1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
- 3.67 - - 0.66 - 2.16 - - - - - - - - 1.01 - - 1.65 - - - - 2.09 - - - - - 0.84
0.78 -0.23 -0.25 1.09 - 0.45 1.28 -0.49 - -0.24 0.76 -1.28 -0.36 -0.37 - -0.16 - 1.51 - - - - - 2.15 -0.31 1.72 0.58 - -0.19 -0.33
- - - - -0.88 - 3.24 - - 3.16 - - - - 1.91 - - 2.87 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_C0003.00142 (LecRK-I.11)
 - - - - - - 4.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.66 - - - -
- - - - - - 4.42 - - - - - - 3.1 - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.42 -0.1 0.16 -0.11 -0.41 -0.01 0.17 -0.26 -0.16 -0.5 0.41 0.38 0.16 0.4 0.68 0.3 -0.04 -0.24 -1.11 -0.63 -0.29 0.33 -0.64 0.15 -0.11 0.03 0.26 -0.3 -0.47 0.71
- 0.48 - - - 0.16 - - 2.9 0.49 - - 0.4 - 0.39 - - 0.13 - 1.07 1.64 - - 1.69 - - - 0.52 0.26 1.93
- - - - - - 4.01 - - - - 3.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.41 - - 1.2 - 2.97 - 1.72 - - - - - - 1.28 - - - - - - - 2.36 2.01 1.23 - - - -
- - - - - - 4.67 - - - - - - 2.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_C0037.00035 (MAPKKK14)
 2.11 - - - - - 3.91 - - 2.45 - 2.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 1.94 1.73 - - - 3.0 - - - - - - 1.78 1.81 2.05 - - - - - - - - 1.91
0.56 0.42 -0.27 -0.26 -0.58 -0.39 0.99 -0.4 0.55 0.67 -0.27 -0.73 0.22 1.26 -0.79 0.85 0.1 -1.9 -0.2 -1.25 -2.03 0.19 -1.62 -1.11 0.19 0.3 0.85 -0.71 -0.35 -0.88
- - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - 3.93 - - 2.21 - - - - - - - - -
- - -0.5 - -0.71 - 1.65 - 0.52 1.17 -0.32 0.46 -0.44 0.39 -0.65 0.54 -0.58 0.27 0.83 0.77 - -0.77 -0.62 1.39 -0.59 0.41 0.21 0.72 -0.41 -0.36
- - -2.19 - - - 3.72 - - - - - -0.52 - - - - - - 1.75 2.85 - - 1.6 - - - 1.18 - -
- 0.72 0.4 0.3 - - 0.32 - 2.48 - 0.5 0.41 - - - - - 0.33 - 1.38 0.1 - - 1.35 - - - - 0.54 2.86
2.12 - - - - - - - 3.81 - - - - - - - - - - -1.1 - - - - - - - - - 3.48
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.72 0.39 0.78 0.0 -0.71 0.74 0.72 -1.22 -1.36 0.25 0.33 -0.28 -0.07 0.31 0.06 0.71 0.5 0.09 -1.05 -0.61 -0.46 0.0 -1.16 -0.34 0.42 -0.0 -0.36 -1.28 0.31 0.18
- - 1.86 - 2.35 - - - - 2.59 - - - - - 2.93 - 1.69 - - - - - - 0.96 -0.17 - - 0.65 -
2.87 - - - - - - 1.67 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.84 - -
- -0.3 - - 0.74 - 2.62 0.1 - - 0.74 -0.52 - -0.29 - - -0.33 1.72 - 0.48 0.56 - - - 1.13 -0.31 2.01 0.68 0.61 -
- - - 1.87 - - 3.22 1.85 0.63 - - - 0.91 - - 1.83 - - - - 1.54 - - - - - - 1.84 - -
1.3 1.9 2.24 0.23 -0.13 - - - - 0.18 0.32 0.05 0.67 - 0.0 - - - - - 0.12 - -0.02 2.2 1.1 - -0.01 - - 0.22
- - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - 2.22 - - 2.11 - - - - 2.21
- - - - - 2.68 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.81 - - - - - -
3.14 - - - - - - - 2.81 - - - - - - - - - - - - - 2.75 - - - - - - 2.89
-12.38 - - - 2.87 0.97 2.58 2.41 -25.71 - - -10.65 - -24.31 - 3.11 -22.94 - - - - - - - - -8.66 - -0.33 - -
-23.3 - - - - - 4.29 2.21 - -11.84 - - - - - - -25.71 - - 2.53 - - - - - - - - - -
-0.97 0.81 -1.06 2.01 - -2.8 0.91 1.34 -0.01 0.08 - -1.0 1.23 0.73 0.52 0.58 1.33 - - -1.02 -1.1 -0.14 - - 0.22 - 0.39 - 0.85 -0.96
