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Heatmap: Cluster_105 (Spinacia oleracea (Sol) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 260 uE m-2 s-1
Light: 195 uE m-2 s-1
Light: 130 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 65 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L18D6
Photoperiod: L13D11 (Control)
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C (Control)
Temperature: 25°C
Temperature: 30°C
1.26 2.16 0.09 0.59 0.07 2.27 2.23 - - - - 1.79 - - - - - 0.8 - -0.28 - -0.1 - - - - - - -0.04 1.03
0.36 0.31 -0.13 -0.76 0.78 0.26 0.3 -0.39 0.03 0.16 0.06 0.18 -0.1 -0.31 -0.47 -0.47 -0.33 -0.36 -0.16 0.03 -0.3 -0.2 -0.23 0.34 0.23 -0.25 -0.13 0.55 0.25 -0.53
0.31 -0.11 -0.08 -0.3 0.2 -0.22 -0.09 -0.64 0.03 -0.0 -0.07 -0.07 -0.3 0.72 -0.11 -0.07 0.0 0.06 0.08 -0.04 0.14 -0.05 -0.1 -0.02 -0.06 0.02 0.02 0.34 -0.03 -0.12
0.36 0.23 -0.06 -0.18 0.4 -0.05 -0.05 -0.2 0.04 0.11 -0.04 0.01 0.02 0.34 -0.19 -0.24 -0.18 -0.19 -0.15 -0.19 -0.23 -0.1 0.1 0.04 -0.15 -0.2 -0.21 0.36 0.28 -0.11
0.36 0.25 -0.15 -0.18 0.17 0.12 -0.05 -0.02 -0.36 -0.12 -0.23 -0.06 -0.01 0.33 -0.16 -0.26 -0.23 0.2 -0.39 -0.32 -0.26 -0.15 0.53 0.22 0.02 -0.05 -0.07 0.21 0.09 0.01
-0.01 -0.13 -0.11 -0.01 -0.14 -0.05 0.1 0.27 0.08 0.13 0.11 0.16 0.04 0.09 0.09 -0.09 0.0 -0.21 -0.18 -0.15 -0.0 -0.1 -0.15 0.09 -0.01 0.04 0.1 0.13 0.04 -0.3
-0.02 -0.01 0.04 0.06 -0.04 -0.0 0.23 0.33 -0.02 -0.06 0.08 0.08 -0.03 -0.07 0.02 -0.03 0.03 -0.43 0.04 -0.1 -0.06 0.03 -0.37 -0.21 0.11 0.01 0.1 0.07 0.05 -0.05
0.02 0.27 -0.14 -0.16 -0.03 -0.22 0.05 0.3 -0.12 0.16 -0.02 -0.12 0.05 0.15 -0.18 -0.23 -0.13 -0.12 0.21 -0.08 -0.21 -0.12 -0.35 0.29 0.05 -0.1 0.1 0.33 0.09 -0.06
- - - - - - 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - -
2.33 0.55 - - - 2.37 - 1.4 - - - 0.33 - - - 1.47 - - - 1.51 0.07 - 0.34 - - - - 0.52 1.89 0.44
-0.17 0.1 0.21 0.28 0.07 -0.03 -0.15 -0.22 -0.29 0.08 -0.17 0.04 0.33 0.12 0.04 -0.12 -0.11 -0.45 -0.11 -0.25 -0.13 -0.03 0.18 -0.46 0.07 -0.04 0.25 0.29 0.4 -0.22
0.23 0.16 0.13 0.11 -0.11 -0.23 -0.02 0.19 -0.07 -0.07 0.02 -0.05 0.02 0.06 -0.01 0.01 0.01 -0.45 -0.09 -0.11 -0.05 -0.1 -0.1 0.02 0.03 0.01 -0.04 0.13 0.18 0.02
