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Heatmap: Cluster_142 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.63 0.36 -0.01 -0.11 0.25 0.27 -0.4 -0.89 -0.15 -0.03 -0.47 -0.36 -0.28 0.68 -0.01 -0.09 -0.27 1.49 -0.89 -0.63 -0.45 -0.38 0.5 -0.27 -0.53 -0.5 -0.5 0.05 0.04 0.1
-0.7 -0.25 -0.68 -1.09 1.39 0.16 -0.63 -0.13 -0.52 0.4 -0.2 -0.93 -0.73 1.57 -0.51 -0.31 -0.54 1.05 -1.02 -0.66 -0.73 -0.56 0.06 -0.03 -0.22 -0.48 -0.09 0.45 0.53 0.18
0.15 0.16 -0.01 -0.08 0.24 -0.05 -0.35 0.24 -0.26 0.06 -0.43 -0.06 0.02 0.7 -0.06 -0.05 -0.01 0.71 -0.28 -0.5 -0.09 -0.43 -0.1 -0.26 -0.09 -0.16 -0.13 -0.16 0.26 0.16
0.13 0.11 -0.22 -0.2 0.24 0.03 -0.07 -0.04 0.07 -0.01 0.02 -0.13 -0.18 0.32 0.04 0.01 0.1 0.73 -0.1 -0.14 0.01 -0.12 -0.25 -0.16 -0.22 -0.05 -0.04 -0.07 -0.1 -0.11
1.48 0.52 -0.11 -2.8 2.05 0.25 -0.66 -2.69 -1.53 -1.7 -1.92 -2.06 -1.55 2.21 -0.15 -1.89 -2.17 0.79 -1.29 -1.55 -2.93 -3.82 1.62 -0.16 -1.55 -0.99 -1.95 -0.41 0.92 -0.58
1.05 0.81 -0.42 -0.49 0.64 0.11 -0.12 -0.78 -0.52 -0.45 -0.8 -0.54 -0.8 1.74 -0.36 -0.58 -0.91 0.73 -0.28 -0.76 -0.47 -0.63 -0.53 -0.03 -0.84 -0.52 -0.5 0.43 0.76 -0.19
0.38 0.46 0.01 -0.33 0.61 -0.27 -0.76 -0.99 -0.57 0.14 -0.37 -0.38 -0.03 0.96 -0.12 -0.14 -0.29 0.92 -0.2 -0.75 -0.08 -0.03 -0.2 0.12 -0.4 -0.14 -0.21 0.0 0.24 0.29
0.3 0.26 0.02 -0.28 0.26 0.05 -0.3 -0.55 0.03 0.02 -0.2 -0.19 -0.73 1.01 -0.17 -0.25 -0.28 0.62 0.02 -0.18 -0.09 -0.2 0.08 -0.12 -0.39 -0.12 -0.14 0.02 0.36 -0.08
-0.1 -0.02 -0.23 -0.47 0.4 -0.24 -0.4 -0.19 0.27 -0.05 -0.36 -0.02 -0.48 0.84 0.08 0.2 0.02 1.06 -0.24 -0.16 -0.25 -0.17 -0.12 0.04 -0.25 0.06 -0.16 -0.35 0.03 -0.07
0.44 0.5 0.0 -0.57 0.56 -0.11 -0.45 -0.72 -0.12 0.04 -0.34 -0.19 -0.3 0.7 -0.21 -0.23 -0.22 1.0 -0.29 -0.39 -0.16 -0.27 -0.07 -0.01 -0.37 -0.17 -0.3 0.13 0.34 0.14
0.28 0.35 0.09 -0.48 0.58 0.08 -0.32 -0.54 -0.23 0.01 -0.4 -0.28 -0.62 0.48 -0.35 -0.29 -0.22 1.47 -0.13 -0.47 -0.43 -0.31 -0.65 -0.13 -0.19 -0.03 -0.15 -0.04 0.26 0.37
0.6 0.46 -0.02 -0.12 0.86 -0.46 -0.4 -0.93 -0.07 0.13 -0.55 -0.22 -0.47 0.8 -0.18 -0.25 -0.33 0.95 -0.37 -0.59 -0.25 -0.13 -0.43 0.02 -0.23 -0.13 -0.45 0.17 0.33 0.06