- - - - - - 3.27 - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - - - -
Spov3_chr1.04684 (ACD31.2)
 - 3.35 3.29 - - - 2.4 - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.83 3.48 - - - - - - - - 0.99 - 2.38 - - - - - - - - 1.06 - 2.59 0.83
- - - - - 1.77 2.66 - - 1.57 - -0.05 - 2.24 - - -0.26 1.78 - - 0.58 0.73 - -0.21 - - - 0.19 1.12 -
-2.38 -1.29 0.33 -0.85 -0.9 -0.22 -2.23 -1.42 - -0.4 0.49 -2.54 -0.39 2.62 0.47 0.53 -0.47 2.53 -0.76 -0.98 -1.1 -0.01 -1.5 -2.25 -2.46 -0.49 0.81 - -2.22 0.13
- 2.33 - 2.28 - - 3.95 - - - 2.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.21 2.17 2.47 - - - - - 2.33 - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.74 2.42 - - 0.56 - 0.94 - -0.46 0.71 - 2.63 - - - 1.12 - 0.62 0.67 0.61 - - 0.9 -0.59 - -
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - -
0.9 - 0.48 - - 0.48 1.8 - - 1.58 - - 0.64 0.52 - 0.85 - 2.41 1.93 - - - 0.77 - - - - 0.69 0.72 -
- 2.13 3.16 - - - - - 2.21 - - - - - - - - - - - 2.05 - - - 1.98 - - - 1.98 -
0.97 - -0.24 0.78 1.62 - 2.44 - 0.67 1.21 -0.15 -0.43 - - - - - 1.07 -0.61 - 0.65 -0.56 - - - 0.4 -0.25 - 1.81 -0.37
Spov3_chr2.03864 (CYCB2;4)
 3.37 - - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.21
3.54 - - - - - 3.55 - 2.74 -19.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.11 - -0.31 -0.15 2.11 1.07 - 0.2 1.41 -0.12 0.97 - - 1.06 -1.0 - 1.69 1.27 - - - -0.12 0.93 - -0.2 - 0.17 -
- - - - - - - - 2.81 - - - - 2.93 - 3.0 - - - - - - - - - - - - - 2.89
1.26 -0.75 1.83 - 0.11 0.53 0.05 - - - - 0.78 0.45 2.07 -0.85 - - - -0.58 -0.71 - - 1.27 1.67 1.28 -0.94 -0.98 -0.74 -0.65 -1.02
- 3.07 3.02 - - - - 1.88 - - - - - - - - - - - - - - - 1.75 - 1.8 1.56 - - -
- - - - - - 4.41 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.55 - - - - - - - - - - 3.19 - - - - - - - - 3.2 - - -
- - - - 2.24 2.25 - - 2.25 - - 1.46 - 2.68 - 2.72 - - - - - - - - - - - - - -
-1.17 -0.16 -0.19 - 0.08 - -1.32 -1.06 -0.37 0.91 - -1.39 - 2.22 0.19 -1.2 - 2.53 - 0.9 0.34 -1.5 -0.28 0.82 - -0.45 0.61 0.42 -1.32 -0.44
-0.7 -0.27 -1.27 -0.14 -0.71 -0.31 0.82 0.32 -1.54 -0.21 -0.86 -0.88 0.6 0.39 0.22 0.16 0.94 1.09 -0.11 -0.24 0.63 -0.48 0.3 -1.16 -1.2 -1.04 1.11 0.01 -0.52 -0.24
- - - - 2.04 2.05 - - - - - 2.05 - - - 3.78 - 1.94 - - - - - - - - - - - -
0.52 0.88 -0.26 -0.97 0.23 -0.13 -1.65 -0.1 0.47 0.19 -1.72 -0.97 -0.13 1.5 -0.38 -0.65 0.04 1.73 -0.66 -0.56 -0.15 -0.67 -2.01 -1.94 0.09 0.39 0.2 -0.2 -0.07 -0.93
2.56 - - - - - 3.93 - - - - - - 1.42 - - - - - - - - - - - - - - 2.63 -
0.6 0.77 - - 1.95 0.45 0.76 0.47 - - - - - 2.48 - 0.6 0.72 2.4 - - - - - - 0.54 0.48 - 0.65 - -
1.27 0.22 - - - - - - - 1.25 - - 0.22 2.09 2.08 - - 3.31 - - - - - - 0.22 - 0.26 - 1.1 -
- - 3.0 - - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - 2.07 - 3.02 2.26 - - - 1.41 -
0.36 - - 0.83 - - 2.58 - - - - - - -0.03 - - 1.78 - - - - 3.26 0.0 - - - 0.16 1.33 - 1.22
-0.04 0.16 0.27 0.06 - - 2.23 1.65 -0.19 - - - - 0.08 - - 0.58 - - 0.98 -0.05 0.39 - 2.15 - 0.13 - 1.26 - 1.15
-0.22 0.26 -0.08 0.08 0.05 0.18 0.15 0.12 0.06 0.22 0.13 -0.1 0.23 0.19 0.01 0.1 -0.03 -0.28 -0.01 -0.43 -0.28 0.13 -0.56 -0.04 -0.12 0.08 0.11 0.19 -0.2 -0.4
