1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_23 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
0.85 0.55 0.41 0.28 -0.76 0.53 0.22 -1.7 1.27 -1.46 0.09 - - 0.91 1.28 -0.58 - -0.18 -1.65 -0.87 0.92 -1.65 - 0.9 - 0.76 -0.05 0.67 0.14 -0.58
- - - 2.78 - - 1.83 2.53 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.74 - -
- - - - - - - - 3.99 - - - - - - 3.82 - - - - - - - - - - - - - -
3.91 - -10.21 2.85 - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.76 - - - 2.48 - - 3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.27 - - -
- - 1.02 -2.02 - 1.04 1.61 0.49 1.74 -1.16 -0.44 - - - - - - 0.14 - - -2.49 1.34 - - 1.51 - -1.32 -1.21 2.67 1.51
3.46 - - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - 3.16 - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.2 4.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.43 - - - - - - 3.38 - - - - - - 3.14 - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.2 -1.33 -0.51 0.05 0.69 -1.75 -0.07 -1.63 -1.52 0.49 0.6 -0.64 -1.35 2.11 -0.67 -0.38 0.79 0.27 0.07 - -1.55 -0.16 0.4 1.55 - -0.79 -0.44 0.32 0.2 -1.66
- - - - - - - 2.57 3.45 - - - - - - - - - - - - - - 3.09 - - - - 2.2 -
- 1.03 - - 1.83 - - - 2.58 - - - - - - - - 2.68 - 1.4 - 1.2 - - - 2.83 - -20.42 -22.0 -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -2.27 3.37 - - - 1.96 - - - 2.67 - - - 0.85 1.98 - - - - - 1.77 -18.94 -
- 1.87 - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - -0.02 - 2.02 - 2.77 - - - - - 2.3
1.34 - 1.35 - 3.04 0.94 - - - - 0.05 - - -0.17 0.97 - 1.19 -0.18 -0.01 - - 2.55 -0.14 - - - - - - -
- - - - - - - 3.07 3.31 2.22 - - - - - - - - - - 1.78 - - - - - 1.83 - - -
- - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 1.45 - 4.15 - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.52 - - 2.66 - - - 1.59 - - - 1.92 1.55 - - - - - 1.49 - - - - 1.74 - 2.31
- 3.27 - - 1.27 1.28 - - 2.77 - - 1.23 - 1.73 - - - - - - - - - - 1.6 - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.47 - - -0.08 - - - - 3.06 - - - - 0.41 - - - - - - - 0.37 - - - - - - 2.81 -
- - - - - - - - 4.19 - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - 1.53 - -
- - - - - - 1.45 - 4.15 - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.86 - - - - - - 2.9 1.67 - - - - - - - - - - - - 2.71 - 2.46 - - - - -
1.49 1.67 - - - - 1.38 - 2.85 - - - - - - - - 1.54 - - - - 2.62 - - - - - - 2.36
- - - 0.58 1.44 - - 0.39 - - 0.68 1.44 - 1.56 - - 0.57 - - - - 0.27 - 2.41 - 0.53 - - 2.3 1.52
- - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.55
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.24 1.32 - 2.25 - - - 0.39 - - - - - 0.49 - - - - 1.64 - 1.72 2.13 - - - 1.21 - - 1.36 1.0
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - -
-0.12 - 1.53 0.96 - - - - 1.28 0.77 - 1.31 - -0.18 - 0.81 - - -0.04 - - 2.25 - -0.35 - -0.29 0.66 -0.08 2.36 -
2.74 - - - - - - - - 3.65 - - - - 3.44 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.69 1.59 - - - 1.96 - - - - - 3.47 - - - - -15.01 1.57 - - - - - 1.38 -8.84 - -
2.83 1.19 - 0.81 - - 1.22 -0.08 0.91 1.12 - - 1.09 - - - - - - - 1.0 1.77 - - - - - - - 2.0
3.03 - - - - 2.66 1.87 - - - - - 1.95 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_chr1.03944 (EXO70A1)
 -0.48 0.13 - - 1.06 - -0.01 - 0.08 1.8 - 1.08 -1.05 1.59 2.29 - - - - -0.14 1.09 - -0.02 - - 0.82 - 1.76 -0.11 -
-0.02 0.26 -0.24 -0.08 0.36 -0.35 -0.07 -0.7 0.59 0.22 0.6 -0.01 0.1 0.37 -0.3 -0.81 -0.74 0.21 0.55 -0.24 0.44 -0.42 0.07 -0.18 -0.44 -0.04 -0.06 -0.05 0.04 -0.54
0.36 2.09 - 1.27 0.69 - 1.63 - 2.85 - - - - 1.91 - -0.61 - - - - - 0.77 - - -1.06 0.59 - - - 0.99
4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.89 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.64 2.73 - -1.61 - - 2.4 1.54 - - - - - - 1.19 - - - - - - - - - - - - -3.46 - -