-0.11 0.14 -0.07 -0.25 0.99 0.6 -0.3 0.09 -0.02 0.18 -0.27 -0.17 -0.64 0.9 -0.1 -0.31 -0.44 0.44 -0.62 -0.48 -0.47 -0.59 0.13 -0.51 -0.71 -0.3 -0.64 0.28 0.4 0.54
0.1 0.17 -0.1 -0.32 0.73 -0.09 -0.72 -0.23 -0.16 -0.06 -0.62 -0.41 -0.6 0.73 -0.2 -0.18 -0.15 1.41 -0.44 -0.62 -0.28 -0.49 0.54 -0.22 -0.46 -0.2 -0.36 0.19 0.32 0.18
0.39 0.51 -0.02 -0.3 0.45 -0.08 -0.22 -0.21 -0.2 -0.04 -0.25 -0.41 -0.22 0.85 -0.11 -0.14 -0.17 0.78 -0.2 -0.4 -0.21 -0.14 0.4 -0.34 -0.34 -0.24 -0.12 0.04 -0.07 -0.25
0.18 0.42 -0.03 -0.45 0.33 -0.09 -0.29 -0.42 -0.23 0.04 -0.39 -0.24 -0.45 0.94 -0.4 -0.14 -0.13 0.72 0.12 -0.2 0.08 -0.11 -0.39 0.16 -0.11 -0.04 -0.06 0.06 0.15 -0.23
0.18 0.35 -0.06 0.04 0.17 -0.16 -0.62 -0.58 -0.14 0.06 -0.29 -0.4 -0.11 0.37 0.01 -0.05 0.01 1.18 -0.41 -0.5 -0.28 -0.06 0.38 -0.09 -0.21 -0.11 -0.13 0.18 0.09 -0.16
-0.72 0.44 -1.77 - 3.07 -0.28 -3.66 - -0.93 0.8 -0.93 -1.74 -1.05 2.7 -2.57 -1.5 -4.39 0.93 -3.53 -1.79 -1.53 -3.53 -2.24 -0.53 -1.44 -1.22 -1.72 -1.01 -0.61 0.94
0.4 0.47 -0.11 -0.88 2.16 -1.06 -1.14 -1.47 -1.02 0.05 -0.64 -1.11 -1.73 2.38 -1.0 -0.24 -1.09 1.38 -1.58 -1.71 -0.7 -0.94 0.49 -2.16 -1.64 -1.19 -1.01 0.31 -0.17 -0.5
Spov3_chr1.04516 (CYP21-1)
 0.19 0.18 -0.01 -0.18 0.4 -0.05 -0.15 -0.1 -0.05 0.11 -0.08 -0.03 -0.24 0.11 -0.02 0.04 -0.05 0.73 -0.11 -0.19 -0.03 0.01 -0.45 -0.16 -0.21 -0.03 -0.05 0.04 -0.01 -0.07
1.0 0.86 -1.09 -3.36 2.08 -0.53 -1.36 0.11 -1.41 -0.28 -1.01 -0.99 -1.65 2.02 -0.99 -1.52 -0.98 1.78 -0.53 -2.69 -0.92 -0.99 -0.75 -1.0 -1.86 -0.62 -1.34 0.85 0.23 -0.82
1.58 0.22 -2.95 -1.75 0.82 -0.76 -1.44 -2.99 -1.55 -1.37 -1.11 -0.86 -0.95 2.78 -0.77 -1.76 -1.9 2.45 -0.67 -3.6 -0.89 -2.11 -0.01 -0.9 -0.58 -2.37 -1.55 0.08 -0.16 -0.57
0.43 0.15 -0.05 -0.55 0.24 0.01 -0.2 -0.53 0.09 0.08 -0.21 -0.0 -0.37 0.43 0.03 -0.11 -0.21 1.13 -0.28 -0.16 -0.28 -0.24 0.57 -0.42 -0.6 -0.3 -0.27 -0.33 0.15 0.28
-0.0 0.29 -0.37 -1.07 0.87 0.32 -0.12 -0.31 -0.02 -0.14 -0.62 -0.36 -0.19 1.17 -0.12 -0.15 0.16 0.67 -0.19 -0.36 0.01 -0.25 0.06 -0.31 -0.39 -0.13 -0.62 -0.25 0.13 0.17
-0.08 0.39 -1.0 -0.97 1.23 0.64 -0.02 -0.4 -1.07 -0.24 -1.28 -0.5 -0.31 1.59 -0.21 -0.3 -0.54 0.18 -0.37 -0.89 -0.5 -0.3 0.62 -0.08 -0.54 -0.27 -0.72 0.12 0.56 0.4