0.36 0.12 -0.61 -1.18 0.76 0.16 0.25 0.56 -0.08 0.1 -0.55 -0.36 -0.42 -0.01 -0.38 -0.1 -0.31 -0.23 -0.56 -0.51 -0.13 -0.2 0.17 0.05 0.19 -0.14 -0.23 0.86 0.69 -0.27
0.11 0.09 -0.07 -0.01 0.13 -0.09 -0.06 -0.06 0.03 0.07 0.05 0.03 -0.16 0.33 -0.02 0.01 0.08 -0.06 -0.13 -0.13 -0.07 -0.14 -0.01 0.03 -0.05 0.06 -0.08 0.14 0.06 -0.19
0.33 0.35 0.32 -0.1 0.43 -0.11 -0.38 -0.2 -0.16 -0.25 0.01 0.04 -0.27 0.61 0.16 0.02 -0.12 -0.34 -0.32 -0.32 0.06 -0.15 -0.82 -0.03 -0.35 -0.07 0.18 0.68 0.04 -0.28
1.49 1.13 -1.43 -3.39 1.69 -0.45 0.26 -2.34 -3.04 -0.99 -1.85 -1.25 -1.7 -2.24 -2.58 -1.92 -1.61 -6.07 -2.1 -1.81 -1.5 -0.6 -0.12 1.42 1.18 -0.54 -1.28 1.74 1.77 0.37
0.29 0.16 0.16 -0.34 0.24 -0.31 -0.22 -0.26 0.21 0.36 0.03 0.09 -0.21 0.51 -0.11 -0.39 -0.24 -0.02 -0.1 -0.27 0.09 -0.15 -0.69 0.01 -0.05 0.1 0.05 0.6 0.3 -0.83
0.27 0.22 -0.04 -0.12 -0.04 -0.32 -0.29 -0.07 -0.23 -0.03 0.16 0.06 0.11 0.19 -0.32 -0.3 -0.06 -0.22 -0.13 -0.09 0.05 -0.05 0.02 0.17 0.18 -0.01 0.08 0.34 0.21 -0.07
-0.04 -0.03 -0.09 -0.06 -0.27 -0.13 -0.02 0.15 0.06 0.07 0.14 0.05 0.06 0.23 0.09 0.09 0.1 -0.4 -0.08 -0.09 -0.01 0.01 -0.28 0.13 0.06 0.07 0.06 0.2 -0.04 -0.25
0.14 0.07 -0.14 0.0 0.37 -0.07 -0.19 -0.06 0.11 0.1 0.07 -0.08 -0.08 0.1 -0.12 -0.13 -0.23 -0.12 -0.14 -0.3 -0.03 -0.12 -0.13 0.14 0.12 0.02 0.03 0.29 0.23 -0.11
0.05 0.09 0.07 0.22 -0.12 -0.26 -0.1 0.31 -0.06 0.01 -0.04 0.01 0.04 -0.02 -0.04 0.04 0.03 -0.29 -0.03 -0.09 -0.06 -0.07 -0.15 0.13 -0.01 -0.01 0.01 0.15 -0.02 0.06
-0.05 -0.02 -0.4 -0.25 0.12 -0.21 0.14 0.25 -0.28 0.22 -0.1 -0.07 0.48 -0.22 -0.03 -0.05 -0.07 -0.01 -0.12 -0.15 -0.09 0.03 -0.06 -0.08 0.08 0.02 0.15 0.54 0.08 -0.27
-0.01 0.09 0.09 0.11 -0.22 -0.02 -0.0 0.16 0.06 0.01 0.12 0.11 -0.15 0.09 0.09 0.19 0.17 -0.68 -0.06 -0.08 0.07 0.0 -0.37 0.05 0.02 0.03 0.06 0.08 -0.02 -0.32
0.13 0.29 0.15 -0.1 0.36 -0.03 -0.08 -0.03 -0.16 0.13 -0.12 -0.05 -0.1 0.24 -0.1 -0.25 -0.11 -0.04 -0.14 -0.2 -0.16 -0.14 0.05 0.11 -0.07 0.13 -0.04 0.34 0.07 -0.41
0.64 0.46 -0.37 -0.77 0.79 0.12 0.0 -0.77 -0.14 -0.01 -0.34 -0.25 -0.73 0.84 -0.34 -0.35 -0.57 -0.57 -0.53 -0.53 -0.36 -0.33 -0.43 0.46 0.4 -0.08 -0.23 0.76 0.82 -0.34
Spov3_chr3.00573 (EMB2799)