-0.28 - -0.54 - -0.42 -0.54 -0.62 1.64 - - - - -0.26 2.18 - 0.76 2.55 - - -0.57 -0.44 - 1.41 - - -0.53 - -0.33 - 2.27
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.16 3.59 - - - -17.94 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.39 2.57 - - - - 1.52 - 1.52 2.73 - - - - - - - - - - - - 1.82 1.55 -
4.48 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.33 - - - - - - 2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.95 -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.1 - - 2.83 - - - - - - - - 0.95 - - - - 1.99 - - 2.73 0.87 - - - - - 2.14 1.0
- - - 1.59 - -6.49 - - 3.5 - - - - - 1.58 1.66 - - 2.6 - - - - - - - - - 1.8 -
3.86 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - 0.88 - 1.28 - - - - - 1.0
2.31 - - - 2.65 - - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - 3.12 - - - 2.4 - -
- - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.02 1.73 - - - -1.2 - 2.56 -0.88 - - - 1.06 -0.85 - - 1.12 - - - - - - 2.64 1.42 - - 0.24 1.53
3.81 - - - 1.82 - - - - - 2.04 - - 1.94 - - - - - - - - - - - - - - - 2.18
0.28 1.27 0.07 - 0.59 -0.04 -1.73 -1.72 0.89 0.83 0.5 -0.66 - 0.59 -0.86 -0.42 -0.77 0.13 0.66 -0.78 0.8 - -0.19 0.29 0.96 0.34 - - 0.01 0.9
- 0.69 - 0.67 0.68 - - 0.81 2.97 - - - - 0.86 2.58 0.76 1.66 - - - - - 0.58 - - - - - 0.53 -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.82 - - - - - - - - 2.68 - 2.59 - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - 3.51
3.93 - - - - 2.72 - - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.04 - - - 2.09 - - - - 1.47 - 1.02 - 2.0 2.0 - - - - - 0.6 - 2.3 - - - 0.78 - 1.45 -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.31 - - - - - - - - 3.01 - - - - - 3.52 2.46 -
4.05 - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - - - - - - - -
4.4 - - - - - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - - - - - - - - - -
Spov3_chr3.01857 (RAPTOR1)
 - 3.34 - - - - - - 3.42 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.2 - - - -
3.92 2.4 - 2.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.21 -
- 2.53 - 2.5 - - - 2.62 - - - - - - - - - - - - - 2.13 - - - - 3.01 - - -
4.01 - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - -
Spov3_chr3.02116 (UMAMIT32)
 3.27 - - - - - - - - - - - - 1.64 2.97 - 1.6 - 2.68 - - - - - - - - - - -
- - - - 2.36 - - - 3.86 - 1.89 - 0.89 - - - - - - - - - - - - 0.72 1.67 - - -
- - 0.63 - 1.94 - 1.85 0.64 - - 0.63 - 0.62 - - 2.61 - 1.46 - - - - - - - - -17.92 1.75 1.51 0.36
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.95 - - - 2.82 - - - - 2.07 - - - 2.96 - - - 1.79 - - - - 1.85 - - - - - - -
- 2.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.16 - 2.89 - - - - 3.6 -
- 1.38 1.22 - - - - 2.1 2.57 - - 1.26 - - - - 1.47 - - - 1.38 - - 1.27 - - - - 2.22 -
- - - - - - - - 3.9 - - - - 2.19 - 3.39 - - - - - - - - - - - - - -
1.47 0.5 0.33 0.01 -1.15 -1.08 -0.68 -1.17 -0.1 0.6 -0.56 0.45 -0.64 1.6 -0.76 -1.07 -1.06 0.3 -1.66 -0.94 -0.34 0.17 0.8 -0.43 -1.19 -0.52 -2.06 0.26 0.14 0.77
- - - - - - - - 3.88 - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 3.86 - - - - - 1.82 2.21 - - - - - 1.99 - - - 1.74 - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.96 - - - 1.82 - - 1.99 - 1.92 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.65 - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.77 - - - - - - - 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.43 0.87 - 0.05 0.52 -0.72 0.13 - 0.58 -1.46 -1.36 0.5 - 0.56 0.04 - -1.28 -1.65 -0.71 -0.66 - 1.37 -0.53 0.39 0.88 - -1.83 0.89 2.41 -0.61
2.22 - - - 2.43 1.51 - - - - - 2.42 - - - - 2.74 -19.08 - - - - - - - - - - - 2.34
3.67 - - - - 1.82 - - - - - - - 1.73 - - - - - - - - - - - - - 2.01 - 2.68
