1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_33 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.64 - 1.31 - - - 1.2 - 1.42 - - - - - - 3.27 - - - - - - - - - - 2.74 -
- 1.59 3.07 - - 1.48 1.37 - - - 1.49 1.26 - - - - - - - - - - - - 1.33 - 1.45 - - 1.45
- - 4.33 - - - - 2.85 - - - - - - - - - - - - - 1.41 - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.12 -2.11 0.84 -2.44 0.23 -0.08 0.21 -2.05 0.15 -0.58 -1.16 0.92 0.13 0.59 -2.34 0.26 0.09 -0.41 0.53 0.41 0.48 -0.41 -2.07 -0.68 0.12 -0.9 -0.8 0.74 0.19 1.39
- - 1.73 -1.47 - -1.31 - - 1.73 2.39 -1.25 1.85 - - 0.41 0.83 1.86 - - -1.03 -0.36 1.52 - -1.3 -1.22 -26.18 - - 0.72 -28.02
- 1.69 - 1.6 - - - - - - - 3.0 - 2.63 - 2.7 - - - - - - - - - - - 1.61 - -
- - 3.05 - - - - - - - - - - 1.95 - - - - 1.89 1.66 - 3.46 - - - - - - - -
- - - - - - - 2.11 - 3.35 - 2.27 - - - - 2.51 - - 2.31 - - - - - - - - - -
- - 3.21 - - - - 1.98 2.34 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - 1.82 - - - -
- - - - - - - - - - - 2.87 - - - 3.16 - 3.79 - - - - - - - - - - - -
1.38 1.24 2.18 - 1.02 - - - - - - 2.0 - - - - - 2.49 - - - - - - - - - 2.75 1.09 -
- -3.5 1.88 - - - 0.14 - -1.11 3.45 - 1.7 - 0.64 - - - - - 2.24 - - - - - - - - - 2.08
- - 3.88 - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.9 - - - - - - - - - - - - 2.6 2.0 - - - - - - - - - - - 2.33 -
- - 3.92 - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.04 3.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.49 3.38 - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - 2.31 - - - - - - - -
2.31 1.28 2.26 -0.73 0.65 - 0.55 1.04 0.05 - -0.66 - 0.16 0.74 - - - 1.55 - - - - 0.3 - - - - 0.33 0.32 0.02
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.56 - - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - -
Spov3_chr1.03099 (UGT76D1)
 - - 3.44 - - - - 3.23 - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.67 - - - - - - - - - 2.29 - - - - 3.06 2.01 - - - - - - - - - - -
0.02 -0.02 1.98 - 2.22 - - 1.65 -0.16 -0.12 - -0.15 - 1.96 - - 0.84 1.32 - - - 2.18 - - - - -0.27 - - -
- 0.32 1.28 -1.61 0.08 1.47 -1.2 1.08 -0.26 -0.36 0.27 0.54 - 0.89 -1.47 0.26 1.2 -1.6 - 0.91 - 0.49 -1.56 - 0.84 0.5 - - 1.08 -1.51
- - - - - - - - - - - - 1.64 3.42 - 2.88 - - - - - 3.15 - - - - - - - -
1.65 0.15 2.09 1.11 2.72 - 0.17 - - 1.92 - -0.14 0.13 - -0.18 - 1.08 - - -0.17 -0.05 - - - -0.02 - - - - -
- - - - - - - - 2.54 - - 2.55 - - - - - 3.47 - - - - - - - - - - 2.85 -
- - 3.84 - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.95 0.64 1.35 -1.77 - -0.15 0.69 0.07 0.03 -0.43 -1.55 -0.57 - -1.66 -0.66 - 0.57 -1.76 0.79 1.26 1.37 0.38 - -1.71 -0.05 - -0.72 1.01 - 1.43
2.25 0.54 1.37 - -0.23 0.87 1.27 -0.21 -0.65 0.43 -0.43 - - 1.49 -0.12 -0.46 0.34 0.27 - 0.6 - - - - -0.0 - - 0.41 0.13 -0.61
- - - - - - - - - - - 3.94 - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - -
- - 2.14 -5.33 -5.6 2.05 - 1.14 - 2.58 - 2.51 - - - -7.55 - - - - 1.63 - -4.27 - - - - -3.62 - 2.1