 -0.02 0.06 -0.01 0.01 0.01 -0.16 0.17 0.13 0.12 0.1 0.06 -0.0 0.13 0.12 0.1 0.04 0.14 -0.71 0.02 -0.11 -0.16 -0.05 -0.45 0.02 0.08 0.01 0.01 -0.02 0.11 -0.07
0.71 0.4 -0.46 -0.78 0.59 -0.09 -0.13 -0.62 -0.44 -0.1 -0.81 -0.67 -0.72 0.84 -0.7 -0.56 -0.87 0.61 -0.77 -1.04 -0.6 -0.57 1.15 0.46 0.17 -0.38 -0.69 0.85 0.84 -0.02
-0.03 -0.12 0.06 0.11 -0.04 0.06 0.19 0.18 0.07 -0.05 0.01 0.11 0.05 0.1 0.08 -0.01 -0.01 -0.48 -0.14 -0.09 -0.05 -0.0 -0.5 -0.06 0.09 -0.01 -0.03 0.18 0.03 0.06
0.38 0.06 -0.28 -0.23 0.16 0.3 0.3 0.02 -0.24 -0.23 -0.21 -0.13 -0.03 0.01 0.16 0.08 0.03 -0.38 -0.36 -0.39 -0.29 -0.07 -0.08 0.35 0.26 -0.09 -0.2 0.34 0.28 -0.1
0.47 0.3 -0.86 -0.84 0.37 0.19 0.3 -0.58 -0.36 0.04 -0.67 -0.19 -0.6 0.12 -0.37 -0.33 -0.1 -0.46 -0.93 -0.57 0.3 -0.15 -0.35 0.95 0.73 -0.07 -0.32 0.29 0.86 0.21
0.22 0.13 0.16 0.09 0.12 0.16 -0.18 -0.35 0.29 0.41 -0.01 0.06 -0.69 0.49 -0.2 -0.18 -0.39 0.31 -0.26 -0.48 -0.08 -0.19 -0.75 -0.07 0.08 -0.06 0.15 0.38 0.17 -0.26
-0.12 -0.25 0.02 0.19 0.08 0.09 0.27 0.27 0.1 0.04 0.18 0.29 0.09 -0.11 -0.03 0.04 0.07 -0.8 -0.11 -0.03 -0.04 0.0 -0.52 -0.07 0.04 -0.07 -0.05 0.01 0.01 -0.01
0.13 0.11 -0.07 -0.25 0.13 -0.08 0.07 -0.04 -0.04 -0.02 -0.11 0.1 0.16 0.37 -0.08 -0.22 -0.2 0.04 -0.03 0.05 -0.19 0.03 0.0 0.11 0.13 -0.17 -0.1 0.24 0.04 -0.38
0.67 0.58 -0.39 -1.03 0.89 0.03 0.27 -0.39 -0.73 -0.25 -0.51 -0.2 -0.37 0.18 -0.47 -0.62 -0.46 -2.02 -0.65 -0.61 -0.51 -0.27 0.39 0.71 0.38 -0.25 -0.42 0.94 0.95 0.06
0.03 0.22 -0.03 -0.01 0.0 -0.12 -0.07 0.1 -0.06 0.04 -0.04 0.01 0.14 0.23 -0.18 -0.14 -0.14 -0.39 -0.03 -0.02 -0.05 -0.09 -0.28 0.05 0.08 0.02 0.07 0.25 0.13 0.07
0.47 0.03 -0.36 -0.39 -0.27 -0.0 0.22 -0.44 -0.12 0.05 0.18 0.18 0.11 0.4 0.1 -0.15 -0.02 -0.46 -0.1 0.04 -0.16 0.03 -0.45 0.22 0.23 0.08 0.01 -0.1 0.17 -0.06
0.92 -0.09 -0.79 -1.2 1.13 1.04 0.2 0.14 -0.76 -0.78 -1.22 -0.87 -1.02 0.37 0.06 0.2 0.34 -0.86 -1.35 -0.87 -0.93 -0.5 -0.31 0.81 0.32 -0.7 -1.03 0.95 1.1 -0.89
0.06 0.02 0.21 0.16 0.35 -0.03 -0.06 0.02 0.07 -0.03 -0.09 -0.19 -0.16 0.5 -0.4 -0.46 -0.41 -0.29 -0.16 0.02 -0.06 -0.2 -0.55 0.03 -0.29 0.07 0.3 0.67 0.16 -0.02
0.2 0.18 0.04 -0.11 0.15 0.12 0.11 -0.15 -0.0 -0.01 -0.17 -0.03 -0.06 -0.24 -0.06 -0.1 -0.14 -0.07 0.05 0.02 -0.07 -0.05 -0.1 0.1 -0.02 -0.02 -0.01 0.21 0.19 -0.09