3.67 - - - - - 1.96 - - - - - - - - - - 1.56 - - - - 1.69 - - - - - - 2.84
0.3 0.47 -0.4 0.01 0.09 0.3 0.26 -0.67 -0.32 0.89 -0.05 0.13 0.68 0.18 -0.81 0.22 0.01 -0.67 -0.02 -0.35 0.03 -0.28 -1.41 -0.25 0.31 0.33 0.26 -0.12 -0.13 -1.68
- - - - - 3.1 4.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.48 0.83 0.14 0.84 -0.25 0.36 0.24 0.01 -0.61 0.13 -0.48 -0.1 0.39 -0.2 0.54 0.69 1.28 -1.88 -1.47 -1.81 -2.21 0.94 -1.06 0.43 -0.96 -0.77 -0.12 -0.4 -0.75 -0.02
- - - - - - 3.93 - - - - - - 3.88 - - - - - - - - - - - - - - - -
2.29 - - - -4.34 -3.27 -4.68 - 0.71 -0.23 0.51 -0.61 1.36 -0.68 -0.57 -1.98 -4.74 2.21 -2.63 -3.93 -0.28 -1.01 -0.92 -2.06 -1.77 0.22 -1.95 1.15 -1.99 2.34
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.03 1.08 -0.93 - - -1.33 2.0 - 1.13 - -0.11 0.37 0.51 2.0 -0.19 - -1.04 -0.27 -0.15 0.35 -0.52 - - 0.08 - -1.36 1.07 0.68 -0.06 0.53
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - 3.43 - - - 2.48 - - - - - -
0.78 - 0.87 0.21 - 2.29 - - 0.58 1.69 - 1.29 - - 1.43 2.65 - - - - - - - - - - - - - 2.09
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.86 - - - - - - - - - 3.84 - - - - - - - - - - - -0.38 - 3.71
- 0.43 - - - - 3.12 0.32 - - - 1.09 - 2.42 0.09 - 1.32 1.62 - - - - - - - 1.1 1.29 - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.64 - - - 3.13 - - - - - - - - - 3.01 - 2.8
- - - - - 3.81 - - - - - - - - - 4.0 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.08 - 2.55 - - 1.46 - - - - 2.26 - - 2.2 - - - - - 2.88 1.35 - - - - -
- - 3.67 - - 1.61 - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - - - 2.24 - - - - -
- 2.86 3.41 - - - - - - - - - - - 1.57 - 2.62 - - 1.58 - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.89 2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 - -
- - - - - - 3.72 - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - 2.99
1.89 - - - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.91 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 4.0 - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - -
Spov3_chr5.03561 (OSCA1.3)
 - - - - - - 4.22 - - - - 3.02 - - - - - - - - - - - - - - 1.71 - - -
- - - - - - 4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.95
- - - - - - 3.39 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - - -
- 2.17 - - - - 2.25 - - - - - 2.12 - 1.91 - - - - - - - - - 3.07 2.09 - - - -
- - - - - - 3.54 - 2.65 - - - - 2.11 - - - - - - - 2.96 - - - - - - - -
-0.36 -0.41 - - -0.54 - 3.09 0.42 - - - 0.49 - 1.03 -0.57 - 0.64 - -0.35 0.35 1.53 - - 0.44 - -0.42 -0.65 1.63 - 0.55
- - - - - - 4.06 - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - - - - - - - -
-0.01 - 1.61 - - 0.94 1.82 0.21 - - - - 0.23 3.12 - - - -0.03 0.06 - 2.18 - - - - - - - - 1.55
-0.23 1.98 0.68 - -1.46 - 0.86 -0.3 0.66 0.09 0.17 0.46 -0.48 - - - 0.69 -0.07 0.37 -0.02 -0.89 -0.11 -1.64 1.31 0.09 - 1.08 1.07 -1.43 -
- 3.92 - - - - 3.62 - - - - - - 1.32 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.05 - -1.22 3.04 - 1.3 - - - - - - - - 2.88 - 0.82 - - - 2.49 - 1.05 - - - -
- - 1.3 - - 2.97 - 0.08 - - - 0.16 - 1.77 - 2.66 0.29 -0.0 - - - - - - 1.78 -0.08 - 0.28 - -
- - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.