.14 -0.61 0.02 -0.04 0.11 -0.01 0.05 0.11 0.07 0.08 0.16 0.1 0.03 -0.27
0.12 0.12 0.05 -0.09 0.18 0.17 -0.08 -0.5 0.21 0.07 0.07 -0.06 -0.37 0.16 0.15 0.2 0.22 -0.17 0.07 0.03 0.14 0.13 0.06 0.14 0.07 0.04 -0.12 -0.31 -0.53 -0.69
0.5 0.68 0.26 -0.15 0.29 -0.54 -0.79 -0.78 -0.72 -0.33 -0.36 -0.66 0.48 0.03 0.28 0.07 0.16 -0.08 0.39 0.23 0.32 0.28 0.13 -0.1 0.01 0.13 0.31 -0.69 -1.08 -0.26
0.29 0.04 0.03 0.22 0.1 -0.85 -0.23 0.11 -0.08 -0.09 0.18 0.11 -0.08 0.06 0.07 0.0 0.13 -0.33 -0.15 -0.07 -0.05 -0.05 -0.37 0.01 -0.01 -0.06 0.18 0.44 0.04 -0.11
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2.25 - - - - - 2.55 - 2.26 - - - - - - - - - - 2.59 - - - 2.56 - - - 1.42 - -
-0.57 0.03 -0.92 -0.06 1.38 -1.5 -1.43 -0.78 0.01 0.3 0.2 -0.73 1.16 - -0.51 0.42 -0.86 -1.41 0.25 0.49 0.4 0.34 -4.22 -0.76 0.01 0.44 0.93 -0.12 0.44 0.43
0.25 0.45 -0.27 -0.52 0.39 0.28 0.26 -0.09 -0.3 -0.17 -0.15 -0.3 -0.46 -0.03 0.16 0.02 0.12 -0.26 0.29 -0.34 0.24 0.15 -1.03 0.17 0.32 0.23 0.33 0.01 -0.33 -0.56
0.75 0.91 0.3 -0.62 0.76 -1.78 -1.56 -0.71 -1.79 0.85 -0.56 -0.36 1.27 -0.22 -0.32 -0.53 0.24 0.41 0.18 -1.12 0.12 -0.94 0.43 -0.59 0.03 0.65 0.35 -0.55 -0.67 -1.22
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-0.15 0.43 -0.53 -2.02 0.24 0.57 0.37 -0.04 -0.46 0.37 -0.29 0.09 -0.33 1.34 0.01 0.09 -0.24 -1.21 0.18 0.17 0.42 0.26 -2.21 -0.11 -0.73 0.61 0.35 -0.43 -1.23 -0.33
0.71 0.21 0.28 -0.05 -0.64 0.39 0.43 -0.47 0.14 -0.23 0.23 0.39 -0.37 -3.18 0.37 0.04 0.31 -2.94 0.49 0.58 0.45 0.41 -1.59 -0.11 -0.28 -0.31 -0.19 -0.51 -0.45 0.26
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-0.09 0.73 -0.76 -0.74 0.83 -0.06 -0.16 -1.85 0.08 0.35 0.22 -0.41 0.75 -1.47 -0.72 0.17 -0.59 -0.07 0.37 -0.03 0.74 0.59 0.13 -0.74 -0.35 0.08 0.14 -1.82 -0.82 0.8
2.75 - - 2.48 2.46 - - - - - - - - - 2.63 - - 2.59 - - - - - - - - - - - -
0.63 0.44 0.25 -0.43 -0.13 0.12 -0.01 -0.5 0.62 0.32 0.3 0.15 -1.02 0.06 0.17 -0.13 -0.18 -0.78 0.12 0.31 0.28 0.3 -0.88 -0.09 0.02 0.1 0.01 -0.22 -0.64 -1.14
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Spov3_chr6.00773 (ALDH10A8)
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Spov3_S09.00057 (POQR-like)
 1.44 1.28 1.17 -2.1 0.7 0.12 -0.84 -1.85 0.08 -0.39 -1.54 -1.37 -2.36 -2.07 -1.91 -0.81 -1.62 0.48 -1.34 -1.84 -0.54 0.04 -1.19 1.11 0.17 0.45 -0.4 1.41 0.87 -0.84
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.