0.2 0.25 0.04 -0.01 0.22 -0.35 -0.24 0.24 -0.14 -0.03 -0.23 -0.16 0.21 0.28 -0.44 -0.15 -0.13 -0.07 -0.25 -0.31 -0.09 0.03 -0.11 0.14 -0.0 0.01 0.02 0.4 0.31 -0.07
0.05 0.01 -0.05 -0.04 0.2 -0.1 -0.15 0.01 0.11 0.15 -0.0 0.05 -0.24 0.33 0.05 -0.06 0.04 0.0 -0.1 -0.2 -0.04 -0.11 -0.23 0.03 0.03 -0.05 0.05 0.13 0.2 -0.26
0.65 0.3 -0.74 -1.02 -0.32 0.5 0.39 -0.41 -0.22 0.32 -0.28 -0.17 -0.24 0.28 -0.07 0.07 -0.03 -1.68 -0.0 -0.16 0.09 0.01 -0.76 0.6 0.3 -0.02 -0.0 -0.14 0.38 0.22
0.17 0.06 0.0 -0.25 0.06 -0.17 0.07 0.0 -0.03 0.16 0.04 0.08 0.08 -0.04 -0.04 -0.06 0.03 -0.6 -0.19 -0.11 -0.12 -0.12 -0.11 0.24 0.13 -0.0 0.12 0.19 0.18 -0.03
0.23 0.06 -0.07 -0.3 0.21 -0.08 -0.12 -0.24 -0.07 0.07 0.01 -0.32 -0.37 0.68 0.05 0.06 0.02 -0.03 -0.01 -0.17 0.27 -0.14 -0.53 0.09 0.02 0.07 -0.11 0.63 0.01 -0.75
Spov3_chr4.01617 (ATERDJ2A)
 0.25 0.22 0.04 0.07 0.13 -0.05 -0.07 0.29 0.1 0.19 -0.12 -0.07 -0.28 0.31 -0.16 -0.07 -0.08 0.25 -0.31 -0.35 -0.3 -0.26 -0.4 0.03 -0.15 0.1 -0.04 0.11 0.22 0.02
0.13 0.24 -0.1 -0.19 0.69 0.22 0.09 0.08 -0.0 0.04 -0.05 0.09 -0.13 0.33 -0.26 -0.17 -0.27 -0.47 -0.2 -0.16 -0.33 -0.18 -0.08 0.19 -0.01 -0.18 -0.16 0.4 0.16 -0.32
0.12 0.03 -0.24 -0.18 0.16 0.13 0.11 0.06 -0.2 0.07 -0.13 -0.07 -0.03 0.38 -0.01 -0.09 -0.15 -0.3 -0.24 -0.24 -0.1 -0.1 0.01 0.29 0.02 -0.1 -0.08 0.4 0.3 -0.16
1.44 - - 0.91 - - 2.63 1.79 - 0.14 - - 1.27 - - - - - 0.05 - - - - 1.02 - - 1.2 2.22 0.16 0.19
-0.08 -0.16 -0.13 0.02 -0.32 -0.3 -0.05 0.2 -0.02 -0.03 0.18 0.05 0.08 0.09 0.31 0.08 0.23 -0.55 0.01 -0.08 -0.05 0.14 -0.0 0.14 -0.04 -0.01 0.01 0.07 -0.01 -0.07
Spov3_chr4.03080 (ALDH11A3)
 0.1 0.07 -0.2 -0.42 -0.33 -0.07 0.19 -0.02 -0.09 0.12 0.02 0.09 0.1 0.07 -0.02 -0.02 -0.0 -0.38 0.01 -0.03 0.02 0.07 -0.32 0.13 0.13 0.08 0.11 0.38 0.11 -0.21
0.15 0.24 -0.04 -0.17 0.28 0.03 0.05 -0.07 -0.06 -0.0 -0.12 -0.03 -0.07 0.2 -0.03 -0.11 -0.02 -0.43 -0.16 -0.08 -0.03 -0.1 -0.3 0.25 0.01 0.02 0.04 0.28 0.2 -0.19
0.97 0.33 -1.57 -1.9 1.2 -0.05 0.52 -1.28 -1.49 -0.79 -0.93 -0.88 -0.91 0.61 -0.46 -0.62 -0.57 -0.15 -0.85 -0.97 -0.85 -0.63 0.12 1.39 1.24 -0.3 -0.97 0.94 0.88 -0.64