- 2.18 - 2.12 2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.92 - - - - - 2.28 2.22 -
- - - 2.05 - - - 0.83 2.9 0.4 1.55 - - - 0.54 1.08 0.22 - - - 0.84 - - 1.39 - - - 0.88 0.5 -
1.85 - - - - - - - 3.39 - - - - 1.44 - - - - - - - 2.88 - - - 1.29 - - 1.75 -
3.12 - - - 2.8 - - - - - - - -0.34 -0.37 -0.03 - 1.61 -0.05 - - - - - 2.28 - - - 1.55 - -
1.05 - - - 0.55 0.16 - 1.37 -0.56 2.17 -0.4 - - 0.37 -0.62 -0.31 - -0.66 0.83 - - -0.73 -0.38 - 1.12 - -0.91 1.47 0.86 1.59
- - 2.19 1.17 - - 1.55 - - 1.04 - 1.99 - - - - - - - 0.88 - 1.79 - - - - 0.86 - 2.83 -
- - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - 2.8 - - - - - - 2.92 - - -
1.65 1.16 -0.03 -0.15 - -1.13 -0.97 1.02 1.72 0.27 - 0.11 -0.68 -0.95 0.06 0.19 0.09 - -1.54 -0.94 0.09 -0.89 0.64 0.02 - -0.14 -0.25 - 1.33 -1.05
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.28 - - - - 2.05 3.0 - 1.3 - - - - - 1.29 1.99 - - - - - - - 1.05 0.98 - 1.34 -
0.92 - 1.66 - - - - - 3.35 - - - - - 1.64 0.86 1.78 - - - - 0.7 1.61 - - - - - 0.8 -
0.0 1.47 -1.21 -0.48 1.41 - - -0.71 2.79 -1.22 1.41 -0.27 - - - 0.33 - - - - 0.51 -1.39 0.91 1.51 -0.95 -0.9 - - 1.08 -
- - - - - 3.71 - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.95 1.07 0.77 1.31 - 1.0 0.09 0.81 0.39 -0.7 -2.32 -2.03 -0.61 0.41 0.38 -0.73 -1.37 - -0.78 - 0.45 - -0.36 0.59 -2.37 0.95 0.81 0.53 - -0.41
-6.95 2.75 - - - - 2.72 - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - -0.76 - - 3.24 -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.02 0.28 -0.02 0.89 -0.14 0.51 0.85 1.51 -0.38 -0.02 -1.04 0.29 -0.82 -1.3 0.05 1.01 -0.29 -1.46 -0.83 0.11 -1.18 0.15 -0.82 -0.93 -1.37 -0.03 0.19 -1.71 -2.43 1.0
- - - - - - - - 4.23 - - - - - - - - - 3.48 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.56 3.61 - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.63 - - - - - - - - - - - - 2.02 2.16 - - - - - - 2.83 - - - - - 0.96 - -
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.24 - - - - - 3.21 - - - - 3.49 - - - - - - - - - - - - - - -
2.48 - - - - - - - 3.75 - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - 2.57 - - - -
2.67 - - 1.02 0.88 0.72 - - - - - - 1.0 - - - - 0.76 - - - 2.27 - 1.78 - - 0.59 2.22 - -
- - - - - 2.26 - - 3.62 - - - 2.53 - - - - - - - 1.18 2.29 - - - - - - - -
3.46 - - - - - - - - - - - 2.16 2.13 - - - - - - - - - - - 2.27 - - - 2.41
0.46 0.28 0.79 -0.17 -0.2 -0.02 -0.36 0.52 -0.01 -0.13 0.17 0.13 -0.52 0.14 0.6 -0.02 -1.17 -0.27 -0.48 -1.97 0.17 -0.24 -1.35 0.2 -0.37 0.46 -0.49 0.58 0.13 0.12
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.97 - - - - - - - - - -12.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.83 -0.8 - 1.93 0.6 - - - - - - 0.12 2.19 - 0.2 0.02 1.99 - - - -0.34 -0.81 1.3 -0.27 1.76 - - - 1.31
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.86 -1.04 1.47 1.77 0.18 - -0.85 -0.36 2.02 -1.21 1.03 - -0.26 1.54 -1.37 -0.12 0.23 - - - 0.12 - - 0.62 - -1.23 - 0.02 - 1.17
0.3 0.59 -0.01 0.73 -0.11 -1.23 0.5 1.12 0.51 -0.08 0.89 0.48 -0.48 0.13 -0.5 -0.08 -0.58 -0.03 -3.08 0.07 -0.0 0.14 - -0.36 -1.07 0.51 -0.08 -1.01 -0.14 -0.63
- - - - - - - - 4.6 - - - - - - - - - - - - 2.51 - - - - - - - -
3.2 3.19 - 2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.9 1.87
3.48 3.52 - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - -11.06 - - - 1.31 - 0.41 - 0.37 - - -
Spov3_S05.00043 (ABCG15)
 4.33 - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.01 - - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.02 - - - 1.75 - - - 2.23 2.25 - - - 1.93 0.84 - - 0.76 - - - - - - 2.62 - - - - 0.77
2.92 - - - - - - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.75
- - - - - - - - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.