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Heatmap: Cluster_54 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.2 0.12 0.04 0.14 0.13 -0.23 -0.06 0.07 -0.24 -0.08 -0.16 -0.18 0.02 0.31 -0.04 -0.1 -0.04 0.16 -0.2 -0.32 -0.06 -0.08 -0.02 0.0 0.03 -0.07 0.08 0.22 0.17 -0.05
0.44 0.58 0.04 -0.21 0.71 -0.31 -0.23 -0.15 -0.45 -0.02 -0.29 -0.34 -0.68 0.79 -0.01 -0.08 -0.14 0.17 -0.05 -0.45 -0.15 -0.14 -0.57 0.08 0.11 -0.25 -0.17 0.37 0.42 -0.44
0.06 0.17 0.09 -0.01 0.33 -0.04 -0.16 0.07 0.13 0.13 -0.12 -0.1 -0.32 0.5 -0.01 -0.05 -0.03 -0.05 -0.22 -0.34 -0.1 -0.11 0.09 -0.08 -0.22 -0.08 -0.16 0.21 0.2 -0.12
-0.05 0.1 -0.01 0.01 0.21 -0.09 -0.1 0.33 0.03 -0.02 -0.13 -0.1 -0.0 0.28 -0.03 -0.03 0.05 0.19 -0.29 -0.28 -0.26 -0.24 0.42 -0.09 -0.22 -0.13 -0.12 -0.0 0.21 0.03
0.37 0.47 0.16 -0.09 0.33 -0.49 -0.49 -0.01 0.4 0.45 -0.18 -0.01 -0.94 0.95 -0.53 -0.59 -0.76 0.35 -0.31 -0.35 -0.13 -0.3 0.16 -0.29 -0.44 -0.13 -0.24 0.43 0.46 -0.22
0.16 0.43 0.47 0.3 0.65 -0.78 -0.77 0.4 0.14 0.45 -0.35 -0.28 -1.31 0.47 -1.27 -0.91 -1.05 0.52 -0.13 -0.25 -0.35 -0.64 -0.35 -0.12 -0.32 -0.11 0.02 0.56 0.65 0.55
0.49 0.62 0.33 -0.07 0.29 0.28 -0.14 -0.12 -0.22 -0.22 -0.56 -0.26 -0.46 1.04 -0.05 -0.15 -0.0 0.62 -0.89 -0.65 -0.28 -0.47 0.09 -0.14 -0.8 -0.35 -0.68 0.28 0.47 -0.15
-0.13 0.09 -0.18 0.12 0.24 -0.07 -0.35 0.13 -0.08 -0.02 -0.16 -0.15 -0.02 0.41 -0.06 -0.18 0.05 0.53 -0.1 -0.39 -0.05 -0.21 0.14 -0.26 -0.16 -0.17 0.11 0.14 0.12 0.24
0.24 0.3 0.2 0.35 0.56 -0.39 -0.61 0.15 -0.09 -0.12 -0.39 -0.41 -0.12 0.26 -0.35 -0.31 -0.2 0.41 -0.38 -0.51 -0.38 -0.28 0.43 -0.3 -0.23 -0.17 -0.15 0.49 0.53 0.21
0.14 1.22 0.44 -0.01 -0.62 -0.23 -0.26 0.08 -0.43 0.29 -0.91 0.16 -1.25 0.99 0.25 -0.36 -0.05 -0.8 -0.81 -1.21 -0.5 -0.92 -0.23 0.48 -0.15 -0.08 -1.33 0.69 0.8 0.28
0.62 0.8 0.39 -0.26 0.16 -0.08 0.4 -0.26 -0.02 -0.16 -0.74 0.06 -0.25 0.67 0.04 -0.12 -0.46 -0.92 -0.48 -0.54 -0.49 -0.17 -0.87 0.07 -0.61 -0.16 0.17 0.45 0.42 0.27
0.6 0.57 0.28 0.09 0.14 -0.15 0.06 0.15 -0.14 0.09 -0.3 -0.15 -0.53 0.46 0.06 -0.1 -0.22 -0.14 -0.71 -0.64 -0.37 -0.11 -0.35 -0.01 -0.44 -0.34 0.13 0.23 0.47 0.23
0.18 0.29 0.1 -0.23 0.54 -0.26 -0.19 0.19 0.04 0.25 -0.26 -0.14 -0.32 0.34 -0.27 -0.29 -0.21 0.22 -0.15 -0.2 -0.09 -0.14 -0.14 -0.04 -0.17 -0.08 -0.07 0.29 0.36 -0.14