0.09 0.16 -0.18 -0.41 0.64 0.13 -0.01 0.03 0.02 0.14 -0.1 0.02 0.12 0.43 -0.17 -0.11 -0.09 -0.07 -0.36 -0.39 -0.32 -0.18 -0.02 0.14 -0.09 -0.08 -0.1 0.28 0.18 -0.27
1.01 0.36 -1.04 -0.68 1.6 0.13 0.35 -1.48 -1.46 -1.21 -1.33 -1.43 -0.62 -2.66 -0.81 -1.01 -0.96 -1.19 -1.72 -1.09 -1.25 -0.55 -0.28 1.16 0.81 -0.67 -1.03 1.4 1.87 0.44
0.13 0.1 -0.09 -0.05 0.1 -0.04 0.14 0.13 0.19 0.14 0.07 0.28 0.08 0.42 -0.19 -0.13 -0.01 -0.84 -0.19 -0.2 -0.17 -0.09 -0.87 -0.09 0.01 0.0 0.06 0.18 0.19 0.07
-0.14 0.08 -0.15 0.11 -0.04 -0.11 0.24 -0.21 -0.45 -0.03 -0.08 0.08 0.67 -0.4 0.03 0.06 0.17 -0.19 -0.24 -0.27 -0.02 -0.09 0.17 -0.12 -0.01 -0.05 0.06 0.32 0.18 -0.09
0.03 -0.01 -0.03 -0.07 0.13 -0.05 0.0 0.35 -0.04 -0.04 0.01 0.15 0.13 0.27 0.09 0.04 -0.01 -0.82 -0.06 -0.03 0.01 -0.1 -0.72 0.03 -0.02 0.1 0.07 -0.05 0.08 0.09
0.27 -0.28 -0.88 0.03 -0.57 -0.79 -0.29 -0.41 0.33 -0.02 0.04 0.19 0.35 1.03 0.08 0.31 0.09 -0.61 0.11 -0.82 -0.11 -0.21 -0.08 0.3 -0.14 -0.28 0.04 -0.06 0.29 0.36
1.58 -1.18 - - 0.67 2.04 1.63 -0.39 - - -1.3 - 0.77 -1.4 0.93 - -1.22 -0.48 -1.35 - - - 1.15 0.62 - 0.93 -0.32 - 1.6 0.67
0.37 0.21 -0.16 -0.13 0.08 0.18 0.1 0.1 -0.0 -0.09 -0.29 -0.2 -0.04 0.28 0.11 -0.11 0.06 -0.23 -0.28 -0.28 -0.33 -0.1 -0.3 0.23 -0.1 -0.02 -0.14 0.37 0.14 0.14
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0.19 0.07 -0.13 -0.21 0.19 -0.14 0.11 0.09 -0.02 0.01 0.02 0.08 0.03 0.18 -0.16 -0.14 -0.13 -0.18 -0.15 -0.23 -0.09 -0.06 -0.34 0.17 0.16 0.01 0.08 0.36 0.18 -0.25
0.37 0.25 -0.06 -0.64 0.54 0.16 0.11 -0.2 -0.17 0.09 -0.16 -0.21 -0.39 0.28 -0.07 -0.07 0.03 0.28 -0.11 -0.22 -0.13 -0.3 -0.17 0.09 -0.14 -0.02 0.15 -0.13 0.29 -0.05
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0.27 0.12 0.05 -0.04 -0.02 -0.13 -0.29 0.07 -0.06 -0.02 0.1 0.06 -0.03 0.47 -0.09 -0.11 -0.08 -0.41 -0.0 -0.15 -0.02 -0.03 -0.51 0.19 -0.02 -0.12 -0.12 0.36 0.18 -0.01
0.25 0.34 0.34 0.46 0.11 -0.15 -0.33 0.08 0.2 0.42 -0.26 0.01 -0.29 0.48 -0.14 -0.4 -0.13 0.4 -0.42 -0.33 -0.12 -0.29 -0.74 -0.2 -0.38 -0.23 -0.15 0.01 0.58 -0.25
Spov3_S08.00037 (CYP724A1)
 -0.05 0.09 0.12 -0.23 -0.42 -0.15 0.0 0.1 0.11 0.1 0.04 0.19 -0.09 0.31 0.1 -0.09 0.05 -0.16 0.0 -0.2 0.07 0.11 -0.22 0.04 0.12 0.12 0.04 0.07 -0.03 -0.42

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.