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.56 - 2.82 - - - - - - 1.24 1.12 - 1.29 1.13 - - - - - - - - - - 0.95 - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.07 - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.68 2.67 1.21 - 2.32 - 2.43 - - - 1.39 1.4 1.31 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 3.27 - 3.49 - - - 3.19 - - - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.4 - 3.94 - 2.19 - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.7 1.79 - - - - - - - - - - - 2.46 - - - - - - - - 2.09 - 1.92 - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.08 3.45 - -0.14 - -0.66 - -4.41 1.47 1.22 - - -0.13 0.84 0.88 - - - - - - - 1.55 - - 1.39 -2.46 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.38 3.61 - - - - - - - - - - 3.66 -
- 2.01 2.44 1.43 - - 1.39 -0.29 - -0.07 -0.0 0.8 - 0.93 -0.29 -0.18 2.14 - - - - - - - -0.22 - -0.34 0.1 - -
- - 3.21 - - 0.1 - 0.66 -0.25 -4.77 - - - - - - 0.1 - - 3.19 - - - 2.81 - - - - - -
- 2.44 3.92 - - 2.01 - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.16 - - - - - - - - - - - 1.9 - - - - 1.91 0.63 1.97 - - - - 1.89 2.14 - -
- - 3.27 - - 2.07 - - - - - - - - - - - 3.58 - 2.08 - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.09 2.45 1.49 - - - -0.01 1.28 -0.16 - 2.11 1.53 - - - 0.11 -0.37 - - - 1.52 - -0.28 - 0.29 0.65 - - -0.3
- - - - - - - - - - - - 1.64 3.42 - 2.88 - - - - - 3.15 - - - - - - - -
- - 3.88 - 2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.46 - -
- - 3.71 - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.56 - 3.92 - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.28 - - 0.72 - - 0.84 - - - - - - - - - - - - - 2.0 - - - - - 1.07 3.42
- - 2.57 - - 1.4 - - - - - 2.59 - - - - - 2.39 - - - 0.85 - - - - - - - 3.06
-0.44 0.23 1.67 -0.07 -0.62 -1.06 -0.92 0.12 - 0.4 - - -0.91 0.54 -0.02 0.68 0.13 -0.34 0.63 -0.25 1.45 -0.18 -0.17 -1.57 -0.79 -0.62 -1.83 1.07 0.4 0.37
0.15 0.04 2.52 - 1.75 - - - - - - - 1.45 -0.19 -0.31 - -0.29 - - - 1.37 0.73 - - 0.82 1.29 1.66 0.92 - -
0.76 - 0.78 - - - 0.28 0.73 1.63 - - - 0.54 2.72 - 2.86 - - - - 0.41 - - - - 0.36 0.35 - - 0.54
- - 1.91 - - - - 1.39 0.11 - 0.35 - 0.22 1.33 - - 1.13 0.04 0.16 - - 1.73 0.37 0.12 - 1.59 - - - 2.19
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.57 1.19 - - - 2.31 0.21 - - - - - - - - - - - 2.57 - - - 1.93 - - - - -
-0.75 -0.08 1.36 -0.39 -0.94 -0.22 -1.23 -0.2 - 0.09 -1.85 0.6 -1.23 0.22 -0.34 0.36 -0.18 -0.66 0.31 -0.56 1.13 0.64 -0.49 -1.89 -1.11 -0.94 1.05 0.75 0.09 0.97
0.51 2.03 1.87 1.14 -1.54 -0.49 1.01 - -1.35 0.69 - -0.45 - 0.69 -0.46 - 0.32 -0.54 0.18 0.94 - - -0.5 -0.51 -1.33 -1.45 0.96 0.45 - -
2.27 - 3.34 - 2.13 - - - - - - - 1.9 1.68 - - - - 1.9 - - - - - - - - - - -
- - 4.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.24 - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.21 2.23 3.16 - - - - - - 2.61 - - - - - - - 0.89 - - 1.04 - - - - - 0.9 - - 1.13
- - 3.1 - - - - 2.27 - 2.92 - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.35 - 1.22 - - - - - - 1.39 - - 1.23 - -1.42 2.42 - - 1.16 2.03 - - - - -1.6 - -3.03 -
- - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.73 - - - - - - - - - 2.63 2.53 - - - 2.46 - - - 2.56 - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.