0.22 -0.02 -1.12 -1.48 0.97 0.68 0.03 0.25 -1.0 0.27 -0.97 -0.41 -0.74 1.55 0.23 0.06 -0.6 -0.06 -0.72 -1.04 -0.08 -0.22 0.28 -0.04 -0.92 0.39 -0.54 -0.16 0.66 -0.23
0.02 0.37 -0.1 -0.31 1.06 0.01 -0.61 0.09 -0.53 -0.2 -0.66 -0.42 -0.38 1.07 -0.13 -0.18 -0.1 0.64 -0.78 -0.74 -0.42 -0.4 0.35 -0.53 -0.81 -0.27 -0.31 0.29 0.44 0.7
0.41 0.42 -0.13 -0.28 0.6 0.17 -0.02 -0.33 -0.27 -0.06 -0.48 -0.49 -0.37 0.73 -0.12 -0.13 -0.13 0.43 -0.39 -0.4 -0.31 -0.17 0.39 -0.25 -0.38 -0.22 -0.33 0.2 0.23 0.41
0.73 0.8 -0.16 -0.81 0.62 -0.52 -0.8 -1.18 -0.51 -0.35 -0.82 -0.6 0.34 0.7 -0.7 -0.34 -0.14 1.35 -0.29 -0.73 -0.48 -0.25 0.0 -0.18 -0.27 -0.38 -0.24 0.45 0.68 0.2
0.4 0.84 -1.57 -2.16 2.34 0.67 -1.93 -2.74 -1.1 -0.56 -1.4 -1.31 -0.94 1.5 -0.98 -0.42 -0.93 1.35 -1.24 -1.9 -1.11 -1.4 0.15 -0.22 -1.92 -0.48 -0.96 0.6 0.63 0.67
0.02 0.3 -1.86 -2.49 2.17 0.9 -1.29 -1.73 -1.02 -0.62 -1.24 -0.8 -1.72 1.87 -0.96 -0.23 -0.65 1.06 -1.13 -1.59 -0.93 -1.1 -0.75 -0.2 -1.68 -0.4 -0.91 0.78 0.62 0.96
0.04 0.22 -0.12 -0.31 0.56 0.22 -0.15 -0.23 -0.05 0.32 -0.3 -0.13 -0.17 0.71 -0.11 -0.15 -0.29 0.83 -0.38 -0.07 -0.0 -0.08 0.08 -0.26 -0.3 -0.29 -0.17 -0.09 -0.02 -0.33
0.34 0.4 -0.07 -0.17 0.61 -0.06 -0.2 -0.26 0.01 0.14 -0.06 -0.12 0.0 0.68 -0.12 0.12 -0.15 0.82 -0.49 -0.55 -0.22 -0.61 -0.47 0.3 -0.3 -0.36 -0.71 -0.24 0.17 0.12
0.25 0.29 -0.03 -0.09 0.46 -0.26 -0.47 -0.5 -0.09 0.08 -0.19 -0.06 0.11 0.68 -0.26 -0.13 -0.03 1.11 -0.31 -0.27 -0.23 -0.3 -0.29 0.36 -0.37 -0.32 -0.51 -0.05 -0.01 -0.0
0.38 0.4 -0.02 -0.21 0.46 -0.12 -0.21 -0.44 0.1 0.07 -0.34 -0.2 -0.31 0.8 -0.16 -0.11 -0.03 0.45 -0.15 -0.28 -0.13 -0.21 0.01 -0.09 -0.29 -0.15 -0.17 -0.08 0.25 -0.1
0.5 0.54 0.03 -0.46 0.53 -0.3 -0.46 -0.56 -0.23 0.11 -0.76 -0.45 -0.59 1.24 -0.31 -0.39 -0.69 1.76 -0.62 -0.85 -0.46 -0.73 0.47 -0.32 -0.62 -0.55 -0.45 0.18 0.31 -0.46
0.03 0.37 -0.59 -0.71 0.33 -0.18 -0.31 -0.24 -0.1 -0.11 -0.11 -0.09 -0.45 1.13 -0.28 0.03 0.03 0.86 -0.14 -0.0 -0.09 -0.07 -0.58 -0.0 -0.06 -0.12 -0.28 -0.06 0.11 0.12