0.3 0.73 0.27 -0.34 0.98 -0.45 -0.66 0.36 -0.04 -0.09 -0.5 -0.26 -0.58 0.45 -0.62 -0.81 -0.65 0.56 -0.63 -0.44 -0.12 -0.42 -0.69 -0.18 -0.58 -0.27 -0.1 0.44 1.16 0.14
-0.06 0.63 0.31 -0.52 0.97 -0.35 -0.35 0.23 -0.06 0.04 -0.92 -0.27 -0.68 0.49 -0.5 -0.82 -0.71 1.08 -0.37 -0.72 -0.33 -0.14 -1.07 -0.33 -0.34 -0.38 -0.18 0.61 1.13 -0.02
0.17 0.47 0.1 -0.36 0.82 -0.39 -0.57 0.45 0.06 0.18 -0.51 -0.5 -0.76 0.5 -0.3 -0.57 -0.24 0.97 -0.52 -0.4 -0.12 -0.43 -0.63 -0.16 -0.66 -0.15 -0.39 0.48 0.85 0.08
0.07 0.24 0.23 0.29 0.51 -0.03 -0.4 0.25 -0.02 0.07 -0.36 -0.31 -0.59 0.76 0.03 -0.06 0.05 0.09 -0.49 -0.49 -0.29 -0.34 0.22 -0.3 -0.4 -0.39 -0.35 0.36 0.38 0.07
0.2 0.37 -0.04 -0.22 0.04 0.18 -0.11 0.23 -0.35 0.06 -0.26 -0.11 -0.32 0.61 0.1 0.08 0.04 0.49 -0.31 -0.33 -0.32 -0.15 -0.24 -0.14 -0.2 -0.13 -0.31 -0.16 0.43 0.14
0.19 0.08 0.32 0.36 0.17 -0.09 -0.33 0.07 0.18 0.22 -0.04 -0.11 -0.29 0.54 -0.21 -0.18 -0.29 0.72 -0.25 -0.29 -0.09 -0.28 -0.76 -0.26 -0.14 -0.17 -0.1 0.27 0.18 -0.4
0.22 0.15 0.18 0.18 0.43 -0.43 -0.37 0.09 0.08 0.08 -0.12 -0.06 -0.23 -0.06 -0.02 -0.13 0.03 0.37 -0.18 -0.2 -0.1 -0.16 -0.01 -0.29 -0.19 -0.04 0.01 0.27 0.21 -0.14
0.09 0.14 0.16 0.33 0.41 -0.4 -0.46 0.33 -0.11 0.05 -0.22 -0.22 -0.14 0.29 -0.2 -0.31 -0.18 0.35 -0.23 -0.24 -0.07 -0.16 0.08 -0.16 -0.08 -0.14 0.07 0.28 0.2 -0.02
0.88 0.95 0.55 0.25 0.39 -0.62 -0.67 -0.66 -0.1 0.09 -0.5 -0.47 -0.87 0.33 -0.4 -0.73 -0.18 0.72 -0.36 -0.61 -0.26 -0.4 -0.17 -0.56 -0.44 -0.21 -0.18 0.47 0.71 0.17
0.21 0.08 -0.12 0.02 0.07 -0.28 -0.11 0.03 -0.13 0.1 -0.11 -0.29 -0.02 0.45 0.01 -0.11 -0.03 0.14 -0.24 -0.41 -0.19 -0.14 0.43 -0.09 -0.19 0.06 0.08 0.28 0.17 -0.05
Spov3_chr1.01786 (AtHMP25)
 0.59 0.54 0.41 0.62 0.62 -0.75 -0.9 -0.06 0.05 0.24 -0.08 -0.34 -0.11 -0.29 -0.82 -0.51 -0.35 0.18 -0.36 -0.47 -0.24 -0.3 -0.02 -0.55 -0.28 -0.38 -0.24 0.71 0.53 0.39
-0.01 0.24 -0.01 -0.3 0.17 -0.03 -0.01 0.52 0.25 0.23 -0.27 0.04 -0.34 0.38 -0.4 -0.26 -0.45 1.2 -0.37 -0.33 -0.4 -0.4 -1.07 -0.3 -0.29 -0.1 -0.17 0.25 0.37 0.08
0.15 0.12 0.05 0.14 0.22 -0.14 -0.1 -0.02 -0.02 0.04 -0.04 -0.15 -0.18 0.34 -0.07 -0.15 -0.07 0.06 -0.21 -0.21 -0.03 -0.15 0.36 -0.36 -0.19 0.01 0.05 0.1 0.15 0.03
0.37 0.35 -0.06 -0.15 0.12 -0.32 -0.36 -0.5 -0.06 0.21 -0.11 -0.23 -0.28 0.45 -0.03 -0.04 -0.07 0.53 -0.13 -0.24 -0.09 -0.11 -0.03 -0.01 -0.05 -0.02 0.06 0.11 0.11 0.01
-0.07 0.11 0.09 -0.07 0.17 -0.34 -0.56 0.55 0.27 0.23 -0.45 -0.23 -0.43 0.9 -0.04 -0.25 -0.17 0.74 -0.77 -0.69 -0.44 -0.54 0.59 -0.37 -0.56 -0.39 -0.45 0.5 0.52 0.01
0.19 0.16 0.05 0.18 0.01 -0.13 -0.13 0.21 0.07 0.11 -0.03 -0.02 -0.16 0.18 -0.08 -0.11 -0.1 0.1 -0.3 -0.4 -0.07 -0.15 -0.01 -0.08 -0.07 0.01 -0.02 0.25 0.19 -0.08
0.19 0.31 0.12 -0.04 0.22 -0.11 -0.24 -0.04 0.05 0.1 -0.24 -0.1 -0.23 0.49 0.02 -0.05 -0.0 0.33 -0.28 -0.33 -0.09 -0.24 -0.02 -0.16 -0.31 -0.01 0.06 0.08 0.19 -0.08
0.27 0.41 -0.06 -0.1 0.28 0.11 -0.12 0.04 -0.09 0.04 -0.27 -0.16 -0.21 0.69 -0.24 0.01 -0.14 0.48 -0.25 -0.43 -0.3 -0.22 -0.52 -0.11 -0.25 -0.19 -0.21 0.04 0.42 0.24
0.37 0.38 0.1 -0.04 0.33 -0.18 -0.34 0.05 0.26 0.31 -0.18 -0.14 -0.63 0.65 -0.12 -0.11 -0.24 -0.09 -0.16 -0.36 -0.21 -0.38 -0.14 -0.19 -0.23 -0.13 -0.14 0.4 0.31 -0.02
0.3 0.25 0.0 -0.35 0.8 -0.2 -0.41 -0.65 -0.22 -0.3 -0.54 -0.69 0.08 1.25 0.2 -0.09 0.1 0.87 -0.24 -0.66 -0.36 -0.39 -0.69 -0.82 -0.34 -0.33 -0.26 -0.35 0.49 0.65
0.54 0.3 0.16 0.09 0.68 -0.21 -0.48 -0.3 -0.38 0.08 -0.26 -0.44 0.09 0.7 -0.37 -0.65 -0.5 0.65 -0.33 -0.34 -0.49 -0.58 -1.99 -0.24 -0.44 -0.04 -0.12 0.67 0.77 0.44
0.25 0.28 0.08 0.08 0.35 -0.06 -0.28 0.15 -0.03 0.03 -0.28 -0.08 -0.18 0.47 -0.07 -0.2 -0.17 0.16 -0.4 -0.44 -0.3 -0.17 -0.1 -0.11 -0.13 -0.1 -0.19 0.37 0.37 0.11
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0.28 0.39 0.17 0.25 0.1 -0.47 -0.44 0.1 0.1 0.08 -0.34 -0.17 -0.12 0.62 -0.18 -0.24 -0.28 0.44 -0.29 -0.44 -0.17 -0.26 0.32 -0.23 -0.31 -0.21 -0.1 0.1 0.29 0.16
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0.23 0.25 -0.03 0.17 -0.01 -0.13 -0.33 0.17 -0.07 -0.13 -0.25 -0.08 -0.04 0.47 -0.08 0.16 0.06 0.24 -0.2 -0.57 -0.3 -0.23 -0.15 -0.13 -0.36 0.12 0.07 -0.32 0.35 0.48
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-0.09 -0.0 0.02 -0.29 0.77 -0.2 -0.63 0.33 0.29 0.37 -0.3 -0.05 -0.64 0.81 -0.55 -0.45 -0.43 0.61 -0.45 -0.53 -0.24 -0.5 -0.55 -0.26 -0.32 -0.04 -0.1 0.74 0.57 0.04
0.74 0.77 0.39 0.13 -0.19 -0.57 -0.13 -0.19 -0.23 -0.24 -0.47 -0.31 -1.21 0.71 -0.0 -0.22 -0.26 0.46 -0.12 -0.61 -0.43 -0.07 -0.39 0.1 -0.18 -0.45 -0.3 0.47 0.64 0.06
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Spov3_chr6.00605 (AtCDC48C)
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Spov3_chr6.00633 (GLCNA.UT2)
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Spov3_S06.00035 (VAMP727)
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.