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0.31 0.4 -0.04 -0.29 0.9 0.02 -0.03 0.05 -0.28 -0.26 -0.31 -0.18 -0.06 0.62 -0.42 -0.43 -0.26 0.76 -0.22 -0.4 -0.38 -0.45 -0.07 0.13 -0.4 -0.29 -0.3 -0.08 0.27 0.23
0.77 1.14 -0.17 -1.61 1.06 -0.49 -1.19 -1.85 -1.17 -0.68 -1.56 -2.82 -0.95 1.75 -0.03 -0.27 -0.18 1.94 -1.3 -0.56 -0.55 -1.04 1.58 -0.46 -0.87 -0.83 -0.9 -0.01 -1.49 -1.13
0.25 0.43 0.09 -0.08 0.32 0.07 -0.26 -0.41 -0.24 -0.33 -0.25 -0.3 -0.36 0.69 0.33 0.11 0.23 0.93 -0.22 -0.34 -0.14 -0.13 0.18 -0.27 -0.43 -0.37 -0.32 -0.2 -0.11 -0.1
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0.59 0.55 0.09 -0.5 1.1 0.47 -0.17 -0.9 -0.42 0.41 -0.44 -0.25 -1.26 1.18 -0.41 -0.46 -0.49 0.37 -0.48 -0.81 -0.62 -0.4 -0.63 0.0 -0.57 -0.15 -0.54 0.4 0.37 0.33
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0.39 0.4 0.0 -0.14 0.49 -0.11 -0.31 -0.6 -0.19 0.05 -0.3 -0.05 -0.33 0.85 -0.14 -0.2 -0.06 0.63 -0.26 -0.33 -0.14 -0.28 -0.1 -0.07 -0.16 -0.03 -0.2 0.11 0.05 -0.03
0.27 0.44 -0.03 -0.48 0.49 0.03 -0.36 -0.21 -0.27 -0.07 -0.42 -0.24 -0.24 0.99 0.08 0.05 0.0 1.21 -0.79 -0.72 -0.26 -0.46 -0.46 -0.35 -0.64 -0.12 -0.05 -0.2 0.22 0.28
0.13 0.34 0.0 0.01 0.26 -0.15 -0.23 -0.04 -0.16 0.02 -0.17 -0.15 -0.11 0.59 -0.06 -0.04 -0.24 0.36 -0.36 -0.38 -0.17 -0.21 0.23 -0.07 -0.17 -0.03 -0.15 -0.07 0.13 0.33
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0.13 0.13 -0.3 -0.16 0.48 0.18 -0.22 -0.05 0.04 0.18 -0.17 -0.07 -0.29 0.77 -0.21 0.06 -0.03 0.63 -0.22 -0.4 -0.41 -0.32 -0.3 -0.23 -0.16 0.01 -0.03 0.02 0.15 -0.08
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0.52 0.69 0.11 -0.43 1.28 -0.57 -0.63 -1.16 -0.44 0.29 -0.83 -0.52 -0.07 1.42 -0.41 -0.38 -0.89 0.87 -0.17 -0.61 -0.56 -0.21 0.24 -1.03 -0.59 -0.17 0.22 0.22 -0.51 -0.18
-0.04 0.21 -0.28 -0.22 0.15 0.19 -0.45 -0.46 -0.04 0.11 -0.32 -0.19 -0.3 0.84 -0.14 -0.01 0.06 1.42 -0.25 -0.42 -0.2 -0.18 -0.44 -0.29 -0.21 -0.01 -0.11 -0.51 -0.04 0.22
Spov3_chr5.01893 (NAD-ME1)
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Spov3_chr6.00775 (ALDH10A8)
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Spov3_chr6.02240 (ADR1-L1)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.